Protein–RNA interactions for Protein: P07951

TPM2, Tropomyosin beta chain, humanhuman

Predictions only

Length 284 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TPM2P07951 SP8-201ENST00000361443 1714 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.54■■■□□ 2.32
TPM2P07951 SIGMAR1-203ENST00000378892 1743 ntTSL 2 BASIC29.54■■■□□ 2.32
TPM2P07951 ANKS1B-202ENST00000333732 1675 ntTSL 2 BASIC29.53■■■□□ 2.32
TPM2P07951 PKM-204ENST00000449901 2526 ntTSL 2 BASIC29.52■■■□□ 2.32
TPM2P07951 CTU1-201ENST00000421832 2087 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.52■■■□□ 2.32
TPM2P07951 SNAI3-AS1-204ENST00000567997 2048 ntBASIC29.52■■■□□ 2.32
TPM2P07951 GALK1-205ENST00000588479 1866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.51■■■□□ 2.31
TPM2P07951 ACTR3B-202ENST00000377776 1566 ntTSL 1 (best) BASIC29.5■■■□□ 2.31
TPM2P07951 WTAP-206ENST00000621533 2109 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.5■■■□□ 2.31
TPM2P07951 AL121749.1-202ENST00000609313 2153 ntBASIC29.49■■■□□ 2.31
TPM2P07951 SHD-201ENST00000543264 2577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.49■■■□□ 2.31
TPM2P07951 VEGFC-202ENST00000618562 2064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.48■■■□□ 2.31
TPM2P07951 DPF1-202ENST00000412732 2303 ntTSL 1 (best) BASIC29.48■■■□□ 2.31
TPM2P07951 FANCE-201ENST00000229769 2554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.48■■■□□ 2.31
TPM2P07951 NPAS3-203ENST00000357798 2763 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.47■■■□□ 2.31
TPM2P07951 ANAPC11-203ENST00000392376 687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.47■■■□□ 2.31
TPM2P07951 SH3GL3-202ENST00000427482 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.47■■■□□ 2.31
TPM2P07951 MFSD12-202ENST00000389395 2039 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.47■■■□□ 2.31
TPM2P07951 MAGI2-215ENST00000628980 6212 ntTSL 5 BASIC29.46■■■□□ 2.31
TPM2P07951 ARTN-211ENST00000498139 1303 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC29.45■■■□□ 2.3
TPM2P07951 CCKBR-201ENST00000334619 2121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.44■■■□□ 2.3
TPM2P07951 MSX2-202ENST00000507785 1188 ntTSL 2 BASIC29.44■■■□□ 2.3
TPM2P07951 BIN1-210ENST00000393041 2272 ntTSL 1 (best) BASIC29.44■■■□□ 2.3
TPM2P07951 CHMP4B-201ENST00000217402 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.44■■■□□ 2.3
TPM2P07951 ST6GALNAC6-204ENST00000373144 2406 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC29.44■■■□□ 2.3
TPM2P07951 MSX1-201ENST00000382723 1939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.43■■■□□ 2.3
TPM2P07951 ACTR3B-201ENST00000256001 2216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.43■■■□□ 2.3
TPM2P07951 HRH3-201ENST00000317393 1419 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.42■■■□□ 2.3
TPM2P07951 LMTK3-202ENST00000600059 5113 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC29.42■■■□□ 2.3
TPM2P07951 LRRC61-202ENST00000359623 1877 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.42■■■□□ 2.3
TPM2P07951 FRAT2-201ENST00000371019 2213 ntAPPRIS P1 BASIC29.41■■■□□ 2.3
TPM2P07951 MAP6D1-202ENST00000431348 890 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC29.41■■■□□ 2.3
TPM2P07951 HNRNPAB-206ENST00000506339 1747 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC29.41■■■□□ 2.3
TPM2P07951 SSBP4-202ENST00000348495 1721 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC29.4■■■□□ 2.3
TPM2P07951 GPR75-ASB3-201ENST00000406625 2113 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.4■■■□□ 2.3
TPM2P07951 PLBD2-202ENST00000545182 2321 ntTSL 2 BASIC29.4■■■□□ 2.3
TPM2P07951 ECI1-201ENST00000301729 1541 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.4■■■□□ 2.3
TPM2P07951 RASSF5-204ENST00000580449 1932 ntTSL 1 (best) BASIC29.39■■■□□ 2.3
TPM2P07951 AL355297.4-201ENST00000603191 1249 ntTSL 3 BASIC29.39■■■□□ 2.3
TPM2P07951 OTUD5-202ENST00000376488 2692 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC29.39■■■□□ 2.3
TPM2P07951 SMARCD3-203ENST00000392811 2018 ntTSL 1 (best) BASIC29.38■■■□□ 2.29
TPM2P07951 MAZ-201ENST00000219782 2698 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC29.38■■■□□ 2.29
TPM2P07951 ABHD17A-201ENST00000250974 1630 ntTSL 1 (best) BASIC29.38■■■□□ 2.29
TPM2P07951 FAM107B-205ENST00000378467 2374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.38■■■□□ 2.29
TPM2P07951 PGM5-201ENST00000396392 1782 ntTSL 1 (best) BASIC29.38■■■□□ 2.29
TPM2P07951 EFEMP2-201ENST00000307998 2034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.38■■■□□ 2.29
TPM2P07951 HDGF-201ENST00000357325 2380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.38■■■□□ 2.29
TPM2P07951 TSPAN33-201ENST00000486685 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.38■■■□□ 2.29
TPM2P07951 CHPT1-205ENST00000549872 2001 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC29.37■■■□□ 2.29
