Protein–RNA interactions for Protein: P06454

PTMA, Prothymosin alpha, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 111 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PTMAP06454 MSX1-201ENST00000382723 1939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.53■■■□□ 2.32
PTMAP06454 MRAP2-201ENST00000257776 2153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.53■■■□□ 2.32
PTMAP06454 MTCH1-202ENST00000373627 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.53■■■□□ 2.32
PTMAP06454 CNIH2-203ENST00000528852 1524 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC29.53■■■□□ 2.32
PTMAP06454 RNF130-201ENST00000261947 1766 ntTSL 1 (best) BASIC29.52■■■□□ 2.32
PTMAP06454 FAM220A-206ENST00000616824 2211 ntTSL 1 (best) BASIC29.51■■■□□ 2.31
PTMAP06454 TARBP1-201ENST00000040877 5130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.51■■■□□ 2.31
PTMAP06454 PLEKHF1-201ENST00000436066 2084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.49■■■□□ 2.31
PTMAP06454 PPP1R26-201ENST00000356818 4932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.49■■■□□ 2.31
PTMAP06454 RUNDC3A-201ENST00000225441 1821 ntTSL 1 (best) BASIC29.48■■■□□ 2.31
PTMAP06454 HNRNPAB-202ENST00000358344 1796 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC29.47■■■□□ 2.31
PTMAP06454 CCKBR-201ENST00000334619 2121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.47■■■□□ 2.31
PTMAP06454 LRRC61-202ENST00000359623 1877 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.47■■■□□ 2.31
PTMAP06454 SHF-207ENST00000560540 2062 ntTSL 5 BASIC29.47■■■□□ 2.31
PTMAP06454 AC113189.4-201ENST00000575331 5553 ntTSL 1 (best) BASIC29.47■■■□□ 2.31
PTMAP06454 DEAF1-201ENST00000382409 2500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.46■■■□□ 2.31
PTMAP06454 NFYB-205ENST00000551727 1727 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC29.46■■■□□ 2.31
PTMAP06454 AC008738.5-201ENST00000587312 482 ntTSL 3 BASIC29.46■■■□□ 2.31
PTMAP06454 TLE6-201ENST00000246112 2100 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.45■■■□□ 2.3
PTMAP06454 THRA-204ENST00000546243 1909 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.44■■■□□ 2.3
PTMAP06454 CPNE1-202ENST00000352393 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.43■■■□□ 2.3
PTMAP06454 FGF18-201ENST00000274625 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.43■■■□□ 2.3
PTMAP06454 AL135925.1-201ENST00000605920 1701 ntBASIC29.42■■■□□ 2.3
PTMAP06454 GIPC1-201ENST00000345425 1782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.42■■■□□ 2.3
PTMAP06454 RAB40C-204ENST00000538492 2569 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.42■■■□□ 2.3
PTMAP06454 CCM2L-201ENST00000262659 2523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.41■■■□□ 2.3
PTMAP06454 KCNC3-201ENST00000376959 5447 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC29.41■■■□□ 2.3
PTMAP06454 RTN2-202ENST00000344680 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.41■■■□□ 2.3
PTMAP06454 TNIP2-201ENST00000315423 1974 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.41■■■□□ 2.3
PTMAP06454 REXO4-202ENST00000371942 2360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.4■■■□□ 2.3
PTMAP06454 FAM107B-205ENST00000378467 2374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.4■■■□□ 2.3
PTMAP06454 DRD5P2-201ENST00000421395 2012 ntBASIC29.38■■■□□ 2.29
PTMAP06454 SKOR2-203ENST00000620245 3048 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC29.38■■■□□ 2.29
PTMAP06454 HNRNPAB-207ENST00000514633 1571 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC29.38■■■□□ 2.29
PTMAP06454 SPTSSA-201ENST00000298130 2777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.37■■■□□ 2.29
PTMAP06454 ZNF768-201ENST00000380412 2315 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.37■■■□□ 2.29
PTMAP06454 C11orf95-202ENST00000433688 5716 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.36■■■□□ 2.29
PTMAP06454 IHH-201ENST00000295731 2023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.35■■■□□ 2.29
PTMAP06454 MVK-208ENST00000539696 608 ntTSL 5 BASIC29.34■■■□□ 2.29
PTMAP06454 TOP2B-204ENST00000435706 5389 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.34■■■□□ 2.29
PTMAP06454 SERPING1-205ENST00000403558 2231 ntTSL 5 BASIC29.33■■■□□ 2.29
PTMAP06454 HYAL2-202ENST00000395139 2136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.32■■■□□ 2.28
PTMAP06454 TMEM55B-201ENST00000250489 1961 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.32■■■□□ 2.28
PTMAP06454 HES7-202ENST00000541682 1674 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC29.31■■■□□ 2.28
PTMAP06454 TMEM187-201ENST00000369982 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.3■■■□□ 2.28
PTMAP06454 PHF23-205ENST00000571362 1768 ntTSL 2 BASIC29.3■■■□□ 2.28
PTMAP06454 CAMKK1-201ENST00000158166 2459 ntTSL 1 (best) BASIC29.29■■■□□ 2.28
PTMAP06454 PLBD2-202ENST00000545182 2321 ntTSL 2 BASIC29.29■■■□□ 2.28
PTMAP06454 OTUD5-202ENST00000376488 2692 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC29.29■■■□□ 2.28
