Protein–RNA interactions for Protein: O60391

GRIN3B, Glutamate receptor ionotropic, NMDA 3B, humanhuman

Predictions only

Length 1,043 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GRIN3BO60391 RNF150-204ENST00000507500 1530 ntTSL 1 (best) BASIC33.32■■■□□ 2.92
GRIN3BO60391 ENHO-201ENST00000399775 1082 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC33.31■■■□□ 2.92
GRIN3BO60391 TRIP10-202ENST00000313285 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.3■■■□□ 2.92
GRIN3BO60391 RPS20-211ENST00000524349 752 ntTSL 1 (best) BASIC33.3■■■□□ 2.92
GRIN3BO60391 CHML-204ENST00000638121 920 ntTSL 2 BASIC33.3■■■□□ 2.92
GRIN3BO60391 ACOT1-202ENST00000557556 1271 ntTSL 1 (best) BASIC33.28■■■□□ 2.92
GRIN3BO60391 CACNG6-201ENST00000252729 1853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.27■■■□□ 2.92
GRIN3BO60391 CAPNS1-216ENST00000628306 1389 ntTSL 5 BASIC33.27■■■□□ 2.92
GRIN3BO60391 ZSCAN1-202ENST00000391700 952 ntTSL 1 (best) BASIC33.27■■■□□ 2.92
GRIN3BO60391 CEP120-209ENST00000515110 606 ntTSL 3 BASIC33.27■■■□□ 2.92
GRIN3BO60391 DTNBP1-202ENST00000344537 1403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.27■■■□□ 2.92
GRIN3BO60391 AGO3-204ENST00000397828 1035 ntTSL 2 BASIC33.26■■■□□ 2.91
GRIN3BO60391 CBWD5-202ENST00000377384 1347 ntTSL 1 (best) BASIC33.26■■■□□ 2.91
GRIN3BO60391 RAD51-210ENST00000557850 1397 ntTSL 2 BASIC33.25■■■□□ 2.91
GRIN3BO60391 CTXN1-201ENST00000318978 1274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.25■■■□□ 2.91
GRIN3BO60391 PTCH1-210ENST00000468211 1254 ntTSL 1 (best) BASIC33.25■■■□□ 2.91
GRIN3BO60391 SNX5-219ENST00000606602 885 ntTSL 1 (best) BASIC33.24■■■□□ 2.91
GRIN3BO60391 MDFIC-208ENST00000614186 1068 ntTSL 1 (best) BASIC33.24■■■□□ 2.91
GRIN3BO60391 AC092902.2-221ENST00000628476 965 ntTSL 5 BASIC33.23■■■□□ 2.91
GRIN3BO60391 C1orf122-201ENST00000373042 973 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC33.22■■■□□ 2.91
GRIN3BO60391 AL033527.3-201ENST00000566366 1196 ntBASIC33.22■■■□□ 2.91
GRIN3BO60391 ARTN-202ENST00000372359 1921 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC33.2■■■□□ 2.91
GRIN3BO60391 LIME1-206ENST00000487026 805 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC33.19■■■□□ 2.9
GRIN3BO60391 RUNX2-211ENST00000625924 1458 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC33.18■■■□□ 2.9
GRIN3BO60391 CTDNEP1-210ENST00000574322 1708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.17■■■□□ 2.9
GRIN3BO60391 FAM168B-201ENST00000389915 944 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC33.17■■■□□ 2.9
GRIN3BO60391 AC008813.1-201ENST00000536597 885 ntBASIC33.17■■■□□ 2.9
GRIN3BO60391 C11orf96-203ENST00000617612 1294 ntAPPRIS P1 BASIC33.16■■■□□ 2.9
GRIN3BO60391 C1orf232-201ENST00000634842 643 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC33.16■■■□□ 2.9
GRIN3BO60391 FAM78B-202ENST00000354422 1475 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC33.16■■■□□ 2.9
GRIN3BO60391 B4GALT7-201ENST00000029410 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.15■■■□□ 2.9
