Protein–RNA interactions for Protein: O94955

RHOBTB3, Rho-related BTB domain-containing protein 3, humanhuman

Predictions only

Length 611 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RHOBTB3O94955 UBALD2-203ENST00000589240 660 ntTSL 2 BASIC29.26■■■□□ 2.27
RHOBTB3O94955 SHF-206ENST00000560471 2499 ntTSL 5 BASIC29.25■■■□□ 2.27
RHOBTB3O94955 GSTP1-202ENST00000398606 965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.25■■■□□ 2.27
RHOBTB3O94955 ARTN-204ENST00000438616 889 ntTSL 1 (best) BASIC29.25■■■□□ 2.27
RHOBTB3O94955 TPGS1-201ENST00000359315 1114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.23■■■□□ 2.27
RHOBTB3O94955 EFNA1-202ENST00000368407 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.23■■■□□ 2.27
RHOBTB3O94955 RDX-210ENST00000530301 1549 ntTSL 1 (best) BASIC29.23■■■□□ 2.27
RHOBTB3O94955 BCL7C-201ENST00000215115 1740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.23■■■□□ 2.27
RHOBTB3O94955 DUSP14-206ENST00000617516 1537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.21■■■□□ 2.27
RHOBTB3O94955 GSC2-201ENST00000086933 1033 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.21■■■□□ 2.27
RHOBTB3O94955 SIGMAR1-203ENST00000378892 1743 ntTSL 2 BASIC29.2■■■□□ 2.27
RHOBTB3O94955 ZNF787-203ENST00000610935 1925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.2■■■□□ 2.27
RHOBTB3O94955 AL139393.1-201ENST00000417479 573 ntTSL 5 BASIC29.2■■■□□ 2.26
RHOBTB3O94955 ARHGAP22-202ENST00000374170 2107 ntTSL 5 BASIC29.2■■■□□ 2.26
RHOBTB3O94955 LY6K-203ENST00000519387 963 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC29.19■■■□□ 2.26
RHOBTB3O94955 PLEKHG6-206ENST00000536531 1683 ntTSL 1 (best) BASIC29.18■■■□□ 2.26
RHOBTB3O94955 HSD11B1L-209ENST00000577917 1553 ntTSL 1 (best) BASIC29.18■■■□□ 2.26
RHOBTB3O94955 FSD1L-208ENST00000495708 1906 ntTSL 1 (best) BASIC29.18■■■□□ 2.26
RHOBTB3O94955 HOXB3-212ENST00000498678 2196 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.18■■■□□ 2.26
RHOBTB3O94955 MARCH2-202ENST00000381035 1192 ntTSL 5 BASIC29.18■■■□□ 2.26
RHOBTB3O94955 STUB1-205ENST00000565677 1560 ntTSL 1 (best) BASIC29.18■■■□□ 2.26
RHOBTB3O94955 PDPK1-203ENST00000389224 2416 ntTSL 2 BASIC29.18■■■□□ 2.26
RHOBTB3O94955 TNK2-201ENST00000333602 5270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.17■■■□□ 2.26
RHOBTB3O94955 FEV-201ENST00000295727 1879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.17■■■□□ 2.26
RHOBTB3O94955 MZT2B-202ENST00000409255 769 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC29.17■■■□□ 2.26
RHOBTB3O94955 FTCDNL1-201ENST00000416668 944 ntTSL 1 (best) BASIC29.17■■■□□ 2.26
RHOBTB3O94955 MKNK2-202ENST00000309340 1744 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.16■■■□□ 2.26
RHOBTB3O94955 SLC30A10-202ENST00000366926 1915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.14■■■□□ 2.26
RHOBTB3O94955 ATF4-201ENST00000337304 2019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.14■■■□□ 2.26
RHOBTB3O94955 AL139393.2-201ENST00000608721 2025 ntBASIC29.13■■■□□ 2.25
RHOBTB3O94955 MYLIP-202ENST00000356840 1666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.12■■■□□ 2.25
RHOBTB3O94955 PQLC1-203ENST00000397778 2555 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.11■■■□□ 2.25
RHOBTB3O94955 HDGF-210ENST00000537739 2073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.11■■■□□ 2.25
