Protein–RNA interactions for Protein: O75531

BANF1, Barrier-to-autointegration factor, humanhuman

Predictions only

Length 89 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
BANF1O75531 TCFL5-201ENST00000217162 2453 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.73■■□□□ 1.87
BANF1O75531 TCFL5-202ENST00000335351 2456 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.73■■□□□ 1.87
BANF1O75531 CBX4-202ENST00000448310 718 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC26.73■■□□□ 1.87
BANF1O75531 C1orf122-204ENST00000468084 1234 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.72■■□□□ 1.87
BANF1O75531 NOG-201ENST00000332822 1892 ntAPPRIS P1 BASIC26.72■■□□□ 1.87
BANF1O75531 ABHD17A-202ENST00000292577 1757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.71■■□□□ 1.87
BANF1O75531 ADNP-AS1-201ENST00000558899 927 ntTSL 3 BASIC26.71■■□□□ 1.87
BANF1O75531 SHARPIN-202ENST00000398712 1765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.71■■□□□ 1.87
BANF1O75531 PLSCR3-209ENST00000574401 2032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.7■■□□□ 1.87
BANF1O75531 IL13RA1-201ENST00000371642 1096 ntTSL 1 (best) BASIC26.7■■□□□ 1.86
BANF1O75531 BMP7-204ENST00000450594 1857 ntTSL 2 BASIC26.69■■□□□ 1.86
BANF1O75531 GPR75-ASB3-201ENST00000406625 2113 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.69■■□□□ 1.86
BANF1O75531 INPP5A-202ENST00000368593 1432 ntTSL 1 (best) BASIC26.68■■□□□ 1.86
BANF1O75531 AGPAT2-202ENST00000371696 1512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.68■■□□□ 1.86
BANF1O75531 MTCH1-201ENST00000373616 2006 ntTSL 1 (best) BASIC26.68■■□□□ 1.86
BANF1O75531 FAM78B-202ENST00000354422 1475 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.68■■□□□ 1.86
BANF1O75531 KANSL1L-207ENST00000452086 2334 ntTSL 1 (best) BASIC26.67■■□□□ 1.86
BANF1O75531 GNPTAB-202ENST00000392919 760 ntTSL 1 (best) BASIC26.67■■□□□ 1.86
BANF1O75531 SDCCAG3-201ENST00000298537 2314 ntTSL 1 (best) BASIC26.67■■□□□ 1.86
BANF1O75531 TCF24-201ENST00000563496 2450 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.66■■□□□ 1.86
BANF1O75531 CCND3-203ENST00000372991 2085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.66■■□□□ 1.86
BANF1O75531 MNX1-201ENST00000252971 2174 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.66■■□□□ 1.86
BANF1O75531 PLSCR3-202ENST00000535512 2067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.66■■□□□ 1.86
BANF1O75531 FSD1L-208ENST00000495708 1906 ntTSL 1 (best) BASIC26.65■■□□□ 1.86
BANF1O75531 PPP3CC-204ENST00000518852 1598 ntTSL 2 BASIC26.65■■□□□ 1.86
BANF1O75531 PURG-201ENST00000339382 2693 ntTSL 1 (best) BASIC26.65■■□□□ 1.86
BANF1O75531 BCL7C-201ENST00000215115 1740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.65■■□□□ 1.86
BANF1O75531 ATPAF1-201ENST00000329231 1241 ntTSL 2 BASIC26.64■■□□□ 1.86
BANF1O75531 AC010864.1-201ENST00000609407 1511 ntBASIC26.64■■□□□ 1.85
BANF1O75531 EFEMP2-201ENST00000307998 2034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.63■■□□□ 1.85
BANF1O75531 SIGMAR1-205ENST00000477726 840 ntTSL 1 (best) BASIC26.63■■□□□ 1.85
BANF1O75531 AC009133.5-201ENST00000562594 473 ntTSL 4 BASIC26.63■■□□□ 1.85
