Protein–RNA interactions for Protein: O43889

CREB3, Cyclic AMP-responsive element-binding protein 3, humanhuman

Predictions only

Length 395 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CREB3O43889 DUX4L28-201ENST00000623687 678 ntBASIC27.27■■□□□ 1.96
CREB3O43889 CGREF1-203ENST00000402394 1906 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC27.27■■□□□ 1.96
CREB3O43889 RCC1L-202ENST00000614461 2419 ntTSL 1 (best) BASIC27.26■■□□□ 1.95
CREB3O43889 HNRNPAB-202ENST00000358344 1796 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC27.25■■□□□ 1.95
CREB3O43889 NOXA1-201ENST00000341349 1678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.25■■□□□ 1.95
CREB3O43889 FAM185A-202ENST00000413034 1179 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC27.25■■□□□ 1.95
CREB3O43889 AP006261.1-201ENST00000584783 668 ntBASIC27.25■■□□□ 1.95
CREB3O43889 SIRT3-201ENST00000382743 2543 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.24■■□□□ 1.95
CREB3O43889 MIR3665-201ENST00000578708 105 ntBASIC27.24■■□□□ 1.95
CREB3O43889 ATPAF1-202ENST00000371937 1827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.24■■□□□ 1.95
CREB3O43889 YAP1-204ENST00000526343 2393 ntTSL 5 BASIC27.23■■□□□ 1.95
CREB3O43889 TSEN34-203ENST00000396388 1349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.23■■□□□ 1.95
CREB3O43889 CCDC88C-205ENST00000553403 1651 ntTSL 1 (best) BASIC27.23■■□□□ 1.95
CREB3O43889 BCL3-201ENST00000164227 2038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.23■■□□□ 1.95
CREB3O43889 ATP6V1E2-204ENST00000522587 1559 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC27.22■■□□□ 1.95
CREB3O43889 NRG1-221ENST00000614767 762 ntTSL 5 BASIC27.22■■□□□ 1.95
CREB3O43889 FGFRL1-205ENST00000510644 2304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.22■■□□□ 1.95
CREB3O43889 STUB1-205ENST00000565677 1560 ntTSL 1 (best) BASIC27.22■■□□□ 1.95
CREB3O43889 NKIRAS2-202ENST00000316082 833 ntTSL 5 BASIC27.21■■□□□ 1.95
CREB3O43889 PHOX2A-201ENST00000298231 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.21■■□□□ 1.95
CREB3O43889 BATF3-201ENST00000243440 980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.2■■□□□ 1.94
CREB3O43889 AL162393.1-201ENST00000437852 946 ntBASIC27.2■■□□□ 1.94
CREB3O43889 AC004080.1-201ENST00000523608 757 ntTSL 2 BASIC27.2■■□□□ 1.94
CREB3O43889 TERF2-207ENST00000567296 1129 ntTSL 1 (best) BASIC27.2■■□□□ 1.94
CREB3O43889 ESRRA-201ENST00000000442 2215 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.2■■□□□ 1.94
CREB3O43889 CHPT1-201ENST00000229266 1585 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.19■■□□□ 1.94
CREB3O43889 GTF3C4-202ENST00000483873 1417 ntTSL 3 BASIC27.19■■□□□ 1.94
CREB3O43889 PSMG4-202ENST00000380305 489 ntTSL 5 BASIC27.19■■□□□ 1.94
CREB3O43889 SCX-201ENST00000567180 999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.19■■□□□ 1.94
CREB3O43889 AP000547.3-202ENST00000592107 1019 ntTSL 1 (best) BASIC27.19■■□□□ 1.94
CREB3O43889 RNF130-205ENST00000521389 2263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.19■■□□□ 1.94
CREB3O43889 NAA50-207ENST00000493900 962 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC27.18■■□□□ 1.94
CREB3O43889 NEUROG2-201ENST00000313341 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.18■■□□□ 1.94
CREB3O43889 PQLC1-202ENST00000357575 2475 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC27.17■■□□□ 1.94
CREB3O43889 CCND3-203ENST00000372991 2085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.17■■□□□ 1.94
CREB3O43889 CUL4A-202ENST00000375440 2364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.16■■□□□ 1.94
CREB3O43889 GIPC1-203ENST00000393033 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.16■■□□□ 1.94
CREB3O43889 EMC10-202ENST00000376918 2014 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.16■■□□□ 1.94
CREB3O43889 MTNR1A-201ENST00000307161 1289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.15■■□□□ 1.94
CREB3O43889 PPP1R14B-201ENST00000309318 982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.15■■□□□ 1.94
CREB3O43889 FSD1L-208ENST00000495708 1906 ntTSL 1 (best) BASIC27.14■■□□□ 1.94
CREB3O43889 TXNL4A-210ENST00000591711 669 ntTSL 2 BASIC27.14■■□□□ 1.94
CREB3O43889 KCTD17-202ENST00000403888 1763 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.14■■□□□ 1.93
CREB3O43889 CCZ1B-215ENST00000626257 2211 ntTSL 2 BASIC27.13■■□□□ 1.93
CREB3O43889 MATK-201ENST00000310132 2133 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.13■■□□□ 1.93
CREB3O43889 ECI1-207ENST00000570258 1512 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.13■■□□□ 1.93
CREB3O43889 TCEA2-202ENST00000343484 1235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.13■■□□□ 1.93
CREB3O43889 CUEDC1-201ENST00000360238 2193 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.13■■□□□ 1.93
CREB3O43889 TMEM268-201ENST00000288502 2314 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.13■■□□□ 1.93
