Protein–RNA interactions for Protein: P02647

APOA1, Apolipoprotein A-I, humanhuman

Predictions only

Length 267 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
APOA1P02647 SKOR2-203ENST00000620245 3048 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.32■■□□□ 1.32
APOA1P02647 FAM193A-211ENST00000637812 4885 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.31■■□□□ 1.32
APOA1P02647 SHOX2-204ENST00000483851 1866 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.3■■□□□ 1.32
APOA1P02647 THRA-204ENST00000546243 1909 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.29■■□□□ 1.32
APOA1P02647 CCKBR-201ENST00000334619 2121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
APOA1P02647 CCND3-202ENST00000372988 2133 ntTSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
APOA1P02647 SHARPIN-202ENST00000398712 1765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
APOA1P02647 LACTB-201ENST00000261893 1972 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
APOA1P02647 FAM89B-203ENST00000530349 1263 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.27■■□□□ 1.32
APOA1P02647 HAGHL-204ENST00000549114 1820 ntTSL 5 BASIC23.26■■□□□ 1.31
APOA1P02647 CARM1-202ENST00000344150 2722 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.26■■□□□ 1.31
APOA1P02647 SCCPDH-201ENST00000366510 2503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
APOA1P02647 FAM107B-205ENST00000378467 2374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
APOA1P02647 PHF23-205ENST00000571362 1768 ntTSL 2 BASIC23.25■■□□□ 1.31
APOA1P02647 COL13A1-214ENST00000522165 2061 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.25■■□□□ 1.31
APOA1P02647 GAL3ST1-205ENST00000406361 1819 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.25■■□□□ 1.31
APOA1P02647 GALK1-205ENST00000588479 1866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
APOA1P02647 POU3F3-201ENST00000361360 3064 ntAPPRIS P1 BASIC23.25■■□□□ 1.31
APOA1P02647 CTDNEP1-201ENST00000318988 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
APOA1P02647 CHPT1-205ENST00000549872 2001 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.24■■□□□ 1.31
APOA1P02647 RASSF7-201ENST00000397582 1731 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.24■■□□□ 1.31
APOA1P02647 PPP2R2D-201ENST00000455566 5738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
APOA1P02647 PGM5P2-201ENST00000613141 1980 ntTSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
APOA1P02647 FRAT2-201ENST00000371019 2213 ntAPPRIS P1 BASIC23.23■■□□□ 1.31
APOA1P02647 HOXB3-210ENST00000489475 1845 ntTSL 2 BASIC23.23■■□□□ 1.31
APOA1P02647 HDGF-201ENST00000357325 2380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
APOA1P02647 CADPS-219ENST00000612439 5455 ntTSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
APOA1P02647 TNIP2-201ENST00000315423 1974 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
APOA1P02647 RASSF5-204ENST00000580449 1932 ntTSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
APOA1P02647 PTPRM-201ENST00000332175 6095 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
APOA1P02647 GTF2IP1-204ENST00000616377 2632 ntTSL 2 BASIC23.2■■□□□ 1.3
APOA1P02647 SLC52A2-201ENST00000329994 1896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
APOA1P02647 MAPK4-202ENST00000540640 1576 ntTSL 2 BASIC23.18■■□□□ 1.3
APOA1P02647 ANKRD53-201ENST00000272421 2185 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
APOA1P02647 HDGF-210ENST00000537739 2073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
APOA1P02647 CAPNS1-204ENST00000587718 1558 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
APOA1P02647 ZNF768-201ENST00000380412 2315 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
APOA1P02647 HNRNPAB-204ENST00000504898 1785 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
APOA1P02647 TMEM187-201ENST00000369982 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
APOA1P02647 OTUD5-203ENST00000396743 2682 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
APOA1P02647 CNIH2-203ENST00000528852 1524 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
APOA1P02647 OTUD5-202ENST00000376488 2692 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
APOA1P02647 PLBD2-202ENST00000545182 2321 ntTSL 2 BASIC23.15■■□□□ 1.3
APOA1P02647 TM6SF1-202ENST00000322019 2074 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
APOA1P02647 RNF130-201ENST00000261947 1766 ntTSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
APOA1P02647 PLEKHF1-201ENST00000436066 2084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
APOA1P02647 MORF4L1-202ENST00000379535 2274 ntTSL 2 BASIC23.15■■□□□ 1.3
APOA1P02647 GIPC1-201ENST00000345425 1782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.3
APOA1P02647 RAB40C-204ENST00000538492 2569 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.14■■□□□ 1.3
