Protein–RNA interactions for Protein: O94953

KDM4B, Lysine-specific demethylase 4B, humanhuman

Predictions only

Length 1,096 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
KDM4BO94953 ZSWIM6-201ENST00000252744 5501 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.81■■□□□ 1.24
KDM4BO94953 RUNDC3A-206ENST00000590941 1675 ntTSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
KDM4BO94953 PLSCR3-209ENST00000574401 2032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
KDM4BO94953 HDAC3-201ENST00000305264 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
KDM4BO94953 BMP7-204ENST00000450594 1857 ntTSL 2 BASIC22.8■■□□□ 1.24
KDM4BO94953 CDK2AP1-203ENST00000535979 1281 ntTSL 3 BASIC22.8■■□□□ 1.24
KDM4BO94953 AL135925.1-201ENST00000605920 1701 ntBASIC22.79■■□□□ 1.24
KDM4BO94953 TCEA2-204ENST00000395053 1733 ntTSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
KDM4BO94953 COL13A1-214ENST00000522165 2061 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.78■■□□□ 1.24
KDM4BO94953 IFFO2-203ENST00000455833 6188 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.78■■□□□ 1.24
KDM4BO94953 PACS2-201ENST00000325438 3708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
KDM4BO94953 HNRNPAB-202ENST00000358344 1796 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
KDM4BO94953 QKI-207ENST00000453779 5685 ntTSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
KDM4BO94953 KCNQ5-204ENST00000370392 1469 ntTSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
KDM4BO94953 MTCH1-201ENST00000373616 2006 ntTSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
KDM4BO94953 SMARCD3-203ENST00000392811 2018 ntTSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
KDM4BO94953 FAAP20-204ENST00000400919 1413 ntTSL 3 BASIC22.75■■□□□ 1.23
KDM4BO94953 AC079305.1-201ENST00000428541 499 ntTSL 3 BASIC22.75■■□□□ 1.23
KDM4BO94953 TP53I13-201ENST00000301057 1530 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
KDM4BO94953 TSPAN11-203ENST00000545802 1649 ntTSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
KDM4BO94953 GKAP1-203ENST00000376371 1778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
KDM4BO94953 AC142086.6-201ENST00000621154 1765 ntBASIC22.74■■□□□ 1.23
KDM4BO94953 PICK1-201ENST00000356976 2055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
KDM4BO94953 GPR75-ASB3-201ENST00000406625 2113 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.72■■□□□ 1.23
KDM4BO94953 AL133380.1-201ENST00000506013 324 ntBASIC22.72■■□□□ 1.23
KDM4BO94953 FGF18-201ENST00000274625 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
KDM4BO94953 RHOQ-201ENST00000238738 2975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
KDM4BO94953 WASH5P-204ENST00000632292 975 ntBASIC22.71■■□□□ 1.23
KDM4BO94953 ARMC10-205ENST00000428183 2445 ntTSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
KDM4BO94953 RNF150-204ENST00000507500 1530 ntTSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
KDM4BO94953 SPATA5L1-208ENST00000638607 1863 ntTSL 2 BASIC22.71■■□□□ 1.23
KDM4BO94953 AP003068.2-202ENST00000526623 1662 ntTSL 2 BASIC22.7■■□□□ 1.22
KDM4BO94953 WHRN-203ENST00000374057 1718 ntTSL 2 BASIC22.69■■□□□ 1.22
KDM4BO94953 SHARPIN-202ENST00000398712 1765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
KDM4BO94953 SHOX2-204ENST00000483851 1866 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.68■■□□□ 1.22
KDM4BO94953 AVEN-201ENST00000306730 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
KDM4BO94953 PLSCR3-214ENST00000619711 2066 ntTSL 5 BASIC22.67■■□□□ 1.22
KDM4BO94953 EFEMP2-201ENST00000307998 2034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
KDM4BO94953 MTCH1-202ENST00000373627 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
KDM4BO94953 DHRS13-202ENST00000394901 2037 ntTSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
KDM4BO94953 ADNP-AS1-201ENST00000558899 927 ntTSL 3 BASIC22.66■■□□□ 1.22
KDM4BO94953 MNX1-201ENST00000252971 2174 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
KDM4BO94953 PCSK6-216ENST00000615296 2921 ntTSL 5 BASIC22.64■■□□□ 1.21
KDM4BO94953 CCM2L-201ENST00000262659 2523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
KDM4BO94953 RRNAD1-201ENST00000368216 2254 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
KDM4BO94953 SCCPDH-201ENST00000366510 2503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
KDM4BO94953 TMEM185A-207ENST00000600449 2840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
KDM4BO94953 AC135731.1-201ENST00000569415 2548 ntBASIC22.63■■□□□ 1.21
KDM4BO94953 CDH24-206ENST00000610348 2037 ntTSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
KDM4BO94953 ATPAF1-202ENST00000371937 1827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
