Protein–RNA interactions for Protein: O60248

SOX15, Protein SOX-15, humanhuman

Predictions only

Length 233 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SOX15O60248 EFNA3-201ENST00000368408 1782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
SOX15O60248 RNF150-204ENST00000507500 1530 ntTSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
SOX15O60248 ZNF513-201ENST00000323703 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
SOX15O60248 HOXD-AS2-202ENST00000440016 999 ntTSL 5 BASIC21.19■□□□□ 0.98
SOX15O60248 ZNF219-201ENST00000360947 3071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
SOX15O60248 TSPOAP1-AS1-203ENST00000579527 2042 ntTSL 2 BASIC21.19■□□□□ 0.98
SOX15O60248 ZFPM1-201ENST00000319555 5380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
SOX15O60248 COL13A1-203ENST00000398969 2267 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.18■□□□□ 0.98
SOX15O60248 FAAH-201ENST00000243167 2094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
SOX15O60248 GNPTAB-202ENST00000392919 760 ntTSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
SOX15O60248 INPP5A-202ENST00000368593 1432 ntTSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
SOX15O60248 ABHD17A-201ENST00000250974 1630 ntTSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
SOX15O60248 RTN4R-201ENST00000043402 2157 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
SOX15O60248 CERS2-205ENST00000368954 2505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
SOX15O60248 PLSCR3-209ENST00000574401 2032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
SOX15O60248 PDPK1-203ENST00000389224 2416 ntTSL 2 BASIC21.16■□□□□ 0.98
SOX15O60248 HOXB3-210ENST00000489475 1845 ntTSL 2 BASIC21.16■□□□□ 0.98
SOX15O60248 COMMD3-201ENST00000376836 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
SOX15O60248 EBPL-202ENST00000378268 680 ntTSL 3 BASIC21.16■□□□□ 0.98
SOX15O60248 AC142086.6-201ENST00000621154 1765 ntBASIC21.15■□□□□ 0.98
SOX15O60248 LMO1-202ENST00000428101 1038 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
SOX15O60248 FOXE3-201ENST00000335071 1981 ntAPPRIS P1 BASIC21.14■□□□□ 0.97
SOX15O60248 ZNF787-203ENST00000610935 1925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
SOX15O60248 WHRN-203ENST00000374057 1718 ntTSL 2 BASIC21.12■□□□□ 0.97
SOX15O60248 RHOQ-201ENST00000238738 2975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
SOX15O60248 HOPX-206ENST00000503639 1248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
SOX15O60248 GSC2-201ENST00000086933 1033 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.12■□□□□ 0.97
SOX15O60248 JMJD8-216ENST00000609261 1901 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
SOX15O60248 AC234582.1-201ENST00000447623 923 ntTSL 5 BASIC21.11■□□□□ 0.97
SOX15O60248 LRRC61-202ENST00000359623 1877 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.11■□□□□ 0.97
SOX15O60248 BMP7-204ENST00000450594 1857 ntTSL 2 BASIC21.1■□□□□ 0.97
SOX15O60248 OSBP-201ENST00000263847 5083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
SOX15O60248 SLC30A10-202ENST00000366926 1915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
SOX15O60248 HNRNPAB-206ENST00000506339 1747 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.09■□□□□ 0.97
SOX15O60248 TESK1-201ENST00000336395 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
SOX15O60248 KCNQ5-204ENST00000370392 1469 ntTSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
SOX15O60248 TPGS1-201ENST00000359315 1114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
SOX15O60248 PSMG4-205ENST00000419065 629 ntTSL 2 BASIC21.09■□□□□ 0.97
SOX15O60248 SLC52A2-201ENST00000329994 1896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
SOX15O60248 FOXQ1-201ENST00000296839 2309 ntAPPRIS P1 BASIC21.08■□□□□ 0.97
SOX15O60248 CACNG6-202ENST00000346968 645 ntTSL 5 BASIC21.08■□□□□ 0.97
SOX15O60248 GABRA5-203ENST00000400081 2761 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.08■□□□□ 0.97
SOX15O60248 HAND2-201ENST00000359562 2780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.96
SOX15O60248 PACS2-201ENST00000325438 3708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
SOX15O60248 PCYT2-203ENST00000538936 5147 ntTSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
SOX15O60248 GAL3ST1-205ENST00000406361 1819 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.07■□□□□ 0.96
SOX15O60248 PGM5-201ENST00000396392 1782 ntTSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
SOX15O60248 PLSCR3-214ENST00000619711 2066 ntTSL 5 BASIC21.06■□□□□ 0.96
SOX15O60248 S100A10-202ENST00000368811 1202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
SOX15O60248 SHOX2-204ENST00000483851 1866 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.06■□□□□ 0.96
