Protein–RNA interactions for Protein: P00374

DHFR, Dihydrofolate reductase, humanhuman

Predictions only

Length 187 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
DHFRP00374 CSNK1E-203ENST00000396832 2791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
DHFRP00374 NFYB-205ENST00000551727 1727 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.62■■□□□ 1.21
DHFRP00374 SPATA5L1-208ENST00000638607 1863 ntTSL 2 BASIC22.62■■□□□ 1.21
DHFRP00374 TMEM187-201ENST00000369982 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
DHFRP00374 HOXB3-210ENST00000489475 1845 ntTSL 2 BASIC22.61■■□□□ 1.21
DHFRP00374 MAP3K5-201ENST00000359015 5197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
DHFRP00374 PLEKHF1-201ENST00000436066 2084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
DHFRP00374 TARBP1-201ENST00000040877 5130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
DHFRP00374 MTCH1-202ENST00000373627 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
DHFRP00374 FRAT2-201ENST00000371019 2213 ntAPPRIS P1 BASIC22.59■■□□□ 1.21
DHFRP00374 ZNF768-201ENST00000380412 2315 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
DHFRP00374 ANKRD65-203ENST00000454272 1506 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.59■■□□□ 1.21
DHFRP00374 IHH-201ENST00000295731 2023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
DHFRP00374 TCF24-201ENST00000563496 2450 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.57■■□□□ 1.2
DHFRP00374 RAB40C-204ENST00000538492 2569 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.56■■□□□ 1.2
DHFRP00374 C16orf72-201ENST00000327827 5953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
DHFRP00374 PLPPR3-201ENST00000359894 2387 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
DHFRP00374 PGM5-201ENST00000396392 1782 ntTSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
DHFRP00374 VIPR2-203ENST00000402066 1926 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.56■■□□□ 1.2
DHFRP00374 RASSF5-204ENST00000580449 1932 ntTSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
DHFRP00374 POU3F3-201ENST00000361360 3064 ntAPPRIS P1 BASIC22.56■■□□□ 1.2
DHFRP00374 SKOR2-203ENST00000620245 3048 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.55■■□□□ 1.2
DHFRP00374 CD151-202ENST00000397420 1648 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
DHFRP00374 HNRNPAB-204ENST00000504898 1785 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
DHFRP00374 ARTN-203ENST00000414809 1943 ntAPPRIS P4 TSL 3 BASIC22.55■■□□□ 1.2
DHFRP00374 FADD-201ENST00000301838 1841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
DHFRP00374 FGF18-201ENST00000274625 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
DHFRP00374 KCNC3-201ENST00000376959 5447 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.54■■□□□ 1.2
DHFRP00374 ALYREF-202ENST00000505490 1088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
DHFRP00374 CYBA-201ENST00000261623 797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
DHFRP00374 CCND3-202ENST00000372988 2133 ntTSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
DHFRP00374 CYB5R3-201ENST00000352397 2124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
DHFRP00374 SYNGR1-202ENST00000318801 1361 ntTSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
DHFRP00374 CAPN10-208ENST00000404753 2570 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.52■■□□□ 1.2
DHFRP00374 YAP1-204ENST00000526343 2393 ntTSL 5 BASIC22.52■■□□□ 1.19
DHFRP00374 PLBD2-202ENST00000545182 2321 ntTSL 2 BASIC22.51■■□□□ 1.19
DHFRP00374 HNRNPAB-202ENST00000358344 1796 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
DHFRP00374 TMEM55B-201ENST00000250489 1961 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
DHFRP00374 RAB26-201ENST00000210187 1675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
DHFRP00374 DSG2-201ENST00000261590 5831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
DHFRP00374 OTUD5-202ENST00000376488 2692 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
DHFRP00374 GIPC1-202ENST00000393028 1483 ntTSL 3 BASIC22.49■■□□□ 1.19
DHFRP00374 CNIH2-203ENST00000528852 1524 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
DHFRP00374 PRELID2-202ENST00000394450 1102 ntTSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
DHFRP00374 ANKRD53-201ENST00000272421 2185 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
DHFRP00374 DRD5P2-201ENST00000421395 2012 ntBASIC22.48■■□□□ 1.19
DHFRP00374 GTF2IP1-204ENST00000616377 2632 ntTSL 2 BASIC22.48■■□□□ 1.19
DHFRP00374 PPP1R26-201ENST00000356818 4932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
DHFRP00374 TOP2B-204ENST00000435706 5389 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
