Protein–RNA interactions for Protein: O75436

VPS26A, Vacuolar protein sorting-associated protein 26A, humanhuman

Predictions only

Length 327 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
VPS26AO75436 FOXQ1-201ENST00000296839 2309 ntAPPRIS P1 BASIC26.01■■□□□ 1.75
VPS26AO75436 YAP1-204ENST00000526343 2393 ntTSL 5 BASIC26.01■■□□□ 1.75
VPS26AO75436 EFNA3-201ENST00000368408 1782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26■■□□□ 1.75
VPS26AO75436 RUNDC3A-206ENST00000590941 1675 ntTSL 1 (best) BASIC26■■□□□ 1.75
VPS26AO75436 AL139393.1-201ENST00000417479 573 ntTSL 5 BASIC26■■□□□ 1.75
VPS26AO75436 RRAGC-201ENST00000373001 2732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.99■■□□□ 1.75
VPS26AO75436 TPRA1-209ENST00000489960 1903 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.99■■□□□ 1.75
VPS26AO75436 SUZ12P1-203ENST00000578195 985 ntBASIC25.99■■□□□ 1.75
VPS26AO75436 CAPNS1-217ENST00000629983 799 ntTSL 5 BASIC25.99■■□□□ 1.75
VPS26AO75436 RDX-210ENST00000530301 1549 ntTSL 1 (best) BASIC25.98■■□□□ 1.75
VPS26AO75436 BIN1-204ENST00000348750 2074 ntTSL 1 (best) BASIC25.98■■□□□ 1.75
VPS26AO75436 JAG2-201ENST00000331782 5835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.98■■□□□ 1.75
VPS26AO75436 WDSUB1-205ENST00000409990 1920 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.97■■□□□ 1.75
VPS26AO75436 AC139426.1-201ENST00000568218 2529 ntBASIC25.96■■□□□ 1.75
VPS26AO75436 CIB1-201ENST00000328649 1247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.96■■□□□ 1.75
VPS26AO75436 AC012615.2-201ENST00000586259 447 ntTSL 4 BASIC25.96■■□□□ 1.75
VPS26AO75436 CIB1-202ENST00000612800 1096 ntTSL 1 (best) BASIC25.96■■□□□ 1.75
VPS26AO75436 SPIRE1-202ENST00000409402 5665 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.96■■□□□ 1.75
VPS26AO75436 TESK1-206ENST00000620767 2438 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.95■■□□□ 1.75
VPS26AO75436 PGM5P2-201ENST00000613141 1980 ntTSL 1 (best) BASIC25.95■■□□□ 1.75
VPS26AO75436 TPRA1-202ENST00000355552 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.95■■□□□ 1.74
VPS26AO75436 TPI1-201ENST00000229270 1763 ntTSL 1 (best) BASIC25.95■■□□□ 1.74
VPS26AO75436 SP8-201ENST00000361443 1714 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.94■■□□□ 1.74
VPS26AO75436 ACOT7-201ENST00000361521 2429 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.94■■□□□ 1.74
VPS26AO75436 MYLIP-202ENST00000356840 1666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.94■■□□□ 1.74
VPS26AO75436 PLEKHG6-206ENST00000536531 1683 ntTSL 1 (best) BASIC25.94■■□□□ 1.74
VPS26AO75436 CACNG6-202ENST00000346968 645 ntTSL 5 BASIC25.94■■□□□ 1.74
VPS26AO75436 LMO1-202ENST00000428101 1038 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.94■■□□□ 1.74
VPS26AO75436 HOPX-206ENST00000503639 1248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.93■■□□□ 1.74
VPS26AO75436 STUB1-205ENST00000565677 1560 ntTSL 1 (best) BASIC25.93■■□□□ 1.74
VPS26AO75436 IRX1-201ENST00000302006 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.93■■□□□ 1.74
VPS26AO75436 FSD1L-208ENST00000495708 1906 ntTSL 1 (best) BASIC25.92■■□□□ 1.74
VPS26AO75436 VWA1-201ENST00000338660 2147 ntTSL 2 BASIC25.91■■□□□ 1.74
