Protein–RNA interactions for Protein: O00311

CDC7, Cell division cycle 7-related protein kinase, humanhuman

Predictions only

Length 574 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CDC7O00311 CRIP1-201ENST00000330233 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.87■■□□□ 1.73
CDC7O00311 PPP3CC-204ENST00000518852 1598 ntTSL 2 BASIC25.86■■□□□ 1.73
CDC7O00311 PGM5P2-201ENST00000613141 1980 ntTSL 1 (best) BASIC25.86■■□□□ 1.73
CDC7O00311 AC010864.1-201ENST00000609407 1511 ntBASIC25.85■■□□□ 1.73
CDC7O00311 GSTP1-202ENST00000398606 965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.85■■□□□ 1.73
CDC7O00311 FGF18-201ENST00000274625 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.84■■□□□ 1.73
CDC7O00311 FTCDNL1-201ENST00000416668 944 ntTSL 1 (best) BASIC25.84■■□□□ 1.73
CDC7O00311 PIK3R2-208ENST00000617642 1446 ntTSL 5 BASIC25.84■■□□□ 1.73
CDC7O00311 PQLC1-203ENST00000397778 2555 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.83■■□□□ 1.73
CDC7O00311 BTBD19-203ENST00000450269 1572 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.82■■□□□ 1.72
CDC7O00311 ARHGAP22-202ENST00000374170 2107 ntTSL 5 BASIC25.8■■□□□ 1.72
CDC7O00311 HSD11B1L-209ENST00000577917 1553 ntTSL 1 (best) BASIC25.8■■□□□ 1.72
CDC7O00311 IRX1-201ENST00000302006 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.8■■□□□ 1.72
CDC7O00311 RUNDC3A-206ENST00000590941 1675 ntTSL 1 (best) BASIC25.79■■□□□ 1.72
CDC7O00311 SIGMAR1-203ENST00000378892 1743 ntTSL 2 BASIC25.79■■□□□ 1.72
CDC7O00311 FSD1L-208ENST00000495708 1906 ntTSL 1 (best) BASIC25.78■■□□□ 1.72
CDC7O00311 STUB1-205ENST00000565677 1560 ntTSL 1 (best) BASIC25.78■■□□□ 1.72
CDC7O00311 SP8-201ENST00000361443 1714 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.77■■□□□ 1.72
CDC7O00311 AC092755.2-201ENST00000560199 402 ntTSL 3 BASIC25.77■■□□□ 1.72
CDC7O00311 GSC2-201ENST00000086933 1033 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.76■■□□□ 1.71
CDC7O00311 PLEKHG6-206ENST00000536531 1683 ntTSL 1 (best) BASIC25.76■■□□□ 1.71
CDC7O00311 ZNF787-203ENST00000610935 1925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.76■■□□□ 1.71
CDC7O00311 HOXB3-212ENST00000498678 2196 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.76■■□□□ 1.71
CDC7O00311 MYLIP-202ENST00000356840 1666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.75■■□□□ 1.71
CDC7O00311 HDGF-210ENST00000537739 2073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.75■■□□□ 1.71
CDC7O00311 ABHD17A-202ENST00000292577 1757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.74■■□□□ 1.71
CDC7O00311 AL139393.1-201ENST00000417479 573 ntTSL 5 BASIC25.74■■□□□ 1.71
CDC7O00311 BCL7C-201ENST00000215115 1740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.74■■□□□ 1.71
CDC7O00311 CIB1-201ENST00000328649 1247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.73■■□□□ 1.71
CDC7O00311 CIB1-202ENST00000612800 1096 ntTSL 1 (best) BASIC25.73■■□□□ 1.71
CDC7O00311 FZD2-201ENST00000315323 2112 ntAPPRIS P1 BASIC25.72■■□□□ 1.71
CDC7O00311 ATF4-201ENST00000337304 2019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.72■■□□□ 1.71
CDC7O00311 SLC30A10-202ENST00000366926 1915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.72■■□□□ 1.71
CDC7O00311 RDX-210ENST00000530301 1549 ntTSL 1 (best) BASIC25.72■■□□□ 1.71
CDC7O00311 PSMG4-205ENST00000419065 629 ntTSL 2 BASIC25.71■■□□□ 1.71
CDC7O00311 PDCD2-215ENST00000614056 1287 ntTSL 2 BASIC25.71■■□□□ 1.71
CDC7O00311 AL139393.2-201ENST00000608721 2025 ntBASIC25.71■■□□□ 1.71
CDC7O00311 MKNK2-202ENST00000309340 1744 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.71■■□□□ 1.71
CDC7O00311 EFNA1-202ENST00000368407 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.71■■□□□ 1.71
CDC7O00311 AL133346.1-201ENST00000435287 495 ntTSL 2 BASIC25.7■■□□□ 1.7
CDC7O00311 SUZ12P1-203ENST00000578195 985 ntBASIC25.7■■□□□ 1.7
CDC7O00311 HNRNPAB-205ENST00000506259 1674 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.69■■□□□ 1.7
CDC7O00311 COL13A1-214ENST00000522165 2061 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.68■■□□□ 1.7
CDC7O00311 NOXA1-201ENST00000341349 1678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.68■■□□□ 1.7
CDC7O00311 NMB-202ENST00000394588 1017 ntTSL 1 (best) BASIC25.68■■□□□ 1.7
CDC7O00311 LMO1-202ENST00000428101 1038 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.68■■□□□ 1.7
CDC7O00311 AC012615.2-201ENST00000586259 447 ntTSL 4 BASIC25.68■■□□□ 1.7
CDC7O00311 SPATA5L1-208ENST00000638607 1863 ntTSL 2 BASIC25.68■■□□□ 1.7
CDC7O00311 VEGFA-231ENST00000640499 1188 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.67■■□□□ 1.7
CDC7O00311 DPF1-202ENST00000412732 2303 ntTSL 1 (best) BASIC25.66■■□□□ 1.7
