Protein–RNA interactions for Protein: O75533

SF3B1, Splicing factor 3B subunit 1, humanhuman

Known RBP eCLIP

Length 1,304 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SF3B1O75533 SETD4-205ENST00000399208 1165 ntTSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.22e-23■■■■■ 275.7
SF3B1O75533 PPFIA1-225ENST00000638133 814 ntTSL 316.32■□□□□ 0.24e-12■■■■■ 275.7
SF3B1O75533 COX14-203ENST00000550487 739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.194e-12■■■■■ 275.7
SF3B1O75533 GRPEL1-202ENST00000504920 2195 ntTSL 216.17■□□□□ 0.184e-12■■■■■ 275.7
SF3B1O75533 TRIM14-201ENST00000341469 4454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.174e-12■■■■■ 275.7
SF3B1O75533 MYO18A-217ENST00000533652 542 ntTSL 516.13■□□□□ 0.174e-12■■■■■ 275.7
SF3B1O75533 SPCS2-205ENST00000527290 265 ntTSL 216.1■□□□□ 0.174e-12■■■■■ 275.7
SF3B1O75533 PPP2CA-203ENST00000481195 4649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.174e-12■■■■■ 275.7
SF3B1O75533 CTNS-206ENST00000488623 537 ntTSL 316.06■□□□□ 0.164e-12■■■■■ 275.7
SF3B1O75533 SH3BP2-207ENST00000503393 9158 ntTSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.164e-12■■■■■ 275.7
SF3B1O75533 SLC8B1-214ENST00000552565 2287 ntTSL 216.02■□□□□ 0.164e-12■■■■■ 275.7
SF3B1O75533 ZNF384-202ENST00000355772 2514 ntTSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.124e-12■■■■■ 275.7
SF3B1O75533 SLC8B1-202ENST00000546737 1656 ntTSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.124e-12■■■■■ 275.7
SF3B1O75533 IFT122-219ENST00000509522 1141 ntTSL 515.75■□□□□ 0.114e-12■■■■■ 275.7
SF3B1O75533 SLC8B1-201ENST00000202831 2975 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.114e-12■■■■■ 275.7
SF3B1O75533 DAPK2-212ENST00000561162 566 ntTSL 415.7■□□□□ 0.14e-12■■■■■ 275.7
SF3B1O75533 CTNS-202ENST00000381870 2470 ntTSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.094e-12■■■■■ 275.7
SF3B1O75533 SH3BP2-229ENST00000515802 2247 ntTSL 215.56■□□□□ 0.084e-12■■■■■ 275.7
SF3B1O75533 IGF1-204ENST00000392905 444 ntTSL 515.56■□□□□ 0.084e-12■■■■■ 275.7
SF3B1O75533 IGF1-203ENST00000392904 761 ntTSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.074e-12■■■■■ 275.7
SF3B1O75533 IGF1-201ENST00000307046 1097 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.074e-12■■■■■ 275.7
SF3B1O75533 PYGM-202ENST00000377432 2611 ntTSL 2 BASIC15.4■□□□□ 0.064e-12■■■■■ 275.7
SF3B1O75533 MRPL21-204ENST00000541265 555 ntTSL 415.35■□□□□ 0.054e-12■■■■■ 275.7
SF3B1O75533 COX14-201ENST00000317943 708 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.33■□□□□ 0.044e-12■■■■■ 275.7
SF3B1O75533 RPTOR-210ENST00000576366 787 ntTSL 315.29■□□□□ 0.044e-12■■■■■ 275.7
SF3B1O75533 ABCC10-201ENST00000244533 5088 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.034e-12■■■■■ 275.7
SF3B1O75533 ARMT1-203ENST00000494826 712 ntTSL 215.05■□□□□ -04e-12■■■■■ 275.7
SF3B1O75533 AKNA-206ENST00000374088 5464 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.02■□□□□ -04e-12■■■■■ 275.7
SF3B1O75533 HIPK3-203ENST00000456517 7399 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.77□□□□□ -0.042e-12■■■■■ 275.7
SF3B1O75533 GPR68-203ENST00000531499 2859 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.054e-12■■■■■ 275.7
SF3B1O75533 HIPK3-201ENST00000303296 7408 ntTSL 5 BASIC14.69□□□□□ -0.062e-12■■■■■ 275.7
SF3B1O75533 AC245884.1-201ENST00000457113 529 ntTSL 3 BASIC14.56□□□□□ -0.084e-12■■■■■ 275.7
SF3B1O75533 GPR68-204ENST00000535815 2859 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.094e-12■■■■■ 275.7
