Protein–RNA interactions for Protein: O75688

PPM1B, Protein phosphatase 1B, humanhuman

Predictions only

Length 479 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PPM1BO75688 PAPD7-201ENST00000230859 5459 ntTSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
PPM1BO75688 TXNL4A-210ENST00000591711 669 ntTSL 2 BASIC24.33■■□□□ 1.49
PPM1BO75688 PLEKHG6-206ENST00000536531 1683 ntTSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
PPM1BO75688 PPP1R35-201ENST00000292330 1031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
PPM1BO75688 MAD2L2-205ENST00000376669 864 ntTSL 3 BASIC24.32■■□□□ 1.48
PPM1BO75688 AP000911.1-206ENST00000531938 711 ntTSL 3 BASIC24.32■■□□□ 1.48
PPM1BO75688 FOXA2-202ENST00000419308 2422 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
PPM1BO75688 COL13A1-210ENST00000517713 2007 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.32■■□□□ 1.48
PPM1BO75688 ESRRA-201ENST00000000442 2215 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
PPM1BO75688 MYLIP-202ENST00000356840 1666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
PPM1BO75688 SH3GL3-202ENST00000427482 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
PPM1BO75688 ANKRD13D-211ENST00000511455 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
PPM1BO75688 AC044849.2-201ENST00000606596 710 ntBASIC24.31■■□□□ 1.48
PPM1BO75688 AL135925.1-201ENST00000605920 1701 ntBASIC24.3■■□□□ 1.48
PPM1BO75688 PPP3CC-204ENST00000518852 1598 ntTSL 2 BASIC24.3■■□□□ 1.48
PPM1BO75688 PHOX2A-201ENST00000298231 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
PPM1BO75688 NOXA1-201ENST00000341349 1678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
PPM1BO75688 ATP6V1E2-204ENST00000522587 1559 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.29■■□□□ 1.48
PPM1BO75688 BATF3-201ENST00000243440 980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
PPM1BO75688 AC009097.4-201ENST00000566738 777 ntTSL 2 BASIC24.29■■□□□ 1.48
PPM1BO75688 GAL3ST1-204ENST00000402369 1712 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.29■■□□□ 1.48
PPM1BO75688 PIP4K2B-204ENST00000619039 5734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
PPM1BO75688 AC010864.1-201ENST00000609407 1511 ntBASIC24.27■■□□□ 1.48
PPM1BO75688 NGB-201ENST00000298352 1884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
PPM1BO75688 CDKN2A-201ENST00000304494 1218 ntTSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
PPM1BO75688 SMIM12-205ENST00000456842 918 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.26■■□□□ 1.47
PPM1BO75688 PELI3-203ENST00000524466 1671 ntTSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
PPM1BO75688 CARS2-201ENST00000257347 1879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
PPM1BO75688 CHPT1-201ENST00000229266 1585 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
PPM1BO75688 DCBLD1-201ENST00000296955 1979 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
PPM1BO75688 SLC12A2-202ENST00000343225 5509 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
PPM1BO75688 CCND3-203ENST00000372991 2085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
PPM1BO75688 CMC4-202ENST00000369484 1107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
PPM1BO75688 MFAP2-202ENST00000375535 1260 ntTSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
PPM1BO75688 AC108673.1-201ENST00000510422 1159 ntBASIC24.24■■□□□ 1.47
PPM1BO75688 HOXD13-201ENST00000392539 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
PPM1BO75688 TSPAN33-201ENST00000486685 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
PPM1BO75688 UBE2S-203ENST00000589978 496 ntTSL 5 BASIC24.23■■□□□ 1.47
PPM1BO75688 HAUS7-201ENST00000370210 1593 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.23■■□□□ 1.47
PPM1BO75688 CUEDC1-201ENST00000360238 2193 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.22■■□□□ 1.47
PPM1BO75688 MATK-201ENST00000310132 2133 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
PPM1BO75688 CGREF1-203ENST00000402394 1906 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC24.22■■□□□ 1.47
PPM1BO75688 SRSF9-201ENST00000229390 1201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
PPM1BO75688 KCTD17-202ENST00000403888 1763 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
PPM1BO75688 LDB1-202ENST00000425280 2089 ntTSL 5 BASIC24.21■■□□□ 1.47
PPM1BO75688 RCE1-201ENST00000309657 1485 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.47
PPM1BO75688 TMEM268-201ENST00000288502 2314 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
PPM1BO75688 AC104109.3-201ENST00000519718 483 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.2■■□□□ 1.46
PPM1BO75688 STUB1-205ENST00000565677 1560 ntTSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
