Protein–RNA interactions for Protein: O95758

PTBP3, Polypyrimidine tract-binding protein 3, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 552 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PTBP3O95758 NAA50-207ENST00000493900 962 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC22.34■■□□□ 1.17
PTBP3O95758 RPS2-209ENST00000529806 993 ntTSL 3 BASIC22.34■■□□□ 1.17
PTBP3O95758 AC010864.1-201ENST00000609407 1511 ntBASIC22.34■■□□□ 1.17
PTBP3O95758 AL162393.1-201ENST00000437852 946 ntBASIC22.33■■□□□ 1.17
PTBP3O95758 CARS2-201ENST00000257347 1879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
PTBP3O95758 SCX-201ENST00000567180 999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
PTBP3O95758 AP000547.3-202ENST00000592107 1019 ntTSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
PTBP3O95758 MYLIP-202ENST00000356840 1666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
PTBP3O95758 AGAP3-216ENST00000479901 1881 ntTSL 5 BASIC22.32■■□□□ 1.16
PTBP3O95758 ECI1-207ENST00000570258 1512 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.31■■□□□ 1.16
PTBP3O95758 GAL3ST1-205ENST00000406361 1819 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.31■■□□□ 1.16
PTBP3O95758 HNRNPAB-202ENST00000358344 1796 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
PTBP3O95758 ATP6V1E2-204ENST00000522587 1559 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.3■■□□□ 1.16
PTBP3O95758 ZNF513-201ENST00000323703 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
PTBP3O95758 NKIRAS2-202ENST00000316082 833 ntTSL 5 BASIC22.3■■□□□ 1.16
PTBP3O95758 TERF2-207ENST00000567296 1129 ntTSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
PTBP3O95758 SLC52A2-201ENST00000329994 1896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
PTBP3O95758 NOXA1-201ENST00000341349 1678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
PTBP3O95758 AGAP1-202ENST00000336665 5427 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
PTBP3O95758 MTNR1A-201ENST00000307161 1289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
PTBP3O95758 PSMG4-202ENST00000380305 489 ntTSL 5 BASIC22.29■■□□□ 1.16
PTBP3O95758 AC004080.1-201ENST00000523608 757 ntTSL 2 BASIC22.29■■□□□ 1.16
PTBP3O95758 TXNL4A-210ENST00000591711 669 ntTSL 2 BASIC22.29■■□□□ 1.16
PTBP3O95758 GTF3C4-202ENST00000483873 1417 ntTSL 3 BASIC22.29■■□□□ 1.16
PTBP3O95758 ATPAF1-202ENST00000371937 1827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
PTBP3O95758 PHOX2A-201ENST00000298231 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
PTBP3O95758 CHPT1-201ENST00000229266 1585 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
PTBP3O95758 PPP1R14B-201ENST00000309318 982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
PTBP3O95758 AC087741.3-201ENST00000624270 1347 ntBASIC22.27■■□□□ 1.16
PTBP3O95758 FOXA2-202ENST00000419308 2422 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
PTBP3O95758 SHOX2-204ENST00000483851 1866 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.26■■□□□ 1.15
PTBP3O95758 STUB1-205ENST00000565677 1560 ntTSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
PTBP3O95758 TM6SF1-202ENST00000322019 2074 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
PTBP3O95758 AMN-201ENST00000299155 1907 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
PTBP3O95758 CCDC88C-205ENST00000553403 1651 ntTSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
PTBP3O95758 BCL3-201ENST00000164227 2038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
PTBP3O95758 MAD2L2-205ENST00000376669 864 ntTSL 3 BASIC22.24■■□□□ 1.15
PTBP3O95758 RASSF8-202ENST00000381352 2320 ntTSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
PTBP3O95758 ABHD17A-202ENST00000292577 1757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
PTBP3O95758 MACROD1-201ENST00000255681 1205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
PTBP3O95758 UBE2S-203ENST00000589978 496 ntTSL 5 BASIC22.23■■□□□ 1.15
PTBP3O95758 DCBLD1-201ENST00000296955 1979 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
PTBP3O95758 TCEA2-202ENST00000343484 1235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
PTBP3O95758 ANKRD13D-211ENST00000511455 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
PTBP3O95758 HNRNPAB-204ENST00000504898 1785 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
PTBP3O95758 CGREF1-203ENST00000402394 1906 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.21■■□□□ 1.15
PTBP3O95758 KCTD17-202ENST00000403888 1763 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
PTBP3O95758 CIC-201ENST00000160740 6111 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.2■■□□□ 1.14
PTBP3O95758 PARD6A-202ENST00000458121 1260 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
