Protein–RNA interactions for Protein: P07384

CAPN1, Calpain-1 catalytic subunit, humanhuman

Predictions only

Length 714 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CAPN1P07384 GUSB-202ENST00000421103 1742 ntTSL 2 BASIC25.74■■□□□ 1.71
CAPN1P07384 FAM89B-201ENST00000316409 1409 ntTSL 1 (best) BASIC25.74■■□□□ 1.71
CAPN1P07384 PGAM5-201ENST00000317555 1182 ntTSL 1 (best) BASIC25.74■■□□□ 1.71
CAPN1P07384 NEUROG2-201ENST00000313341 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.74■■□□□ 1.71
CAPN1P07384 PCYT2-206ENST00000571105 1628 ntTSL 5 BASIC25.74■■□□□ 1.71
CAPN1P07384 DENR-202ENST00000455982 1052 ntTSL 5 BASIC25.73■■□□□ 1.71
CAPN1P07384 SLC9A3R2-202ENST00000432365 1564 ntTSL 1 (best) BASIC25.73■■□□□ 1.71
CAPN1P07384 BHLHE23-201ENST00000370346 1057 ntAPPRIS P1 BASIC25.72■■□□□ 1.71
CAPN1P07384 TPRA1-209ENST00000489960 1903 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.72■■□□□ 1.71
CAPN1P07384 AGFG1-205ENST00000409979 2089 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC25.72■■□□□ 1.71
CAPN1P07384 SHF-206ENST00000560471 2499 ntTSL 5 BASIC25.71■■□□□ 1.71
CAPN1P07384 CGREF1-204ENST00000402550 1575 ntTSL 2 BASIC25.71■■□□□ 1.71
CAPN1P07384 VWA1-201ENST00000338660 2147 ntTSL 2 BASIC25.71■■□□□ 1.71
CAPN1P07384 WDSUB1-205ENST00000409990 1920 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.71■■□□□ 1.71
CAPN1P07384 AC087741.3-201ENST00000624270 1347 ntBASIC25.69■■□□□ 1.7
CAPN1P07384 AC012629.2-201ENST00000606513 377 ntTSL 5 BASIC25.69■■□□□ 1.7
CAPN1P07384 HNRNPAB-202ENST00000358344 1796 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.69■■□□□ 1.7
CAPN1P07384 MXD3-203ENST00000439742 1483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.68■■□□□ 1.7
CAPN1P07384 RCC1L-205ENST00000618035 1409 ntTSL 1 (best) BASIC25.68■■□□□ 1.7
CAPN1P07384 RTN4R-201ENST00000043402 2157 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.68■■□□□ 1.7
CAPN1P07384 AC005559.1-201ENST00000589661 871 ntBASIC25.67■■□□□ 1.7
CAPN1P07384 CERS2-205ENST00000368954 2505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.66■■□□□ 1.7
CAPN1P07384 FOXE3-201ENST00000335071 1981 ntAPPRIS P1 BASIC25.66■■□□□ 1.7
CAPN1P07384 GFRA4-202ENST00000319242 900 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.66■■□□□ 1.7
CAPN1P07384 GKAP1-203ENST00000376371 1778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.66■■□□□ 1.7
CAPN1P07384 SECTM1-201ENST00000269389 2235 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.65■■□□□ 1.7
CAPN1P07384 FOXQ1-201ENST00000296839 2309 ntAPPRIS P1 BASIC25.65■■□□□ 1.7
CAPN1P07384 YAP1-204ENST00000526343 2393 ntTSL 5 BASIC25.65■■□□□ 1.7
CAPN1P07384 PIP4K2B-204ENST00000619039 5734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.65■■□□□ 1.7
CAPN1P07384 GLRB-203ENST00000509282 1757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.64■■□□□ 1.69
CAPN1P07384 SSU72-201ENST00000291386 1290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.63■■□□□ 1.69
CAPN1P07384 AC009097.4-201ENST00000566738 777 ntTSL 2 BASIC25.63■■□□□ 1.69
CAPN1P07384 XKR6-201ENST00000297303 1550 ntTSL 1 (best) BASIC25.63■■□□□ 1.69
CAPN1P07384 EFNA1-202ENST00000368407 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.63■■□□□ 1.69
CAPN1P07384 NPTXR-202ENST00000640136 1503 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.63■■□□□ 1.69
CAPN1P07384 MISP3-201ENST00000269720 1424 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.63■■□□□ 1.69
CAPN1P07384 EFNA3-201ENST00000368408 1782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.62■■□□□ 1.69
CAPN1P07384 HAUS7-201ENST00000370210 1593 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.61■■□□□ 1.69
CAPN1P07384 PDPK1-203ENST00000389224 2416 ntTSL 2 BASIC25.61■■□□□ 1.69
CAPN1P07384 JAG2-201ENST00000331782 5835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.61■■□□□ 1.69
CAPN1P07384 ATPAF1-202ENST00000371937 1827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.6■■□□□ 1.69
CAPN1P07384 ZFAND2B-206ENST00000409336 944 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.59■■□□□ 1.69
CAPN1P07384 AC104109.3-201ENST00000519718 483 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.59■■□□□ 1.69
CAPN1P07384 ZFAND2B-221ENST00000621130 1070 ntTSL 5 BASIC25.59■■□□□ 1.69
CAPN1P07384 PQLC1-203ENST00000397778 2555 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.59■■□□□ 1.69
CAPN1P07384 SHOX2-204ENST00000483851 1866 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.59■■□□□ 1.69
CAPN1P07384 PGM5P2-201ENST00000613141 1980 ntTSL 1 (best) BASIC25.58■■□□□ 1.69
CAPN1P07384 AGPAT2-202ENST00000371696 1512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.58■■□□□ 1.68
CAPN1P07384 NKIRAS2-202ENST00000316082 833 ntTSL 5 BASIC25.57■■□□□ 1.68