PPM1BO75688 ST7-AS1-201ENST00000456775 1889 ntBASIC24.19■■□□□ 1.46
PPM1BO75688 ARL8A-201ENST00000272217 1793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
PPM1BO75688 ECI1-207ENST00000570258 1512 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.19■■□□□ 1.46
PPM1BO75688 EXOC3-209ENST00000512944 2825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
PPM1BO75688 AMN-201ENST00000299155 1907 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
PPM1BO75688 PXDC1-202ENST00000380283 2190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
PPM1BO75688 VAX2-201ENST00000234392 1147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
PPM1BO75688 KLC2-205ENST00000394078 1557 ntTSL 5 BASIC24.17■■□□□ 1.46
PPM1BO75688 BOD1-201ENST00000285908 1286 ntTSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
PPM1BO75688 BOD1-206ENST00000480951 814 ntTSL 2 BASIC24.17■■□□□ 1.46
PPM1BO75688 MIR6090-201ENST00000622481 60 ntBASIC24.17■■□□□ 1.46
PPM1BO75688 GIPC1-203ENST00000393033 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
PPM1BO75688 MAPK13-201ENST00000211287 2052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
PPM1BO75688 POLR1D-201ENST00000302979 1166 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
PPM1BO75688 BHLHE23-201ENST00000370346 1057 ntAPPRIS P1 BASIC24.16■■□□□ 1.46
PPM1BO75688 COPRS-202ENST00000378634 1041 ntTSL 2 BASIC24.16■■□□□ 1.46
PPM1BO75688 ZNF513-201ENST00000323703 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
PPM1BO75688 MISP3-202ENST00000587086 1535 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
PPM1BO75688 ABHD17A-202ENST00000292577 1757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
PPM1BO75688 ABCB10P3-201ENST00000561950 2166 ntBASIC24.15■■□□□ 1.46
PPM1BO75688 CCDC88C-205ENST00000553403 1651 ntTSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
PPM1BO75688 GAL3ST1-205ENST00000406361 1819 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.14■■□□□ 1.46
PPM1BO75688 RTN2-201ENST00000245923 2293 ntTSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.46
PPM1BO75688 RNF130-205ENST00000521389 2263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.46
PPM1BO75688 NPHP3-202ENST00000383282 782 ntTSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.45
PPM1BO75688 ATPAF1-202ENST00000371937 1827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.45
PPM1BO75688 CCZ1B-215ENST00000626257 2211 ntTSL 2 BASIC24.13■■□□□ 1.45
PPM1BO75688 AC139426.1-201ENST00000568218 2529 ntBASIC24.12■■□□□ 1.45
PPM1BO75688 HNRNPAB-202ENST00000358344 1796 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
PPM1BO75688 HNRNPAB-204ENST00000504898 1785 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
PPM1BO75688 HDAC11-206ENST00000405025 576 ntTSL 4 BASIC24.12■■□□□ 1.45
PPM1BO75688 VEGFA-207ENST00000413642 1197 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
PPM1BO75688 SLC52A2-201ENST00000329994 1896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
PPM1BO75688 ARHGEF7-206ENST00000375741 5525 ntTSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
PPM1BO75688 DTNBP1-202ENST00000344537 1403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
PPM1BO75688 FGFRL1-205ENST00000510644 2304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
PPM1BO75688 AP002884.3-203ENST00000419895 1711 ntTSL 2 BASIC24.1■■□□□ 1.45
PPM1BO75688 DOCK5-202ENST00000410074 786 ntTSL 2 BASIC24.1■■□□□ 1.45
PPM1BO75688 CIB2-204ENST00000557846 934 ntTSL 3 BASIC24.1■■□□□ 1.45
PPM1BO75688 UBE2A-207ENST00000628549 934 ntTSL 2 BASIC24.1■■□□□ 1.45
PPM1BO75688 EMC10-202ENST00000376918 2014 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
PPM1BO75688 TM6SF1-202ENST00000322019 2074 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
PPM1BO75688 TPI1-201ENST00000229270 1763 ntTSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.44
PPM1BO75688 FSD1L-208ENST00000495708 1906 ntTSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.44
PPM1BO75688 CUL4A-202ENST00000375440 2364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
PPM1BO75688 ACOT7-201ENST00000361521 2429 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
PPM1BO75688 RASSF8-202ENST00000381352 2320 ntTSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
PPM1BO75688 ENKD1-201ENST00000243878 1579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
PPM1BO75688 HNRNPAB-205ENST00000506259 1674 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
PPM1BO75688 RCC1L-202ENST00000614461 2419 ntTSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
PPM1BO75688 SHOX2-204ENST00000483851 1866 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.04■■□□□ 1.44
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 73.8 ms