GRIN3BO60391 HDAC3-201ENST00000305264 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.15■■■□□ 2.9
GRIN3BO60391 KLC2-205ENST00000394078 1557 ntTSL 5 BASIC33.15■■■□□ 2.9
GRIN3BO60391 UBE2L6-201ENST00000287156 1354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.14■■■□□ 2.9
GRIN3BO60391 HES4-202ENST00000428771 1040 ntTSL 2 BASIC33.11■■■□□ 2.89
GRIN3BO60391 BANF1-208ENST00000533166 1135 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC33.11■■■□□ 2.89
GRIN3BO60391 ATP8B2-201ENST00000368487 1523 ntTSL 1 (best) BASIC33.11■■■□□ 2.89
GRIN3BO60391 STUB1-201ENST00000219548 1472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.11■■■□□ 2.89
GRIN3BO60391 CLTA-207ENST00000470744 1102 ntTSL 2 BASIC33.1■■■□□ 2.89
GRIN3BO60391 MANF-204ENST00000528157 1153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.1■■■□□ 2.89
GRIN3BO60391 AP000251.1-201ENST00000433071 822 ntTSL 1 (best) BASIC33.09■■■□□ 2.89
GRIN3BO60391 RUNX2-203ENST00000371436 1588 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC33.09■■■□□ 2.89
GRIN3BO60391 FEZF2-201ENST00000283268 2074 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.08■■■□□ 2.89
GRIN3BO60391 AC073111.5-206ENST00000642087 859 ntAPPRIS P1 BASIC33.07■■■□□ 2.88
GRIN3BO60391 CGREF1-202ENST00000312734 1610 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC33.06■■■□□ 2.88
GRIN3BO60391 C2orf88-204ENST00000409870 1441 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC33.05■■■□□ 2.88
GRIN3BO60391 AC022413.1-201ENST00000624602 984 ntBASIC33.05■■■□□ 2.88
GRIN3BO60391 TRAPPC10-202ENST00000380221 1763 ntTSL 1 (best) BASIC33.05■■■□□ 2.88
GRIN3BO60391 CHST11-202ENST00000546689 756 ntTSL 2 BASIC33.04■■■□□ 2.88
GRIN3BO60391 AC138207.2-201ENST00000583377 492 ntTSL 2 BASIC33.03■■■□□ 2.88
GRIN3BO60391 SMARCD3-201ENST00000262188 1993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.03■■■□□ 2.88
GRIN3BO60391 AC019069.1-201ENST00000610008 1333 ntBASIC33.02■■■□□ 2.88
GRIN3BO60391 QDPR-208ENST00000513615 1188 ntTSL 2 BASIC33.01■■■□□ 2.87
GRIN3BO60391 S1PR4-201ENST00000246115 1565 ntAPPRIS P1 BASIC33■■■□□ 2.87
GRIN3BO60391 AL590677.1-201ENST00000438431 380 ntTSL 5 BASIC33■■■□□ 2.87
GRIN3BO60391 EI24-212ENST00000615917 1407 ntTSL 2 BASIC32.97■■■□□ 2.87
GRIN3BO60391 PXMP2-201ENST00000317479 957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.97■■■□□ 2.87
GRIN3BO60391 TSR3-201ENST00000007390 1243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.96■■■□□ 2.87
GRIN3BO60391 BRF1-221ENST00000619151 1530 ntTSL 5 BASIC32.96■■■□□ 2.87
GRIN3BO60391 LINC01770-201ENST00000417917 634 ntTSL 2 BASIC32.95■■■□□ 2.87
GRIN3BO60391 BAX-202ENST00000345358 793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.94■■■□□ 2.86
GRIN3BO60391 HSD17B12-202ENST00000395700 994 ntTSL 1 (best) BASIC32.94■■■□□ 2.86
GRIN3BO60391 RARRES2P1-201ENST00000474487 481 ntBASIC32.94■■■□□ 2.86
GRIN3BO60391 PXMP2-205ENST00000543589 632 ntTSL 3 BASIC32.94■■■□□ 2.86
GRIN3BO60391 ACTR3B-202ENST00000377776 1566 ntTSL 1 (best) BASIC32.92■■■□□ 2.86
GRIN3BO60391 AC231981.1-201ENST00000450917 974 ntTSL 3 BASIC32.92■■■□□ 2.86