SF3B1O75533 TGFBR3-204ENST00000465892 2908 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.43□□□□□ -0.14e-12■■■■■ 275.7
SF3B1O75533 AKNA-204ENST00000374075 5038 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.37□□□□□ -0.114e-12■■■■■ 275.7
SF3B1O75533 EGR2-206ENST00000639815 1075 ntTSL 514.32□□□□□ -0.124e-12■■■■■ 275.7
SF3B1O75533 ZNF384-204ENST00000396801 3008 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.19□□□□□ -0.144e-12■■■■■ 275.7
SF3B1O75533 EGR2-201ENST00000242480 2968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.12□□□□□ -0.154e-12■■■■■ 275.7
SF3B1O75533 ABCC10-204ENST00000372530 5033 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.99□□□□□ -0.174e-12■■■■■ 275.7
SF3B1O75533 TRIM26-267ENST00000453195 3318 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.98□□□□□ -0.174e-12■■■■■ 275.7
SF3B1O75533 SGTB-201ENST00000381007 5469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.98□□□□□ -0.174e-12■■■■■ 275.7
SF3B1O75533 ACAA1-213ENST00000465181 656 ntTSL 313.91□□□□□ -0.184e-12■■■■■ 275.7
SF3B1O75533 COX14-204ENST00000550654 580 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.88□□□□□ -0.194e-12■■■■■ 275.7
SF3B1O75533 ZNF384-201ENST00000319770 3266 ntTSL 2 BASIC13.77□□□□□ -0.24e-12■■■■■ 275.7
SF3B1O75533 CCDC57-208ENST00000475635 571 ntTSL 413.75□□□□□ -0.214e-12■■■■■ 275.7
SF3B1O75533 SMIM14-205ENST00000511809 830 ntTSL 2 BASIC13.75□□□□□ -0.214e-12■■■■■ 275.7
SF3B1O75533 HIPK3-202ENST00000379016 7345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.212e-12■■■■■ 275.7
SF3B1O75533 EGR2-202ENST00000411732 2824 ntTSL 2 BASIC13.68□□□□□ -0.224e-12■■■■■ 275.7
SF3B1O75533 SMIM14-201ENST00000295958 6483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.234e-12■■■■■ 275.7
SF3B1O75533 MRPL21-203ENST00000536637 557 ntTSL 213.6□□□□□ -0.234e-12■■■■■ 275.7
SF3B1O75533 TGFBR3-201ENST00000212355 6465 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.244e-12■■■■■ 275.7
SF3B1O75533 SLC8B1-211ENST00000550672 2925 ntTSL 1 (best)13.47□□□□□ -0.254e-12■■■■■ 275.7
SF3B1O75533 SLC39A14-211ENST00000522881 560 ntTSL 513.39□□□□□ -0.274e-12■■■■■ 275.7
SF3B1O75533 CTNS-201ENST00000046640 2866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.274e-12■■■■■ 275.7
SF3B1O75533 MAP3K15-203ENST00000470101 2049 ntTSL 213.33□□□□□ -0.284e-12■■■■■ 275.7
SF3B1O75533 CTNS-208ENST00000574218 581 ntTSL 513.3□□□□□ -0.284e-12■■■■■ 275.7
SF3B1O75533 SMIM14-202ENST00000505729 612 ntTSL 413.17□□□□□ -0.34e-12■■■■■ 275.7
SF3B1O75533 PYGM-201ENST00000164139 3198 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.314e-12■■■■■ 275.7
SF3B1O75533 AKNA-209ENST00000492875 3894 ntTSL 213.11□□□□□ -0.314e-12■■■■■ 275.7
SF3B1O75533 ADARB1-214ENST00000629643 4583 ntTSL 5 BASIC13.08□□□□□ -0.324e-12■■■■■ 275.7
SF3B1O75533 ZNF384-203ENST00000361959 2978 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.06□□□□□ -0.324e-12■■■■■ 275.7
SF3B1O75533 AKNA-201ENST00000223791 4414 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.06□□□□□ -0.324e-12■■■■■ 275.7
SF3B1O75533 CTNS-205ENST00000467663 590 ntTSL 313.05□□□□□ -0.324e-12■■■■■ 275.7
SF3B1O75533 SH3BP2-203ENST00000442312 9211 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13□□□□□ -0.334e-12■■■■■ 275.7
SF3B1O75533 SLC8B1-213ENST00000552014 3289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.92□□□□□ -0.344e-12■■■■■ 275.7