CDC7O00311 BATF3-201ENST00000243440 980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.66■■□□□ 1.7
CDC7O00311 MIR762-201ENST00000390236 83 ntBASIC25.66■■□□□ 1.7
CDC7O00311 AC012629.2-201ENST00000606513 377 ntTSL 5 BASIC25.66■■□□□ 1.7
CDC7O00311 ITGA9-203ENST00000422441 2282 ntTSL 1 (best) BASIC25.66■■□□□ 1.7
CDC7O00311 FEV-201ENST00000295727 1879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.66■■□□□ 1.7
CDC7O00311 ATP6V1E2-204ENST00000522587 1559 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.65■■□□□ 1.7
CDC7O00311 ECI1-207ENST00000570258 1512 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.65■■□□□ 1.7
CDC7O00311 SEC61G-204ENST00000450622 512 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.65■■□□□ 1.7
CDC7O00311 MNX1-207ENST00000543409 1620 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.65■■□□□ 1.7
CDC7O00311 RUNX2-205ENST00000465038 1770 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC25.64■■□□□ 1.7
CDC7O00311 MARCH11-201ENST00000332432 1741 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.64■■□□□ 1.7
CDC7O00311 ZFAND2B-208ENST00000409594 2021 ntTSL 2 BASIC25.64■■□□□ 1.69
CDC7O00311 MTCH1-202ENST00000373627 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.64■■□□□ 1.69
CDC7O00311 MISP3-201ENST00000269720 1424 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.63■■□□□ 1.69
CDC7O00311 LANCL3-203ENST00000614025 1469 ntTSL 2 BASIC25.63■■□□□ 1.69
CDC7O00311 CHPT1-201ENST00000229266 1585 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.62■■□□□ 1.69
CDC7O00311 ADAP1-201ENST00000265846 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.62■■□□□ 1.69
CDC7O00311 TESK1-201ENST00000336395 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.62■■□□□ 1.69
CDC7O00311 COL13A1-213ENST00000520267 2276 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.61■■□□□ 1.69
CDC7O00311 H2AFV-205ENST00000381124 628 ntTSL 3 BASIC25.61■■□□□ 1.69
CDC7O00311 WSB2-201ENST00000315436 2646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.61■■□□□ 1.69
CDC7O00311 THAP11-201ENST00000303596 2114 ntAPPRIS P1 BASIC25.6■■□□□ 1.69
CDC7O00311 CHML-205ENST00000638160 705 ntTSL 3 BASIC25.59■■□□□ 1.69
CDC7O00311 TOMM40-201ENST00000252487 1707 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.59■■□□□ 1.69
CDC7O00311 TOMM40-202ENST00000405636 1709 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.59■■□□□ 1.69
CDC7O00311 ENKD1-201ENST00000243878 1579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.58■■□□□ 1.69
CDC7O00311 HNRNPAB-204ENST00000504898 1785 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.58■■□□□ 1.69
CDC7O00311 IL17D-201ENST00000304920 1861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.57■■□□□ 1.68
CDC7O00311 GFRA4-202ENST00000319242 900 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.57■■□□□ 1.68
CDC7O00311 HOPX-206ENST00000503639 1248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.57■■□□□ 1.68
CDC7O00311 GRK6-206ENST00000507633 1660 ntTSL 5 BASIC25.57■■□□□ 1.68
CDC7O00311 ECI1-203ENST00000562238 948 ntTSL 1 (best) BASIC25.56■■□□□ 1.68
CDC7O00311 SHARPIN-202ENST00000398712 1765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.56■■□□□ 1.68
CDC7O00311 ACTR3B-201ENST00000256001 2216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.55■■□□□ 1.68
CDC7O00311 AMZ2-201ENST00000359783 1722 ntTSL 5 BASIC25.53■■□□□ 1.68
CDC7O00311 RCC1L-205ENST00000618035 1409 ntTSL 1 (best) BASIC25.53■■□□□ 1.68
CDC7O00311 S100A10-202ENST00000368811 1202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.52■■□□□ 1.68
CDC7O00311 HNRNPLP2-201ENST00000568980 1570 ntBASIC25.52■■□□□ 1.68
CDC7O00311 AP000547.3-202ENST00000592107 1019 ntTSL 1 (best) BASIC25.5■■□□□ 1.67
CDC7O00311 TMEM9-201ENST00000367330 1959 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.49■■□□□ 1.67
CDC7O00311 AC127502.1-201ENST00000399971 1502 ntBASIC25.49■■□□□ 1.67
CDC7O00311 EBAG9-202ENST00000395785 1467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.49■■□□□ 1.67
CDC7O00311 AC005559.1-201ENST00000589661 871 ntBASIC25.49■■□□□ 1.67
CDC7O00311 AP002884.3-203ENST00000419895 1711 ntTSL 2 BASIC25.49■■□□□ 1.67
CDC7O00311 SDCCAG3-201ENST00000298537 2314 ntTSL 1 (best) BASIC25.48■■□□□ 1.67
CDC7O00311 RAB40C-201ENST00000248139 2699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.48■■□□□ 1.67
CDC7O00311 TSEN34-203ENST00000396388 1349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.48■■□□□ 1.67
CDC7O00311 RPS2-209ENST00000529806 993 ntTSL 3 BASIC25.48■■□□□ 1.67
CDC7O00311 SCX-201ENST00000567180 999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.48■■□□□ 1.67
CDC7O00311 ZIC2-201ENST00000376335 2983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.48■■□□□ 1.67
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 140.3 ms