Protein–RNA interactions for Protein: P02766

TTR, Transthyretin, humanhuman

Predictions only

Length 147 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TTRP02766 AC010864.1-201ENST00000609407 1511 ntBASIC22.87■■□□□ 1.25
TTRP02766 TMEM9-201ENST00000367330 1959 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
TTRP02766 ZNF787-203ENST00000610935 1925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
TTRP02766 COMMD3-201ENST00000376836 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
TTRP02766 ADAP1-201ENST00000265846 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
TTRP02766 MTCH1-202ENST00000373627 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
TTRP02766 ATF4-201ENST00000337304 2019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
TTRP02766 HOXB3-211ENST00000490677 1109 ntTSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
TTRP02766 THAP11-201ENST00000303596 2114 ntAPPRIS P1 BASIC22.85■■□□□ 1.25
TTRP02766 FSD1L-208ENST00000495708 1906 ntTSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
TTRP02766 ZIC2-201ENST00000376335 2983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
TTRP02766 SHARPIN-202ENST00000398712 1765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
TTRP02766 AC234582.1-201ENST00000447623 923 ntTSL 5 BASIC22.82■■□□□ 1.24
TTRP02766 MKNK2-202ENST00000309340 1744 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
TTRP02766 PIK3R2-208ENST00000617642 1446 ntTSL 5 BASIC22.82■■□□□ 1.24
TTRP02766 BTBD19-203ENST00000450269 1572 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.81■■□□□ 1.24
TTRP02766 ACTR3B-201ENST00000256001 2216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
TTRP02766 ABHD17A-202ENST00000292577 1757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
TTRP02766 SSU72-201ENST00000291386 1290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
TTRP02766 PLSCR3-209ENST00000574401 2032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
TTRP02766 PLEKHG6-206ENST00000536531 1683 ntTSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
TTRP02766 WSB2-201ENST00000315436 2646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
TTRP02766 STUB1-201ENST00000219548 1472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
TTRP02766 STUB1-205ENST00000565677 1560 ntTSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
TTRP02766 AC068152.1-210ENST00000574741 836 ntTSL 3 BASIC22.78■■□□□ 1.24
TTRP02766 COL13A1-203ENST00000398969 2267 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.78■■□□□ 1.24
TTRP02766 TSPOAP1-AS1-203ENST00000579527 2042 ntTSL 2 BASIC22.77■■□□□ 1.24
TTRP02766 ARPC5L-202ENST00000353214 2507 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.77■■□□□ 1.24
TTRP02766 LZTS2-201ENST00000370220 5741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.23
TTRP02766 EXOC3-209ENST00000512944 2825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
TTRP02766 HNRNPAB-205ENST00000506259 1674 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
TTRP02766 FAAH-201ENST00000243167 2094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
TTRP02766 RAB40C-201ENST00000248139 2699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
TTRP02766 CRIP1-201ENST00000330233 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
TTRP02766 ZFAND2B-208ENST00000409594 2021 ntTSL 2 BASIC22.75■■□□□ 1.23
TTRP02766 ATRAID-201ENST00000380171 1240 ntTSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
TTRP02766 EMID1-203ENST00000404820 2118 ntTSL 5 BASIC22.75■■□□□ 1.23
TTRP02766 BMP7-204ENST00000450594 1857 ntTSL 2 BASIC22.75■■□□□ 1.23
TTRP02766 MTCH1-201ENST00000373616 2006 ntTSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
TTRP02766 SMARCD3-203ENST00000392811 2018 ntTSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
TTRP02766 RUNX2-205ENST00000465038 1770 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC22.74■■□□□ 1.23
TTRP02766 AC142086.6-201ENST00000621154 1765 ntBASIC22.74■■□□□ 1.23
TTRP02766 MARCH11-201ENST00000332432 1741 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.74■■□□□ 1.23
TTRP02766 AL391121.1-201ENST00000607967 1349 ntBASIC22.73■■□□□ 1.23
TTRP02766 GPR75-ASB3-201ENST00000406625 2113 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.73■■□□□ 1.23
TTRP02766 DUSP14-206ENST00000617516 1537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
TTRP02766 GSTP1-202ENST00000398606 965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
TTRP02766 DENR-202ENST00000455982 1052 ntTSL 5 BASIC22.72■■□□□ 1.23
TTRP02766 PLSCR3-202ENST00000535512 2067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