SF3B1O75533 SETD4-207ENST00000399215 4272 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.88□□□□□ -0.352e-23■■■■■ 275.7
SF3B1O75533 AKNA-202ENST00000307564 7380 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.77□□□□□ -0.374e-12■■■■■ 275.7
SF3B1O75533 LINC02210-CRHR1-202ENST00000634540 2695 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.54□□□□□ -0.44e-12■■■■■ 275.7
SF3B1O75533 SETD4-215ENST00000481477 2761 ntTSL 1 (best)12.54□□□□□ -0.42e-23■■■■■ 275.7
SF3B1O75533 ATXN3-201ENST00000340660 1205 ntTSL 1 (best) BASIC12.49□□□□□ -0.414e-12■■■■■ 275.7
SF3B1O75533 RAB31-209ENST00000580795 342 ntTSL 212.48□□□□□ -0.414e-12■■■■■ 275.7
SF3B1O75533 AC074032.1-201ENST00000548468 698 ntTSL 3 BASIC12.47□□□□□ -0.414e-12■■■■■ 275.7
SF3B1O75533 PPFIA1-214ENST00000530390 879 ntTSL 512.46□□□□□ -0.414e-12■■■■■ 275.7
SF3B1O75533 SETD4-212ENST00000446166 754 ntTSL 312.39□□□□□ -0.432e-23■■■■■ 275.7
SF3B1O75533 MRPL21-201ENST00000362034 683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.21□□□□□ -0.454e-12■■■■■ 275.7
SF3B1O75533 TRIM26-269ENST00000480999 3114 ntTSL 212.14□□□□□ -0.474e-12■■■■■ 275.7
SF3B1O75533 SETD4-202ENST00000399201 1212 ntTSL 1 (best) BASIC12.1□□□□□ -0.472e-23■■■■■ 275.7
SF3B1O75533 SETD4-203ENST00000399205 1208 ntTSL 1 (best) BASIC12.1□□□□□ -0.472e-23■■■■■ 275.7
SF3B1O75533 ARMT1-204ENST00000545879 2495 ntTSL 2 BASIC12.09□□□□□ -0.474e-12■■■■■ 275.7
SF3B1O75533 DHX8-203ENST00000587044 6215 ntTSL 212.08□□□□□ -0.484e-12■■■■■ 275.7
SF3B1O75533 LINC02320-201ENST00000557778 454 ntTSL 3 BASIC12□□□□□ -0.494e-12■■■■■ 275.7
SF3B1O75533 SETD4-204ENST00000399207 1160 ntTSL 3 BASIC11.98□□□□□ -0.492e-23■■■■■ 275.7
SF3B1O75533 SH3BP2-217ENST00000510204 3617 ntTSL 211.91□□□□□ -0.54e-12■■■■■ 275.7
SF3B1O75533 CLPTM1L-208ENST00000507195 628 ntTSL 511.71□□□□□ -0.534e-12■■■■■ 275.7
SF3B1O75533 TGFBR3-205ENST00000468996 569 ntTSL 411.69□□□□□ -0.544e-12■■■■■ 275.7
SF3B1O75533 TRIM26-268ENST00000454678 3478 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.554e-12■■■■■ 275.7
SF3B1O75533 SETD4-201ENST00000332131 3015 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.57□□□□□ -0.562e-23■■■■■ 275.7
SF3B1O75533 GRPEL1-201ENST00000264954 2775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.47□□□□□ -0.574e-12■■■■■ 275.7
SF3B1O75533 SH3BP2-201ENST00000356331 9211 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.2□□□□□ -0.624e-12■■■■■ 275.7
SF3B1O75533 SH3BP2-209ENST00000504450 844 ntTSL 511.17□□□□□ -0.624e-12■■■■■ 275.7
SF3B1O75533 MRPS21-202ENST00000614145 1226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.14□□□□□ -0.634e-12■■■■■ 275.7
SF3B1O75533 BTN2A1-207ENST00000541522 2845 ntTSL 2 BASIC11.09□□□□□ -0.634e-12■■■■■ 275.7
SF3B1O75533 MRPL21-205ENST00000541279 764 ntTSL 511.09□□□□□ -0.634e-12■■■■■ 275.7
SF3B1O75533 SLC7A6-207ENST00000563208 572 ntTSL 511.09□□□□□ -0.634e-12■■■■■ 275.7
SF3B1O75533 TSC2-224ENST00000568692 636 ntTSL 311.07□□□□□ -0.644e-12■■■■■ 275.7
SF3B1O75533 TRIM26-266ENST00000437089 3250 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.04□□□□□ -0.644e-12■■■■■ 275.7
SF3B1O75533 CLPTM1L-204ENST00000503534 742 ntTSL 210.86□□□□□ -0.674e-12■■■■■ 275.7
SF3B1O75533 BTN2A1-206ENST00000493173 551 ntTSL 410.74□□□□□ -0.694e-12■■■■■ 275.7
SF3B1O75533 ARMT1-201ENST00000367294 2576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.71□□□□□ -0.694e-12■■■■■ 275.7
SF3B1O75533 MRPL21-202ENST00000450904 662 ntTSL 2 BASIC10.54□□□□□ -0.724e-12■■■■■ 275.7
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