Protein–RNA interactions for Protein: O14530

TXNDC9, Thioredoxin domain-containing protein 9, humanhuman

Predictions only

Length 226 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TXNDC9O14530 ZSWIM6-201ENST00000252744 5501 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.68■■□□□ 1.7
TXNDC9O14530 KCTD17-202ENST00000403888 1763 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.67■■□□□ 1.7
TXNDC9O14530 HOXD8-201ENST00000313173 1917 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC25.67■■□□□ 1.7
TXNDC9O14530 COL13A1-210ENST00000517713 2007 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.66■■□□□ 1.7
TXNDC9O14530 CHML-205ENST00000638160 705 ntTSL 3 BASIC25.66■■□□□ 1.7
TXNDC9O14530 CERS2-205ENST00000368954 2505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.66■■□□□ 1.7
TXNDC9O14530 HMX1-201ENST00000400677 1895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.66■■□□□ 1.7
TXNDC9O14530 FTCD-202ENST00000397743 1834 ntTSL 1 (best) BASIC25.65■■□□□ 1.7
TXNDC9O14530 PDPK1-203ENST00000389224 2416 ntTSL 2 BASIC25.65■■□□□ 1.7
TXNDC9O14530 GSTP1-202ENST00000398606 965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.65■■□□□ 1.7
TXNDC9O14530 AP006261.1-201ENST00000584783 668 ntBASIC25.65■■□□□ 1.7
TXNDC9O14530 QKI-207ENST00000453779 5685 ntTSL 1 (best) BASIC25.65■■□□□ 1.7
TXNDC9O14530 C9orf40-201ENST00000376854 2327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.64■■□□□ 1.7
TXNDC9O14530 CNIH2-203ENST00000528852 1524 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.64■■□□□ 1.7
TXNDC9O14530 PKDCC-201ENST00000294964 2502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.64■■□□□ 1.69
TXNDC9O14530 TPGS1-201ENST00000359315 1114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.63■■□□□ 1.69
TXNDC9O14530 H2AFV-205ENST00000381124 628 ntTSL 3 BASIC25.63■■□□□ 1.69
TXNDC9O14530 WDSUB1-205ENST00000409990 1920 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.63■■□□□ 1.69
TXNDC9O14530 HNRNPAB-206ENST00000506339 1747 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.63■■□□□ 1.69
TXNDC9O14530 CRIP1-201ENST00000330233 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.62■■□□□ 1.69
TXNDC9O14530 PACS2-201ENST00000325438 3708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.61■■□□□ 1.69
TXNDC9O14530 MIR762-201ENST00000390236 83 ntBASIC25.61■■□□□ 1.69
TXNDC9O14530 CGREF1-204ENST00000402550 1575 ntTSL 2 BASIC25.61■■□□□ 1.69
TXNDC9O14530 ST6GALNAC6-205ENST00000373146 2460 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.6■■□□□ 1.69
TXNDC9O14530 RTN4R-201ENST00000043402 2157 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.6■■□□□ 1.69
TXNDC9O14530 FAM89B-201ENST00000316409 1409 ntTSL 1 (best) BASIC25.6■■□□□ 1.69
TXNDC9O14530 TSPAN11-203ENST00000545802 1649 ntTSL 1 (best) BASIC25.59■■□□□ 1.69
TXNDC9O14530 HAND2-201ENST00000359562 2780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.58■■□□□ 1.69
TXNDC9O14530 SLC9A3R2-202ENST00000432365 1564 ntTSL 1 (best) BASIC25.58■■□□□ 1.69
TXNDC9O14530 DLG3-203ENST00000374360 5905 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.57■■□□□ 1.68
TXNDC9O14530 ATRAID-201ENST00000380171 1240 ntTSL 1 (best) BASIC25.57■■□□□ 1.68
TXNDC9O14530 FAM185A-202ENST00000413034 1179 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC25.56■■□□□ 1.68