CREB3O43889 MAD2L2-205ENST00000376669 864 ntTSL 3 BASIC27.12■■□□□ 1.93
CREB3O43889 SHOX2-204ENST00000483851 1866 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.12■■□□□ 1.93
CREB3O43889 ABHD17A-202ENST00000292577 1757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.12■■□□□ 1.93
CREB3O43889 NGB-201ENST00000298352 1884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.11■■□□□ 1.93
CREB3O43889 MEX3D-201ENST00000402693 2850 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.11■■□□□ 1.93
CREB3O43889 RRAGC-201ENST00000373001 2732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.11■■□□□ 1.93
CREB3O43889 FOXE3-201ENST00000335071 1981 ntAPPRIS P1 BASIC27.1■■□□□ 1.93
CREB3O43889 HOXD13-201ENST00000392539 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.09■■□□□ 1.93
CREB3O43889 AC087741.3-201ENST00000624270 1347 ntBASIC27.09■■□□□ 1.93
CREB3O43889 ABCB10P3-201ENST00000561950 2166 ntBASIC27.08■■□□□ 1.93
CREB3O43889 MFAP2-202ENST00000375535 1260 ntTSL 1 (best) BASIC27.07■■□□□ 1.92
CREB3O43889 RTN2-201ENST00000245923 2293 ntTSL 1 (best) BASIC27.06■■□□□ 1.92
CREB3O43889 FOXQ1-201ENST00000296839 2309 ntAPPRIS P1 BASIC27.06■■□□□ 1.92
CREB3O43889 HNRNPAB-205ENST00000506259 1674 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.06■■□□□ 1.92
CREB3O43889 AC139426.1-201ENST00000568218 2529 ntBASIC27.06■■□□□ 1.92
CREB3O43889 MACROD1-201ENST00000255681 1205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.06■■□□□ 1.92
CREB3O43889 HNRNPAB-204ENST00000504898 1785 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC27.06■■□□□ 1.92
CREB3O43889 RCE1-201ENST00000309657 1485 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.06■■□□□ 1.92
CREB3O43889 MKNK2-202ENST00000309340 1744 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.05■■□□□ 1.92
CREB3O43889 ACOT7-201ENST00000361521 2429 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.05■■□□□ 1.92
CREB3O43889 COX4I1-203ENST00000562336 873 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.05■■□□□ 1.92
CREB3O43889 KLC2-205ENST00000394078 1557 ntTSL 5 BASIC27.05■■□□□ 1.92
CREB3O43889 ZNF787-203ENST00000610935 1925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.04■■□□□ 1.92
CREB3O43889 PXDC1-202ENST00000380283 2190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.04■■□□□ 1.92
CREB3O43889 RPS2P35-201ENST00000443417 897 ntBASIC27.04■■□□□ 1.92
CREB3O43889 EXOC3-209ENST00000512944 2825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.04■■□□□ 1.92
CREB3O43889 IRX1-201ENST00000302006 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.04■■□□□ 1.92
CREB3O43889 AP002884.3-203ENST00000419895 1711 ntTSL 2 BASIC27.03■■□□□ 1.92
CREB3O43889 UBE2S-203ENST00000589978 496 ntTSL 5 BASIC27.03■■□□□ 1.92
CREB3O43889 TOMM40-201ENST00000252487 1707 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.02■■□□□ 1.92
CREB3O43889 TOMM40-202ENST00000405636 1709 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.02■■□□□ 1.92
CREB3O43889 AP000911.1-206ENST00000531938 711 ntTSL 3 BASIC27.02■■□□□ 1.92
CREB3O43889 ENKD1-201ENST00000243878 1579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.01■■□□□ 1.92
CREB3O43889 AC108673.1-201ENST00000510422 1159 ntBASIC27.01■■□□□ 1.91
CREB3O43889 BCL7C-201ENST00000215115 1740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.01■■□□□ 1.91
CREB3O43889 RDX-210ENST00000530301 1549 ntTSL 1 (best) BASIC27■■□□□ 1.91
CREB3O43889 MIR6090-201ENST00000622481 60 ntBASIC27■■□□□ 1.91
CREB3O43889 FGF18-201ENST00000274625 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27■■□□□ 1.91
CREB3O43889 EFNA3-201ENST00000368408 1782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.99■■□□□ 1.91
CREB3O43889 AGFG1-205ENST00000409979 2089 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC26.99■■□□□ 1.91
CREB3O43889 PGM5P2-201ENST00000613141 1980 ntTSL 1 (best) BASIC26.99■■□□□ 1.91
CREB3O43889 SMIM12-205ENST00000456842 918 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.99■■□□□ 1.91
CREB3O43889 RUNX2-205ENST00000465038 1770 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC26.99■■□□□ 1.91
CREB3O43889 GRK6-206ENST00000507633 1660 ntTSL 5 BASIC26.98■■□□□ 1.91
CREB3O43889 PPP1R35-201ENST00000292330 1031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.98■■□□□ 1.91
CREB3O43889 POLR1D-201ENST00000302979 1166 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.98■■□□□ 1.91
CREB3O43889 CDKN2A-201ENST00000304494 1218 ntTSL 1 (best) BASIC26.98■■□□□ 1.91
CREB3O43889 AC044849.2-201ENST00000606596 710 ntBASIC26.98■■□□□ 1.91
CREB3O43889 HOXB3-212ENST00000498678 2196 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.98■■□□□ 1.91
CREB3O43889 DTNBP1-202ENST00000344537 1403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.98■■□□□ 1.91
CREB3O43889 MISP3-202ENST00000587086 1535 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.97■■□□□ 1.91
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 90.9 ms