Protein–RNA interactions for Protein: O76015

KRT38, Keratin, type I cuticular Ha8, humanhuman

Predictions only

Length 456 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
KRT38O76015 BCL7C-201ENST00000215115 1740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.35■■□□□ 1.81
KRT38O76015 AC025431.1-201ENST00000559684 874 ntTSL 3 BASIC26.35■■□□□ 1.81
KRT38O76015 KLF16-203ENST00000592313 508 ntTSL 3 BASIC26.33■■□□□ 1.81
KRT38O76015 GPR75-ASB3-201ENST00000406625 2113 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.32■■□□□ 1.8
KRT38O76015 FAM117A-201ENST00000240364 2365 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.32■■□□□ 1.8
KRT38O76015 NRTN-201ENST00000303212 1109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.32■■□□□ 1.8
KRT38O76015 SMARCD3-203ENST00000392811 2018 ntTSL 1 (best) BASIC26.32■■□□□ 1.8
KRT38O76015 WSB2-201ENST00000315436 2646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.31■■□□□ 1.8
KRT38O76015 ATF4-201ENST00000337304 2019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.31■■□□□ 1.8
KRT38O76015 WHRN-203ENST00000374057 1718 ntTSL 2 BASIC26.31■■□□□ 1.8
KRT38O76015 AL133380.1-201ENST00000506013 324 ntBASIC26.3■■□□□ 1.8
KRT38O76015 NOP53-201ENST00000246802 1528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.29■■□□□ 1.8
KRT38O76015 AGPAT2-202ENST00000371696 1512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.29■■□□□ 1.8
KRT38O76015 LACTB-201ENST00000261893 1972 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.28■■□□□ 1.8
KRT38O76015 ST6GALNAC6-205ENST00000373146 2460 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.28■■□□□ 1.8
KRT38O76015 NRGN-202ENST00000412681 1106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.27■■□□□ 1.8
KRT38O76015 PELI3-203ENST00000524466 1671 ntTSL 1 (best) BASIC26.26■■□□□ 1.79
KRT38O76015 ZNF775-201ENST00000329630 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.26■■□□□ 1.79
KRT38O76015 GAL3ST1-204ENST00000402369 1712 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC26.25■■□□□ 1.79
KRT38O76015 GABRA5-203ENST00000400081 2761 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.25■■□□□ 1.79
KRT38O76015 HOOK2-201ENST00000264827 2603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.25■■□□□ 1.79
KRT38O76015 AC079305.1-201ENST00000428541 499 ntTSL 3 BASIC26.24■■□□□ 1.79
KRT38O76015 PLEKHG6-206ENST00000536531 1683 ntTSL 1 (best) BASIC26.23■■□□□ 1.79
KRT38O76015 CDH24-206ENST00000610348 2037 ntTSL 1 (best) BASIC26.23■■□□□ 1.79
KRT38O76015 TNFSF12-201ENST00000293825 1553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.23■■□□□ 1.79
KRT38O76015 MKNK2-202ENST00000309340 1744 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.22■■□□□ 1.79
KRT38O76015 MNX1-201ENST00000252971 2174 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.22■■□□□ 1.79
KRT38O76015 C9orf40-201ENST00000376854 2327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.22■■□□□ 1.79
KRT38O76015 TCFL5-201ENST00000217162 2453 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.21■■□□□ 1.79
KRT38O76015 TCFL5-202ENST00000335351 2456 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.21■■□□□ 1.79
KRT38O76015 SIGMAR1-205ENST00000477726 840 ntTSL 1 (best) BASIC26.21■■□□□ 1.79
