Protein–RNA interactions for Protein: P01766

IGHV3-13, Immunoglobulin heavy variable 3-13, humanhuman

Predictions only

Length 116 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
IGHV3-13P01766 SRSF9-201ENST00000229390 1201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
IGHV3-13P01766 AC010864.1-201ENST00000609407 1511 ntBASIC22.55■■□□□ 1.2
IGHV3-13P01766 SH3GL3-202ENST00000427482 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
IGHV3-13P01766 VAX2-201ENST00000234392 1147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
IGHV3-13P01766 COPRS-202ENST00000378634 1041 ntTSL 2 BASIC22.54■■□□□ 1.2
IGHV3-13P01766 AC104109.3-201ENST00000519718 483 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.54■■□□□ 1.2
IGHV3-13P01766 TMEM158-201ENST00000503771 1813 ntAPPRIS P1 BASIC22.54■■□□□ 1.2
IGHV3-13P01766 BOD1-201ENST00000285908 1286 ntTSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
IGHV3-13P01766 BOD1-206ENST00000480951 814 ntTSL 2 BASIC22.53■■□□□ 1.2
IGHV3-13P01766 PELI3-203ENST00000524466 1671 ntTSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
IGHV3-13P01766 CARS2-201ENST00000257347 1879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
IGHV3-13P01766 RCE1-201ENST00000309657 1485 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
IGHV3-13P01766 ECI1-207ENST00000570258 1512 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.52■■□□□ 1.19
IGHV3-13P01766 NPHP3-202ENST00000383282 782 ntTSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
IGHV3-13P01766 MIR6090-201ENST00000622481 60 ntBASIC22.5■■□□□ 1.19
IGHV3-13P01766 MISP3-202ENST00000587086 1535 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
IGHV3-13P01766 HAUS7-201ENST00000370210 1593 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.5■■□□□ 1.19
IGHV3-13P01766 POLR1D-201ENST00000302979 1166 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
IGHV3-13P01766 KLC2-205ENST00000394078 1557 ntTSL 5 BASIC22.49■■□□□ 1.19
IGHV3-13P01766 FAM149A-201ENST00000227065 2708 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
IGHV3-13P01766 STUB1-205ENST00000565677 1560 ntTSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
IGHV3-13P01766 FTCD-204ENST00000397748 1955 ntTSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
IGHV3-13P01766 VEGFA-207ENST00000413642 1197 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
IGHV3-13P01766 ARMC10-211ENST00000541300 2266 ntTSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
IGHV3-13P01766 KIAA2013-202ENST00000376576 2539 ntTSL 2 BASIC22.46■■□□□ 1.19
IGHV3-13P01766 FEZF2-202ENST00000475839 1918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
IGHV3-13P01766 HDAC11-206ENST00000405025 576 ntTSL 4 BASIC22.45■■□□□ 1.18
IGHV3-13P01766 CIB2-204ENST00000557846 934 ntTSL 3 BASIC22.45■■□□□ 1.18
IGHV3-13P01766 ABHD17A-202ENST00000292577 1757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
IGHV3-13P01766 LDB1-202ENST00000425280 2089 ntTSL 5 BASIC22.45■■□□□ 1.18
IGHV3-13P01766 NRXN1-228ENST00000628364 2444 ntTSL 5 BASIC22.45■■□□□ 1.18
IGHV3-13P01766 DOCK5-202ENST00000410074 786 ntTSL 2 BASIC22.44■■□□□ 1.18
IGHV3-13P01766 SH3BP2-221ENST00000511747 2351 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
IGHV3-13P01766 UBE2A-207ENST00000628549 934 ntTSL 2 BASIC22.44■■□□□ 1.18
IGHV3-13P01766 HNRNPAB-204ENST00000504898 1785 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
IGHV3-13P01766 DTNBP1-202ENST00000344537 1403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
IGHV3-13P01766 TPM2-203ENST00000378292 2147 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
IGHV3-13P01766 ZFAND2B-206ENST00000409336 944 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.42■■□□□ 1.18
IGHV3-13P01766 ZFAND2B-221ENST00000621130 1070 ntTSL 5 BASIC22.42■■□□□ 1.18
IGHV3-13P01766 ATPAF1-202ENST00000371937 1827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
IGHV3-13P01766 AP002884.3-203ENST00000419895 1711 ntTSL 2 BASIC22.42■■□□□ 1.18
IGHV3-13P01766 ST7-AS1-201ENST00000456775 1889 ntBASIC22.41■■□□□ 1.18
IGHV3-13P01766 ARL8A-201ENST00000272217 1793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
IGHV3-13P01766 MLEC-202ENST00000412616 841 ntTSL 3 BASIC22.4■■□□□ 1.18
IGHV3-13P01766 COL13A1-210ENST00000517713 2007 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.4■■□□□ 1.18
IGHV3-13P01766 HNRNPAB-202ENST00000358344 1796 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
IGHV3-13P01766 SLC52A2-201ENST00000329994 1896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
IGHV3-13P01766 GAL3ST1-205ENST00000406361 1819 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.38■■□□□ 1.17
IGHV3-13P01766 DUX4L29-201ENST00000425409 679 ntBASIC22.38■■□□□ 1.17
