Protein–RNA interactions for Protein: O14521

SDHD, Succinate dehydrogenase [ubiquinone] cytochrome b small subunit, mitochondrial, humanhuman

Predictions only

Length 159 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SDHDO14521 MAP6D1-202ENST00000431348 890 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.49■■□□□ 1.67
SDHDO14521 PICK1-201ENST00000356976 2055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.49■■□□□ 1.67
SDHDO14521 HAND2-201ENST00000359562 2780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.49■■□□□ 1.67
SDHDO14521 LINC01578-204ENST00000554894 556 ntTSL 3 BASIC25.48■■□□□ 1.67
SDHDO14521 LINC01578-207ENST00000556895 802 ntTSL 2 BASIC25.48■■□□□ 1.67
SDHDO14521 CDH24-206ENST00000610348 2037 ntTSL 1 (best) BASIC25.47■■□□□ 1.67
SDHDO14521 DRD5P2-201ENST00000421395 2012 ntBASIC25.46■■□□□ 1.67
SDHDO14521 ZNF219-201ENST00000360947 3071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.66
SDHDO14521 DHRS13-202ENST00000394901 2037 ntTSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.66
SDHDO14521 NOP53-201ENST00000246802 1528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.43■■□□□ 1.66
SDHDO14521 PELI3-203ENST00000524466 1671 ntTSL 1 (best) BASIC25.43■■□□□ 1.66
SDHDO14521 ZFAND2B-208ENST00000409594 2021 ntTSL 2 BASIC25.43■■□□□ 1.66
SDHDO14521 FAAP20-204ENST00000400919 1413 ntTSL 3 BASIC25.43■■□□□ 1.66
SDHDO14521 GAL3ST1-204ENST00000402369 1712 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.43■■□□□ 1.66
SDHDO14521 NFYB-205ENST00000551727 1727 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.41■■□□□ 1.66
SDHDO14521 AL355297.4-201ENST00000603191 1249 ntTSL 3 BASIC25.41■■□□□ 1.66
SDHDO14521 ABHD17A-202ENST00000292577 1757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
SDHDO14521 TCF24-201ENST00000563496 2450 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.4■■□□□ 1.66
SDHDO14521 TP53I13-201ENST00000301057 1530 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.38■■□□□ 1.65
SDHDO14521 AL133380.1-201ENST00000506013 324 ntBASIC25.38■■□□□ 1.65
SDHDO14521 TNFSF12-201ENST00000293825 1553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.38■■□□□ 1.65
SDHDO14521 PLEKHG6-206ENST00000536531 1683 ntTSL 1 (best) BASIC25.38■■□□□ 1.65
SDHDO14521 CLK2-201ENST00000355560 2120 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC25.37■■□□□ 1.65
SDHDO14521 FSD1L-208ENST00000495708 1906 ntTSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
SDHDO14521 SCCPDH-201ENST00000366510 2503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
SDHDO14521 COMMD7-201ENST00000278980 1900 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
SDHDO14521 MKNK2-202ENST00000309340 1744 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
SDHDO14521 NPB-202ENST00000573081 2154 ntAPPRIS ALT2 BASIC25.36■■□□□ 1.65
SDHDO14521 SDCCAG3-201ENST00000298537 2314 ntTSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
SDHDO14521 MFSD12-201ENST00000355415 2124 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
SDHDO14521 AGPAT2-202ENST00000371696 1512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
SDHDO14521 PPP3CC-204ENST00000518852 1598 ntTSL 2 BASIC25.35■■□□□ 1.65
SDHDO14521 NPDC1-201ENST00000371600 2187 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
SDHDO14521 MBD2-202ENST00000398398 1237 ntTSL 2 BASIC25.34■■□□□ 1.65
SDHDO14521 MBD2-205ENST00000583046 1182 ntTSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
SDHDO14521 KLF16-203ENST00000592313 508 ntTSL 3 BASIC25.34■■□□□ 1.65
SDHDO14521 AC010864.1-201ENST00000609407 1511 ntBASIC25.33■■□□□ 1.65
SDHDO14521 C11orf80-204ENST00000525908 2135 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC25.33■■□□□ 1.64
SDHDO14521 MARCH11-201ENST00000332432 1741 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.32■■□□□ 1.64
SDHDO14521 KANSL1L-207ENST00000452086 2334 ntTSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
SDHDO14521 NOG-201ENST00000332822 1892 ntAPPRIS P1 BASIC25.3■■□□□ 1.64
SDHDO14521 NRGN-202ENST00000412681 1106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
SDHDO14521 CHST14-202ENST00000559991 1968 ntTSL 5 BASIC25.28■■□□□ 1.64
SDHDO14521 FAM78B-202ENST00000354422 1475 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.28■■□□□ 1.64
SDHDO14521 PLEKHF1-201ENST00000436066 2084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
SDHDO14521 ZDHHC23-206ENST00000498275 2055 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.27■■□□□ 1.64
SDHDO14521 HYAL2-202ENST00000395139 2136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
SDHDO14521 RUNX2-205ENST00000465038 1770 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC25.27■■□□□ 1.64
SDHDO14521 AC025431.1-201ENST00000559684 874 ntTSL 3 BASIC25.27■■□□□ 1.64
