Protein–RNA interactions for Protein: O00287

RFXAP, Regulatory factor X-associated protein, humanhuman

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Length 272 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RFXAPO00287 VEGFA-228ENST00000617771 1116 ntTSL 1 (best) BASIC28.56■■■□□ 2.16
RFXAPO00287 VEGFA-229ENST00000621747 1116 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.56■■■□□ 2.16
RFXAPO00287 U2AF1L5-212ENST00000639996 1019 ntTSL 1 (best) BASIC28.56■■■□□ 2.16
RFXAPO00287 VEGFA-230ENST00000640482 1065 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.56■■■□□ 2.16
RFXAPO00287 VEGFA-232ENST00000640653 1170 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.56■■■□□ 2.16
RFXAPO00287 C11orf95-204ENST00000546282 390 ntTSL 3 BASIC28.55■■■□□ 2.16
RFXAPO00287 CHML-204ENST00000638121 920 ntTSL 2 BASIC28.55■■■□□ 2.16
RFXAPO00287 GNPTAB-206ENST00000549940 1678 ntTSL 1 (best) BASIC28.54■■■□□ 2.16
RFXAPO00287 POLR3H-201ENST00000337566 1330 ntTSL 1 (best) BASIC28.54■■■□□ 2.16
RFXAPO00287 GPX1-201ENST00000419349 1106 ntBASIC28.54■■■□□ 2.16
RFXAPO00287 AC016595.1-201ENST00000559410 383 ntTSL 3 BASIC28.54■■■□□ 2.16
RFXAPO00287 FBRSL1-201ENST00000434748 5568 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.54■■■□□ 2.16
RFXAPO00287 SLC9A3R2-202ENST00000432365 1564 ntTSL 1 (best) BASIC28.54■■■□□ 2.16
RFXAPO00287 ZBTB25-202ENST00000555220 1440 ntTSL 1 (best) BASIC28.53■■■□□ 2.16
RFXAPO00287 ATP6V1E2-204ENST00000522587 1559 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC28.52■■■□□ 2.16
RFXAPO00287 KIAA2013-203ENST00000616327 2170 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.51■■■□□ 2.16
RFXAPO00287 MAPK3-205ENST00000395202 1008 ntTSL 1 (best) BASIC28.51■■■□□ 2.15
RFXAPO00287 CPNE1-203ENST00000397442 1695 ntTSL 5 BASIC28.51■■■□□ 2.15
RFXAPO00287 IGFBP2-201ENST00000233809 1439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.51■■■□□ 2.15
RFXAPO00287 RUNX2-203ENST00000371436 1588 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.5■■■□□ 2.15
RFXAPO00287 AC004837.3-201ENST00000420748 565 ntTSL 4 BASIC28.49■■■□□ 2.15
RFXAPO00287 H2AFV-204ENST00000350771 687 ntTSL 2 BASIC28.48■■■□□ 2.15
RFXAPO00287 TWIST1-201ENST00000242261 1666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.48■■■□□ 2.15
RFXAPO00287 CTXN1-201ENST00000318978 1274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.47■■■□□ 2.15
RFXAPO00287 AC005540.1-201ENST00000413911 919 ntTSL 3 BASIC28.47■■■□□ 2.15
RFXAPO00287 NEURL1B-203ENST00000522853 1263 ntTSL 1 (best) BASIC28.47■■■□□ 2.15
RFXAPO00287 AP000251.1-201ENST00000433071 822 ntTSL 1 (best) BASIC28.46■■■□□ 2.15
RFXAPO00287 CBWD5-202ENST00000377384 1347 ntTSL 1 (best) BASIC28.45■■■□□ 2.15
RFXAPO00287 UBA52-204ENST00000595158 743 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC28.45■■■□□ 2.14
RFXAPO00287 RUNX2-211ENST00000625924 1458 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.44■■■□□ 2.14
RFXAPO00287 RNF126P1-201ENST00000567452 1320 ntBASIC28.43■■■□□ 2.14
RFXAPO00287 ABHD17A-201ENST00000250974 1630 ntTSL 1 (best) BASIC28.43■■■□□ 2.14