PTBP3O95758 NEUROG2-201ENST00000313341 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
PTBP3O95758 AC108673.1-201ENST00000510422 1159 ntBASIC22.19■■□□□ 1.14
PTBP3O95758 RDX-210ENST00000530301 1549 ntTSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
PTBP3O95758 MKNK2-202ENST00000309340 1744 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
PTBP3O95758 RCC1L-202ENST00000614461 2419 ntTSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
PTBP3O95758 MBD2-201ENST00000256429 5188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
PTBP3O95758 POLR1D-201ENST00000302979 1166 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
PTBP3O95758 JAG2-201ENST00000331782 5835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
PTBP3O95758 BCL7C-201ENST00000215115 1740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
PTBP3O95758 CDKN2A-201ENST00000304494 1218 ntTSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
PTBP3O95758 COX4I1-203ENST00000562336 873 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.17■■□□□ 1.14
PTBP3O95758 FSD1L-208ENST00000495708 1906 ntTSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
PTBP3O95758 ESRRA-201ENST00000000442 2215 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
PTBP3O95758 KLC2-205ENST00000394078 1557 ntTSL 5 BASIC22.16■■□□□ 1.14
PTBP3O95758 AC044849.2-201ENST00000606596 710 ntBASIC22.16■■□□□ 1.14
PTBP3O95758 AP002884.3-203ENST00000419895 1711 ntTSL 2 BASIC22.16■■□□□ 1.14
PTBP3O95758 HNRNPAB-205ENST00000506259 1674 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
PTBP3O95758 SIRT3-201ENST00000382743 2543 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
PTBP3O95758 ENKD1-201ENST00000243878 1579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
PTBP3O95758 FGFRL1-205ENST00000510644 2304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
PTBP3O95758 RCE1-201ENST00000309657 1485 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
PTBP3O95758 RNF130-205ENST00000521389 2263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
PTBP3O95758 MISP3-202ENST00000587086 1535 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
PTBP3O95758 RPS2P35-201ENST00000443417 897 ntBASIC22.13■■□□□ 1.13
PTBP3O95758 ST6GALNAC6-203ENST00000373142 2448 ntTSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
PTBP3O95758 GIPC1-203ENST00000393033 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
PTBP3O95758 ZNF787-203ENST00000610935 1925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
PTBP3O95758 GRK6-206ENST00000507633 1660 ntTSL 5 BASIC22.13■■□□□ 1.13
PTBP3O95758 IRX1-201ENST00000302006 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
PTBP3O95758 EBAG9-202ENST00000395785 1467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
PTBP3O95758 VAX2-201ENST00000234392 1147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
PTBP3O95758 AP000911.1-206ENST00000531938 711 ntTSL 3 BASIC22.12■■□□□ 1.13
PTBP3O95758 AC009097.4-201ENST00000566738 777 ntTSL 2 BASIC22.12■■□□□ 1.13
PTBP3O95758 MIR6090-201ENST00000622481 60 ntBASIC22.12■■□□□ 1.13
PTBP3O95758 CUL4A-202ENST00000375440 2364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
PTBP3O95758 MATK-201ENST00000310132 2133 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
PTBP3O95758 YAP1-204ENST00000526343 2393 ntTSL 5 BASIC22.11■■□□□ 1.13
PTBP3O95758 CUEDC1-201ENST00000360238 2193 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.11■■□□□ 1.13
PTBP3O95758 TMEM268-201ENST00000288502 2314 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
PTBP3O95758 PQLC1-202ENST00000357575 2475 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.11■■□□□ 1.13
PTBP3O95758 EFNA3-201ENST00000368408 1782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
PTBP3O95758 FOXE3-201ENST00000335071 1981 ntAPPRIS P1 BASIC22.1■■□□□ 1.13
PTBP3O95758 RUNX2-205ENST00000465038 1770 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC22.1■■□□□ 1.13
PTBP3O95758 DTNBP1-202ENST00000344537 1403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
PTBP3O95758 MFAP2-202ENST00000375535 1260 ntTSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
PTBP3O95758 EMC10-202ENST00000376918 2014 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
PTBP3O95758 CCZ1B-215ENST00000626257 2211 ntTSL 2 BASIC22.1■■□□□ 1.13
PTBP3O95758 SMIM12-205ENST00000456842 918 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.09■■□□□ 1.13
PTBP3O95758 PURG-201ENST00000339382 2693 ntTSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
PTBP3O95758 NGB-201ENST00000298352 1884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
PTBP3O95758 HOXD13-201ENST00000392539 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 14.5 ms