SDHDO14521 SERPING1-205ENST00000403558 2231 ntTSL 5 BASIC25.27■■□□□ 1.64
SDHDO14521 HNRNPAB-205ENST00000506259 1674 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
SDHDO14521 NRTN-201ENST00000303212 1109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
SDHDO14521 AC079305.1-201ENST00000428541 499 ntTSL 3 BASIC25.26■■□□□ 1.63
SDHDO14521 ROM1-201ENST00000278833 1878 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
SDHDO14521 MAPKAPK2-201ENST00000294981 2171 ntTSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
SDHDO14521 STUB1-205ENST00000565677 1560 ntTSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
SDHDO14521 FTCD-201ENST00000291670 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
SDHDO14521 AL121749.1-202ENST00000609313 2153 ntBASIC25.22■■□□□ 1.63
SDHDO14521 WTAP-206ENST00000621533 2109 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.21■■□□□ 1.63
SDHDO14521 AMZ2-201ENST00000359783 1722 ntTSL 5 BASIC25.21■■□□□ 1.63
SDHDO14521 VEGFC-202ENST00000618562 2064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
SDHDO14521 CARM1-202ENST00000344150 2722 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.21■■□□□ 1.63
SDHDO14521 TNIP2-201ENST00000315423 1974 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
SDHDO14521 UBE2L6-201ENST00000287156 1354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.63
SDHDO14521 CAPNS1-204ENST00000587718 1558 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.62
SDHDO14521 TMEM55B-201ENST00000250489 1961 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.62
SDHDO14521 SNTB1-202ENST00000517992 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
SDHDO14521 GNPTAB-202ENST00000392919 760 ntTSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
SDHDO14521 C1orf122-204ENST00000468084 1234 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.18■■□□□ 1.62
SDHDO14521 SIGMAR1-205ENST00000477726 840 ntTSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
SDHDO14521 SLC16A3-214ENST00000582743 2002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
SDHDO14521 FLJ37453-201ENST00000317122 2473 ntTSL 2 BASIC25.17■■□□□ 1.62
SDHDO14521 PIK3R2-208ENST00000617642 1446 ntTSL 5 BASIC25.17■■□□□ 1.62
SDHDO14521 THRA-204ENST00000546243 1909 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.17■■□□□ 1.62
SDHDO14521 TMEM187-201ENST00000369982 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
SDHDO14521 ZNF276-202ENST00000443381 2267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
SDHDO14521 RCOR3-202ENST00000367006 2525 ntTSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
SDHDO14521 CDK2AP1-203ENST00000535979 1281 ntTSL 3 BASIC25.16■■□□□ 1.62
SDHDO14521 KCNJ4-201ENST00000303592 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
SDHDO14521 GNAS-211ENST00000371095 1931 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
SDHDO14521 PPP1CC-208ENST00000551676 1581 ntTSL 2 BASIC25.15■■□□□ 1.62
SDHDO14521 INPP5A-202ENST00000368593 1432 ntTSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
SDHDO14521 NAPA-201ENST00000263354 1839 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
SDHDO14521 IHH-201ENST00000295731 2023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
SDHDO14521 HDGF-201ENST00000357325 2380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
SDHDO14521 BTBD19-203ENST00000450269 1572 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.14■■□□□ 1.62
SDHDO14521 GNAS-207ENST00000354359 1975 ntTSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.61
SDHDO14521 GNAS-210ENST00000371085 1972 ntTSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.61
SDHDO14521 ANKS1B-203ENST00000341752 2115 ntTSL 2 BASIC25.13■■□□□ 1.61
SDHDO14521 RHEB-201ENST00000262187 2075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
SDHDO14521 MRAP2-201ENST00000257776 2153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
SDHDO14521 LINC01089-207ENST00000538335 630 ntTSL 3 BASIC25.12■■□□□ 1.61
SDHDO14521 PEA15-201ENST00000360472 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.11■■□□□ 1.61
SDHDO14521 F8A3-201ENST00000622749 1759 ntAPPRIS P1 BASIC25.11■■□□□ 1.61
SDHDO14521 CDH23-208ENST00000461841 2000 ntTSL 5 BASIC25.11■■□□□ 1.61
SDHDO14521 ECI1-207ENST00000570258 1512 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.11■■□□□ 1.61
SDHDO14521 SLC16A8-201ENST00000320521 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
SDHDO14521 RRNAD1-201ENST00000368216 2254 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
SDHDO14521 TMEM200C-201ENST00000383490 1920 ntAPPRIS P1 BASIC25.1■■□□□ 1.61
SDHDO14521 STUB1-201ENST00000219548 1472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 16.6 ms