Protein–RNA interactions for Protein: P08779

KRT16, Keratin, type I cytoskeletal 16, humanhuman

Predictions only

Length 473 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
KRT16P08779 CAPN10-208ENST00000404753 2570 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.9■■□□□ 1.74
KRT16P08779 CSNK1E-203ENST00000396832 2791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.89■■□□□ 1.74
KRT16P08779 RASSF8-202ENST00000381352 2320 ntTSL 1 (best) BASIC25.88■■□□□ 1.73
KRT16P08779 PQLC1-211ENST00000590381 1247 ntTSL 2 BASIC25.88■■□□□ 1.73
KRT16P08779 CTDNEP1-201ENST00000318988 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.88■■□□□ 1.73
KRT16P08779 SPATA5L1-208ENST00000638607 1863 ntTSL 2 BASIC25.87■■□□□ 1.73
KRT16P08779 YAP1-204ENST00000526343 2393 ntTSL 5 BASIC25.87■■□□□ 1.73
KRT16P08779 PLBD2-202ENST00000545182 2321 ntTSL 2 BASIC25.87■■□□□ 1.73
KRT16P08779 SPTSSA-201ENST00000298130 2777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.86■■□□□ 1.73
KRT16P08779 H2AFV-202ENST00000308153 752 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.86■■□□□ 1.73
KRT16P08779 GKAP1-203ENST00000376371 1778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.86■■□□□ 1.73
KRT16P08779 THRA-204ENST00000546243 1909 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.86■■□□□ 1.73
KRT16P08779 OTUD5-202ENST00000376488 2692 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.86■■□□□ 1.73
KRT16P08779 PLEKHF1-201ENST00000436066 2084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.86■■□□□ 1.73
KRT16P08779 RAB40C-204ENST00000538492 2569 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.85■■□□□ 1.73
KRT16P08779 FAM58A-202ENST00000440428 1164 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC25.85■■□□□ 1.73
KRT16P08779 MAPK4-202ENST00000540640 1576 ntTSL 2 BASIC25.85■■□□□ 1.73
KRT16P08779 TNIP2-201ENST00000315423 1974 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.84■■□□□ 1.73
KRT16P08779 AL031258.1-201ENST00000623562 325 ntBASIC25.83■■□□□ 1.73
KRT16P08779 FAM89A-201ENST00000366654 1495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.83■■□□□ 1.73
KRT16P08779 GALK1-205ENST00000588479 1866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.83■■□□□ 1.72
KRT16P08779 ZNF768-201ENST00000380412 2315 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.82■■□□□ 1.72
KRT16P08779 HOXB3-210ENST00000489475 1845 ntTSL 2 BASIC25.82■■□□□ 1.72
KRT16P08779 FRAT2-201ENST00000371019 2213 ntAPPRIS P1 BASIC25.81■■□□□ 1.72
KRT16P08779 GIPC1-201ENST00000345425 1782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.81■■□□□ 1.72
KRT16P08779 MTCH1-202ENST00000373627 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.81■■□□□ 1.72
KRT16P08779 ARTN-203ENST00000414809 1943 ntAPPRIS P4 TSL 3 BASIC25.8■■□□□ 1.72
KRT16P08779 CCND3-202ENST00000372988 2133 ntTSL 1 (best) BASIC25.79■■□□□ 1.72
KRT16P08779 PACS2-201ENST00000325438 3708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.79■■□□□ 1.72
KRT16P08779 NFYB-205ENST00000551727 1727 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.79■■□□□ 1.72
KRT16P08779 PLPPR3-201ENST00000359894 2387 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.78■■□□□ 1.72
KRT16P08779 GTF2IP1-204ENST00000616377 2632 ntTSL 2 BASIC25.78■■□□□ 1.72
KRT16P08779 IHH-201ENST00000295731 2023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.78■■□□□ 1.72
KRT16P08779 RNF130-201ENST00000261947 1766 ntTSL 1 (best) BASIC25.77■■□□□ 1.72
KRT16P08779 GRK2-204ENST00000526285 1458 ntTSL 5 BASIC25.77■■□□□ 1.72
KRT16P08779 PGM5-201ENST00000396392 1782 ntTSL 1 (best) BASIC25.76■■□□□ 1.71
KRT16P08779 PHF23-205ENST00000571362 1768 ntTSL 2 BASIC25.76■■□□□ 1.71
KRT16P08779 CAMKK1-201ENST00000158166 2459 ntTSL 1 (best) BASIC25.75■■□□□ 1.71
KRT16P08779 CYB5R3-201ENST00000352397 2124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.75■■□□□ 1.71
KRT16P08779 FGF18-201ENST00000274625 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.75■■□□□ 1.71
KRT16P08779 DDX42-201ENST00000359353 2783 ntTSL 5 BASIC25.75■■□□□ 1.71
KRT16P08779 TMEM55B-201ENST00000250489 1961 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.75■■□□□ 1.71
KRT16P08779 TMEM187-201ENST00000369982 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.74■■□□□ 1.71
KRT16P08779 DRD5P2-201ENST00000421395 2012 ntBASIC25.74■■□□□ 1.71
KRT16P08779 DEDD-212ENST00000545495 2329 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.74■■□□□ 1.71
KRT16P08779 ANKRD53-201ENST00000272421 2185 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.73■■□□□ 1.71
KRT16P08779 ESRRA-203ENST00000406310 2218 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.73■■□□□ 1.71
KRT16P08779 CNIH2-203ENST00000528852 1524 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.73■■□□□ 1.71
KRT16P08779 HNRNPAB-202ENST00000358344 1796 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.72■■□□□ 1.71
