Protein–RNA interactions for Protein: P04180

LCAT, Phosphatidylcholine-sterol acyltransferase, humanhuman

Predictions only

Length 440 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LCATP04180 ACTG1-210ENST00000575842 2256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
LCATP04180 YAP1-204ENST00000526343 2393 ntTSL 5 BASIC22.88■■□□□ 1.25
LCATP04180 SNX24-201ENST00000261369 2158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
LCATP04180 PELI3-203ENST00000524466 1671 ntTSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
LCATP04180 NEUROG2-201ENST00000313341 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
LCATP04180 GSC2-201ENST00000086933 1033 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.86■■□□□ 1.25
LCATP04180 SHOX2-204ENST00000483851 1866 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.85■■□□□ 1.25
LCATP04180 FOXE3-201ENST00000335071 1981 ntAPPRIS P1 BASIC22.85■■□□□ 1.25
LCATP04180 MAPK13-201ENST00000211287 2052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
LCATP04180 AC012615.2-201ENST00000586259 447 ntTSL 4 BASIC22.85■■□□□ 1.25
LCATP04180 AC010864.1-201ENST00000609407 1511 ntBASIC22.85■■□□□ 1.25
LCATP04180 PPP3CC-204ENST00000518852 1598 ntTSL 2 BASIC22.84■■□□□ 1.25
LCATP04180 GGA1-204ENST00000381756 2107 ntTSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
LCATP04180 LMO1-202ENST00000428101 1038 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
LCATP04180 AC139426.1-201ENST00000568218 2529 ntBASIC22.84■■□□□ 1.25
LCATP04180 CIB1-201ENST00000328649 1247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
LCATP04180 AL139393.1-201ENST00000417479 573 ntTSL 5 BASIC22.83■■□□□ 1.25
LCATP04180 SUZ12P1-203ENST00000578195 985 ntBASIC22.83■■□□□ 1.25
LCATP04180 CIB1-202ENST00000612800 1096 ntTSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
LCATP04180 FOXQ1-201ENST00000296839 2309 ntAPPRIS P1 BASIC22.81■■□□□ 1.24
LCATP04180 MIR762-201ENST00000390236 83 ntBASIC22.81■■□□□ 1.24
LCATP04180 AGFG1-205ENST00000409979 2089 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.81■■□□□ 1.24
LCATP04180 AC012629.2-201ENST00000606513 377 ntTSL 5 BASIC22.8■■□□□ 1.24
LCATP04180 MYLIP-202ENST00000356840 1666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
LCATP04180 NMB-202ENST00000394588 1017 ntTSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
LCATP04180 CHML-205ENST00000638160 705 ntTSL 3 BASIC22.78■■□□□ 1.24
LCATP04180 PLEKHG6-206ENST00000536531 1683 ntTSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
LCATP04180 STUB1-205ENST00000565677 1560 ntTSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
LCATP04180 EFNA3-201ENST00000368408 1782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
LCATP04180 H2AFV-205ENST00000381124 628 ntTSL 3 BASIC22.77■■□□□ 1.24
LCATP04180 RUNDC3A-206ENST00000590941 1675 ntTSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
LCATP04180 RDX-210ENST00000530301 1549 ntTSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
LCATP04180 ST6GALNAC6-203ENST00000373142 2448 ntTSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
LCATP04180 TESK1-206ENST00000620767 2438 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.77■■□□□ 1.24
LCATP04180 BIN1-204ENST00000348750 2074 ntTSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.23
LCATP04180 WDSUB1-205ENST00000409990 1920 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.76■■□□□ 1.23
LCATP04180 FSD1L-208ENST00000495708 1906 ntTSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
LCATP04180 PGM5P2-201ENST00000613141 1980 ntTSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
LCATP04180 MISP3-201ENST00000269720 1424 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.76■■□□□ 1.23
LCATP04180 TPRA1-209ENST00000489960 1903 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.75■■□□□ 1.23
LCATP04180 LANCL3-203ENST00000614025 1469 ntTSL 2 BASIC22.75■■□□□ 1.23
LCATP04180 FBXO45-201ENST00000311630 5899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
LCATP04180 HOPX-206ENST00000503639 1248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
LCATP04180 IRX1-201ENST00000302006 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
LCATP04180 MNX1-207ENST00000543409 1620 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
LCATP04180 ACOT7-201ENST00000361521 2429 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
LCATP04180 VWA1-201ENST00000338660 2147 ntTSL 2 BASIC22.73■■□□□ 1.23
LCATP04180 ECI1-207ENST00000570258 1512 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.73■■□□□ 1.23
LCATP04180 HNRNPLP2-201ENST00000568980 1570 ntBASIC22.73■■□□□ 1.23
LCATP04180 BATF3-201ENST00000243440 980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
