Protein–RNA interactions for Protein: O75400

PRPF40A, Pre-mRNA-processing factor 40 homolog A, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 957 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PRPF40AO75400 CBX4-202ENST00000448310 718 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC30.43■■■□□ 2.46
PRPF40AO75400 RCOR3-202ENST00000367006 2525 ntTSL 1 (best) BASIC30.42■■■□□ 2.46
PRPF40AO75400 CATIP-201ENST00000289388 1323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.41■■■□□ 2.46
PRPF40AO75400 ATF4-201ENST00000337304 2019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.4■■■□□ 2.46
PRPF40AO75400 ZFAND2B-208ENST00000409594 2021 ntTSL 2 BASIC30.39■■■□□ 2.46
PRPF40AO75400 FLJ37453-201ENST00000317122 2473 ntTSL 2 BASIC30.39■■■□□ 2.46
PRPF40AO75400 NFYB-205ENST00000551727 1727 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC30.39■■■□□ 2.45
PRPF40AO75400 SSBP4-206ENST00000599699 793 ntTSL 2 BASIC30.38■■■□□ 2.45
PRPF40AO75400 HDGF-201ENST00000357325 2380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.37■■■□□ 2.45
PRPF40AO75400 AGAP1-202ENST00000336665 5427 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC30.37■■■□□ 2.45
PRPF40AO75400 SDCCAG3-201ENST00000298537 2314 ntTSL 1 (best) BASIC30.36■■■□□ 2.45
PRPF40AO75400 KANSL1L-207ENST00000452086 2334 ntTSL 1 (best) BASIC30.36■■■□□ 2.45
PRPF40AO75400 TMEM266-201ENST00000388942 2520 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC30.36■■■□□ 2.45
PRPF40AO75400 PLEKHF1-201ENST00000436066 2084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.35■■■□□ 2.45
PRPF40AO75400 WTAP-206ENST00000621533 2109 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC30.35■■■□□ 2.45
PRPF40AO75400 RRNAD1-201ENST00000368216 2254 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC30.35■■■□□ 2.45
PRPF40AO75400 AHSA2-201ENST00000357022 2437 ntTSL 1 (best) BASIC30.35■■■□□ 2.45
PRPF40AO75400 LINC01578-204ENST00000554894 556 ntTSL 3 BASIC30.35■■■□□ 2.45
PRPF40AO75400 LINC01578-207ENST00000556895 802 ntTSL 2 BASIC30.35■■■□□ 2.45
PRPF40AO75400 RDX-210ENST00000530301 1549 ntTSL 1 (best) BASIC30.34■■■□□ 2.45
PRPF40AO75400 LINC01089-207ENST00000538335 630 ntTSL 3 BASIC30.34■■■□□ 2.45
PRPF40AO75400 PCYT2-206ENST00000571105 1628 ntTSL 5 BASIC30.33■■■□□ 2.45
PRPF40AO75400 CLK2-201ENST00000355560 2120 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC30.32■■■□□ 2.44
PRPF40AO75400 ARMC10-205ENST00000428183 2445 ntTSL 1 (best) BASIC30.32■■■□□ 2.44
PRPF40AO75400 HYAL2-202ENST00000395139 2136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.31■■■□□ 2.44
PRPF40AO75400 PEA15-201ENST00000360472 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.31■■■□□ 2.44
PRPF40AO75400 NRTN-201ENST00000303212 1109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.31■■■□□ 2.44
PRPF40AO75400 COMMD7-201ENST00000278980 1900 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC30.31■■■□□ 2.44
PRPF40AO75400 AL121749.1-202ENST00000609313 2153 ntBASIC30.31■■■□□ 2.44
PRPF40AO75400 RNF150-204ENST00000507500 1530 ntTSL 1 (best) BASIC30.3■■■□□ 2.44
PRPF40AO75400 BCL7C-201ENST00000215115 1740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.29■■■□□ 2.44
PRPF40AO75400 CARS2-201ENST00000257347 1879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.29■■■□□ 2.44
PRPF40AO75400 SNTB1-202ENST00000517992 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.28■■■□□ 2.44