TXNDC9O14530 MIR3665-201ENST00000578708 105 ntBASIC25.56■■□□□ 1.68
TXNDC9O14530 AC012629.2-201ENST00000606513 377 ntTSL 5 BASIC25.56■■□□□ 1.68
TXNDC9O14530 ARMC10-205ENST00000428183 2445 ntTSL 1 (best) BASIC25.56■■□□□ 1.68
TXNDC9O14530 EMC10-202ENST00000376918 2014 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.56■■□□□ 1.68
TXNDC9O14530 ZCCHC2-201ENST00000269499 5959 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC25.56■■□□□ 1.68
TXNDC9O14530 FAM78B-202ENST00000354422 1475 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.55■■□□□ 1.68
TXNDC9O14530 RRNAD1-201ENST00000368216 2254 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.55■■□□□ 1.68
TXNDC9O14530 LMTK3-201ENST00000270238 4972 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.55■■□□□ 1.68
TXNDC9O14530 ZNF787-203ENST00000610935 1925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.55■■□□□ 1.68
TXNDC9O14530 PLSCR3-202ENST00000535512 2067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.54■■□□□ 1.68
TXNDC9O14530 HSD11B1L-209ENST00000577917 1553 ntTSL 1 (best) BASIC25.54■■□□□ 1.68
TXNDC9O14530 ECI1-203ENST00000562238 948 ntTSL 1 (best) BASIC25.54■■□□□ 1.68
TXNDC9O14530 AC005559.1-201ENST00000589661 871 ntBASIC25.54■■□□□ 1.68
TXNDC9O14530 PICK1-201ENST00000356976 2055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.53■■□□□ 1.68
TXNDC9O14530 MLST8-203ENST00000397124 1691 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC25.53■■□□□ 1.68
TXNDC9O14530 RHOQ-201ENST00000238738 2975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.53■■□□□ 1.68
TXNDC9O14530 MISP3-201ENST00000269720 1424 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.53■■□□□ 1.68
TXNDC9O14530 TSPOAP1-AS1-203ENST00000579527 2042 ntTSL 2 BASIC25.53■■□□□ 1.68
TXNDC9O14530 AGFG1-205ENST00000409979 2089 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC25.52■■□□□ 1.68
TXNDC9O14530 FEV-201ENST00000295727 1879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.51■■□□□ 1.67
TXNDC9O14530 TGFBRAP1-202ENST00000393359 5979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.51■■□□□ 1.67
TXNDC9O14530 GFRA4-202ENST00000319242 900 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.51■■□□□ 1.67
TXNDC9O14530 MXD3-203ENST00000439742 1483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.51■■□□□ 1.67
TXNDC9O14530 AGPAT2-202ENST00000371696 1512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.51■■□□□ 1.67
TXNDC9O14530 C11orf80-204ENST00000525908 2135 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC25.51■■□□□ 1.67
TXNDC9O14530 PGAM5-201ENST00000317555 1182 ntTSL 1 (best) BASIC25.5■■□□□ 1.67
TXNDC9O14530 ZNF513-201ENST00000323703 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.5■■□□□ 1.67
TXNDC9O14530 ZNF276-202ENST00000443381 2267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.5■■□□□ 1.67
TXNDC9O14530 AMN-201ENST00000299155 1907 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.49■■□□□ 1.67
TXNDC9O14530 TMEM158-201ENST00000503771 1813 ntAPPRIS P1 BASIC25.49■■□□□ 1.67
TXNDC9O14530 DUSP14-206ENST00000617516 1537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.49■■□□□ 1.67
TXNDC9O14530 CCNG2-201ENST00000316355 5526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.49■■□□□ 1.67