KRT38O76015 LINC01089-207ENST00000538335 630 ntTSL 3 BASIC26.21■■□□□ 1.79
KRT38O76015 CDK2AP1-203ENST00000535979 1281 ntTSL 3 BASIC26.2■■□□□ 1.78
KRT38O76015 FSD1L-208ENST00000495708 1906 ntTSL 1 (best) BASIC26.2■■□□□ 1.78
KRT38O76015 PLSCR3-214ENST00000619711 2066 ntTSL 5 BASIC26.19■■□□□ 1.78
KRT38O76015 CADPS-215ENST00000490353 2669 ntTSL 5 BASIC26.19■■□□□ 1.78
KRT38O76015 DRD5P2-201ENST00000421395 2012 ntBASIC26.19■■□□□ 1.78
KRT38O76015 AC010864.1-201ENST00000609407 1511 ntBASIC26.19■■□□□ 1.78
KRT38O76015 FAM78B-202ENST00000354422 1475 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.18■■□□□ 1.78
KRT38O76015 HOXB3-201ENST00000311626 2642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.18■■□□□ 1.78
KRT38O76015 C1orf122-204ENST00000468084 1234 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.18■■□□□ 1.78
KRT38O76015 PPP3CC-204ENST00000518852 1598 ntTSL 2 BASIC26.18■■□□□ 1.78
KRT38O76015 NFYB-205ENST00000551727 1727 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC26.18■■□□□ 1.78
KRT38O76015 CTBP1-201ENST00000290921 2297 ntTSL 1 (best) BASIC26.18■■□□□ 1.78
KRT38O76015 ABHD17A-202ENST00000292577 1757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.18■■□□□ 1.78
KRT38O76015 ZFAND2B-208ENST00000409594 2021 ntTSL 2 BASIC26.17■■□□□ 1.78
KRT38O76015 PICK1-201ENST00000356976 2055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.17■■□□□ 1.78
KRT38O76015 DHRS13-202ENST00000394901 2037 ntTSL 1 (best) BASIC26.17■■□□□ 1.78
KRT38O76015 EFEMP2-201ENST00000307998 2034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.16■■□□□ 1.78
KRT38O76015 SENP3-201ENST00000321337 2611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.16■■□□□ 1.78
KRT38O76015 CLK2-201ENST00000355560 2120 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC26.16■■□□□ 1.78
KRT38O76015 PURG-201ENST00000339382 2693 ntTSL 1 (best) BASIC26.16■■□□□ 1.78
KRT38O76015 COMMD7-201ENST00000278980 1900 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.16■■□□□ 1.78
KRT38O76015 CAPNS1-217ENST00000629983 799 ntTSL 5 BASIC26.15■■□□□ 1.78
KRT38O76015 LMTK3-202ENST00000600059 5113 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.14■■□□□ 1.78
KRT38O76015 NOG-201ENST00000332822 1892 ntAPPRIS P1 BASIC26.13■■□□□ 1.77
KRT38O76015 AMZ2-201ENST00000359783 1722 ntTSL 5 BASIC26.13■■□□□ 1.77
KRT38O76015 RUNX2-205ENST00000465038 1770 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC26.12■■□□□ 1.77
KRT38O76015 HNRNPAB-205ENST00000506259 1674 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.11■■□□□ 1.77
KRT38O76015 MARCH11-201ENST00000332432 1741 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.1■■□□□ 1.77
KRT38O76015 MFSD12-201ENST00000355415 2124 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.09■■□□□ 1.77
KRT38O76015 ZNF219-201ENST00000360947 3071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.09■■□□□ 1.77
KRT38O76015 UBE2L6-201ENST00000287156 1354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.08■■□□□ 1.77
KRT38O76015 PIK3R2-208ENST00000617642 1446 ntTSL 5 BASIC26.08■■□□□ 1.77
KRT38O76015 STUB1-205ENST00000565677 1560 ntTSL 1 (best) BASIC26.07■■□□□ 1.76
KRT38O76015 GNPTAB-202ENST00000392919 760 ntTSL 1 (best) BASIC26.07■■□□□ 1.76