GRIN3BO60391 TRIM52-AS1-202ENST00000507434 672 ntTSL 1 (best) BASIC32.92■■■□□ 2.86
GRIN3BO60391 ANXA5-201ENST00000296511 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.9■■■□□ 2.86
GRIN3BO60391 NPW-202ENST00000566435 991 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC32.89■■■□□ 2.86
GRIN3BO60391 KIF13A-207ENST00000502704 1330 ntTSL 1 (best) BASIC32.88■■■□□ 2.85
GRIN3BO60391 MZT2B-201ENST00000281871 933 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC32.87■■■□□ 2.85
GRIN3BO60391 MZT2A-201ENST00000309451 624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.87■■■□□ 2.85
GRIN3BO60391 TSPY13P-201ENST00000338964 914 ntBASIC32.87■■■□□ 2.85
GRIN3BO60391 GFER-205ENST00000569451 517 ntTSL 5 BASIC32.87■■■□□ 2.85
GRIN3BO60391 MMP28-203ENST00000612672 1092 ntTSL 1 (best) BASIC32.87■■■□□ 2.85
GRIN3BO60391 SERINC2-201ENST00000373709 1997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.87■■■□□ 2.85
GRIN3BO60391 MAPK3-202ENST00000322266 1743 ntTSL 5 BASIC32.86■■■□□ 2.85
GRIN3BO60391 LYSMD2-202ENST00000454181 1228 ntTSL 1 (best) BASIC32.86■■■□□ 2.85
GRIN3BO60391 TXNL4A-208ENST00000588162 752 ntTSL 2 BASIC32.86■■■□□ 2.85
GRIN3BO60391 U85056.1-201ENST00000616429 682 ntBASIC32.86■■■□□ 2.85
GRIN3BO60391 CTDNEP1-201ENST00000318988 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.86■■■□□ 2.85
GRIN3BO60391 AL592295.1-201ENST00000400984 884 ntBASIC32.84■■■□□ 2.85
GRIN3BO60391 HOMER3-207ENST00000594794 903 ntTSL 5 BASIC32.84■■■□□ 2.85
GRIN3BO60391 WHRN-203ENST00000374057 1718 ntTSL 2 BASIC32.84■■■□□ 2.85
GRIN3BO60391 TNFRSF4-201ENST00000379236 1068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.83■■■□□ 2.85
GRIN3BO60391 LINC01918-201ENST00000436841 797 ntTSL 2 BASIC32.82■■■□□ 2.84
GRIN3BO60391 CCDC37-AS1-202ENST00000506660 986 ntTSL 1 (best) BASIC32.81■■■□□ 2.84
GRIN3BO60391 TMEM114-202ENST00000568335 899 ntTSL 3 BASIC32.81■■■□□ 2.84
GRIN3BO60391 ZDHHC16-201ENST00000345745 1519 ntTSL 1 (best) BASIC32.79■■■□□ 2.84
GRIN3BO60391 SURF1-201ENST00000371974 1093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.79■■■□□ 2.84
GRIN3BO60391 SURF1-205ENST00000615505 991 ntTSL 1 (best) BASIC32.79■■■□□ 2.84
GRIN3BO60391 SLC9A3R2-202ENST00000432365 1564 ntTSL 1 (best) BASIC32.79■■■□□ 2.84
GRIN3BO60391 ATP6V1E2-204ENST00000522587 1559 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC32.79■■■□□ 2.84
GRIN3BO60391 HYI-213ENST00000583037 1322 ntTSL 5 BASIC32.78■■■□□ 2.84
GRIN3BO60391 SFRP5-201ENST00000266066 1836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.77■■■□□ 2.84
GRIN3BO60391 C20orf24-203ENST00000373852 1059 ntTSL 1 (best) BASIC32.77■■■□□ 2.84
GRIN3BO60391 CTDNEP1-208ENST00000573600 1724 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC32.75■■■□□ 2.83
GRIN3BO60391 AC004987.1-201ENST00000428627 508 ntBASIC32.75■■■□□ 2.83
GRIN3BO60391 JUND-201ENST00000252818 1863 ntAPPRIS P1 BASIC32.74■■■□□ 2.83
GRIN3BO60391 ATP5G2P3-201ENST00000429083 425 ntBASIC32.74■■■□□ 2.83
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 14.7 ms