Protein–RNA interactions for Protein: P09067

HOXB5, Homeobox protein Hox-B5, humanhuman

Predictions only

Length 269 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HOXB5P09067 OTUD5-208ENST00000610466 2487 ntTSL 5 BASIC21.72■■□□□ 1.07
HOXB5P09067 POU3F3-201ENST00000361360 3064 ntAPPRIS P1 BASIC21.72■■□□□ 1.07
HOXB5P09067 LMO2-201ENST00000257818 2294 ntTSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
HOXB5P09067 PLEKHF1-201ENST00000436066 2084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
HOXB5P09067 AL121749.1-202ENST00000609313 2153 ntBASIC21.72■■□□□ 1.07
HOXB5P09067 VEGFC-202ENST00000618562 2064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
HOXB5P09067 TMEM185A-207ENST00000600449 2840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
HOXB5P09067 ACTR3B-202ENST00000377776 1566 ntTSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
HOXB5P09067 DRD5P2-201ENST00000421395 2012 ntBASIC21.71■■□□□ 1.07
HOXB5P09067 MAPKAPK2-201ENST00000294981 2171 ntTSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
HOXB5P09067 ROM1-201ENST00000278833 1878 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
HOXB5P09067 AL139393.2-201ENST00000608721 2025 ntBASIC21.7■■□□□ 1.06
HOXB5P09067 SSBP4-202ENST00000348495 1721 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC21.7■■□□□ 1.06
HOXB5P09067 TSPAN11-203ENST00000545802 1649 ntTSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
HOXB5P09067 NAPA-201ENST00000263354 1839 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
HOXB5P09067 CCNG2-201ENST00000316355 5526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
HOXB5P09067 RTN2-202ENST00000344680 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
HOXB5P09067 AVEN-201ENST00000306730 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
HOXB5P09067 ZSWIM6-201ENST00000252744 5501 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.68■■□□□ 1.06
HOXB5P09067 MRAP2-201ENST00000257776 2153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
HOXB5P09067 HOXB3-212ENST00000498678 2196 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.68■■□□□ 1.06
HOXB5P09067 HAUS7-201ENST00000370210 1593 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.67■■□□□ 1.06
HOXB5P09067 THAP4-204ENST00000407315 2367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
HOXB5P09067 FAM220A-206ENST00000616824 2211 ntTSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
HOXB5P09067 RCAN1-201ENST00000313806 2490 ntTSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
HOXB5P09067 SH3GL1-202ENST00000417295 1404 ntTSL 2 BASIC21.65■■□□□ 1.06
HOXB5P09067 FGF2-203ENST00000614010 867 ntTSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
HOXB5P09067 ABHD17A-201ENST00000250974 1630 ntTSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
HOXB5P09067 COMMD7-201ENST00000278980 1900 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
HOXB5P09067 THRA-204ENST00000546243 1909 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.65■■□□□ 1.06
HOXB5P09067 ZCCHC2-201ENST00000269499 5959 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.64■■□□□ 1.06
HOXB5P09067 SERPING1-205ENST00000403558 2231 ntTSL 5 BASIC21.64■■□□□ 1.06
HOXB5P09067 HYAL2-202ENST00000395139 2136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.06
HOXB5P09067 TADA2B-201ENST00000310074 4350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
HOXB5P09067 QKI-207ENST00000453779 5685 ntTSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
HOXB5P09067 LINC01578-201ENST00000553829 732 ntTSL 2 BASIC21.64■■□□□ 1.05
HOXB5P09067 CCKBR-201ENST00000334619 2121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
HOXB5P09067 TNIP2-201ENST00000315423 1974 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
HOXB5P09067 AC079848.1-201ENST00000511301 327 ntTSL 3 BASIC21.63■■□□□ 1.05
HOXB5P09067 RAB40C-204ENST00000538492 2569 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.62■■□□□ 1.05
HOXB5P09067 CREM-210ENST00000374721 2020 ntTSL 5 BASIC21.62■■□□□ 1.05
HOXB5P09067 ZFAND2B-208ENST00000409594 2021 ntTSL 2 BASIC21.62■■□□□ 1.05
HOXB5P09067 RDX-210ENST00000530301 1549 ntTSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
HOXB5P09067 CLK2-201ENST00000355560 2120 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.62■■□□□ 1.05
HOXB5P09067 ATF4-201ENST00000337304 2019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
HOXB5P09067 GLRX5-201ENST00000331334 1564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
HOXB5P09067 SLC22A23-201ENST00000380298 1574 ntTSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
HOXB5P09067 NRGN-201ENST00000284292 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
HOXB5P09067 TMEM55B-201ENST00000250489 1961 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
