Protein–RNA interactions for Protein: P01782

IGHV3-9, Immunoglobulin heavy variable 3-9, humanhuman

Predictions only

Length 118 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
IGHV3-9P01782 BHLHE23-201ENST00000370346 1057 ntAPPRIS P1 BASIC23.32■■□□□ 1.32
IGHV3-9P01782 TPM2-203ENST00000378292 2147 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
IGHV3-9P01782 SH3BP2-221ENST00000511747 2351 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
IGHV3-9P01782 AL135925.1-201ENST00000605920 1701 ntBASIC23.3■■□□□ 1.32
IGHV3-9P01782 ECI1-207ENST00000570258 1512 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.3■■□□□ 1.32
IGHV3-9P01782 PELI3-203ENST00000524466 1671 ntTSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
IGHV3-9P01782 NPHP3-202ENST00000383282 782 ntTSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
IGHV3-9P01782 VEGFA-207ENST00000413642 1197 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
IGHV3-9P01782 AC010864.1-201ENST00000609407 1511 ntBASIC23.29■■□□□ 1.32
IGHV3-9P01782 TMEM158-201ENST00000503771 1813 ntAPPRIS P1 BASIC23.29■■□□□ 1.32
IGHV3-9P01782 FTCD-204ENST00000397748 1955 ntTSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
IGHV3-9P01782 CARS2-201ENST00000257347 1879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
IGHV3-9P01782 BOD1-201ENST00000285908 1286 ntTSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
IGHV3-9P01782 BOD1-206ENST00000480951 814 ntTSL 2 BASIC23.29■■□□□ 1.32
IGHV3-9P01782 PPP3CC-204ENST00000518852 1598 ntTSL 2 BASIC23.29■■□□□ 1.32
IGHV3-9P01782 MIR6090-201ENST00000622481 60 ntBASIC23.29■■□□□ 1.32
IGHV3-9P01782 TM6SF1-202ENST00000322019 2074 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
IGHV3-9P01782 NRXN1-228ENST00000628364 2444 ntTSL 5 BASIC23.28■■□□□ 1.32
IGHV3-9P01782 VAX2-201ENST00000234392 1147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
IGHV3-9P01782 BATF3-201ENST00000243440 980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
IGHV3-9P01782 HDAC11-206ENST00000405025 576 ntTSL 4 BASIC23.27■■□□□ 1.32
IGHV3-9P01782 AC108673.1-201ENST00000510422 1159 ntBASIC23.27■■□□□ 1.32
IGHV3-9P01782 KLC2-205ENST00000394078 1557 ntTSL 5 BASIC23.27■■□□□ 1.32
IGHV3-9P01782 LDB1-202ENST00000425280 2089 ntTSL 5 BASIC23.26■■□□□ 1.31
IGHV3-9P01782 COPRS-202ENST00000378634 1041 ntTSL 2 BASIC23.26■■□□□ 1.31
IGHV3-9P01782 UBE2S-203ENST00000589978 496 ntTSL 5 BASIC23.26■■□□□ 1.31
IGHV3-9P01782 ZNF513-201ENST00000323703 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
IGHV3-9P01782 ZFAND2B-206ENST00000409336 944 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.25■■□□□ 1.31
IGHV3-9P01782 ZFAND2B-221ENST00000621130 1070 ntTSL 5 BASIC23.25■■□□□ 1.31
IGHV3-9P01782 MISP3-202ENST00000587086 1535 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
IGHV3-9P01782 STUB1-205ENST00000565677 1560 ntTSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
IGHV3-9P01782 FEZF2-202ENST00000475839 1918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
IGHV3-9P01782 CIB2-204ENST00000557846 934 ntTSL 3 BASIC23.23■■□□□ 1.31
IGHV3-9P01782 DTNBP1-202ENST00000344537 1403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
IGHV3-9P01782 COL13A1-210ENST00000517713 2007 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.23■■□□□ 1.31
IGHV3-9P01782 POLR1D-201ENST00000302979 1166 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
IGHV3-9P01782 FAM149A-201ENST00000227065 2708 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
IGHV3-9P01782 KIAA2013-202ENST00000376576 2539 ntTSL 2 BASIC23.2■■□□□ 1.3
IGHV3-9P01782 ABCB10P1-201ENST00000614297 2181 ntBASIC23.2■■□□□ 1.3
IGHV3-9P01782 AP002884.3-203ENST00000419895 1711 ntTSL 2 BASIC23.19■■□□□ 1.3
IGHV3-9P01782 ST7-AS1-201ENST00000456775 1889 ntBASIC23.18■■□□□ 1.3
IGHV3-9P01782 GAL3ST1-205ENST00000406361 1819 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.18■■□□□ 1.3
IGHV3-9P01782 HAUS7-201ENST00000370210 1593 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.18■■□□□ 1.3
IGHV3-9P01782 YAP1-204ENST00000526343 2393 ntTSL 5 BASIC23.17■■□□□ 1.3
IGHV3-9P01782 DOCK5-202ENST00000410074 786 ntTSL 2 BASIC23.17■■□□□ 1.3
IGHV3-9P01782 NME2-202ENST00000393190 866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
IGHV3-9P01782 GLTP-201ENST00000318348 2356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
IGHV3-9P01782 ABHD17A-202ENST00000292577 1757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
IGHV3-9P01782 AC004540.2-201ENST00000451368 611 ntTSL 2 BASIC23.15■■□□□ 1.3
IGHV3-9P01782 ZNF706-207ENST00000519882 959 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.15■■□□□ 1.3
