Protein–RNA interactions for Protein: P04000

OPN1LW, Long-wave-sensitive opsin 1, humanhuman

Predictions only

Length 364 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
OPN1LWP04000 GAL3ST1-204ENST00000402369 1712 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.82■■□□□ 1.4
OPN1LWP04000 MAD2L2-205ENST00000376669 864 ntTSL 3 BASIC23.82■■□□□ 1.4
OPN1LWP04000 KCNF1-201ENST00000295082 2289 ntAPPRIS P1 BASIC23.81■■□□□ 1.4
OPN1LWP04000 COL13A1-210ENST00000517713 2007 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.81■■□□□ 1.4
OPN1LWP04000 PLEKHG6-206ENST00000536531 1683 ntTSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
OPN1LWP04000 CHPT1-201ENST00000229266 1585 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
OPN1LWP04000 SRSF9-201ENST00000229390 1201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
OPN1LWP04000 GLTP-201ENST00000318348 2356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
OPN1LWP04000 PI4KAP2-202ENST00000450651 2294 ntTSL 5 BASIC23.8■■□□□ 1.4
OPN1LWP04000 TXNL4A-210ENST00000591711 669 ntTSL 2 BASIC23.79■■□□□ 1.4
OPN1LWP04000 AP000547.3-202ENST00000592107 1019 ntTSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
OPN1LWP04000 RCE1-201ENST00000309657 1485 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
OPN1LWP04000 PELI3-203ENST00000524466 1671 ntTSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
OPN1LWP04000 CARS2-201ENST00000257347 1879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
OPN1LWP04000 AC010864.1-201ENST00000609407 1511 ntBASIC23.78■■□□□ 1.4
OPN1LWP04000 SCX-201ENST00000567180 999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
OPN1LWP04000 PPP3CC-204ENST00000518852 1598 ntTSL 2 BASIC23.76■■□□□ 1.39
OPN1LWP04000 ECI1-207ENST00000570258 1512 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.75■■□□□ 1.39
OPN1LWP04000 AC009097.4-201ENST00000566738 777 ntTSL 2 BASIC23.75■■□□□ 1.39
OPN1LWP04000 AC044849.2-201ENST00000606596 710 ntBASIC23.75■■□□□ 1.39
OPN1LWP04000 PLPPR3-204ENST00000520876 2328 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
OPN1LWP04000 BATF3-201ENST00000243440 980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
OPN1LWP04000 CMC4-202ENST00000369484 1107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
OPN1LWP04000 YAP1-204ENST00000526343 2393 ntTSL 5 BASIC23.74■■□□□ 1.39
OPN1LWP04000 GAL3ST1-205ENST00000406361 1819 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.73■■□□□ 1.39
OPN1LWP04000 MIR6090-201ENST00000622481 60 ntBASIC23.73■■□□□ 1.39
OPN1LWP04000 STUB1-205ENST00000565677 1560 ntTSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
OPN1LWP04000 ST7-AS1-201ENST00000456775 1889 ntBASIC23.73■■□□□ 1.39
OPN1LWP04000 CDKN2A-201ENST00000304494 1218 ntTSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
OPN1LWP04000 VEGFA-207ENST00000413642 1197 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
OPN1LWP04000 KLC2-205ENST00000394078 1557 ntTSL 5 BASIC23.71■■□□□ 1.39
OPN1LWP04000 VAX2-201ENST00000234392 1147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
OPN1LWP04000 RCC1L-202ENST00000614461 2419 ntTSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
OPN1LWP04000 MAF-201ENST00000326043 2646 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
OPN1LWP04000 LRRC10B-201ENST00000378075 2219 ntAPPRIS P1 BASIC23.69■■□□□ 1.38
OPN1LWP04000 ARL8A-201ENST00000272217 1793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
OPN1LWP04000 UBE2S-203ENST00000589978 496 ntTSL 5 BASIC23.68■■□□□ 1.38
OPN1LWP04000 MISP3-202ENST00000587086 1535 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
OPN1LWP04000 HAUS7-201ENST00000370210 1593 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.67■■□□□ 1.38
OPN1LWP04000 HDAC11-206ENST00000405025 576 ntTSL 4 BASIC23.67■■□□□ 1.38
OPN1LWP04000 AC108673.1-201ENST00000510422 1159 ntBASIC23.67■■□□□ 1.38
OPN1LWP04000 DTNBP1-202ENST00000344537 1403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
OPN1LWP04000 SIRT3-201ENST00000382743 2543 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
OPN1LWP04000 BOD1-201ENST00000285908 1286 ntTSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
OPN1LWP04000 BOD1-206ENST00000480951 814 ntTSL 2 BASIC23.66■■□□□ 1.38
OPN1LWP04000 SLC52A2-201ENST00000329994 1896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
OPN1LWP04000 AP002884.3-203ENST00000419895 1711 ntTSL 2 BASIC23.65■■□□□ 1.38
OPN1LWP04000 BHLHE23-201ENST00000370346 1057 ntAPPRIS P1 BASIC23.65■■□□□ 1.38
OPN1LWP04000 FOXA2-202ENST00000419308 2422 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.38
OPN1LWP04000 NPHP3-202ENST00000383282 782 ntTSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.37