LCATP04180 SP8-201ENST00000361443 1714 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
LCATP04180 RTN4R-201ENST00000043402 2157 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
LCATP04180 MAGI2-215ENST00000628980 6212 ntTSL 5 BASIC22.72■■□□□ 1.23
LCATP04180 NOXA1-201ENST00000341349 1678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
LCATP04180 MKNK2-202ENST00000309340 1744 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
LCATP04180 SIGMAR1-203ENST00000378892 1743 ntTSL 2 BASIC22.72■■□□□ 1.23
LCATP04180 GFRA4-202ENST00000319242 900 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
LCATP04180 S100A10-202ENST00000368811 1202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
LCATP04180 LYNX1-208ENST00000615007 1293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
LCATP04180 VEGFA-231ENST00000640499 1188 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
LCATP04180 TPRA1-202ENST00000355552 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
LCATP04180 FGF18-201ENST00000274625 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
LCATP04180 GNPTAB-201ENST00000299314 5701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
LCATP04180 BCL7C-201ENST00000215115 1740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
LCATP04180 EXOC3L4-201ENST00000380069 2293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
LCATP04180 CERS2-205ENST00000368954 2505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
LCATP04180 RPS2-209ENST00000529806 993 ntTSL 3 BASIC22.7■■□□□ 1.22
LCATP04180 AC005559.1-201ENST00000589661 871 ntBASIC22.7■■□□□ 1.22
LCATP04180 TPI1-201ENST00000229270 1763 ntTSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
LCATP04180 ABHD17A-202ENST00000292577 1757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
LCATP04180 SECTM1-201ENST00000269389 2235 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
LCATP04180 HNRNPAB-205ENST00000506259 1674 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
LCATP04180 ATP6V1E2-204ENST00000522587 1559 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.69■■□□□ 1.22
LCATP04180 SCX-201ENST00000567180 999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
LCATP04180 DPY19L1-209ENST00000638088 5075 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.69■■□□□ 1.22
LCATP04180 ZNF787-203ENST00000610935 1925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
LCATP04180 HOXB3-212ENST00000498678 2196 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.68■■□□□ 1.22
LCATP04180 ECI1-203ENST00000562238 948 ntTSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
LCATP04180 PDPK1-203ENST00000389224 2416 ntTSL 2 BASIC22.67■■□□□ 1.22
LCATP04180 CGGBP1-206ENST00000482016 1147 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.67■■□□□ 1.22
LCATP04180 CHPT1-201ENST00000229266 1585 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
LCATP04180 PXDC1-202ENST00000380283 2190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
LCATP04180 ATF4-201ENST00000337304 2019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
LCATP04180 SHF-206ENST00000560471 2499 ntTSL 5 BASIC22.65■■□□□ 1.22
LCATP04180 AP000547.3-202ENST00000592107 1019 ntTSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
LCATP04180 RUNX2-205ENST00000465038 1770 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC22.65■■□□□ 1.22
LCATP04180 NMB-201ENST00000360476 1007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
LCATP04180 SLC30A10-202ENST00000366926 1915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
LCATP04180 AL139393.2-201ENST00000608721 2025 ntBASIC22.63■■□□□ 1.21
LCATP04180 CACNG6-202ENST00000346968 645 ntTSL 5 BASIC22.62■■□□□ 1.21
LCATP04180 HNRNPAB-204ENST00000504898 1785 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
LCATP04180 RCC1L-205ENST00000618035 1409 ntTSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
LCATP04180 MARCH11-201ENST00000332432 1741 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.6■■□□□ 1.21
LCATP04180 AMZ2-201ENST00000359783 1722 ntTSL 5 BASIC22.6■■□□□ 1.21
LCATP04180 ENKD1-201ENST00000243878 1579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
LCATP04180 PGAM5-201ENST00000317555 1182 ntTSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
LCATP04180 GRK6-206ENST00000507633 1660 ntTSL 5 BASIC22.6■■□□□ 1.21
LCATP04180 TOMM40-201ENST00000252487 1707 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
LCATP04180 TOMM40-202ENST00000405636 1709 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
LCATP04180 TSEN34-203ENST00000396388 1349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 49.7 ms