Protein–RNA interactions for Protein: P01137

TGFB1, Transforming growth factor beta-1, humanhuman

Predictions only

Length 390 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TGFB1P01137 H2AFV-205ENST00000381124 628 ntTSL 3 BASIC25.2■■□□□ 1.62
TGFB1P01137 CHML-205ENST00000638160 705 ntTSL 3 BASIC25.2■■□□□ 1.62
TGFB1P01137 MISP3-201ENST00000269720 1424 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.2■■□□□ 1.62
TGFB1P01137 NMB-202ENST00000394588 1017 ntTSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
TGFB1P01137 PLEKHG6-206ENST00000536531 1683 ntTSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
TGFB1P01137 LANCL3-203ENST00000614025 1469 ntTSL 2 BASIC25.18■■□□□ 1.62
TGFB1P01137 VEGFA-231ENST00000640499 1188 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
TGFB1P01137 FOXE3-201ENST00000335071 1981 ntAPPRIS P1 BASIC25.18■■□□□ 1.62
TGFB1P01137 MYLIP-202ENST00000356840 1666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
TGFB1P01137 SNX24-201ENST00000261369 2158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
TGFB1P01137 MNX1-207ENST00000543409 1620 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
TGFB1P01137 SHOX2-204ENST00000483851 1866 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.17■■□□□ 1.62
TGFB1P01137 AGAP1-202ENST00000336665 5427 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
TGFB1P01137 ACTG1-210ENST00000575842 2256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
TGFB1P01137 GFRA4-202ENST00000319242 900 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
TGFB1P01137 ECI1-203ENST00000562238 948 ntTSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
TGFB1P01137 FOXQ1-201ENST00000296839 2309 ntAPPRIS P1 BASIC25.15■■□□□ 1.62
TGFB1P01137 STUB1-205ENST00000565677 1560 ntTSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
TGFB1P01137 HNRNPLP2-201ENST00000568980 1570 ntBASIC25.15■■□□□ 1.62
TGFB1P01137 LYNX1-208ENST00000615007 1293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
TGFB1P01137 NMB-201ENST00000360476 1007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.62
TGFB1P01137 MAPK13-201ENST00000211287 2052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.61
TGFB1P01137 CACNG6-202ENST00000346968 645 ntTSL 5 BASIC25.13■■□□□ 1.61
TGFB1P01137 CGGBP1-206ENST00000482016 1147 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.13■■□□□ 1.61
TGFB1P01137 NOXA1-201ENST00000341349 1678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
TGFB1P01137 AGFG1-205ENST00000409979 2089 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC25.12■■□□□ 1.61
TGFB1P01137 FSD1L-208ENST00000495708 1906 ntTSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
TGFB1P01137 ATP6V1E2-204ENST00000522587 1559 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.11■■□□□ 1.61
TGFB1P01137 ST6GALNAC6-203ENST00000373142 2448 ntTSL 1 (best) BASIC25.11■■□□□ 1.61
TGFB1P01137 BATF3-201ENST00000243440 980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.11■■□□□ 1.61
TGFB1P01137 GGA1-204ENST00000381756 2107 ntTSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
TGFB1P01137 AC005559.1-201ENST00000589661 871 ntBASIC25.1■■□□□ 1.61
TGFB1P01137 ACOT7-201ENST00000361521 2429 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
TGFB1P01137 EFNA3-201ENST00000368408 1782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
TGFB1P01137 TESK1-206ENST00000620767 2438 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.09■■□□□ 1.61
TGFB1P01137 WDSUB1-205ENST00000409990 1920 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.09■■□□□ 1.61
TGFB1P01137 RCC1L-205ENST00000618035 1409 ntTSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
TGFB1P01137 BIN1-204ENST00000348750 2074 ntTSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
TGFB1P01137 PGM5P2-201ENST00000613141 1980 ntTSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
TGFB1P01137 RTN4R-201ENST00000043402 2157 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.61
TGFB1P01137 CERS2-205ENST00000368954 2505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.61
TGFB1P01137 CHPT1-201ENST00000229266 1585 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.61
TGFB1P01137 IRX1-201ENST00000302006 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.61
TGFB1P01137 FGF18-201ENST00000274625 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
TGFB1P01137 CAPNS1-217ENST00000629983 799 ntTSL 5 BASIC25.07■■□□□ 1.6
TGFB1P01137 ECI1-207ENST00000570258 1512 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.07■■□□□ 1.6
TGFB1P01137 VWA1-201ENST00000338660 2147 ntTSL 2 BASIC25.06■■□□□ 1.6
TGFB1P01137 ABHD17A-202ENST00000292577 1757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