HOXB5P09067 IHH-201ENST00000295731 2023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
HOXB5P09067 RUNDC3A-201ENST00000225441 1821 ntTSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
HOXB5P09067 CHMP4B-201ENST00000217402 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
HOXB5P09067 BTBD7-201ENST00000298896 2621 ntTSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
HOXB5P09067 PCSK6-216ENST00000615296 2921 ntTSL 5 BASIC21.6■■□□□ 1.05
HOXB5P09067 RSG1-201ENST00000375599 1545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
HOXB5P09067 ZNF768-201ENST00000380412 2315 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
HOXB5P09067 KCNQ5-204ENST00000370392 1469 ntTSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
HOXB5P09067 JAG2-202ENST00000347004 5720 ntTSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
HOXB5P09067 TNFSF12-201ENST00000293825 1553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
HOXB5P09067 SDCCAG3-201ENST00000298537 2314 ntTSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
HOXB5P09067 GUSB-202ENST00000421103 1742 ntTSL 2 BASIC21.59■■□□□ 1.05
HOXB5P09067 KANSL1L-207ENST00000452086 2334 ntTSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
HOXB5P09067 FAM107B-205ENST00000378467 2374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
HOXB5P09067 TMEM187-201ENST00000369982 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.04
HOXB5P09067 CYBA-201ENST00000261623 797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
HOXB5P09067 CAMKK1-201ENST00000158166 2459 ntTSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
HOXB5P09067 NREP-202ENST00000379671 2581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
HOXB5P09067 CAPNS1-204ENST00000587718 1558 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
HOXB5P09067 SHF-207ENST00000560540 2062 ntTSL 5 BASIC21.55■■□□□ 1.04
HOXB5P09067 SLC16A3-214ENST00000582743 2002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
HOXB5P09067 AC006077.2-201ENST00000623591 457 ntBASIC21.54■■□□□ 1.04
HOXB5P09067 ZDHHC23-206ENST00000498275 2055 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.54■■□□□ 1.04
HOXB5P09067 CPNE1-202ENST00000352393 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
HOXB5P09067 VIPR2-203ENST00000402066 1926 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.53■■□□□ 1.04
HOXB5P09067 TGFBRAP1-202ENST00000393359 5979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
HOXB5P09067 BCL7C-201ENST00000215115 1740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
HOXB5P09067 PHF23-205ENST00000571362 1768 ntTSL 2 BASIC21.53■■□□□ 1.04
HOXB5P09067 KCNMA1-283ENST00000640523 5425 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.53■■□□□ 1.04
HOXB5P09067 RHEB-201ENST00000262187 2075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
HOXB5P09067 HDAC3-201ENST00000305264 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
HOXB5P09067 SPTSSA-201ENST00000298130 2777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.03
HOXB5P09067 TLE6-201ENST00000246112 2100 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.03
HOXB5P09067 FADD-201ENST00000301838 1841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
HOXB5P09067 CYB5R3-201ENST00000352397 2124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
HOXB5P09067 CARS2-201ENST00000257347 1879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
HOXB5P09067 ANKS1B-202ENST00000333732 1675 ntTSL 2 BASIC21.49■■□□□ 1.03
HOXB5P09067 LMTK3-201ENST00000270238 4972 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
HOXB5P09067 GSTZ1-201ENST00000216465 1338 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
HOXB5P09067 DNAJC21-201ENST00000342382 2309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
HOXB5P09067 TMEM64-201ENST00000418210 4663 ntTSL 2 BASIC21.47■■□□□ 1.03
HOXB5P09067 FRAT2-201ENST00000371019 2213 ntAPPRIS P1 BASIC21.47■■□□□ 1.03
HOXB5P09067 ABHD17A-202ENST00000292577 1757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
HOXB5P09067 NXPH3-201ENST00000328741 2179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
HOXB5P09067 EBPL-203ENST00000378270 579 ntTSL 2 BASIC21.46■■□□□ 1.03
HOXB5P09067 FTCD-201ENST00000291670 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
HOXB5P09067 PLBD2-202ENST00000545182 2321 ntTSL 2 BASIC21.46■■□□□ 1.03
HOXB5P09067 OTUD5-202ENST00000376488 2692 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
HOXB5P09067 PLEKHG6-206ENST00000536531 1683 ntTSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
HOXB5P09067 REXO4-202ENST00000371942 2360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
HOXB5P09067 NPAS3-201ENST00000346562 5847 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 14 ms