APOA1P02647 FAM89B-202ENST00000449319 1337 ntTSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.3
APOA1P02647 ARTN-203ENST00000414809 1943 ntAPPRIS P4 TSL 3 BASIC23.14■■□□□ 1.3
APOA1P02647 MAGI2-208ENST00000522391 4878 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.13■■□□□ 1.29
APOA1P02647 AGTRAP-204ENST00000376637 1067 ntTSL 2 BASIC23.13■■□□□ 1.29
APOA1P02647 GKAP1-203ENST00000376371 1778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
APOA1P02647 PGM5-201ENST00000396392 1782 ntTSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
APOA1P02647 SPTSSA-201ENST00000298130 2777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
APOA1P02647 GATA3-AS1-201ENST00000355358 2214 ntTSL 2 BASIC23.13■■□□□ 1.29
APOA1P02647 NFYB-205ENST00000551727 1727 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.13■■□□□ 1.29
APOA1P02647 IHH-201ENST00000295731 2023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
APOA1P02647 MVK-208ENST00000539696 608 ntTSL 5 BASIC23.12■■□□□ 1.29
APOA1P02647 DEDD-212ENST00000545495 2329 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.12■■□□□ 1.29
APOA1P02647 VIPR2-203ENST00000402066 1926 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.12■■□□□ 1.29
APOA1P02647 TM9SF3-201ENST00000371142 6141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
APOA1P02647 HNRNPAB-207ENST00000514633 1571 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.1■■□□□ 1.29
APOA1P02647 FADD-201ENST00000301838 1841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
APOA1P02647 SHD-201ENST00000543264 2577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
APOA1P02647 RAB26-201ENST00000210187 1675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
APOA1P02647 TCF24-201ENST00000563496 2450 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.09■■□□□ 1.29
APOA1P02647 LRRC61-202ENST00000359623 1877 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.09■■□□□ 1.29
APOA1P02647 CYB5R3-201ENST00000352397 2124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
APOA1P02647 SPATA5L1-208ENST00000638607 1863 ntTSL 2 BASIC23.09■■□□□ 1.29
APOA1P02647 ADGRA2-202ENST00000412232 5651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.28
APOA1P02647 ST6GALNAC6-204ENST00000373144 2406 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.28
APOA1P02647 FBXO2-201ENST00000354287 1560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
APOA1P02647 SATB1-AS1-216ENST00000598149 1119 ntTSL 2 BASIC23.07■■□□□ 1.28
APOA1P02647 MFSD12-202ENST00000389395 2039 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
APOA1P02647 DDX42-201ENST00000359353 2783 ntTSL 5 BASIC23.07■■□□□ 1.28
APOA1P02647 FGF18-201ENST00000274625 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
APOA1P02647 MYH7B-209ENST00000618182 6197 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.06■■□□□ 1.28
APOA1P02647 MTCH1-202ENST00000373627 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
APOA1P02647 NPAS3-203ENST00000357798 2763 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
APOA1P02647 FANCE-201ENST00000229769 2554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
APOA1P02647 CACNG6-201ENST00000252729 1853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
APOA1P02647 HNRNPAB-202ENST00000358344 1796 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
APOA1P02647 PHLPP1-201ENST00000262719 6390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
APOA1P02647 CDV3-203ENST00000431519 955 ntTSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
APOA1P02647 AC091230.1-202ENST00000564823 5356 ntTSL 2 BASIC23.05■■□□□ 1.28
APOA1P02647 MSX1-201ENST00000382723 1939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
APOA1P02647 NXPH3-201ENST00000328741 2179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
APOA1P02647 TMEM55B-201ENST00000250489 1961 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
APOA1P02647 EVC-203ENST00000509451 1960 ntTSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
APOA1P02647 LRIG1-202ENST00000383703 5283 ntTSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
APOA1P02647 PKM-204ENST00000449901 2526 ntTSL 2 BASIC23.03■■□□□ 1.28
APOA1P02647 MSANTD3-203ENST00000395067 1362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
APOA1P02647 FAM57A-202ENST00000308278 2412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
APOA1P02647 PTPA-202ENST00000347048 1989 ntTSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
APOA1P02647 FOXO1-201ENST00000379561 5735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
APOA1P02647 AL135925.1-201ENST00000605920 1701 ntBASIC23.02■■□□□ 1.28
APOA1P02647 ONECUT3-201ENST00000382349 8318 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.01■■□□□ 1.27
APOA1P02647 GRK2-204ENST00000526285 1458 ntTSL 5 BASIC23.01■■□□□ 1.27
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 120.5 ms