TGFB1P01137 RPS2-209ENST00000529806 993 ntTSL 3 BASIC25.06■■□□□ 1.6
TGFB1P01137 PDPK1-203ENST00000389224 2416 ntTSL 2 BASIC25.06■■□□□ 1.6
TGFB1P01137 ZNF787-203ENST00000610935 1925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
TGFB1P01137 HNRNPAB-205ENST00000506259 1674 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
TGFB1P01137 MKNK2-202ENST00000309340 1744 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
TGFB1P01137 RDX-210ENST00000530301 1549 ntTSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
TGFB1P01137 LZTS2-201ENST00000370220 5741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
TGFB1P01137 TPRA1-209ENST00000489960 1903 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.04■■□□□ 1.6
TGFB1P01137 BCL7C-201ENST00000215115 1740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
TGFB1P01137 HOXB3-212ENST00000498678 2196 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.03■■□□□ 1.6
TGFB1P01137 TSEN34-203ENST00000396388 1349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
TGFB1P01137 RUNDC3A-206ENST00000590941 1675 ntTSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
TGFB1P01137 PGAM5-201ENST00000317555 1182 ntTSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
TGFB1P01137 SCX-201ENST00000567180 999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
TGFB1P01137 AP000547.3-202ENST00000592107 1019 ntTSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
TGFB1P01137 EXOC3L4-201ENST00000380069 2293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
TGFB1P01137 TPRA1-202ENST00000355552 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
TGFB1P01137 SECTM1-201ENST00000269389 2235 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
TGFB1P01137 MSANTD2-203ENST00000524950 1109 ntTSL 2 BASIC25.01■■□□□ 1.59
TGFB1P01137 DUX4L28-201ENST00000623687 678 ntBASIC25.01■■□□□ 1.59
TGFB1P01137 GTF3C4-202ENST00000483873 1417 ntTSL 3 BASIC25.01■■□□□ 1.59
TGFB1P01137 SIGMAR1-203ENST00000378892 1743 ntTSL 2 BASIC25■■□□□ 1.59
TGFB1P01137 TERF2-207ENST00000567296 1129 ntTSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
TGFB1P01137 HNRNPAB-204ENST00000504898 1785 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
TGFB1P01137 ATF4-201ENST00000337304 2019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
TGFB1P01137 RUNX2-205ENST00000465038 1770 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC24.99■■□□□ 1.59
TGFB1P01137 ZFP90-204ENST00000564323 560 ntTSL 4 BASIC24.99■■□□□ 1.59
TGFB1P01137 ZFP90-219ENST00000611381 695 ntTSL 1 (best) BASIC24.99■■□□□ 1.59
TGFB1P01137 PSMG4-202ENST00000380305 489 ntTSL 5 BASIC24.98■■□□□ 1.59
TGFB1P01137 FAM185A-202ENST00000413034 1179 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC24.98■■□□□ 1.59
TGFB1P01137 NAA50-207ENST00000493900 962 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC24.98■■□□□ 1.59
TGFB1P01137 SHF-206ENST00000560471 2499 ntTSL 5 BASIC24.98■■□□□ 1.59
TGFB1P01137 SP8-201ENST00000361443 1714 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
TGFB1P01137 NKIRAS2-202ENST00000316082 833 ntTSL 5 BASIC24.97■■□□□ 1.59
TGFB1P01137 ENKD1-201ENST00000243878 1579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
TGFB1P01137 TPI1-201ENST00000229270 1763 ntTSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
TGFB1P01137 PXDC1-202ENST00000380283 2190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
TGFB1P01137 TOMM40-201ENST00000252487 1707 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
TGFB1P01137 TOMM40-202ENST00000405636 1709 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
TGFB1P01137 MIR3665-201ENST00000578708 105 ntBASIC24.96■■□□□ 1.59
TGFB1P01137 TXNL4A-210ENST00000591711 669 ntTSL 2 BASIC24.96■■□□□ 1.59
TGFB1P01137 AL139393.2-201ENST00000608721 2025 ntBASIC24.96■■□□□ 1.59
TGFB1P01137 AP006261.1-201ENST00000584783 668 ntBASIC24.95■■□□□ 1.58
TGFB1P01137 MARCH11-201ENST00000332432 1741 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.95■■□□□ 1.58
TGFB1P01137 PQLC1-203ENST00000397778 2555 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.58
TGFB1P01137 GRK6-206ENST00000507633 1660 ntTSL 5 BASIC24.94■■□□□ 1.58
TGFB1P01137 ARHGAP22-202ENST00000374170 2107 ntTSL 5 BASIC24.94■■□□□ 1.58
TGFB1P01137 HDGF-210ENST00000537739 2073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
TGFB1P01137 AP002884.3-203ENST00000419895 1711 ntTSL 2 BASIC24.94■■□□□ 1.58
TGFB1P01137 PPP1R14B-201ENST00000309318 982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
TGFB1P01137 MAD2L2-205ENST00000376669 864 ntTSL 3 BASIC24.93■■□□□ 1.58
TGFB1P01137 SLC30A10-202ENST00000366926 1915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 19.8 ms