IGHV3-13P01766 TSPAN33-201ENST00000486685 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
IGHV3-13P01766 NME2-202ENST00000393190 866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
IGHV3-13P01766 HSPB11-201ENST00000194214 915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
IGHV3-13P01766 AC004540.2-201ENST00000451368 611 ntTSL 2 BASIC22.36■■□□□ 1.17
IGHV3-13P01766 ENKD1-201ENST00000243878 1579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
IGHV3-13P01766 PABPC1L2B-AS1-201ENST00000416989 1167 ntTSL 3 BASIC22.35■■□□□ 1.17
IGHV3-13P01766 AL662864.1-201ENST00000454388 1167 ntTSL 3 BASIC22.35■■□□□ 1.17
IGHV3-13P01766 FSD1L-208ENST00000495708 1906 ntTSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
IGHV3-13P01766 KCNF1-201ENST00000295082 2289 ntAPPRIS P1 BASIC22.34■■□□□ 1.17
IGHV3-13P01766 MPST-206ENST00000429360 1331 ntTSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
IGHV3-13P01766 EI24-212ENST00000615917 1407 ntTSL 2 BASIC22.34■■□□□ 1.17
IGHV3-13P01766 TRAM2-AS1-201ENST00000453216 664 ntTSL 3 BASIC22.34■■□□□ 1.17
IGHV3-13P01766 ZNF706-207ENST00000519882 959 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.34■■□□□ 1.17
IGHV3-13P01766 ZNF706-213ENST00000521272 732 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.34■■□□□ 1.17
IGHV3-13P01766 EBAG9-202ENST00000395785 1467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
IGHV3-13P01766 DNLZ-201ENST00000371738 724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
IGHV3-13P01766 AC021231.2-201ENST00000594613 730 ntBASIC22.33■■□□□ 1.17
IGHV3-13P01766 MKNK2-202ENST00000309340 1744 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
IGHV3-13P01766 HNRNPAB-205ENST00000506259 1674 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.16
IGHV3-13P01766 SHOX2-204ENST00000483851 1866 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.32■■□□□ 1.16
IGHV3-13P01766 SLC35D2-202ENST00000375257 889 ntTSL 2 BASIC22.32■■□□□ 1.16
IGHV3-13P01766 AC004837.3-201ENST00000420748 565 ntTSL 4 BASIC22.32■■□□□ 1.16
IGHV3-13P01766 CCDC149-203ENST00000502801 1079 ntTSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
IGHV3-13P01766 HGH1-207ENST00000628266 258 ntTSL 5 BASIC22.32■■□□□ 1.16
IGHV3-13P01766 C14orf80-202ENST00000334656 1358 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.32■■□□□ 1.16
IGHV3-13P01766 RP9P-201ENST00000381639 1303 ntTSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
IGHV3-13P01766 TM6SF1-202ENST00000322019 2074 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
IGHV3-13P01766 GRK6-206ENST00000507633 1660 ntTSL 5 BASIC22.31■■□□□ 1.16
IGHV3-13P01766 HINT2-201ENST00000259667 628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
IGHV3-13P01766 ZNF513-201ENST00000323703 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
IGHV3-13P01766 ABHD17AP4-201ENST00000411545 909 ntBASIC22.3■■□□□ 1.16
IGHV3-13P01766 JAG2-201ENST00000331782 5835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
IGHV3-13P01766 PIP4K2B-204ENST00000619039 5734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
IGHV3-13P01766 ARHGDIG-201ENST00000219409 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
IGHV3-13P01766 UBALD1-202ENST00000587615 799 ntTSL 2 BASIC22.29■■□□□ 1.16
IGHV3-13P01766 AGAP3-216ENST00000479901 1881 ntTSL 5 BASIC22.28■■□□□ 1.16
IGHV3-13P01766 BARX1-201ENST00000253968 1533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
IGHV3-13P01766 RDX-210ENST00000530301 1549 ntTSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
IGHV3-13P01766 CCDC88C-205ENST00000553403 1651 ntTSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
IGHV3-13P01766 TOMM40-201ENST00000252487 1707 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
IGHV3-13P01766 TOMM40-202ENST00000405636 1709 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
IGHV3-13P01766 RASSF8-202ENST00000381352 2320 ntTSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
IGHV3-13P01766 GSC-201ENST00000238558 1264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
IGHV3-13P01766 LSM14B-204ENST00000370915 1079 ntTSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
IGHV3-13P01766 AMN-201ENST00000299155 1907 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
IGHV3-13P01766 AC127502.1-201ENST00000399971 1502 ntBASIC22.26■■□□□ 1.15
IGHV3-13P01766 BCL7C-201ENST00000215115 1740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
IGHV3-13P01766 REPIN1-204ENST00000466559 1022 ntTSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
IGHV3-13P01766 VEGFA-226ENST00000611736 1239 ntTSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
IGHV3-13P01766 QDPR-201ENST00000281243 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
IGHV3-13P01766 COQ2-202ENST00000311469 1641 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 70.3 ms