RHOBTB3O94955 ECI1-207ENST00000570258 1512 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC29.11■■■□□ 2.25
RHOBTB3O94955 AC092755.2-201ENST00000560199 402 ntTSL 3 BASIC29.11■■■□□ 2.25
RHOBTB3O94955 HNRNPAB-205ENST00000506259 1674 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.11■■■□□ 2.25
RHOBTB3O94955 PSMG4-205ENST00000419065 629 ntTSL 2 BASIC29.1■■■□□ 2.25
RHOBTB3O94955 ABHD17A-202ENST00000292577 1757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.1■■■□□ 2.25
RHOBTB3O94955 COL13A1-214ENST00000522165 2061 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC29.09■■■□□ 2.25
RHOBTB3O94955 FZD2-201ENST00000315323 2112 ntAPPRIS P1 BASIC29.09■■■□□ 2.25
RHOBTB3O94955 BATF3-201ENST00000243440 980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.07■■■□□ 2.24
RHOBTB3O94955 RUNX2-205ENST00000465038 1770 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC29.07■■■□□ 2.24
RHOBTB3O94955 SPATA5L1-208ENST00000638607 1863 ntTSL 2 BASIC29.06■■■□□ 2.24
RHOBTB3O94955 CIB1-201ENST00000328649 1247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.06■■■□□ 2.24
RHOBTB3O94955 CIB1-202ENST00000612800 1096 ntTSL 1 (best) BASIC29.06■■■□□ 2.24
RHOBTB3O94955 DPF1-202ENST00000412732 2303 ntTSL 1 (best) BASIC29.05■■■□□ 2.24
RHOBTB3O94955 MTCH1-202ENST00000373627 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.05■■■□□ 2.24
RHOBTB3O94955 NMB-202ENST00000394588 1017 ntTSL 1 (best) BASIC29.05■■■□□ 2.24
RHOBTB3O94955 NOXA1-201ENST00000341349 1678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.05■■■□□ 2.24
RHOBTB3O94955 TESK1-201ENST00000336395 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.04■■■□□ 2.24
RHOBTB3O94955 ITGA9-203ENST00000422441 2282 ntTSL 1 (best) BASIC29.03■■■□□ 2.24
RHOBTB3O94955 SUZ12P1-203ENST00000578195 985 ntBASIC29.03■■■□□ 2.24
RHOBTB3O94955 VEGFA-231ENST00000640499 1188 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.03■■■□□ 2.24
RHOBTB3O94955 MARCH11-201ENST00000332432 1741 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.03■■■□□ 2.24
RHOBTB3O94955 IL17D-201ENST00000304920 1861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.02■■■□□ 2.24
RHOBTB3O94955 ATP6V1E2-204ENST00000522587 1559 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC29.02■■■□□ 2.24
RHOBTB3O94955 AL133346.1-201ENST00000435287 495 ntTSL 2 BASIC29.02■■■□□ 2.24
RHOBTB3O94955 AC012615.2-201ENST00000586259 447 ntTSL 4 BASIC29.02■■■□□ 2.24
RHOBTB3O94955 LMO1-202ENST00000428101 1038 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC29■■■□□ 2.23
RHOBTB3O94955 MISP3-201ENST00000269720 1424 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC29■■■□□ 2.23
RHOBTB3O94955 MNX1-207ENST00000543409 1620 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.99■■■□□ 2.23
RHOBTB3O94955 HNRNPAB-204ENST00000504898 1785 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC28.99■■■□□ 2.23
RHOBTB3O94955 MIR762-201ENST00000390236 83 ntBASIC28.99■■■□□ 2.23
RHOBTB3O94955 SEC61G-204ENST00000450622 512 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.99■■■□□ 2.23
RHOBTB3O94955 AC012629.2-201ENST00000606513 377 ntTSL 5 BASIC28.99■■■□□ 2.23
RHOBTB3O94955 CHPT1-201ENST00000229266 1585 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.99■■■□□ 2.23