SOX15O60248 PICK1-201ENST00000356976 2055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
SOX15O60248 NREP-202ENST00000379671 2581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
SOX15O60248 PGM5P2-201ENST00000613141 1980 ntTSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
SOX15O60248 HOXB3-201ENST00000311626 2642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
SOX15O60248 NMB-201ENST00000360476 1007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
SOX15O60248 CAPNS1-217ENST00000629983 799 ntTSL 5 BASIC21.05■□□□□ 0.96
SOX15O60248 CAPN10-208ENST00000404753 2570 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.05■□□□□ 0.96
SOX15O60248 CHPT1-205ENST00000549872 2001 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.05■□□□□ 0.96
SOX15O60248 ARHGAP22-202ENST00000374170 2107 ntTSL 5 BASIC21.05■□□□□ 0.96
SOX15O60248 DENR-202ENST00000455982 1052 ntTSL 5 BASIC21.04■□□□□ 0.96
SOX15O60248 RAB26-201ENST00000210187 1675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
SOX15O60248 EPB41L4B-202ENST00000374566 5800 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
SOX15O60248 GKAP1-203ENST00000376371 1778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
SOX15O60248 TMEM185A-207ENST00000600449 2840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
SOX15O60248 ARMC10-205ENST00000428183 2445 ntTSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
SOX15O60248 TSPAN11-203ENST00000545802 1649 ntTSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
SOX15O60248 MTCH1-201ENST00000373616 2006 ntTSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.96
SOX15O60248 SLC9A3R2-202ENST00000432365 1564 ntTSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.96
SOX15O60248 CDH24-206ENST00000610348 2037 ntTSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.96
SOX15O60248 SSU72-201ENST00000291386 1290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.96
SOX15O60248 MSX1-201ENST00000382723 1939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.95
SOX15O60248 DPF1-202ENST00000412732 2303 ntTSL 1 (best) BASIC21■□□□□ 0.95
SOX15O60248 IFFO2-203ENST00000455833 6188 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.99■□□□□ 0.95
SOX15O60248 DHRS13-202ENST00000394901 2037 ntTSL 1 (best) BASIC20.99■□□□□ 0.95
SOX15O60248 HNRNPAB-202ENST00000358344 1796 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.98■□□□□ 0.95
SOX15O60248 SHARPIN-202ENST00000398712 1765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.98■□□□□ 0.95
SOX15O60248 SEC61G-204ENST00000450622 512 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.98■□□□□ 0.95
SOX15O60248 CGGBP1-206ENST00000482016 1147 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.98■□□□□ 0.95
SOX15O60248 MXD3-203ENST00000439742 1483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.98■□□□□ 0.95
SOX15O60248 HOOK2-201ENST00000264827 2603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.98■□□□□ 0.95
SOX15O60248 COL13A1-213ENST00000520267 2276 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.98■□□□□ 0.95
SOX15O60248 RDX-210ENST00000530301 1549 ntTSL 1 (best) BASIC20.98■□□□□ 0.95
SOX15O60248 TCEA2-204ENST00000395053 1733 ntTSL 1 (best) BASIC20.98■□□□□ 0.95
SOX15O60248 PCYT2-206ENST00000571105 1628 ntTSL 5 BASIC20.97■□□□□ 0.95
SOX15O60248 CTBP1-201ENST00000290921 2297 ntTSL 1 (best) BASIC20.97■□□□□ 0.95
SOX15O60248 FAM78B-202ENST00000354422 1475 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.97■□□□□ 0.95
SOX15O60248 MFSD12-201ENST00000355415 2124 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.97■□□□□ 0.95
SOX15O60248 LYNX1-208ENST00000615007 1293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.97■□□□□ 0.95
SOX15O60248 CGREF1-204ENST00000402550 1575 ntTSL 2 BASIC20.97■□□□□ 0.95
SOX15O60248 FAM89B-201ENST00000316409 1409 ntTSL 1 (best) BASIC20.96■□□□□ 0.95
SOX15O60248 HES7-202ENST00000541682 1674 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.96■□□□□ 0.95
SOX15O60248 ECI1-203ENST00000562238 948 ntTSL 1 (best) BASIC20.96■□□□□ 0.95
SOX15O60248 YAP1-204ENST00000526343 2393 ntTSL 5 BASIC20.95■□□□□ 0.94
SOX15O60248 ATRAID-201ENST00000380171 1240 ntTSL 1 (best) BASIC20.95■□□□□ 0.94
SOX15O60248 MIR762-201ENST00000390236 83 ntBASIC20.95■□□□□ 0.94
SOX15O60248 C9orf40-201ENST00000376854 2327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.94■□□□□ 0.94
SOX15O60248 HNRNPLP2-201ENST00000568980 1570 ntBASIC20.94■□□□□ 0.94
SOX15O60248 H2AFV-205ENST00000381124 628 ntTSL 3 BASIC20.94■□□□□ 0.94
SOX15O60248 GSTP1-202ENST00000398606 965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.94■□□□□ 0.94
SOX15O60248 COL13A1-214ENST00000522165 2061 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.93■□□□□ 0.94
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 179.6 ms