TTRP02766 EBPL-202ENST00000378268 680 ntTSL 3 BASIC22.71■■□□□ 1.23
TTRP02766 ECI1-207ENST00000570258 1512 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.71■■□□□ 1.23
TTRP02766 CAHM-201ENST00000604200 896 ntBASIC22.7■■□□□ 1.22
TTRP02766 MYLIP-202ENST00000356840 1666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
TTRP02766 LRRC75B-201ENST00000318753 1238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
TTRP02766 AL139393.1-201ENST00000417479 573 ntTSL 5 BASIC22.69■■□□□ 1.22
TTRP02766 AC136428.2-201ENST00000563187 214 ntBASIC22.69■■□□□ 1.22
TTRP02766 AMZ2-201ENST00000359783 1722 ntTSL 5 BASIC22.68■■□□□ 1.22
TTRP02766 FGF3-201ENST00000334134 892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
TTRP02766 DRD5P2-201ENST00000421395 2012 ntBASIC22.68■■□□□ 1.22
TTRP02766 LACTB-201ENST00000261893 1972 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
TTRP02766 AP003068.2-202ENST00000526623 1662 ntTSL 2 BASIC22.68■■□□□ 1.22
TTRP02766 HSD11B1L-209ENST00000577917 1553 ntTSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
TTRP02766 CLK2-201ENST00000355560 2120 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.67■■□□□ 1.22
TTRP02766 NADK2-210ENST00000514504 1233 ntTSL 5 BASIC22.67■■□□□ 1.22
TTRP02766 MNX1-201ENST00000252971 2174 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
TTRP02766 TNFSF12-201ENST00000293825 1553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
TTRP02766 ZNF775-201ENST00000329630 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
TTRP02766 TPGS1-201ENST00000359315 1114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
TTRP02766 AC006486.1-201ENST00000594664 634 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.65■■□□□ 1.22
TTRP02766 AC097358.2-201ENST00000607541 1159 ntBASIC22.65■■□□□ 1.22
TTRP02766 WHRN-203ENST00000374057 1718 ntTSL 2 BASIC22.65■■□□□ 1.22
TTRP02766 GABRA5-203ENST00000400081 2761 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.64■■□□□ 1.22
TTRP02766 BATF3-201ENST00000243440 980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
TTRP02766 SDCCAG3-201ENST00000298537 2314 ntTSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
TTRP02766 ST6GALNAC6-205ENST00000373146 2460 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
TTRP02766 GRK6-206ENST00000507633 1660 ntTSL 5 BASIC22.63■■□□□ 1.21
TTRP02766 DUSP15-202ENST00000339738 1454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
TTRP02766 CIB1-201ENST00000328649 1247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
TTRP02766 CIB1-202ENST00000612800 1096 ntTSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
TTRP02766 ENKD1-201ENST00000243878 1579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
TTRP02766 COMMD7-201ENST00000278980 1900 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
TTRP02766 NOXA1-201ENST00000341349 1678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
TTRP02766 HOOK2-201ENST00000264827 2603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
TTRP02766 CHST14-202ENST00000559991 1968 ntTSL 5 BASIC22.61■■□□□ 1.21
TTRP02766 ZFAND2B-204ENST00000409217 886 ntTSL 2 BASIC22.61■■□□□ 1.21
TTRP02766 NFYB-205ENST00000551727 1727 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.61■■□□□ 1.21
TTRP02766 EFEMP2-201ENST00000307998 2034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
TTRP02766 CCND3-203ENST00000372991 2085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
TTRP02766 KANSL1L-207ENST00000452086 2334 ntTSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
TTRP02766 TOMM40-201ENST00000252487 1707 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
TTRP02766 TOMM40-202ENST00000405636 1709 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
TTRP02766 FAM117A-201ENST00000240364 2365 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
TTRP02766 HNRNPAB-204ENST00000504898 1785 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
TTRP02766 ATP6V1E2-204ENST00000522587 1559 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.58■■□□□ 1.2
TTRP02766 HOXB3-201ENST00000311626 2642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
TTRP02766 AC012615.2-201ENST00000586259 447 ntTSL 4 BASIC22.57■■□□□ 1.2
TTRP02766 TCF24-201ENST00000563496 2450 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.56■■□□□ 1.2
TTRP02766 CHPT1-201ENST00000229266 1585 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
TTRP02766 PPP1CC-208ENST00000551676 1581 ntTSL 2 BASIC22.56■■□□□ 1.2
TTRP02766 CDH24-206ENST00000610348 2037 ntTSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 10.1 ms