RFXAPO00287 KCNK1-202ENST00000366621 2161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.43■■■□□ 2.14
RFXAPO00287 SSBP4-202ENST00000348495 1721 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC28.43■■■□□ 2.14
RFXAPO00287 SSTR4-201ENST00000255008 1427 ntAPPRIS P1 BASIC28.43■■■□□ 2.14
RFXAPO00287 CHPT1-201ENST00000229266 1585 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.42■■■□□ 2.14
RFXAPO00287 DCUN1D5-201ENST00000260247 1337 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.42■■■□□ 2.14
RFXAPO00287 NOXA1-201ENST00000341349 1678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.42■■■□□ 2.14
RFXAPO00287 CDKN3-202ENST00000335183 893 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.41■■■□□ 2.14
RFXAPO00287 TPT1-202ENST00000379055 948 ntTSL 2 BASIC28.41■■■□□ 2.14
RFXAPO00287 CDKN3-211ENST00000611205 874 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.41■■■□□ 2.14
RFXAPO00287 AGPAT2-202ENST00000371696 1512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.39■■■□□ 2.14
RFXAPO00287 MAP3K8-203ENST00000375322 932 ntTSL 2 BASIC28.39■■■□□ 2.14
RFXAPO00287 TMEM80-202ENST00000397512 1572 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.38■■■□□ 2.13
RFXAPO00287 CEP120-209ENST00000515110 606 ntTSL 3 BASIC28.38■■■□□ 2.13
RFXAPO00287 CHST11-202ENST00000546689 756 ntTSL 2 BASIC28.38■■■□□ 2.13
RFXAPO00287 AC092902.2-221ENST00000628476 965 ntTSL 5 BASIC28.38■■■□□ 2.13
RFXAPO00287 WHRN-203ENST00000374057 1718 ntTSL 2 BASIC28.38■■■□□ 2.13
RFXAPO00287 BLOC1S3-202ENST00000587722 732 ntAPPRIS P1 BASIC28.37■■■□□ 2.13
RFXAPO00287 BANF1-208ENST00000533166 1135 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.36■■■□□ 2.13
RFXAPO00287 ATP8B2-201ENST00000368487 1523 ntTSL 1 (best) BASIC28.36■■■□□ 2.13
RFXAPO00287 EI24-212ENST00000615917 1407 ntTSL 2 BASIC28.35■■■□□ 2.13
RFXAPO00287 KHSRP-213ENST00000619396 2226 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.35■■■□□ 2.13
RFXAPO00287 TGIF1-202ENST00000343820 2076 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.35■■■□□ 2.13
RFXAPO00287 RPRML-201ENST00000322329 1093 ntAPPRIS P1 BASIC28.35■■■□□ 2.13
RFXAPO00287 VPS37D-201ENST00000324941 1624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.34■■■□□ 2.13
RFXAPO00287 CLTA-207ENST00000470744 1102 ntTSL 2 BASIC28.34■■■□□ 2.13
RFXAPO00287 MXD3-203ENST00000439742 1483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.34■■■□□ 2.13
RFXAPO00287 RAD51-210ENST00000557850 1397 ntTSL 2 BASIC28.32■■■□□ 2.12
RFXAPO00287 IL1R1-201ENST00000409288 1735 ntTSL 5 BASIC28.32■■■□□ 2.12
RFXAPO00287 AC012354.3-201ENST00000623734 483 ntBASIC28.31■■■□□ 2.12
RFXAPO00287 NTF6A-201ENST00000591175 560 ntBASIC28.3■■■□□ 2.12
RFXAPO00287 AGO3-204ENST00000397828 1035 ntTSL 2 BASIC28.29■■■□□ 2.12
RFXAPO00287 AC073111.5-206ENST00000642087 859 ntAPPRIS P1 BASIC28.29■■■□□ 2.12
RFXAPO00287 PCYT2-206ENST00000571105 1628 ntTSL 5 BASIC28.29■■■□□ 2.12
RFXAPO00287 KCNQ5-204ENST00000370392 1469 ntTSL 1 (best) BASIC28.28■■■□□ 2.12
RFXAPO00287 FAM168B-201ENST00000389915 944 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC28.28■■■□□ 2.12
