Protein–RNA interactions for Protein: P05976

MYL1, Myosin light chain 1/3, skeletal muscle isoform, humanhuman

Predictions only

Length 194 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
MYL1P05976 SECTM1-201ENST00000269389 2235 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.36■■■□□ 2.29
MYL1P05976 AC139426.1-201ENST00000568218 2529 ntBASIC29.35■■■□□ 2.29
MYL1P05976 FTCDNL1-201ENST00000416668 944 ntTSL 1 (best) BASIC29.34■■■□□ 2.29
MYL1P05976 GSC2-201ENST00000086933 1033 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.34■■■□□ 2.29
MYL1P05976 ECI1-207ENST00000570258 1512 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC29.34■■■□□ 2.29
MYL1P05976 HSD11B1L-209ENST00000577917 1553 ntTSL 1 (best) BASIC29.34■■■□□ 2.29
MYL1P05976 SIGMAR1-203ENST00000378892 1743 ntTSL 2 BASIC29.34■■■□□ 2.29
MYL1P05976 EXOC3L4-201ENST00000380069 2293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.33■■■□□ 2.29
MYL1P05976 MKNK2-202ENST00000309340 1744 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.33■■■□□ 2.29
MYL1P05976 YAP1-204ENST00000526343 2393 ntTSL 5 BASIC29.33■■■□□ 2.29
MYL1P05976 ST6GALNAC6-203ENST00000373142 2448 ntTSL 1 (best) BASIC29.31■■■□□ 2.28
MYL1P05976 RRAGC-201ENST00000373001 2732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.31■■■□□ 2.28
MYL1P05976 ZNF787-203ENST00000610935 1925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.31■■■□□ 2.28
MYL1P05976 PLEKHG6-206ENST00000536531 1683 ntTSL 1 (best) BASIC29.31■■■□□ 2.28
MYL1P05976 DUSP14-206ENST00000617516 1537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.3■■■□□ 2.28
MYL1P05976 FSD1L-208ENST00000495708 1906 ntTSL 1 (best) BASIC29.29■■■□□ 2.28
MYL1P05976 SLC30A10-202ENST00000366926 1915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.28■■■□□ 2.28
MYL1P05976 HOXB3-212ENST00000498678 2196 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.28■■■□□ 2.28
MYL1P05976 STUB1-205ENST00000565677 1560 ntTSL 1 (best) BASIC29.28■■■□□ 2.28
MYL1P05976 UBALD2-203ENST00000589240 660 ntTSL 2 BASIC29.28■■■□□ 2.28
MYL1P05976 TPGS1-201ENST00000359315 1114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.27■■■□□ 2.28
MYL1P05976 PSMG4-205ENST00000419065 629 ntTSL 2 BASIC29.27■■■□□ 2.28
MYL1P05976 MYLIP-202ENST00000356840 1666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.25■■■□□ 2.27
MYL1P05976 HNRNPAB-205ENST00000506259 1674 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.25■■■□□ 2.27
MYL1P05976 ATF4-201ENST00000337304 2019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.24■■■□□ 2.27
MYL1P05976 ARTN-204ENST00000438616 889 ntTSL 1 (best) BASIC29.24■■■□□ 2.27
MYL1P05976 LY6K-203ENST00000519387 963 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC29.24■■■□□ 2.27
MYL1P05976 AL139393.2-201ENST00000608721 2025 ntBASIC29.23■■■□□ 2.27
MYL1P05976 CERS2-205ENST00000368954 2505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.23■■■□□ 2.27
MYL1P05976 BATF3-201ENST00000243440 980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.22■■■□□ 2.27
MYL1P05976 AC092755.2-201ENST00000560199 402 ntTSL 3 BASIC29.22■■■□□ 2.27
MYL1P05976 SHF-206ENST00000560471 2499 ntTSL 5 BASIC29.21■■■□□ 2.27
MYL1P05976 ABHD17A-202ENST00000292577 1757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.21■■■□□ 2.27
MYL1P05976 RUNX2-205ENST00000465038 1770 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC29.21■■■□□ 2.27
MYL1P05976 MARCH2-202ENST00000381035 1192 ntTSL 5 BASIC29.21■■■□□ 2.27
MYL1P05976 ARHGAP22-202ENST00000374170 2107 ntTSL 5 BASIC29.21■■■□□ 2.27
MYL1P05976 SEC61G-204ENST00000450622 512 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.2■■■□□ 2.26
MYL1P05976 AC012615.2-201ENST00000586259 447 ntTSL 4 BASIC29.19■■■□□ 2.26
MYL1P05976 COL13A1-214ENST00000522165 2061 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC29.19■■■□□ 2.26
MYL1P05976 MTCH1-202ENST00000373627 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.18■■■□□ 2.26
MYL1P05976 CIB1-201ENST00000328649 1247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.18■■■□□ 2.26
MYL1P05976 CIB1-202ENST00000612800 1096 ntTSL 1 (best) BASIC29.18■■■□□ 2.26
MYL1P05976 NMB-202ENST00000394588 1017 ntTSL 1 (best) BASIC29.17■■■□□ 2.26
MYL1P05976 AMZ2-201ENST00000359783 1722 ntTSL 5 BASIC29.15■■■□□ 2.26
MYL1P05976 MZT2B-202ENST00000409255 769 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC29.15■■■□□ 2.26
MYL1P05976 SPATA5L1-208ENST00000638607 1863 ntTSL 2 BASIC29.14■■■□□ 2.26
MYL1P05976 TESK1-201ENST00000336395 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.14■■■□□ 2.26
MYL1P05976 IL17D-201ENST00000304920 1861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.14■■■□□ 2.26
MYL1P05976 GRK6-206ENST00000507633 1660 ntTSL 5 BASIC29.13■■■□□ 2.25