BANF1O75531 AC142086.6-201ENST00000621154 1765 ntBASIC26.63■■□□□ 1.85
BANF1O75531 LGALS3-201ENST00000254301 1146 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.62■■□□□ 1.85
BANF1O75531 C9orf40-201ENST00000376854 2327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.62■■□□□ 1.85
BANF1O75531 SCCPDH-201ENST00000366510 2503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.62■■□□□ 1.85
BANF1O75531 RARRES2P7-201ENST00000567349 469 ntBASIC26.61■■□□□ 1.85
BANF1O75531 CTBP1-201ENST00000290921 2297 ntTSL 1 (best) BASIC26.6■■□□□ 1.85
BANF1O75531 UBE2L6-201ENST00000287156 1354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.59■■□□□ 1.85
BANF1O75531 TXN-202ENST00000374517 869 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.59■■□□□ 1.85
BANF1O75531 SETD8P1-201ENST00000623146 1180 ntBASIC26.59■■□□□ 1.85
BANF1O75531 DRD5P2-201ENST00000421395 2012 ntBASIC26.59■■□□□ 1.85
BANF1O75531 RHOC-208ENST00000369642 1355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.58■■□□□ 1.85
BANF1O75531 AL109917.1-201ENST00000412228 906 ntTSL 2 BASIC26.58■■□□□ 1.85
BANF1O75531 MARCH11-201ENST00000332432 1741 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.58■■□□□ 1.85
BANF1O75531 RDX-210ENST00000530301 1549 ntTSL 1 (best) BASIC26.58■■□□□ 1.85
BANF1O75531 PLEKHG6-206ENST00000536531 1683 ntTSL 1 (best) BASIC26.57■■□□□ 1.84
BANF1O75531 STUB1-205ENST00000565677 1560 ntTSL 1 (best) BASIC26.57■■□□□ 1.84
BANF1O75531 CLK2-201ENST00000355560 2120 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC26.56■■□□□ 1.84
BANF1O75531 LFNG-203ENST00000359574 1377 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.56■■□□□ 1.84
BANF1O75531 MKNK2-202ENST00000309340 1744 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.56■■□□□ 1.84
BANF1O75531 LACTB-201ENST00000261893 1972 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.55■■□□□ 1.84
BANF1O75531 HOXD-AS2-202ENST00000440016 999 ntTSL 5 BASIC26.55■■□□□ 1.84
BANF1O75531 STUB1-201ENST00000219548 1472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.53■■□□□ 1.84
BANF1O75531 CCNYL1-205ENST00000420822 952 ntTSL 1 (best) BASIC26.52■■□□□ 1.84
BANF1O75531 HOXB3-211ENST00000490677 1109 ntTSL 1 (best) BASIC26.52■■□□□ 1.84
BANF1O75531 ZDHHC23-206ENST00000498275 2055 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.52■■□□□ 1.84
BANF1O75531 HNRNPAB-205ENST00000506259 1674 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.52■■□□□ 1.84
BANF1O75531 WHRN-203ENST00000374057 1718 ntTSL 2 BASIC26.51■■□□□ 1.83
BANF1O75531 PIK3R2-208ENST00000617642 1446 ntTSL 5 BASIC26.51■■□□□ 1.83
BANF1O75531 PCBD2-201ENST00000254908 1223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.51■■□□□ 1.83
BANF1O75531 ZNF219-201ENST00000360947 3071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.51■■□□□ 1.83
BANF1O75531 AUTS2-202ENST00000403018 957 ntTSL 1 (best) BASIC26.5■■□□□ 1.83
BANF1O75531 RUNX2-205ENST00000465038 1770 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC26.49■■□□□ 1.83
BANF1O75531 COMMD3-201ENST00000376836 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.49■■□□□ 1.83
BANF1O75531 COMMD7-201ENST00000278980 1900 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.49■■□□□ 1.83