RFXAPO00287 PTCH1-210ENST00000468211 1254 ntTSL 1 (best) BASIC28.28■■■□□ 2.12
RFXAPO00287 GRASP-206ENST00000552049 1688 ntTSL 1 (best) BASIC28.27■■■□□ 2.12
RFXAPO00287 AC231981.1-201ENST00000450917 974 ntTSL 3 BASIC28.27■■■□□ 2.12
RFXAPO00287 HNRNPUL1-221ENST00000617305 1018 ntTSL 1 (best) BASIC28.27■■■□□ 2.12
RFXAPO00287 BTBD19-203ENST00000450269 1572 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.27■■■□□ 2.12
RFXAPO00287 LIME1-206ENST00000487026 805 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.26■■■□□ 2.11
RFXAPO00287 MDFIC-208ENST00000614186 1068 ntTSL 1 (best) BASIC28.26■■■□□ 2.11
RFXAPO00287 SDCCAG3-204ENST00000371725 2129 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.25■■■□□ 2.11
RFXAPO00287 HOXB3-207ENST00000472863 1909 ntTSL 2 BASIC28.25■■■□□ 2.11
RFXAPO00287 ACOT1-202ENST00000557556 1271 ntTSL 1 (best) BASIC28.23■■■□□ 2.11
RFXAPO00287 PIK3R2-208ENST00000617642 1446 ntTSL 5 BASIC28.23■■■□□ 2.11
RFXAPO00287 SLC2A4RG-201ENST00000266077 1731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.22■■■□□ 2.11
RFXAPO00287 AP002884.3-203ENST00000419895 1711 ntTSL 2 BASIC28.22■■■□□ 2.11
RFXAPO00287 ENHO-201ENST00000399775 1082 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.21■■■□□ 2.11
RFXAPO00287 AC022413.1-201ENST00000624602 984 ntBASIC28.21■■■□□ 2.11
RFXAPO00287 C1orf122-201ENST00000373042 973 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.2■■■□□ 2.1
RFXAPO00287 AL033527.3-201ENST00000566366 1196 ntBASIC28.2■■■□□ 2.1
RFXAPO00287 KIF13A-207ENST00000502704 1330 ntTSL 1 (best) BASIC28.19■■■□□ 2.1
RFXAPO00287 AC008813.1-201ENST00000536597 885 ntBASIC28.19■■■□□ 2.1
RFXAPO00287 INO80B-WBP1-202ENST00000452361 2040 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC28.18■■■□□ 2.1
RFXAPO00287 MAPK3-201ENST00000263025 1861 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.18■■■□□ 2.1
RFXAPO00287 MYLIP-202ENST00000356840 1666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.17■■■□□ 2.1
RFXAPO00287 BATF3-201ENST00000243440 980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.17■■■□□ 2.1
RFXAPO00287 MXD3-208ENST00000513063 861 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.17■■■□□ 2.1
RFXAPO00287 MANF-204ENST00000528157 1153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.17■■■□□ 2.1
RFXAPO00287 RASGEF1C-207ENST00000615330 2268 ntTSL 5 BASIC28.17■■■□□ 2.1
RFXAPO00287 METTL24-201ENST00000338882 1119 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.16■■■□□ 2.1
RFXAPO00287 HSD17B12-202ENST00000395700 994 ntTSL 1 (best) BASIC28.16■■■□□ 2.1
RFXAPO00287 SNX5-219ENST00000606602 885 ntTSL 1 (best) BASIC28.16■■■□□ 2.1
RFXAPO00287 LINC02323-201ENST00000559946 1603 ntTSL 3 BASIC28.15■■■□□ 2.1
RFXAPO00287 TMEM251-202ENST00000415050 1303 ntTSL 2 BASIC28.15■■■□□ 2.1
RFXAPO00287 PLEKHG6-206ENST00000536531 1683 ntTSL 1 (best) BASIC28.14■■■□□ 2.1
RFXAPO00287 RNF215-203ENST00000382363 1992 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.14■■■□□ 2.1
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