KRT38O76015 BTBD19-203ENST00000450269 1572 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.07■■□□□ 1.76
KRT38O76015 TCF24-201ENST00000563496 2450 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.07■■□□□ 1.76
KRT38O76015 NPDC1-201ENST00000371600 2187 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.06■■□□□ 1.76
KRT38O76015 ECI1-207ENST00000570258 1512 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.05■■□□□ 1.76
KRT38O76015 ATPAF1-201ENST00000329231 1241 ntTSL 2 BASIC26.04■■□□□ 1.76
KRT38O76015 INPP5A-202ENST00000368593 1432 ntTSL 1 (best) BASIC26.04■■□□□ 1.76
KRT38O76015 CHST14-202ENST00000559991 1968 ntTSL 5 BASIC26.04■■□□□ 1.76
KRT38O76015 NPB-202ENST00000573081 2154 ntAPPRIS ALT2 BASIC26.03■■□□□ 1.76
KRT38O76015 SERPING1-205ENST00000403558 2231 ntTSL 5 BASIC26.03■■□□□ 1.76
KRT38O76015 SDCCAG3-201ENST00000298537 2314 ntTSL 1 (best) BASIC26.03■■□□□ 1.76
KRT38O76015 HAND2-201ENST00000359562 2780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.03■■□□□ 1.76
KRT38O76015 COMMD3-201ENST00000376836 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.02■■□□□ 1.76
KRT38O76015 SCCPDH-201ENST00000366510 2503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.01■■□□□ 1.75
KRT38O76015 SPIRE1-203ENST00000410092 5533 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26■■□□□ 1.75
KRT38O76015 MAGI2-211ENST00000535697 6146 ntTSL 5 BASIC26■■□□□ 1.75
KRT38O76015 CCNYL1-205ENST00000420822 952 ntTSL 1 (best) BASIC26■■□□□ 1.75
KRT38O76015 FTCD-201ENST00000291670 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26■■□□□ 1.75
KRT38O76015 CAPNS1-204ENST00000587718 1558 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.99■■□□□ 1.75
KRT38O76015 C11orf80-204ENST00000525908 2135 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC25.99■■□□□ 1.75
KRT38O76015 PLEKHF1-201ENST00000436066 2084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.99■■□□□ 1.75
KRT38O76015 LGALS3-201ENST00000254301 1146 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.99■■□□□ 1.75
KRT38O76015 ADNP-AS1-201ENST00000558899 927 ntTSL 3 BASIC25.99■■□□□ 1.75
KRT38O76015 HYAL2-202ENST00000395139 2136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.98■■□□□ 1.75
KRT38O76015 KANSL1L-207ENST00000452086 2334 ntTSL 1 (best) BASIC25.98■■□□□ 1.75
KRT38O76015 MAPKAPK2-201ENST00000294981 2171 ntTSL 1 (best) BASIC25.97■■□□□ 1.75
KRT38O76015 RHOC-208ENST00000369642 1355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.97■■□□□ 1.75
KRT38O76015 AC234582.1-201ENST00000447623 923 ntTSL 5 BASIC25.97■■□□□ 1.75
KRT38O76015 AC009133.5-201ENST00000562594 473 ntTSL 4 BASIC25.97■■□□□ 1.75
KRT38O76015 ZDHHC23-206ENST00000498275 2055 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.97■■□□□ 1.75
KRT38O76015 F8A3-201ENST00000622749 1759 ntAPPRIS P1 BASIC25.96■■□□□ 1.75
KRT38O76015 STUB1-201ENST00000219548 1472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.96■■□□□ 1.75
KRT38O76015 PPP1CC-208ENST00000551676 1581 ntTSL 2 BASIC25.95■■□□□ 1.75
KRT38O76015 CRIP1-201ENST00000330233 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.95■■□□□ 1.75
KRT38O76015 IL13RA1-201ENST00000371642 1096 ntTSL 1 (best) BASIC25.95■■□□□ 1.74
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 48.3 ms