VPS26AO75436 BCL7C-201ENST00000215115 1740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.91■■□□□ 1.74
VPS26AO75436 MIR762-201ENST00000390236 83 ntBASIC25.91■■□□□ 1.74
VPS26AO75436 NMB-202ENST00000394588 1017 ntTSL 1 (best) BASIC25.91■■□□□ 1.74
VPS26AO75436 ECI1-207ENST00000570258 1512 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.91■■□□□ 1.74
VPS26AO75436 ARHGEF7-205ENST00000375739 5375 ntTSL 1 (best) BASIC25.91■■□□□ 1.74
VPS26AO75436 MKNK2-202ENST00000309340 1744 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.91■■□□□ 1.74
VPS26AO75436 ST6GALNAC6-203ENST00000373142 2448 ntTSL 1 (best) BASIC25.9■■□□□ 1.74
VPS26AO75436 FGF18-201ENST00000274625 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.9■■□□□ 1.74
VPS26AO75436 AC012629.2-201ENST00000606513 377 ntTSL 5 BASIC25.9■■□□□ 1.74
VPS26AO75436 SIGMAR1-203ENST00000378892 1743 ntTSL 2 BASIC25.9■■□□□ 1.74
VPS26AO75436 RTN4R-201ENST00000043402 2157 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.89■■□□□ 1.74
VPS26AO75436 BATF3-201ENST00000243440 980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.88■■□□□ 1.73
VPS26AO75436 SECTM1-201ENST00000269389 2235 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.88■■□□□ 1.73
VPS26AO75436 MISP3-201ENST00000269720 1424 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.88■■□□□ 1.73
VPS26AO75436 LYNX1-208ENST00000615007 1293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.87■■□□□ 1.73
VPS26AO75436 CHML-205ENST00000638160 705 ntTSL 3 BASIC25.87■■□□□ 1.73
VPS26AO75436 EXOC3L4-201ENST00000380069 2293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.87■■□□□ 1.73
VPS26AO75436 ZNF787-203ENST00000610935 1925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.86■■□□□ 1.73
VPS26AO75436 PXDC1-202ENST00000380283 2190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.86■■□□□ 1.73
VPS26AO75436 LANCL3-203ENST00000614025 1469 ntTSL 2 BASIC25.86■■□□□ 1.73
VPS26AO75436 HNRNPAB-205ENST00000506259 1674 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.86■■□□□ 1.73
VPS26AO75436 ABHD17A-202ENST00000292577 1757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.85■■□□□ 1.73
VPS26AO75436 HOXB3-212ENST00000498678 2196 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.85■■□□□ 1.73
VPS26AO75436 NOXA1-201ENST00000341349 1678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.85■■□□□ 1.73
VPS26AO75436 S100A10-202ENST00000368811 1202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.85■■□□□ 1.73
VPS26AO75436 ADGRB2-204ENST00000398542 5176 ntTSL 5 BASIC25.85■■□□□ 1.73
VPS26AO75436 CERS2-205ENST00000368954 2505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.84■■□□□ 1.73
VPS26AO75436 MNX1-207ENST00000543409 1620 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.84■■□□□ 1.73
VPS26AO75436 H2AFV-205ENST00000381124 628 ntTSL 3 BASIC25.83■■□□□ 1.73
VPS26AO75436 VEGFA-231ENST00000640499 1188 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.83■■□□□ 1.73
VPS26AO75436 ATF4-201ENST00000337304 2019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.82■■□□□ 1.72
VPS26AO75436 CGGBP1-206ENST00000482016 1147 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.82■■□□□ 1.72
VPS26AO75436 SCX-201ENST00000567180 999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.82■■□□□ 1.72