PRPF40AO75400 VEGFC-202ENST00000618562 2064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.27■■■□□ 2.44
PRPF40AO75400 SERPING1-205ENST00000403558 2231 ntTSL 5 BASIC30.27■■■□□ 2.44
PRPF40AO75400 KIAA1456-206ENST00000528753 2392 ntTSL 2 BASIC30.27■■■□□ 2.44
PRPF40AO75400 MXI1-201ENST00000239007 2424 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC30.27■■■□□ 2.44
PRPF40AO75400 XKR6-201ENST00000297303 1550 ntTSL 1 (best) BASIC30.27■■■□□ 2.44
PRPF40AO75400 ROM1-201ENST00000278833 1878 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC30.26■■■□□ 2.43
PRPF40AO75400 NRGN-202ENST00000412681 1106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.26■■■□□ 2.43
PRPF40AO75400 OTUD5-208ENST00000610466 2487 ntTSL 5 BASIC30.26■■■□□ 2.43
PRPF40AO75400 KCNJ4-201ENST00000303592 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.26■■■□□ 2.43
PRPF40AO75400 MAPKAPK2-201ENST00000294981 2171 ntTSL 1 (best) BASIC30.25■■■□□ 2.43
PRPF40AO75400 ZDHHC23-206ENST00000498275 2055 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC30.24■■■□□ 2.43
PRPF40AO75400 ABHD17A-202ENST00000292577 1757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.24■■■□□ 2.43
PRPF40AO75400 POU3F3-201ENST00000361360 3064 ntAPPRIS P1 BASIC30.24■■■□□ 2.43
PRPF40AO75400 GLRB-203ENST00000509282 1757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.23■■■□□ 2.43
PRPF40AO75400 ECI1-201ENST00000301729 1541 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC30.23■■■□□ 2.43
PRPF40AO75400 TNFSF12-201ENST00000293825 1553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.23■■■□□ 2.43
PRPF40AO75400 MRAP2-201ENST00000257776 2153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.22■■■□□ 2.43
PRPF40AO75400 LMO2-201ENST00000257818 2294 ntTSL 1 (best) BASIC30.21■■■□□ 2.43
PRPF40AO75400 TMEM55B-201ENST00000250489 1961 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC30.21■■■□□ 2.43
PRPF40AO75400 MSX2-202ENST00000507785 1188 ntTSL 2 BASIC30.21■■■□□ 2.43
PRPF40AO75400 CDK2AP1-203ENST00000535979 1281 ntTSL 3 BASIC30.2■■■□□ 2.43
PRPF40AO75400 SLC9A3R2-202ENST00000432365 1564 ntTSL 1 (best) BASIC30.2■■■□□ 2.42
PRPF40AO75400 TNIP2-201ENST00000315423 1974 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC30.19■■■□□ 2.42
PRPF40AO75400 NPTXR-202ENST00000640136 1503 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC30.18■■■□□ 2.42
PRPF40AO75400 PLEKHG6-206ENST00000536531 1683 ntTSL 1 (best) BASIC30.18■■■□□ 2.42
PRPF40AO75400 NAPA-201ENST00000263354 1839 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.18■■■□□ 2.42
PRPF40AO75400 CCKBR-201ENST00000334619 2121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.18■■■□□ 2.42
PRPF40AO75400 THRA-204ENST00000546243 1909 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC30.18■■■□□ 2.42
PRPF40AO75400 CGREF1-204ENST00000402550 1575 ntTSL 2 BASIC30.17■■■□□ 2.42
PRPF40AO75400 RAB40C-204ENST00000538492 2569 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC30.17■■■□□ 2.42
PRPF40AO75400 PELI3-203ENST00000524466 1671 ntTSL 1 (best) BASIC30.17■■■□□ 2.42
PRPF40AO75400 IHH-201ENST00000295731 2023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.17■■■□□ 2.42
PRPF40AO75400 FAM89B-201ENST00000316409 1409 ntTSL 1 (best) BASIC30.16■■■□□ 2.42
PRPF40AO75400 RCAN1-201ENST00000313806 2490 ntTSL 1 (best) BASIC30.16■■■□□ 2.42
