Protein–RNA interactions for Protein: O15079

SNPH, Syntaphilin, humanhuman

Predictions only

Length 494 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SNPHO15079 MLST8-203ENST00000397124 1691 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC24.38■■□□□ 1.49
SNPHO15079 SOX1-201ENST00000330949 2842 ntAPPRIS P1 BASIC24.38■■□□□ 1.49
SNPHO15079 VEGFA-231ENST00000640499 1188 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
SNPHO15079 AGPAT2-202ENST00000371696 1512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
SNPHO15079 PCYT2-206ENST00000571105 1628 ntTSL 5 BASIC24.35■■□□□ 1.49
SNPHO15079 PANK2-207ENST00000610179 1807 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
SNPHO15079 ELK4-201ENST00000289703 2118 ntTSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
SNPHO15079 GALK1-205ENST00000588479 1866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
SNPHO15079 NKIRAS2-202ENST00000316082 833 ntTSL 5 BASIC24.32■■□□□ 1.48
SNPHO15079 STUB1-201ENST00000219548 1472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
SNPHO15079 MSX1-201ENST00000382723 1939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
SNPHO15079 FSD1L-204ENST00000469022 1836 ntTSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
SNPHO15079 RPS2-209ENST00000529806 993 ntTSL 3 BASIC24.31■■□□□ 1.48
SNPHO15079 AC087741.3-201ENST00000624270 1347 ntBASIC24.31■■□□□ 1.48
SNPHO15079 ABHD12-201ENST00000339157 2117 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.3■■□□□ 1.48
SNPHO15079 HES7-202ENST00000541682 1674 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
SNPHO15079 TSEN34-203ENST00000396388 1349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
SNPHO15079 AL139393.1-201ENST00000417479 573 ntTSL 5 BASIC24.29■■□□□ 1.48
SNPHO15079 AC012615.2-201ENST00000586259 447 ntTSL 4 BASIC24.29■■□□□ 1.48
SNPHO15079 UCK1-201ENST00000372208 2063 ntTSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
SNPHO15079 HOXB3-210ENST00000489475 1845 ntTSL 2 BASIC24.28■■□□□ 1.48
SNPHO15079 TCEA2-204ENST00000395053 1733 ntTSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
SNPHO15079 NAA50-207ENST00000493900 962 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC24.28■■□□□ 1.48
SNPHO15079 COX4I1-203ENST00000562336 873 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.28■■□□□ 1.48
SNPHO15079 GLRX5-201ENST00000331334 1564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
SNPHO15079 MNX1-207ENST00000543409 1620 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
SNPHO15079 PQLC1-203ENST00000397778 2555 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
SNPHO15079 AVEN-201ENST00000306730 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
SNPHO15079 RRNAD1-201ENST00000368216 2254 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
SNPHO15079 RCC1L-202ENST00000614461 2419 ntTSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
SNPHO15079 JMJD8-216ENST00000609261 1901 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
SNPHO15079 PPP1R35-201ENST00000292330 1031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
SNPHO15079 MBOAT7-203ENST00000391754 1797 ntTSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
SNPHO15079 NPTXR-202ENST00000640136 1503 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
SNPHO15079 COL13A1-212ENST00000520133 1833 ntTSL 5 BASIC24.24■■□□□ 1.47
SNPHO15079 BTBD19-203ENST00000450269 1572 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.24■■□□□ 1.47
SNPHO15079 FADS3-201ENST00000278829 1779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
SNPHO15079 PPP1R14B-201ENST00000309318 982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
SNPHO15079 CIB1-201ENST00000328649 1247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
SNPHO15079 AP000911.1-206ENST00000531938 711 ntTSL 3 BASIC24.23■■□□□ 1.47
SNPHO15079 CIB1-202ENST00000612800 1096 ntTSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
SNPHO15079 ARMC10-205ENST00000428183 2445 ntTSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
SNPHO15079 LRRC61-202ENST00000359623 1877 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.22■■□□□ 1.47
SNPHO15079 HMX1-201ENST00000400677 1895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
SNPHO15079 CMC4-202ENST00000369484 1107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
SNPHO15079 PSMG4-202ENST00000380305 489 ntTSL 5 BASIC24.22■■□□□ 1.47
SNPHO15079 TERF2-207ENST00000567296 1129 ntTSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
SNPHO15079 AC044849.2-201ENST00000606596 710 ntBASIC24.22■■□□□ 1.47
SNPHO15079 RAPGEF1-203ENST00000372195 6256 ntTSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