CAPN1P07384 NPHP3-202ENST00000383282 782 ntTSL 1 (best) BASIC25.56■■□□□ 1.68
CAPN1P07384 AP000911.1-206ENST00000531938 711 ntTSL 3 BASIC25.56■■□□□ 1.68
CAPN1P07384 VEGFA-231ENST00000640499 1188 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.56■■□□□ 1.68
CAPN1P07384 SP8-201ENST00000361443 1714 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.56■■□□□ 1.68
CAPN1P07384 RUNDC3A-206ENST00000590941 1675 ntTSL 1 (best) BASIC25.55■■□□□ 1.68
CAPN1P07384 FAM78B-202ENST00000354422 1475 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.55■■□□□ 1.68
CAPN1P07384 SMIM12-205ENST00000456842 918 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.55■■□□□ 1.68
CAPN1P07384 SIGMAR1-203ENST00000378892 1743 ntTSL 2 BASIC25.54■■□□□ 1.68
CAPN1P07384 LANCL3-203ENST00000614025 1469 ntTSL 2 BASIC25.54■■□□□ 1.68
CAPN1P07384 FZD2-201ENST00000315323 2112 ntAPPRIS P1 BASIC25.54■■□□□ 1.68
CAPN1P07384 NOP53-201ENST00000246802 1528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.54■■□□□ 1.68
CAPN1P07384 CARS2-201ENST00000257347 1879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.54■■□□□ 1.68
CAPN1P07384 ARHGAP22-202ENST00000374170 2107 ntTSL 5 BASIC25.54■■□□□ 1.68
CAPN1P07384 AC044849.2-201ENST00000606596 710 ntBASIC25.53■■□□□ 1.68
CAPN1P07384 GSTP1-202ENST00000398606 965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.52■■□□□ 1.68
CAPN1P07384 PAPD7-201ENST00000230859 5459 ntTSL 1 (best) BASIC25.51■■□□□ 1.67
CAPN1P07384 FGF18-201ENST00000274625 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.51■■□□□ 1.67
CAPN1P07384 GAL3ST1-204ENST00000402369 1712 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.49■■□□□ 1.67
CAPN1P07384 PELI3-203ENST00000524466 1671 ntTSL 1 (best) BASIC25.49■■□□□ 1.67
CAPN1P07384 TSEN34-203ENST00000396388 1349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.49■■□□□ 1.67
CAPN1P07384 MPST-206ENST00000429360 1331 ntTSL 1 (best) BASIC25.49■■□□□ 1.67
CAPN1P07384 UBE2L6-201ENST00000287156 1354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.47■■□□□ 1.67
CAPN1P07384 COPRS-202ENST00000378634 1041 ntTSL 2 BASIC25.47■■□□□ 1.67
CAPN1P07384 FEV-201ENST00000295727 1879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.47■■□□□ 1.67
CAPN1P07384 IRX1-201ENST00000302006 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.47■■□□□ 1.67
CAPN1P07384 NOG-201ENST00000332822 1892 ntAPPRIS P1 BASIC25.47■■□□□ 1.67
CAPN1P07384 SLC30A10-202ENST00000366926 1915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.46■■□□□ 1.67
CAPN1P07384 ATRAID-201ENST00000380171 1240 ntTSL 1 (best) BASIC25.46■■□□□ 1.67
CAPN1P07384 NMB-202ENST00000394588 1017 ntTSL 1 (best) BASIC25.46■■□□□ 1.67
CAPN1P07384 ABHD17AP4-201ENST00000411545 909 ntBASIC25.45■■□□□ 1.66
CAPN1P07384 NAA50-207ENST00000493900 962 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC25.45■■□□□ 1.66
CAPN1P07384 ITGA9-203ENST00000422441 2282 ntTSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.66
CAPN1P07384 HSPB11-201ENST00000194214 915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
CAPN1P07384 SRSF9-201ENST00000229390 1201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
CAPN1P07384 HDGF-210ENST00000537739 2073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
CAPN1P07384 PPP3CC-204ENST00000518852 1598 ntTSL 2 BASIC25.44■■□□□ 1.66
CAPN1P07384 HSD11B1L-209ENST00000577917 1553 ntTSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
CAPN1P07384 DUSP14-206ENST00000617516 1537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.43■■□□□ 1.66
CAPN1P07384 RDX-210ENST00000530301 1549 ntTSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
CAPN1P07384 AC010864.1-201ENST00000609407 1511 ntBASIC25.42■■□□□ 1.66
CAPN1P07384 HOXB3-212ENST00000498678 2196 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.42■■□□□ 1.66
CAPN1P07384 CRIP1-201ENST00000330233 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
CAPN1P07384 DPF1-202ENST00000412732 2303 ntTSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
CAPN1P07384 MLEC-202ENST00000412616 841 ntTSL 3 BASIC25.41■■□□□ 1.66
CAPN1P07384 COL13A1-214ENST00000522165 2061 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.41■■□□□ 1.66
CAPN1P07384 BCL7C-201ENST00000215115 1740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
CAPN1P07384 CDKN2A-201ENST00000304494 1218 ntTSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
CAPN1P07384 SPATA5L1-208ENST00000638607 1863 ntTSL 2 BASIC25.39■■□□□ 1.66
CAPN1P07384 TCEA2-202ENST00000343484 1235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.66
CAPN1P07384 AL139393.2-201ENST00000608721 2025 ntBASIC25.39■■□□□ 1.65
CAPN1P07384 PIK3R2-208ENST00000617642 1446 ntTSL 5 BASIC25.38■■□□□ 1.65
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 51.7 ms