VPS26AO75436 SLC30A10-202ENST00000366926 1915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.82■■□□□ 1.72
VPS26AO75436 HNRNPLP2-201ENST00000568980 1570 ntBASIC25.82■■□□□ 1.72
VPS26AO75436 GFRA4-202ENST00000319242 900 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.81■■□□□ 1.72
VPS26AO75436 RUNX2-205ENST00000465038 1770 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC25.81■■□□□ 1.72
VPS26AO75436 ATP6V1E2-204ENST00000522587 1559 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.81■■□□□ 1.72
VPS26AO75436 NMB-201ENST00000360476 1007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.8■■□□□ 1.72
VPS26AO75436 RPS2-209ENST00000529806 993 ntTSL 3 BASIC25.8■■□□□ 1.72
VPS26AO75436 SHF-206ENST00000560471 2499 ntTSL 5 BASIC25.79■■□□□ 1.72
VPS26AO75436 AL139393.2-201ENST00000608721 2025 ntBASIC25.79■■□□□ 1.72
VPS26AO75436 CHPT1-201ENST00000229266 1585 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.78■■□□□ 1.72
VPS26AO75436 AC005559.1-201ENST00000589661 871 ntBASIC25.77■■□□□ 1.72
VPS26AO75436 AP000547.3-202ENST00000592107 1019 ntTSL 1 (best) BASIC25.77■■□□□ 1.72
VPS26AO75436 PDPK1-203ENST00000389224 2416 ntTSL 2 BASIC25.76■■□□□ 1.71
VPS26AO75436 ECI1-203ENST00000562238 948 ntTSL 1 (best) BASIC25.76■■□□□ 1.71
VPS26AO75436 GRK6-206ENST00000507633 1660 ntTSL 5 BASIC25.76■■□□□ 1.71
VPS26AO75436 MARCH11-201ENST00000332432 1741 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.76■■□□□ 1.71
VPS26AO75436 AMZ2-201ENST00000359783 1722 ntTSL 5 BASIC25.76■■□□□ 1.71
VPS26AO75436 HNRNPAB-204ENST00000504898 1785 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.76■■□□□ 1.71
VPS26AO75436 FEV-201ENST00000295727 1879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.76■■□□□ 1.71
VPS26AO75436 ARHGAP22-202ENST00000374170 2107 ntTSL 5 BASIC25.75■■□□□ 1.71
VPS26AO75436 ENKD1-201ENST00000243878 1579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.75■■□□□ 1.71
VPS26AO75436 SPATA5L1-208ENST00000638607 1863 ntTSL 2 BASIC25.74■■□□□ 1.71
VPS26AO75436 MTCH1-202ENST00000373627 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.74■■□□□ 1.71
VPS26AO75436 COL13A1-214ENST00000522165 2061 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.73■■□□□ 1.71
VPS26AO75436 EFNA1-202ENST00000368407 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.72■■□□□ 1.71
VPS26AO75436 HDGF-210ENST00000537739 2073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.72■■□□□ 1.71
VPS26AO75436 TOMM40-201ENST00000252487 1707 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.71■■□□□ 1.71
VPS26AO75436 TOMM40-202ENST00000405636 1709 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.71■■□□□ 1.71
VPS26AO75436 RCC1L-205ENST00000618035 1409 ntTSL 1 (best) BASIC25.71■■□□□ 1.71
VPS26AO75436 CIC-201ENST00000160740 6111 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC25.7■■□□□ 1.71
VPS26AO75436 AP006261.1-201ENST00000584783 668 ntBASIC25.7■■□□□ 1.7
VPS26AO75436 TSEN34-203ENST00000396388 1349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.69■■□□□ 1.7
VPS26AO75436 TERF2-207ENST00000567296 1129 ntTSL 1 (best) BASIC25.69■■□□□ 1.7
VPS26AO75436 DPF1-202ENST00000412732 2303 ntTSL 1 (best) BASIC25.68■■□□□ 1.7
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 17 ms