SNPHO15079 KLHL35-204ENST00000539798 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
SNPHO15079 PI4KAP1-202ENST00000611748 1906 ntTSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
SNPHO15079 TCFL5-201ENST00000217162 2453 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
SNPHO15079 TCFL5-202ENST00000335351 2456 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
SNPHO15079 AC009097.4-201ENST00000566738 777 ntTSL 2 BASIC24.21■■□□□ 1.47
SNPHO15079 GUSB-202ENST00000421103 1742 ntTSL 2 BASIC24.21■■□□□ 1.47
SNPHO15079 GTF3C4-202ENST00000483873 1417 ntTSL 3 BASIC24.2■■□□□ 1.46
SNPHO15079 PIK3R2-208ENST00000617642 1446 ntTSL 5 BASIC24.2■■□□□ 1.46
SNPHO15079 TCEA2-202ENST00000343484 1235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
SNPHO15079 GLRB-203ENST00000509282 1757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
SNPHO15079 XKR6-201ENST00000297303 1550 ntTSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
SNPHO15079 TPRA1-209ENST00000489960 1903 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.18■■□□□ 1.46
SNPHO15079 MAD2L2-205ENST00000376669 864 ntTSL 3 BASIC24.18■■□□□ 1.46
SNPHO15079 SCX-201ENST00000567180 999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
SNPHO15079 AP000547.3-202ENST00000592107 1019 ntTSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
SNPHO15079 ZFPM1-201ENST00000319555 5380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
SNPHO15079 RAB40C-201ENST00000248139 2699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
SNPHO15079 SMIM12-205ENST00000456842 918 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.17■■□□□ 1.46
SNPHO15079 MAPK12-201ENST00000215659 1918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
SNPHO15079 LMTK3-202ENST00000600059 5113 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.16■■□□□ 1.46
SNPHO15079 CDKN2A-201ENST00000304494 1218 ntTSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
SNPHO15079 TXNL4A-210ENST00000591711 669 ntTSL 2 BASIC24.16■■□□□ 1.46
SNPHO15079 AC135731.1-201ENST00000569415 2548 ntBASIC24.15■■□□□ 1.46
SNPHO15079 TPRA1-201ENST00000296210 1725 ntTSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.45
SNPHO15079 BHLHE23-201ENST00000370346 1057 ntAPPRIS P1 BASIC24.14■■□□□ 1.45
SNPHO15079 TPM2-203ENST00000378292 2147 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.45
SNPHO15079 NOP53-201ENST00000246802 1528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.45
SNPHO15079 ITGA9-203ENST00000422441 2282 ntTSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
SNPHO15079 NOG-201ENST00000332822 1892 ntAPPRIS P1 BASIC24.13■■□□□ 1.45
SNPHO15079 FAAH-201ENST00000243167 2094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
SNPHO15079 AC104109.3-201ENST00000519718 483 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.12■■□□□ 1.45
SNPHO15079 PLSCR3-202ENST00000535512 2067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
SNPHO15079 PLSCR3-214ENST00000619711 2066 ntTSL 5 BASIC24.11■■□□□ 1.45
SNPHO15079 DPY19L1-209ENST00000638088 5075 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.11■■□□□ 1.45
SNPHO15079 VWA1-201ENST00000338660 2147 ntTSL 2 BASIC24.11■■□□□ 1.45
SNPHO15079 SRSF9-201ENST00000229390 1201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
SNPHO15079 MFAP2-202ENST00000375535 1260 ntTSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
SNPHO15079 TMEM9-201ENST00000367330 1959 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
SNPHO15079 HOXD8-201ENST00000313173 1917 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC24.1■■□□□ 1.45
SNPHO15079 GKAP1-203ENST00000376371 1778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
SNPHO15079 PLEKHG6-206ENST00000536531 1683 ntTSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
SNPHO15079 RHOQ-201ENST00000238738 2975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
SNPHO15079 COPRS-202ENST00000378634 1041 ntTSL 2 BASIC24.09■■□□□ 1.45
SNPHO15079 NPHP3-202ENST00000383282 782 ntTSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
SNPHO15079 CCM2L-201ENST00000262659 2523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
SNPHO15079 PGM5-201ENST00000396392 1782 ntTSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
SNPHO15079 ANGPTL6-201ENST00000253109 1900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
SNPHO15079 NOXA1-201ENST00000341349 1678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.44
SNPHO15079 MYLIP-202ENST00000356840 1666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.44
SNPHO15079 ATP6V1E2-204ENST00000522587 1559 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.08■■□□□ 1.44
SNPHO15079 C9orf40-201ENST00000376854 2327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 15.2 ms