TXNDC9O14530 MACROD1-201ENST00000255681 1205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.49■■□□□ 1.67
TXNDC9O14530 MSANTD2-203ENST00000524950 1109 ntTSL 2 BASIC25.49■■□□□ 1.67
TXNDC9O14530 ZNF775-201ENST00000329630 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.49■■□□□ 1.67
TXNDC9O14530 FAM220A-201ENST00000313324 2214 ntTSL 1 (best) BASIC25.49■■□□□ 1.67
TXNDC9O14530 SOX1-201ENST00000330949 2842 ntAPPRIS P1 BASIC25.49■■□□□ 1.67
TXNDC9O14530 UBE2L6-201ENST00000287156 1354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.48■■□□□ 1.67
TXNDC9O14530 ZFP90-204ENST00000564323 560 ntTSL 4 BASIC25.48■■□□□ 1.67
TXNDC9O14530 ZFP90-219ENST00000611381 695 ntTSL 1 (best) BASIC25.48■■□□□ 1.67
TXNDC9O14530 LANCL3-203ENST00000614025 1469 ntTSL 2 BASIC25.47■■□□□ 1.67
TXNDC9O14530 KCNMA1-283ENST00000640523 5425 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.46■■□□□ 1.67
TXNDC9O14530 GXYLT1-201ENST00000280876 1937 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.46■■□□□ 1.67
TXNDC9O14530 AL162393.1-201ENST00000437852 946 ntBASIC25.45■■□□□ 1.66
TXNDC9O14530 ARHGAP22-202ENST00000374170 2107 ntTSL 5 BASIC25.44■■□□□ 1.66
TXNDC9O14530 TMEM185A-207ENST00000600449 2840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.43■■□□□ 1.66
TXNDC9O14530 NMB-202ENST00000394588 1017 ntTSL 1 (best) BASIC25.43■■□□□ 1.66
TXNDC9O14530 RPS2-209ENST00000529806 993 ntTSL 3 BASIC25.43■■□□□ 1.66
TXNDC9O14530 NPB-202ENST00000573081 2154 ntAPPRIS ALT2 BASIC25.43■■□□□ 1.66
TXNDC9O14530 COL13A1-213ENST00000520267 2276 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.43■■□□□ 1.66
TXNDC9O14530 HOXB3-210ENST00000489475 1845 ntTSL 2 BASIC25.42■■□□□ 1.66
TXNDC9O14530 PCYT2-206ENST00000571105 1628 ntTSL 5 BASIC25.42■■□□□ 1.66
TXNDC9O14530 AC012615.2-201ENST00000586259 447 ntTSL 4 BASIC25.42■■□□□ 1.66
TXNDC9O14530 NRG1-221ENST00000614767 762 ntTSL 5 BASIC25.42■■□□□ 1.66
TXNDC9O14530 DUX4L28-201ENST00000623687 678 ntBASIC25.42■■□□□ 1.66
TXNDC9O14530 JAG2-202ENST00000347004 5720 ntTSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
TXNDC9O14530 NKIRAS2-202ENST00000316082 833 ntTSL 5 BASIC25.41■■□□□ 1.66
TXNDC9O14530 AL139393.1-201ENST00000417479 573 ntTSL 5 BASIC25.41■■□□□ 1.66
TXNDC9O14530 PARD6A-202ENST00000458121 1260 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
TXNDC9O14530 TADA2B-201ENST00000310074 4350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
TXNDC9O14530 AVEN-201ENST00000306730 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
TXNDC9O14530 LRRC61-202ENST00000359623 1877 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.4■■□□□ 1.66
TXNDC9O14530 MSX1-201ENST00000382723 1939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
TXNDC9O14530 NAA50-207ENST00000493900 962 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC25.4■■□□□ 1.66
TXNDC9O14530 JMJD8-216ENST00000609261 1901 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.66
TXNDC9O14530 HES7-202ENST00000541682 1674 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.66
TXNDC9O14530 BMP7-204ENST00000450594 1857 ntTSL 2 BASIC25.39■■□□□ 1.66
TXNDC9O14530 MBOAT7-203ENST00000391754 1797 ntTSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.65
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 50.1 ms