DHFRP00374 DEDD-212ENST00000545495 2329 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.47■■□□□ 1.19
DHFRP00374 EVC-203ENST00000509451 1960 ntTSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
DHFRP00374 CMAS-201ENST00000229329 1787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
DHFRP00374 LRRC61-202ENST00000359623 1877 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.47■■□□□ 1.19
DHFRP00374 SPTSSA-201ENST00000298130 2777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
DHFRP00374 ZNRF2P1-201ENST00000441407 443 ntBASIC22.46■■□□□ 1.19
DHFRP00374 DVL3-201ENST00000313143 5254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
DHFRP00374 SERPING1-205ENST00000403558 2231 ntTSL 5 BASIC22.46■■□□□ 1.19
DHFRP00374 HYAL2-202ENST00000395139 2136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
DHFRP00374 NXPH3-201ENST00000328741 2179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
DHFRP00374 CAMKK1-201ENST00000158166 2459 ntTSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
DHFRP00374 AGTRAP-204ENST00000376637 1067 ntTSL 2 BASIC22.45■■□□□ 1.18
DHFRP00374 CTDNEP1-201ENST00000318988 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
DHFRP00374 KCTD17-209ENST00000610767 1502 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC22.44■■□□□ 1.18
DHFRP00374 MORF4L1-202ENST00000379535 2274 ntTSL 2 BASIC22.43■■□□□ 1.18
DHFRP00374 LY6K-202ENST00000518841 855 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.43■■□□□ 1.18
DHFRP00374 RHEB-201ENST00000262187 2075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
DHFRP00374 TNFSF12-201ENST00000293825 1553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
DHFRP00374 RASSF8-202ENST00000381352 2320 ntTSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
DHFRP00374 AL135925.1-201ENST00000605920 1701 ntBASIC22.41■■□□□ 1.18
DHFRP00374 COMMD7-201ENST00000278980 1900 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
DHFRP00374 C11orf95-202ENST00000433688 5716 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.39■■□□□ 1.17
DHFRP00374 RPUSD1-207ENST00000565809 1918 ntTSL 2 BASIC22.39■■□□□ 1.17
DHFRP00374 ABL2-203ENST00000392043 2140 ntTSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
DHFRP00374 GRIN2D-201ENST00000263269 5093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
DHFRP00374 PTPA-202ENST00000347048 1989 ntTSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
DHFRP00374 MSX1-201ENST00000382723 1939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
DHFRP00374 ST6GALNAC6-204ENST00000373144 2406 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
DHFRP00374 AJAP1-201ENST00000378190 2383 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.38■■□□□ 1.17
DHFRP00374 TAZ-213ENST00000601016 1889 ntTSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
DHFRP00374 DDX42-201ENST00000359353 2783 ntTSL 5 BASIC22.37■■□□□ 1.17
DHFRP00374 MFSD12-202ENST00000389395 2039 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
DHFRP00374 AEBP2-204ENST00000398864 5099 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
DHFRP00374 SHD-201ENST00000543264 2577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
DHFRP00374 OTUD5-203ENST00000396743 2682 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
DHFRP00374 SLCO3A1-201ENST00000318445 5115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
DHFRP00374 DNAJB2-202ENST00000392086 1946 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.35■■□□□ 1.17
DHFRP00374 OXSR1-203ENST00000446845 1908 ntTSL 5 BASIC22.35■■□□□ 1.17
DHFRP00374 SLC9A3R2-201ENST00000424542 2194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
DHFRP00374 MAPK1-202ENST00000398822 1487 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
DHFRP00374 AL139393.2-201ENST00000608721 2025 ntBASIC22.33■■□□□ 1.17
DHFRP00374 RNF130-201ENST00000261947 1766 ntTSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
DHFRP00374 CACNG7-203ENST00000391767 2688 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.33■■□□□ 1.17
DHFRP00374 NPAS3-203ENST00000357798 2763 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
DHFRP00374 FANCE-201ENST00000229769 2554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.16
DHFRP00374 DNAJC21-201ENST00000342382 2309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
DHFRP00374 RDX-210ENST00000530301 1549 ntTSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
DHFRP00374 SLC16A3-214ENST00000582743 2002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
DHFRP00374 LINC01578-203ENST00000554669 578 ntTSL 5 BASIC22.31■■□□□ 1.16
DHFRP00374 SPG21-201ENST00000204566 1822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
DHFRP00374 ANO1-202ENST00000355303 4790 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 30.4 ms