PTMAP06454 FRAT2-201ENST00000371019 2213 ntAPPRIS P1 BASIC29.29■■■□□ 2.28
PTMAP06454 COMMD7-201ENST00000278980 1900 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.28■■■□□ 2.28
PTMAP06454 SLCO3A1-201ENST00000318445 5115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.27■■■□□ 2.28
PTMAP06454 CAPNS1-204ENST00000587718 1558 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.27■■■□□ 2.28
PTMAP06454 AL139393.2-201ENST00000608721 2025 ntBASIC29.27■■■□□ 2.28
PTMAP06454 VIPR2-203ENST00000402066 1926 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC29.27■■■□□ 2.28
PTMAP06454 AGTRAP-204ENST00000376637 1067 ntTSL 2 BASIC29.26■■■□□ 2.27
PTMAP06454 ATPAF1-202ENST00000371937 1827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.25■■■□□ 2.27
PTMAP06454 GRK2-204ENST00000526285 1458 ntTSL 5 BASIC29.24■■■□□ 2.27
PTMAP06454 CHCHD4-201ENST00000295767 1603 ntTSL 2 BASIC29.24■■■□□ 2.27
PTMAP06454 CYB5R3-201ENST00000352397 2124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.23■■■□□ 2.27
PTMAP06454 FBXO2-201ENST00000354287 1560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.23■■■□□ 2.27
PTMAP06454 CSNK1E-203ENST00000396832 2791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.23■■■□□ 2.27
PTMAP06454 FADD-201ENST00000301838 1841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.23■■■□□ 2.27
PTMAP06454 ARTN-203ENST00000414809 1943 ntAPPRIS P4 TSL 3 BASIC29.23■■■□□ 2.27
PTMAP06454 HOXB3-212ENST00000498678 2196 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.21■■■□□ 2.27
PTMAP06454 CLK2-201ENST00000355560 2120 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC29.21■■■□□ 2.27
PTMAP06454 TAZ-205ENST00000475699 1862 ntTSL 1 (best) BASIC29.21■■■□□ 2.27
PTMAP06454 CACNG7-203ENST00000391767 2688 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.2■■■□□ 2.27
PTMAP06454 NXPH3-201ENST00000328741 2179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.2■■■□□ 2.26
PTMAP06454 AJAP1-201ENST00000378190 2383 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.2■■■□□ 2.26
PTMAP06454 TCEA2-204ENST00000395053 1733 ntTSL 1 (best) BASIC29.2■■■□□ 2.26
PTMAP06454 DDX42-201ENST00000359353 2783 ntTSL 5 BASIC29.19■■■□□ 2.26
PTMAP06454 RHEB-201ENST00000262187 2075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.19■■■□□ 2.26
PTMAP06454 TNFSF12-201ENST00000293825 1553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.18■■■□□ 2.26
PTMAP06454 HNRNPAB-206ENST00000506339 1747 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC29.18■■■□□ 2.26
PTMAP06454 SLC16A3-214ENST00000582743 2002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.18■■■□□ 2.26
PTMAP06454 KIAA2013-201ENST00000376572 2815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.17■■■□□ 2.26
PTMAP06454 DEDD-212ENST00000545495 2329 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC29.17■■■□□ 2.26
PTMAP06454 AEBP2-204ENST00000398864 5099 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC29.16■■■□□ 2.26
PTMAP06454 MSANTD3-203ENST00000395067 1362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.16■■■□□ 2.26
PTMAP06454 DNAJC21-201ENST00000342382 2309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.16■■■□□ 2.26
PTMAP06454 DBP-205ENST00000601104 1489 ntTSL 1 (best) BASIC29.16■■■□□ 2.26
PTMAP06454 SYNGR1-202ENST00000318801 1361 ntTSL 1 (best) BASIC29.15■■■□□ 2.26
PTMAP06454 TBL1X-201ENST00000217964 5871 ntTSL 1 (best) BASIC29.15■■■□□ 2.26
PTMAP06454 ZFAND2B-208ENST00000409594 2021 ntTSL 2 BASIC29.15■■■□□ 2.26
PTMAP06454 HAUS7-201ENST00000370210 1593 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC29.14■■■□□ 2.26
PTMAP06454 SDCCAG3-201ENST00000298537 2314 ntTSL 1 (best) BASIC29.14■■■□□ 2.26
PTMAP06454 ANO1-202ENST00000355303 4790 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.14■■■□□ 2.26
PTMAP06454 GTF2IP1-204ENST00000616377 2632 ntTSL 2 BASIC29.14■■■□□ 2.26
PTMAP06454 KANSL1L-207ENST00000452086 2334 ntTSL 1 (best) BASIC29.14■■■□□ 2.25
PTMAP06454 EVC-203ENST00000509451 1960 ntTSL 1 (best) BASIC29.13■■■□□ 2.25
PTMAP06454 DVL3-201ENST00000313143 5254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.13■■■□□ 2.25
PTMAP06454 AC006077.2-201ENST00000623591 457 ntBASIC29.13■■■□□ 2.25
PTMAP06454 RDX-210ENST00000530301 1549 ntTSL 1 (best) BASIC29.12■■■□□ 2.25
PTMAP06454 ATF4-201ENST00000337304 2019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.11■■■□□ 2.25
PTMAP06454 CACNG6-201ENST00000252729 1853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.11■■■□□ 2.25
PTMAP06454 ZDHHC23-206ENST00000498275 2055 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC29.1■■■□□ 2.25
PTMAP06454 HOMER1-202ENST00000334082 5881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.1■■■□□ 2.25
PTMAP06454 CAPN10-208ENST00000404753 2570 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC29.1■■■□□ 2.25
PTMAP06454 RASSF5-204ENST00000580449 1932 ntTSL 1 (best) BASIC29.1■■■□□ 2.25
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 11.7 ms