PRPF40AO75400 MXD3-203ENST00000439742 1483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.15■■■□□ 2.42
PRPF40AO75400 ZNF768-201ENST00000380412 2315 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC30.15■■■□□ 2.42
PRPF40AO75400 GAL3ST1-204ENST00000402369 1712 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC30.15■■■□□ 2.42
PRPF40AO75400 SLC16A3-214ENST00000582743 2002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.15■■■□□ 2.42
PRPF40AO75400 CHST14-202ENST00000559991 1968 ntTSL 5 BASIC30.14■■■□□ 2.42
PRPF40AO75400 PIP4K2B-204ENST00000619039 5734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.14■■■□□ 2.42
PRPF40AO75400 NOP53-201ENST00000246802 1528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.14■■■□□ 2.42
PRPF40AO75400 TMEM187-201ENST00000369982 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.14■■■□□ 2.42
PRPF40AO75400 AC068152.1-207ENST00000573341 647 ntTSL 2 BASIC30.13■■■□□ 2.41
PRPF40AO75400 FSD1L-208ENST00000495708 1906 ntTSL 1 (best) BASIC30.13■■■□□ 2.41
PRPF40AO75400 CDKN2D-202ENST00000393599 1422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.13■■■□□ 2.41
PRPF40AO75400 RHOQ-201ENST00000238738 2975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.12■■■□□ 2.41
PRPF40AO75400 CAMKK1-201ENST00000158166 2459 ntTSL 1 (best) BASIC30.12■■■□□ 2.41
PRPF40AO75400 WASH5P-204ENST00000632292 975 ntBASIC30.12■■■□□ 2.41
PRPF40AO75400 AC025431.1-201ENST00000559684 874 ntTSL 3 BASIC30.11■■■□□ 2.41
PRPF40AO75400 RHEB-201ENST00000262187 2075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.11■■■□□ 2.41
PRPF40AO75400 PKDCC-201ENST00000294964 2502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.1■■■□□ 2.41
PRPF40AO75400 ADNP-AS1-201ENST00000558899 927 ntTSL 3 BASIC30.1■■■□□ 2.41
PRPF40AO75400 FAM107B-205ENST00000378467 2374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.1■■■□□ 2.41
PRPF40AO75400 THAP4-204ENST00000407315 2367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.1■■■□□ 2.41
PRPF40AO75400 FTCD-201ENST00000291670 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.09■■■□□ 2.41
PRPF40AO75400 CAPNS1-204ENST00000587718 1558 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC30.09■■■□□ 2.41
PRPF40AO75400 MARCH11-201ENST00000332432 1741 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC30.08■■■□□ 2.41
PRPF40AO75400 MKNK2-202ENST00000309340 1744 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC30.08■■■□□ 2.41
PRPF40AO75400 TMEM185A-207ENST00000600449 2840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.05■■■□□ 2.4
PRPF40AO75400 RUNDC3A-201ENST00000225441 1821 ntTSL 1 (best) BASIC30.05■■■□□ 2.4
PRPF40AO75400 PSMG1-201ENST00000331573 2154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.04■■■□□ 2.4
PRPF40AO75400 CYB5R3-201ENST00000352397 2124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.04■■■□□ 2.4
PRPF40AO75400 KLF16-203ENST00000592313 508 ntTSL 3 BASIC30.03■■■□□ 2.4
PRPF40AO75400 FADD-201ENST00000301838 1841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.03■■■□□ 2.4
PRPF40AO75400 VIPR2-203ENST00000402066 1926 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC30.02■■■□□ 2.4
PRPF40AO75400 ARHGEF7-206ENST00000375741 5525 ntTSL 1 (best) BASIC30.02■■■□□ 2.4
PRPF40AO75400 AC010864.1-201ENST00000609407 1511 ntBASIC30.01■■■□□ 2.4
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 14.3 ms