KRT16P08779 HYAL2-202ENST00000395139 2136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.72■■□□□ 1.71
KRT16P08779 ST6GALNAC6-204ENST00000373144 2406 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.72■■□□□ 1.71
KRT16P08779 AJAP1-201ENST00000378190 2383 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.72■■□□□ 1.71
KRT16P08779 NOG-201ENST00000332822 1892 ntAPPRIS P1 BASIC25.72■■□□□ 1.71
KRT16P08779 TAZ-205ENST00000475699 1862 ntTSL 1 (best) BASIC25.72■■□□□ 1.71
KRT16P08779 FADD-201ENST00000301838 1841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.72■■□□□ 1.71
KRT16P08779 ARTN-211ENST00000498139 1303 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.71■■□□□ 1.71
KRT16P08779 SSBP4-206ENST00000599699 793 ntTSL 2 BASIC25.7■■□□□ 1.7
KRT16P08779 RAB26-201ENST00000210187 1675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.7■■□□□ 1.7
KRT16P08779 RSG1-201ENST00000375599 1545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.69■■□□□ 1.7
KRT16P08779 CAPNS1-204ENST00000587718 1558 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.69■■□□□ 1.7
KRT16P08779 OTUD5-203ENST00000396743 2682 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.69■■□□□ 1.7
KRT16P08779 NXPH3-201ENST00000328741 2179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.68■■□□□ 1.7
KRT16P08779 AL355297.4-201ENST00000603191 1249 ntTSL 3 BASIC25.67■■□□□ 1.7
KRT16P08779 CACNG7-203ENST00000391767 2688 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.67■■□□□ 1.7
KRT16P08779 KIAA2013-201ENST00000376572 2815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.66■■□□□ 1.7
KRT16P08779 LRRC61-202ENST00000359623 1877 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.66■■□□□ 1.7
KRT16P08779 ANAPC11-203ENST00000392376 687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.65■■□□□ 1.7
KRT16P08779 MBD2-202ENST00000398398 1237 ntTSL 2 BASIC25.65■■□□□ 1.7
KRT16P08779 MAP6D1-202ENST00000431348 890 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.65■■□□□ 1.7
KRT16P08779 MBD2-205ENST00000583046 1182 ntTSL 1 (best) BASIC25.65■■□□□ 1.7
KRT16P08779 CHCHD4-201ENST00000295767 1603 ntTSL 2 BASIC25.65■■□□□ 1.7
KRT16P08779 AL135925.1-201ENST00000605920 1701 ntBASIC25.64■■□□□ 1.7
KRT16P08779 MORF4L1-202ENST00000379535 2274 ntTSL 2 BASIC25.64■■□□□ 1.7
KRT16P08779 HMGB1-205ENST00000399494 1282 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.64■■□□□ 1.7
KRT16P08779 MSX1-201ENST00000382723 1939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.64■■□□□ 1.69
KRT16P08779 VIPR2-203ENST00000402066 1926 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.64■■□□□ 1.69
KRT16P08779 RASSF5-204ENST00000580449 1932 ntTSL 1 (best) BASIC25.64■■□□□ 1.69
KRT16P08779 SERPING1-205ENST00000403558 2231 ntTSL 5 BASIC25.64■■□□□ 1.69
KRT16P08779 RHEB-201ENST00000262187 2075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.62■■□□□ 1.69
KRT16P08779 HRH3-201ENST00000317393 1419 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.62■■□□□ 1.69
KRT16P08779 CATIP-201ENST00000289388 1323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.6■■□□□ 1.69
KRT16P08779 DBP-205ENST00000601104 1489 ntTSL 1 (best) BASIC25.6■■□□□ 1.69
KRT16P08779 SHD-201ENST00000543264 2577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.58■■□□□ 1.69
KRT16P08779 PKM-204ENST00000449901 2526 ntTSL 2 BASIC25.58■■□□□ 1.68
KRT16P08779 AL139393.2-201ENST00000608721 2025 ntBASIC25.57■■□□□ 1.68
KRT16P08779 COMMD7-201ENST00000278980 1900 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.57■■□□□ 1.68
KRT16P08779 EVC-203ENST00000509451 1960 ntTSL 1 (best) BASIC25.56■■□□□ 1.68
KRT16P08779 HNRNPAB-204ENST00000504898 1785 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.55■■□□□ 1.68
KRT16P08779 DNAJC21-201ENST00000342382 2309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.55■■□□□ 1.68
KRT16P08779 FANCE-201ENST00000229769 2554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.54■■□□□ 1.68
KRT16P08779 PSMG1-201ENST00000331573 2154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.54■■□□□ 1.68
KRT16P08779 SLC9A3R2-201ENST00000424542 2194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.54■■□□□ 1.68
KRT16P08779 MTMR1-202ENST00000370390 2755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.54■■□□□ 1.68
KRT16P08779 BCL7C-202ENST00000380317 2409 ntTSL 1 (best) BASIC25.53■■□□□ 1.68
KRT16P08779 LINC01578-204ENST00000554894 556 ntTSL 3 BASIC25.52■■□□□ 1.68
KRT16P08779 LINC01578-207ENST00000556895 802 ntTSL 2 BASIC25.52■■□□□ 1.68
KRT16P08779 KANSL1L-207ENST00000452086 2334 ntTSL 1 (best) BASIC25.52■■□□□ 1.68
KRT16P08779 HES7-202ENST00000541682 1674 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.52■■□□□ 1.68
KRT16P08779 HNRNPAB-206ENST00000506339 1747 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.51■■□□□ 1.68
KRT16P08779 KHSRP-201ENST00000398148 2993 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.51■■□□□ 1.67
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 9.3 ms