RHOBTB3O94955 ENKD1-201ENST00000243878 1579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.99■■■□□ 2.23
RHOBTB3O94955 LANCL3-203ENST00000614025 1469 ntTSL 2 BASIC28.98■■■□□ 2.23
RHOBTB3O94955 GRK6-206ENST00000507633 1660 ntTSL 5 BASIC28.98■■■□□ 2.23
RHOBTB3O94955 ADAP1-201ENST00000265846 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.97■■■□□ 2.23
RHOBTB3O94955 SHARPIN-202ENST00000398712 1765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.97■■■□□ 2.23
RHOBTB3O94955 COL13A1-213ENST00000520267 2276 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.97■■■□□ 2.23
RHOBTB3O94955 THAP11-201ENST00000303596 2114 ntAPPRIS P1 BASIC28.96■■■□□ 2.23
RHOBTB3O94955 ZFAND2B-208ENST00000409594 2021 ntTSL 2 BASIC28.96■■■□□ 2.23
RHOBTB3O94955 AMZ2-201ENST00000359783 1722 ntTSL 5 BASIC28.95■■■□□ 2.23
RHOBTB3O94955 HOPX-206ENST00000503639 1248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.95■■■□□ 2.22
RHOBTB3O94955 PDCD2-215ENST00000614056 1287 ntTSL 2 BASIC28.95■■■□□ 2.22
RHOBTB3O94955 CHML-205ENST00000638160 705 ntTSL 3 BASIC28.95■■■□□ 2.22
RHOBTB3O94955 TMEM9-201ENST00000367330 1959 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.93■■■□□ 2.22
RHOBTB3O94955 TOMM40-201ENST00000252487 1707 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.91■■■□□ 2.22
RHOBTB3O94955 TOMM40-202ENST00000405636 1709 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.91■■■□□ 2.22
RHOBTB3O94955 H2AFV-205ENST00000381124 628 ntTSL 3 BASIC28.91■■■□□ 2.22
RHOBTB3O94955 GFRA4-202ENST00000319242 900 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC28.9■■■□□ 2.22
RHOBTB3O94955 PLSCR3-209ENST00000574401 2032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.9■■■□□ 2.22
RHOBTB3O94955 ACTR3B-201ENST00000256001 2216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.88■■■□□ 2.21
RHOBTB3O94955 EBAG9-202ENST00000395785 1467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.88■■■□□ 2.21
RHOBTB3O94955 WSB2-201ENST00000315436 2646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.88■■■□□ 2.21
RHOBTB3O94955 ECI1-203ENST00000562238 948 ntTSL 1 (best) BASIC28.86■■■□□ 2.21
RHOBTB3O94955 AP000547.3-202ENST00000592107 1019 ntTSL 1 (best) BASIC28.86■■■□□ 2.21
RHOBTB3O94955 TNFSF12-201ENST00000293825 1553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.86■■■□□ 2.21
RHOBTB3O94955 RCC1L-201ENST00000610322 2300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.86■■■□□ 2.21
RHOBTB3O94955 HNRNPLP2-201ENST00000568980 1570 ntBASIC28.85■■■□□ 2.21
RHOBTB3O94955 SCX-201ENST00000567180 999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.85■■■□□ 2.21
RHOBTB3O94955 AP002884.3-203ENST00000419895 1711 ntTSL 2 BASIC28.85■■■□□ 2.21
RHOBTB3O94955 RCC1L-205ENST00000618035 1409 ntTSL 1 (best) BASIC28.85■■■□□ 2.21
RHOBTB3O94955 AC127502.1-201ENST00000399971 1502 ntBASIC28.84■■■□□ 2.21
RHOBTB3O94955 CLK2-201ENST00000355560 2120 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC28.83■■■□□ 2.21
RHOBTB3O94955 TNFRSF25-204ENST00000356876 1625 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.83■■■□□ 2.21
RHOBTB3O94955 CAPNS1-201ENST00000246533 1918 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.82■■■□□ 2.2
RHOBTB3O94955 CHST14-202ENST00000559991 1968 ntTSL 5 BASIC28.82■■■□□ 2.2
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 11.9 ms