KDM4BO94953 CBX4-202ENST00000448310 718 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC22.62■■□□□ 1.21
KDM4BO94953 GLRX5-201ENST00000331334 1564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
KDM4BO94953 NPB-202ENST00000573081 2154 ntAPPRIS ALT2 BASIC22.62■■□□□ 1.21
KDM4BO94953 TCF24-201ENST00000563496 2450 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.62■■□□□ 1.21
KDM4BO94953 C11orf80-204ENST00000525908 2135 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.61■■□□□ 1.21
KDM4BO94953 EPB41L4B-202ENST00000374566 5800 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
KDM4BO94953 KCNMA1-283ENST00000640523 5425 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.61■■□□□ 1.21
KDM4BO94953 LACTB-201ENST00000261893 1972 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
KDM4BO94953 HAUS7-201ENST00000370210 1593 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.59■■□□□ 1.21
KDM4BO94953 SIGMAR1-205ENST00000477726 840 ntTSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
KDM4BO94953 AC009133.5-201ENST00000562594 473 ntTSL 4 BASIC22.59■■□□□ 1.21
KDM4BO94953 FAM89B-201ENST00000316409 1409 ntTSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
KDM4BO94953 GUSB-202ENST00000421103 1742 ntTSL 2 BASIC22.58■■□□□ 1.21
KDM4BO94953 ATPAF1-201ENST00000329231 1241 ntTSL 2 BASIC22.58■■□□□ 1.21
KDM4BO94953 AL139393.2-201ENST00000608721 2025 ntBASIC22.58■■□□□ 1.2
KDM4BO94953 CGREF1-204ENST00000402550 1575 ntTSL 2 BASIC22.58■■□□□ 1.2
KDM4BO94953 SLC9A3R2-202ENST00000432365 1564 ntTSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.2
KDM4BO94953 IRX1-201ENST00000302006 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.2
KDM4BO94953 TGFBRAP1-202ENST00000393359 5979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
KDM4BO94953 C1orf122-204ENST00000468084 1234 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.57■■□□□ 1.2
KDM4BO94953 NPDC1-201ENST00000371600 2187 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
KDM4BO94953 HOXB3-212ENST00000498678 2196 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.57■■□□□ 1.2
KDM4BO94953 NREP-202ENST00000379671 2581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
KDM4BO94953 MXD3-203ENST00000439742 1483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
KDM4BO94953 MFSD12-201ENST00000355415 2124 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
KDM4BO94953 IL13RA1-201ENST00000371642 1096 ntTSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
KDM4BO94953 RARRES2P7-201ENST00000567349 469 ntBASIC22.55■■□□□ 1.2
KDM4BO94953 PCYT2-206ENST00000571105 1628 ntTSL 5 BASIC22.55■■□□□ 1.2
KDM4BO94953 DRD5P2-201ENST00000421395 2012 ntBASIC22.54■■□□□ 1.2
KDM4BO94953 ZNF276-202ENST00000443381 2267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
KDM4BO94953 CARM1-202ENST00000344150 2722 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.53■■□□□ 1.2
KDM4BO94953 LGALS3-201ENST00000254301 1146 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
KDM4BO94953 ATF4-201ENST00000337304 2019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.19
KDM4BO94953 ZCCHC2-201ENST00000269499 5959 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.51■■□□□ 1.19
KDM4BO94953 GLRB-203ENST00000509282 1757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
KDM4BO94953 NPTXR-202ENST00000640136 1503 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
KDM4BO94953 ZFAND2B-208ENST00000409594 2021 ntTSL 2 BASIC22.5■■□□□ 1.19
KDM4BO94953 RCOR3-202ENST00000367006 2525 ntTSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
KDM4BO94953 SETD8P1-201ENST00000623146 1180 ntBASIC22.5■■□□□ 1.19
KDM4BO94953 NFYB-205ENST00000551727 1727 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.5■■□□□ 1.19
KDM4BO94953 CRIM1-201ENST00000280527 5912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
KDM4BO94953 WTAP-206ENST00000621533 2109 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.49■■□□□ 1.19
KDM4BO94953 BTBD7-201ENST00000298896 2621 ntTSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
KDM4BO94953 FLJ37453-201ENST00000317122 2473 ntTSL 2 BASIC22.49■■□□□ 1.19
KDM4BO94953 SDCCAG3-201ENST00000298537 2314 ntTSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
KDM4BO94953 CACNA1H-201ENST00000348261 8208 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
KDM4BO94953 RDX-210ENST00000530301 1549 ntTSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
KDM4BO94953 HDGF-201ENST00000357325 2380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
KDM4BO94953 CCNG2-201ENST00000316355 5526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
KDM4BO94953 AHSA2-201ENST00000357022 2437 ntTSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 40.6 ms