TPM2P07951 FBXO45-201ENST00000311630 5899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.37■■■□□ 2.29
TPM2P07951 MBD2-202ENST00000398398 1237 ntTSL 2 BASIC29.36■■■□□ 2.29
TPM2P07951 MBD2-205ENST00000583046 1182 ntTSL 1 (best) BASIC29.36■■■□□ 2.29
TPM2P07951 ZNF513-201ENST00000323703 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.36■■■□□ 2.29
TPM2P07951 HECA-201ENST00000367658 5614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.36■■■□□ 2.29
TPM2P07951 LDB1-202ENST00000425280 2089 ntTSL 5 BASIC29.35■■■□□ 2.29
TPM2P07951 AC068152.1-207ENST00000573341 647 ntTSL 2 BASIC29.34■■■□□ 2.29
TPM2P07951 ETS1-201ENST00000319397 2231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.34■■■□□ 2.29
TPM2P07951 DEDD-212ENST00000545495 2329 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC29.34■■■□□ 2.29
TPM2P07951 THAP11-201ENST00000303596 2114 ntAPPRIS P1 BASIC29.33■■■□□ 2.29
TPM2P07951 LINC01578-204ENST00000554894 556 ntTSL 3 BASIC29.33■■■□□ 2.29
TPM2P07951 LINC01578-207ENST00000556895 802 ntTSL 2 BASIC29.33■■■□□ 2.29
TPM2P07951 SHOX2-204ENST00000483851 1866 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC29.33■■■□□ 2.29
TPM2P07951 ARTN-203ENST00000414809 1943 ntAPPRIS P4 TSL 3 BASIC29.33■■■□□ 2.29
TPM2P07951 DDX42-201ENST00000359353 2783 ntTSL 5 BASIC29.32■■■□□ 2.28
TPM2P07951 HES7-202ENST00000541682 1674 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC29.32■■■□□ 2.28
TPM2P07951 TSPAN11-203ENST00000545802 1649 ntTSL 1 (best) BASIC29.32■■■□□ 2.28
TPM2P07951 ST7-AS1-201ENST00000456775 1889 ntBASIC29.31■■■□□ 2.28
TPM2P07951 RAB26-201ENST00000210187 1675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.31■■■□□ 2.28
TPM2P07951 ARL8A-201ENST00000272217 1793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.31■■■□□ 2.28
TPM2P07951 DPY19L1-209ENST00000638088 5075 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC29.3■■■□□ 2.28
TPM2P07951 KCNQ5-204ENST00000370392 1469 ntTSL 1 (best) BASIC29.3■■■□□ 2.28
TPM2P07951 PHF23-205ENST00000571362 1768 ntTSL 2 BASIC29.3■■■□□ 2.28
TPM2P07951 ARMC10-208ENST00000441711 2524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.3■■■□□ 2.28
TPM2P07951 HDAC3-201ENST00000305264 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.3■■■□□ 2.28
TPM2P07951 THRA-204ENST00000546243 1909 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.3■■■□□ 2.28
TPM2P07951 SPTSSA-201ENST00000298130 2777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.29■■■□□ 2.28
TPM2P07951 CCDC88C-205ENST00000553403 1651 ntTSL 1 (best) BASIC29.28■■■□□ 2.28
TPM2P07951 OTUD5-201ENST00000156084 2740 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.28■■■□□ 2.28
TPM2P07951 PKM-203ENST00000389093 2279 ntTSL 5 BASIC29.27■■■□□ 2.28
TPM2P07951 AC025431.1-201ENST00000559684 874 ntTSL 3 BASIC29.27■■■□□ 2.28
TPM2P07951 NRXN1-205ENST00000401710 2873 ntTSL 5 BASIC29.27■■■□□ 2.28
TPM2P07951 NRTN-201ENST00000303212 1109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.26■■■□□ 2.27
TPM2P07951 CDKN2D-202ENST00000393599 1422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.26■■■□□ 2.27
TPM2P07951 ADAP1-201ENST00000265846 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.25■■■□□ 2.27
TPM2P07951 ZNF768-201ENST00000380412 2315 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.25■■■□□ 2.27
TPM2P07951 CARM1-202ENST00000344150 2722 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC29.25■■■□□ 2.27
TPM2P07951 FAAP20-204ENST00000400919 1413 ntTSL 3 BASIC29.23■■■□□ 2.27
TPM2P07951 KCNQ3-202ENST00000519445 2801 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC29.23■■■□□ 2.27
TPM2P07951 AVEN-201ENST00000306730 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.22■■■□□ 2.27
TPM2P07951 D2HGDH-203ENST00000403782 2208 ntTSL 2 BASIC29.22■■■□□ 2.27
TPM2P07951 SCCPDH-201ENST00000366510 2503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.22■■■□□ 2.27
TPM2P07951 TCEA2-204ENST00000395053 1733 ntTSL 1 (best) BASIC29.21■■■□□ 2.27
TPM2P07951 TNIP2-201ENST00000315423 1974 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.21■■■□□ 2.27
TPM2P07951 GAL3ST1-205ENST00000406361 1819 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.2■■■□□ 2.27
TPM2P07951 SLC30A10-202ENST00000366926 1915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.2■■■□□ 2.27
TPM2P07951 TP53I13-201ENST00000301057 1530 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.2■■■□□ 2.26
TPM2P07951 KLF16-203ENST00000592313 508 ntTSL 3 BASIC29.19■■■□□ 2.26
TPM2P07951 RNF150-204ENST00000507500 1530 ntTSL 1 (best) BASIC29.19■■■□□ 2.26
TPM2P07951 SLC52A2-201ENST00000329994 1896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.18■■■□□ 2.26
TPM2P07951 HNRNPAB-204ENST00000504898 1785 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC29.18■■■□□ 2.26
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 19.3 ms