MYL1P05976 NOXA1-201ENST00000341349 1678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.12■■■□□ 2.25
MYL1P05976 HDGF-210ENST00000537739 2073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.12■■■□□ 2.25
MYL1P05976 FZD2-201ENST00000315323 2112 ntAPPRIS P1 BASIC29.12■■■□□ 2.25
MYL1P05976 MISP3-201ENST00000269720 1424 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC29.11■■■□□ 2.25
MYL1P05976 MARCH11-201ENST00000332432 1741 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.11■■■□□ 2.25
MYL1P05976 DPF1-202ENST00000412732 2303 ntTSL 1 (best) BASIC29.11■■■□□ 2.25
MYL1P05976 HNRNPAB-204ENST00000504898 1785 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC29.11■■■□□ 2.25
MYL1P05976 ENKD1-201ENST00000243878 1579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.11■■■□□ 2.25
MYL1P05976 SHARPIN-202ENST00000398712 1765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.11■■■□□ 2.25
MYL1P05976 LANCL3-203ENST00000614025 1469 ntTSL 2 BASIC29.1■■■□□ 2.25
MYL1P05976 MIR762-201ENST00000390236 83 ntBASIC29.1■■■□□ 2.25
MYL1P05976 AL133346.1-201ENST00000435287 495 ntTSL 2 BASIC29.1■■■□□ 2.25
MYL1P05976 ATP6V1E2-204ENST00000522587 1559 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC29.09■■■□□ 2.25
MYL1P05976 AC012629.2-201ENST00000606513 377 ntTSL 5 BASIC29.09■■■□□ 2.25
MYL1P05976 CHML-205ENST00000638160 705 ntTSL 3 BASIC29.09■■■□□ 2.25
MYL1P05976 VEGFA-231ENST00000640499 1188 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.09■■■□□ 2.25
MYL1P05976 PDPK1-203ENST00000389224 2416 ntTSL 2 BASIC29.09■■■□□ 2.25
MYL1P05976 TNFSF12-201ENST00000293825 1553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.08■■■□□ 2.25
MYL1P05976 CHPT1-201ENST00000229266 1585 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.07■■■□□ 2.24
MYL1P05976 MNX1-207ENST00000543409 1620 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.07■■■□□ 2.24
MYL1P05976 LMO1-202ENST00000428101 1038 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC29.06■■■□□ 2.24
MYL1P05976 HOPX-206ENST00000503639 1248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.06■■■□□ 2.24
MYL1P05976 SCX-201ENST00000567180 999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.06■■■□□ 2.24
MYL1P05976 SUZ12P1-203ENST00000578195 985 ntBASIC29.06■■■□□ 2.24
MYL1P05976 ITGA9-203ENST00000422441 2282 ntTSL 1 (best) BASIC29.06■■■□□ 2.24
MYL1P05976 PLSCR3-209ENST00000574401 2032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.04■■■□□ 2.24
MYL1P05976 ADAP1-201ENST00000265846 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.04■■■□□ 2.24
MYL1P05976 AP004833.2-201ENST00000532228 1454 ntBASIC29.04■■■□□ 2.24
MYL1P05976 TMEM9-201ENST00000367330 1959 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.03■■■□□ 2.24
MYL1P05976 THAP11-201ENST00000303596 2114 ntAPPRIS P1 BASIC29.02■■■□□ 2.24
MYL1P05976 AP000547.3-202ENST00000592107 1019 ntTSL 1 (best) BASIC29.01■■■□□ 2.23
MYL1P05976 MISP3-202ENST00000587086 1535 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29■■■□□ 2.23
MYL1P05976 GFRA4-202ENST00000319242 900 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC29■■■□□ 2.23
MYL1P05976 PQLC1-203ENST00000397778 2555 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29■■■□□ 2.23
MYL1P05976 EBAG9-202ENST00000395785 1467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.99■■■□□ 2.23
MYL1P05976 CAPNS1-201ENST00000246533 1918 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.99■■■□□ 2.23
MYL1P05976 TNFRSF25-204ENST00000356876 1625 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.98■■■□□ 2.23
MYL1P05976 ZFAND2B-208ENST00000409594 2021 ntTSL 2 BASIC28.98■■■□□ 2.23
MYL1P05976 TOMM40-201ENST00000252487 1707 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.98■■■□□ 2.23
MYL1P05976 TOMM40-202ENST00000405636 1709 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.98■■■□□ 2.23
MYL1P05976 HNRNPLP2-201ENST00000568980 1570 ntBASIC28.98■■■□□ 2.23
MYL1P05976 COL13A1-213ENST00000520267 2276 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.98■■■□□ 2.23
MYL1P05976 PDCD2-215ENST00000614056 1287 ntTSL 2 BASIC28.98■■■□□ 2.23
MYL1P05976 H2AFV-205ENST00000381124 628 ntTSL 3 BASIC28.97■■■□□ 2.23
MYL1P05976 AC142086.6-201ENST00000621154 1765 ntBASIC28.96■■■□□ 2.23
MYL1P05976 AP003068.2-202ENST00000526623 1662 ntTSL 2 BASIC28.96■■■□□ 2.23
MYL1P05976 RPS2-209ENST00000529806 993 ntTSL 3 BASIC28.95■■■□□ 2.22
MYL1P05976 PPP1CC-208ENST00000551676 1581 ntTSL 2 BASIC28.95■■■□□ 2.22
MYL1P05976 AC127502.1-201ENST00000399971 1502 ntBASIC28.94■■■□□ 2.22
MYL1P05976 ACTR3B-201ENST00000256001 2216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.93■■■□□ 2.22
MYL1P05976 AC005559.1-201ENST00000589661 871 ntBASIC28.93■■■□□ 2.22
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 186.6 ms