IGHV3-9P01782 ZNF706-213ENST00000521272 732 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.15■■□□□ 1.3
IGHV3-9P01782 UBE2A-207ENST00000628549 934 ntTSL 2 BASIC23.15■■□□□ 1.3
IGHV3-9P01782 PI4KAP2-202ENST00000450651 2294 ntTSL 5 BASIC23.15■■□□□ 1.3
IGHV3-9P01782 PABPC1L2B-AS1-201ENST00000416989 1167 ntTSL 3 BASIC23.14■■□□□ 1.29
IGHV3-9P01782 AL662864.1-201ENST00000454388 1167 ntTSL 3 BASIC23.14■■□□□ 1.29
IGHV3-9P01782 ARL8A-201ENST00000272217 1793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
IGHV3-9P01782 HNRNPAB-204ENST00000504898 1785 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
IGHV3-9P01782 FSD1L-208ENST00000495708 1906 ntTSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
IGHV3-9P01782 MPST-206ENST00000429360 1331 ntTSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
IGHV3-9P01782 ATPAF1-202ENST00000371937 1827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
IGHV3-9P01782 HSPB11-201ENST00000194214 915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
IGHV3-9P01782 DUX4L29-201ENST00000425409 679 ntBASIC23.13■■□□□ 1.29
IGHV3-9P01782 SLC52A2-201ENST00000329994 1896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
IGHV3-9P01782 KCNF1-201ENST00000295082 2289 ntAPPRIS P1 BASIC23.12■■□□□ 1.29
IGHV3-9P01782 TRAM2-AS1-201ENST00000453216 664 ntTSL 3 BASIC23.12■■□□□ 1.29
IGHV3-9P01782 AC021231.2-201ENST00000594613 730 ntBASIC23.12■■□□□ 1.29
IGHV3-9P01782 TOMM40-201ENST00000252487 1707 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
IGHV3-9P01782 TOMM40-202ENST00000405636 1709 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
IGHV3-9P01782 MLEC-202ENST00000412616 841 ntTSL 3 BASIC23.11■■□□□ 1.29
IGHV3-9P01782 JAG2-201ENST00000331782 5835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
IGHV3-9P01782 PAPD7-201ENST00000230859 5459 ntTSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
IGHV3-9P01782 HNRNPAB-202ENST00000358344 1796 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
IGHV3-9P01782 SLC35D2-202ENST00000375257 889 ntTSL 2 BASIC23.09■■□□□ 1.29
IGHV3-9P01782 ABHD17AP4-201ENST00000411545 909 ntBASIC23.09■■□□□ 1.29
IGHV3-9P01782 HGH1-207ENST00000628266 258 ntTSL 5 BASIC23.09■■□□□ 1.29
IGHV3-9P01782 TSPAN33-201ENST00000486685 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
IGHV3-9P01782 PIP4K2B-204ENST00000619039 5734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
IGHV3-9P01782 DNLZ-201ENST00000371738 724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
IGHV3-9P01782 CCDC149-203ENST00000502801 1079 ntTSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
IGHV3-9P01782 ENKD1-201ENST00000243878 1579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
IGHV3-9P01782 EBAG9-202ENST00000395785 1467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
IGHV3-9P01782 SIRT3-201ENST00000382743 2543 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
IGHV3-9P01782 RCC1L-202ENST00000614461 2419 ntTSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
IGHV3-9P01782 LSM14B-204ENST00000370915 1079 ntTSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
IGHV3-9P01782 PRSS41-201ENST00000399677 1127 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.05■■□□□ 1.28
IGHV3-9P01782 HNRNPAB-205ENST00000506259 1674 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
IGHV3-9P01782 LRRC10B-201ENST00000378075 2219 ntAPPRIS P1 BASIC23.05■■□□□ 1.28
IGHV3-9P01782 AC116407.1-201ENST00000398832 1599 ntTSL 2 BASIC23.05■■□□□ 1.28
IGHV3-9P01782 VEGFA-226ENST00000611736 1239 ntTSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
IGHV3-9P01782 SPIRE1-202ENST00000409402 5665 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
IGHV3-9P01782 AC127502.1-201ENST00000399971 1502 ntBASIC23.03■■□□□ 1.28
IGHV3-9P01782 AGAP3-216ENST00000479901 1881 ntTSL 5 BASIC23.03■■□□□ 1.28
IGHV3-9P01782 GSC-201ENST00000238558 1264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
IGHV3-9P01782 AMN-201ENST00000299155 1907 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
IGHV3-9P01782 EI24-212ENST00000615917 1407 ntTSL 2 BASIC23.02■■□□□ 1.28
IGHV3-9P01782 AL451007.3-201ENST00000640271 588 ntAPPRIS P1 BASIC23.02■■□□□ 1.28
IGHV3-9P01782 GRK6-206ENST00000507633 1660 ntTSL 5 BASIC23.02■■□□□ 1.28
IGHV3-9P01782 ACOT7-201ENST00000361521 2429 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
IGHV3-9P01782 FOXA2-202ENST00000419308 2422 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
IGHV3-9P01782 NEUROG2-201ENST00000313341 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 24.7 ms