Protein–RNA interactions for Protein: O14678

ABCD4, ATP-binding cassette sub-family D member 4, humanhuman

Predictions only

Length 606 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ABCD4O14678 TPI1-201ENST00000229270 1763 ntTSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
ABCD4O14678 HOXD13-201ENST00000392539 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
ABCD4O14678 PIP4K2B-204ENST00000619039 5734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
ABCD4O14678 CNIH2-203ENST00000528852 1524 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
ABCD4O14678 NME2-202ENST00000393190 866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
ABCD4O14678 AC108673.1-201ENST00000510422 1159 ntBASIC23.02■■□□□ 1.28
ABCD4O14678 PKDCC-201ENST00000294964 2502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.27
ABCD4O14678 ATRNL1-209ENST00000609571 1818 ntTSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
ABCD4O14678 DUX4L29-201ENST00000425409 679 ntBASIC23■■□□□ 1.27
ABCD4O14678 CIB2-204ENST00000557846 934 ntTSL 3 BASIC23■■□□□ 1.27
ABCD4O14678 UBALD1-202ENST00000587615 799 ntTSL 2 BASIC23■■□□□ 1.27
ABCD4O14678 GLTP-201ENST00000318348 2356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
ABCD4O14678 RRAGC-201ENST00000373001 2732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
ABCD4O14678 ABHD12-201ENST00000339157 2117 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.99■■□□□ 1.27
ABCD4O14678 HGH1-207ENST00000628266 258 ntTSL 5 BASIC22.99■■□□□ 1.27
ABCD4O14678 SOX1-201ENST00000330949 2842 ntAPPRIS P1 BASIC22.99■■□□□ 1.27
ABCD4O14678 RCE1-201ENST00000309657 1485 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
ABCD4O14678 BTBD19-203ENST00000450269 1572 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.97■■□□□ 1.27
ABCD4O14678 ZNRF2P2-203ENST00000454624 420 ntBASIC22.97■■□□□ 1.27
ABCD4O14678 MIR6090-201ENST00000622481 60 ntBASIC22.97■■□□□ 1.27
ABCD4O14678 JAG2-201ENST00000331782 5835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
ABCD4O14678 ARHGDIG-201ENST00000219409 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
ABCD4O14678 SLC35D2-202ENST00000375257 889 ntTSL 2 BASIC22.96■■□□□ 1.27
ABCD4O14678 PVT1-219ENST00000523427 938 ntTSL 3 BASIC22.96■■□□□ 1.27
ABCD4O14678 UBE2S-203ENST00000589978 496 ntTSL 5 BASIC22.96■■□□□ 1.27
ABCD4O14678 ZIC2-201ENST00000376335 2983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
ABCD4O14678 AC092647.5-201ENST00000426595 1732 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.96■■□□□ 1.27
ABCD4O14678 MATK-201ENST00000310132 2133 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
ABCD4O14678 ARPC5L-202ENST00000353214 2507 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.96■■□□□ 1.27
ABCD4O14678 PIK3R2-208ENST00000617642 1446 ntTSL 5 BASIC22.95■■□□□ 1.26
ABCD4O14678 MSX1-201ENST00000382723 1939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
ABCD4O14678 LSM14B-204ENST00000370915 1079 ntTSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
ABCD4O14678 REPIN1-204ENST00000466559 1022 ntTSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
ABCD4O14678 PDCD2-209ENST00000542896 1082 ntTSL 2 BASIC22.94■■□□□ 1.26
ABCD4O14678 UBE2A-207ENST00000628549 934 ntTSL 2 BASIC22.94■■□□□ 1.26
ABCD4O14678 MLST8-203ENST00000397124 1691 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.93■■□□□ 1.26
ABCD4O14678 LMNTD2-201ENST00000329451 2084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
ABCD4O14678 MISP3-202ENST00000587086 1535 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
ABCD4O14678 AC021231.2-201ENST00000594613 730 ntBASIC22.92■■□□□ 1.26
ABCD4O14678 UCK1-201ENST00000372208 2063 ntTSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
ABCD4O14678 GLRX5-201ENST00000331334 1564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
ABCD4O14678 JMJD8-216ENST00000609261 1901 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
ABCD4O14678 GLRB-203ENST00000509282 1757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
ABCD4O14678 DOCK5-202ENST00000410074 786 ntTSL 2 BASIC22.9■■□□□ 1.26
ABCD4O14678 U2AF2-206ENST00000590551 1104 ntTSL 3 BASIC22.9■■□□□ 1.26
ABCD4O14678 NPTXR-202ENST00000640136 1503 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
ABCD4O14678 TCEA2-204ENST00000395053 1733 ntTSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
ABCD4O14678 HES7-202ENST00000541682 1674 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
ABCD4O14678 ATP6V1E2-204ENST00000522587 1559 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.89■■□□□ 1.26
ABCD4O14678 PLPPR3-201ENST00000359894 2387 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.26