OPN1LWP04000 CIB2-204ENST00000557846 934 ntTSL 3 BASIC23.64■■□□□ 1.37
OPN1LWP04000 ATPAF1-202ENST00000371937 1827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
OPN1LWP04000 FSD1L-208ENST00000495708 1906 ntTSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
OPN1LWP04000 POLR1D-201ENST00000302979 1166 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
OPN1LWP04000 PQLC1-202ENST00000357575 2475 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.63■■□□□ 1.37
OPN1LWP04000 AGAP3-216ENST00000479901 1881 ntTSL 5 BASIC23.62■■□□□ 1.37
OPN1LWP04000 ABHD17A-202ENST00000292577 1757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
OPN1LWP04000 HNRNPAB-202ENST00000358344 1796 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
OPN1LWP04000 TSPAN33-201ENST00000486685 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
OPN1LWP04000 HNRNPAB-204ENST00000504898 1785 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
OPN1LWP04000 COPRS-202ENST00000378634 1041 ntTSL 2 BASIC23.61■■□□□ 1.37
OPN1LWP04000 RRAGC-201ENST00000373001 2732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
OPN1LWP04000 TOMM40-201ENST00000252487 1707 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
OPN1LWP04000 TOMM40-202ENST00000405636 1709 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
OPN1LWP04000 JAG2-201ENST00000331782 5835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
OPN1LWP04000 DCBLD1-201ENST00000296955 1979 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
OPN1LWP04000 AMN-201ENST00000299155 1907 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
OPN1LWP04000 ZFAND2B-206ENST00000409336 944 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.59■■□□□ 1.37
OPN1LWP04000 DOCK5-202ENST00000410074 786 ntTSL 2 BASIC23.59■■□□□ 1.37
OPN1LWP04000 ZFAND2B-221ENST00000621130 1070 ntTSL 5 BASIC23.59■■□□□ 1.37
OPN1LWP04000 NEUROG2-201ENST00000313341 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
OPN1LWP04000 CGREF1-203ENST00000402394 1906 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC23.58■■□□□ 1.37
OPN1LWP04000 ACOT7-201ENST00000361521 2429 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.36
OPN1LWP04000 FGFRL1-205ENST00000510644 2304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.36
OPN1LWP04000 PIP4K2B-204ENST00000619039 5734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
OPN1LWP04000 ANKRD13D-211ENST00000511455 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
OPN1LWP04000 NME2-202ENST00000393190 866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
OPN1LWP04000 CCDC88C-205ENST00000553403 1651 ntTSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
OPN1LWP04000 MEX3D-201ENST00000402693 2850 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
OPN1LWP04000 PAPD7-201ENST00000230859 5459 ntTSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
OPN1LWP04000 HNRNPAB-205ENST00000506259 1674 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
OPN1LWP04000 ENKD1-201ENST00000243878 1579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
OPN1LWP04000 RNF130-205ENST00000521389 2263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
OPN1LWP04000 UBE2A-207ENST00000628549 934 ntTSL 2 BASIC23.53■■□□□ 1.36
OPN1LWP04000 CUL4A-202ENST00000375440 2364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
OPN1LWP04000 EBAG9-202ENST00000395785 1467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
OPN1LWP04000 AC139426.1-201ENST00000568218 2529 ntBASIC23.53■■□□□ 1.36
OPN1LWP04000 DUX4L29-201ENST00000425409 679 ntBASIC23.52■■□□□ 1.36
OPN1LWP04000 ZNF706-207ENST00000519882 959 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.52■■□□□ 1.36
OPN1LWP04000 ZNF706-213ENST00000521272 732 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.52■■□□□ 1.36
OPN1LWP04000 AC021231.2-201ENST00000594613 730 ntBASIC23.52■■□□□ 1.36
OPN1LWP04000 AC127502.1-201ENST00000399971 1502 ntBASIC23.51■■□□□ 1.35
OPN1LWP04000 PCSK6-201ENST00000331826 2309 ntTSL 5 BASIC23.51■■□□□ 1.35
OPN1LWP04000 MPST-206ENST00000429360 1331 ntTSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
OPN1LWP04000 SPIRE1-202ENST00000409402 5665 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
OPN1LWP04000 ZNF787-203ENST00000610935 1925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
OPN1LWP04000 EMC10-202ENST00000376918 2014 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
OPN1LWP04000 HSPB11-201ENST00000194214 915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
OPN1LWP04000 PABPC1L2B-AS1-201ENST00000416989 1167 ntTSL 3 BASIC23.49■■□□□ 1.35
OPN1LWP04000 AC004540.2-201ENST00000451368 611 ntTSL 2 BASIC23.49■■□□□ 1.35
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 136.7 ms