BANF1O75531 NFYB-205ENST00000551727 1727 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC26.46■■□□□ 1.83
BANF1O75531 AC068152.1-210ENST00000574741 836 ntTSL 3 BASIC26.46■■□□□ 1.83
BANF1O75531 AP003068.2-202ENST00000526623 1662 ntTSL 2 BASIC26.46■■□□□ 1.83
BANF1O75531 CHST14-202ENST00000559991 1968 ntTSL 5 BASIC26.46■■□□□ 1.83
BANF1O75531 BTBD19-203ENST00000450269 1572 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.46■■□□□ 1.83
BANF1O75531 CARM1-202ENST00000344150 2722 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.45■■□□□ 1.82
BANF1O75531 DUSP14-206ENST00000617516 1537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.44■■□□□ 1.82
BANF1O75531 MYLIP-202ENST00000356840 1666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.44■■□□□ 1.82
BANF1O75531 PICK1-201ENST00000356976 2055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.44■■□□□ 1.82
BANF1O75531 PLSCR3-214ENST00000619711 2066 ntTSL 5 BASIC26.44■■□□□ 1.82
BANF1O75531 DHRS13-202ENST00000394901 2037 ntTSL 1 (best) BASIC26.43■■□□□ 1.82
BANF1O75531 CDH24-206ENST00000610348 2037 ntTSL 1 (best) BASIC26.43■■□□□ 1.82
BANF1O75531 ANKS1B-203ENST00000341752 2115 ntTSL 2 BASIC26.43■■□□□ 1.82
BANF1O75531 SSU72-201ENST00000291386 1290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.42■■□□□ 1.82
BANF1O75531 ATRAID-201ENST00000380171 1240 ntTSL 1 (best) BASIC26.42■■□□□ 1.82
BANF1O75531 HYAL2-202ENST00000395139 2136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.42■■□□□ 1.82
BANF1O75531 TOMM40-201ENST00000252487 1707 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.4■■□□□ 1.82
BANF1O75531 TOMM40-202ENST00000405636 1709 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.4■■□□□ 1.82
BANF1O75531 SERPING1-205ENST00000403558 2231 ntTSL 5 BASIC26.4■■□□□ 1.82
BANF1O75531 PLEKHF1-201ENST00000436066 2084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.4■■□□□ 1.82
BANF1O75531 TNFSF12-201ENST00000293825 1553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.39■■□□□ 1.82
BANF1O75531 LRRC75B-201ENST00000318753 1238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.39■■□□□ 1.82
BANF1O75531 AC234582.1-201ENST00000447623 923 ntTSL 5 BASIC26.39■■□□□ 1.82
BANF1O75531 AMZ2-201ENST00000359783 1722 ntTSL 5 BASIC26.37■■□□□ 1.81
BANF1O75531 CAHM-201ENST00000604200 896 ntBASIC26.37■■□□□ 1.81
BANF1O75531 CRIP1-201ENST00000330233 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.37■■□□□ 1.81
BANF1O75531 AL391121.1-201ENST00000607967 1349 ntBASIC26.37■■□□□ 1.81
BANF1O75531 HDGF-201ENST00000357325 2380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.36■■□□□ 1.81
BANF1O75531 NOXA1-201ENST00000341349 1678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.36■■□□□ 1.81
BANF1O75531 TPGS1-201ENST00000359315 1114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.36■■□□□ 1.81
BANF1O75531 NADK2-210ENST00000514504 1233 ntTSL 5 BASIC26.36■■□□□ 1.81
BANF1O75531 GNAS-207ENST00000354359 1975 ntTSL 1 (best) BASIC26.36■■□□□ 1.81
BANF1O75531 GNAS-210ENST00000371085 1972 ntTSL 1 (best) BASIC26.36■■□□□ 1.81
BANF1O75531 DNPEP-201ENST00000273075 2425 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.36■■□□□ 1.81
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 8.9 ms