ABCD4O14678 GSC-201ENST00000238558 1264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
ABCD4O14678 CCDC149-203ENST00000502801 1079 ntTSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
ABCD4O14678 AL451007.3-201ENST00000640271 588 ntAPPRIS P1 BASIC22.89■■□□□ 1.25
ABCD4O14678 NOXA1-201ENST00000341349 1678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
ABCD4O14678 AVEN-201ENST00000306730 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
ABCD4O14678 FOXA2-202ENST00000419308 2422 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
ABCD4O14678 E2F4-201ENST00000379378 2096 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
ABCD4O14678 NOG-201ENST00000332822 1892 ntAPPRIS P1 BASIC22.88■■□□□ 1.25
ABCD4O14678 POLR1D-201ENST00000302979 1166 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
ABCD4O14678 RNF130-205ENST00000521389 2263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
ABCD4O14678 FOXD3-201ENST00000371116 2086 ntAPPRIS P1 BASIC22.88■■□□□ 1.25
ABCD4O14678 GUSB-202ENST00000421103 1742 ntTSL 2 BASIC22.88■■□□□ 1.25
ABCD4O14678 ECI1-207ENST00000570258 1512 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.87■■□□□ 1.25
ABCD4O14678 AC096888.1-201ENST00000487097 565 ntTSL 4 BASIC22.87■■□□□ 1.25
ABCD4O14678 KLC2-205ENST00000394078 1557 ntTSL 5 BASIC22.87■■□□□ 1.25
ABCD4O14678 HOXB3-210ENST00000489475 1845 ntTSL 2 BASIC22.87■■□□□ 1.25
ABCD4O14678 PHF23-201ENST00000320316 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
ABCD4O14678 XKR6-201ENST00000297303 1550 ntTSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
ABCD4O14678 DNLZ-201ENST00000371738 724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
ABCD4O14678 MYLIP-202ENST00000356840 1666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
ABCD4O14678 FTCD-203ENST00000397746 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
ABCD4O14678 CHPT1-201ENST00000229266 1585 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
ABCD4O14678 AC116407.1-201ENST00000398832 1599 ntTSL 2 BASIC22.85■■□□□ 1.25
ABCD4O14678 DTNBP1-202ENST00000344537 1403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
ABCD4O14678 HINT2-201ENST00000259667 628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
ABCD4O14678 PI4KAP1-202ENST00000611748 1906 ntTSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
ABCD4O14678 HS3ST6-201ENST00000454677 1273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
ABCD4O14678 ELK4-201ENST00000289703 2118 ntTSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
ABCD4O14678 RP9P-201ENST00000381639 1303 ntTSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
ABCD4O14678 LAPTM4B-203ENST00000521545 915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
ABCD4O14678 MTMR1-214ENST00000542156 1227 ntTSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
ABCD4O14678 ZNF219-201ENST00000360947 3071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.24
ABCD4O14678 PLEKHG6-206ENST00000536531 1683 ntTSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
ABCD4O14678 BATF3-201ENST00000243440 980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
ABCD4O14678 TPRA1-201ENST00000296210 1725 ntTSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
ABCD4O14678 NOP53-201ENST00000246802 1528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
ABCD4O14678 AGAP3-211ENST00000473312 2039 ntTSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
ABCD4O14678 SHF-206ENST00000560471 2499 ntTSL 5 BASIC22.79■■□□□ 1.24
ABCD4O14678 MRPL9-201ENST00000368829 882 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.79■■□□□ 1.24
ABCD4O14678 PRSS41-201ENST00000399677 1127 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.79■■□□□ 1.24
ABCD4O14678 HLA-V-202ENST00000446817 847 ntBASIC22.79■■□□□ 1.24
ABCD4O14678 AL589765.4-201ENST00000512280 382 ntTSL 3 BASIC22.79■■□□□ 1.24
ABCD4O14678 SENP3-201ENST00000321337 2611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
ABCD4O14678 PANK2-207ENST00000610179 1807 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
ABCD4O14678 SLC12A2-202ENST00000343225 5509 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
ABCD4O14678 AC135731.1-201ENST00000569415 2548 ntBASIC22.79■■□□□ 1.24
ABCD4O14678 EXOC3L4-201ENST00000380069 2293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
ABCD4O14678 LRRC61-202ENST00000359623 1877 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.79■■□□□ 1.24
ABCD4O14678 SPIRE1-202ENST00000409402 5665 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
ABCD4O14678 HMX1-201ENST00000400677 1895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 14.7 ms