Protein–RNA interactions for Protein: H3BP13

TRAPPC2L, Trafficking protein particle complex subunit 2-like protein, humanhuman

Predictions only

Length 241 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TRAPPC2LH3BP13 TM6SF1-202ENST00000322019 2074 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
TRAPPC2LH3BP13 PQLC1-202ENST00000357575 2475 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.49■■□□□ 1.19
TRAPPC2LH3BP13 AGPAT2-202ENST00000371696 1512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
TRAPPC2LH3BP13 NPTXR-202ENST00000640136 1503 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
TRAPPC2LH3BP13 GNPTAB-201ENST00000299314 5701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
TRAPPC2LH3BP13 MIR762-201ENST00000390236 83 ntBASIC22.47■■□□□ 1.19
TRAPPC2LH3BP13 ACOT7-201ENST00000361521 2429 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
TRAPPC2LH3BP13 XKR6-201ENST00000297303 1550 ntTSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
TRAPPC2LH3BP13 MSANTD2-203ENST00000524950 1109 ntTSL 2 BASIC22.46■■□□□ 1.19
TRAPPC2LH3BP13 CHML-205ENST00000638160 705 ntTSL 3 BASIC22.46■■□□□ 1.19
TRAPPC2LH3BP13 FAM78B-202ENST00000354422 1475 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.46■■□□□ 1.19
TRAPPC2LH3BP13 HAUS7-201ENST00000370210 1593 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.46■■□□□ 1.19
TRAPPC2LH3BP13 HNRNPAB-202ENST00000358344 1796 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.19
TRAPPC2LH3BP13 RRAGC-201ENST00000373001 2732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
TRAPPC2LH3BP13 ATPAF1-202ENST00000371937 1827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
TRAPPC2LH3BP13 GKAP1-203ENST00000376371 1778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
TRAPPC2LH3BP13 FAM185A-202ENST00000413034 1179 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC22.44■■□□□ 1.18
TRAPPC2LH3BP13 MIR3665-201ENST00000578708 105 ntBASIC22.44■■□□□ 1.18
TRAPPC2LH3BP13 MAGI2-215ENST00000628980 6212 ntTSL 5 BASIC22.43■■□□□ 1.18
TRAPPC2LH3BP13 FBXO45-201ENST00000311630 5899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
TRAPPC2LH3BP13 PPP1R35-201ENST00000292330 1031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
TRAPPC2LH3BP13 DENR-202ENST00000455982 1052 ntTSL 5 BASIC22.43■■□□□ 1.18
TRAPPC2LH3BP13 BIN1-204ENST00000348750 2074 ntTSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
TRAPPC2LH3BP13 FOXE3-201ENST00000335071 1981 ntAPPRIS P1 BASIC22.42■■□□□ 1.18
TRAPPC2LH3BP13 TPI1-201ENST00000229270 1763 ntTSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
TRAPPC2LH3BP13 AGFG1-205ENST00000409979 2089 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.42■■□□□ 1.18
TRAPPC2LH3BP13 TPRA1-209ENST00000489960 1903 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.41■■□□□ 1.18
TRAPPC2LH3BP13 SHOX2-204ENST00000483851 1866 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.41■■□□□ 1.18
TRAPPC2LH3BP13 PGAM5-201ENST00000317555 1182 ntTSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
TRAPPC2LH3BP13 CMC4-202ENST00000369484 1107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
TRAPPC2LH3BP13 DUX4L28-201ENST00000623687 678 ntBASIC22.41■■□□□ 1.18
TRAPPC2LH3BP13 CARS2-201ENST00000257347 1879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
TRAPPC2LH3BP13 ST6GALNAC6-203ENST00000373142 2448 ntTSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
TRAPPC2LH3BP13 TESK1-206ENST00000620767 2438 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.4■■□□□ 1.18
TRAPPC2LH3BP13 RASSF8-202ENST00000381352 2320 ntTSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
TRAPPC2LH3BP13 NEUROG2-201ENST00000313341 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
TRAPPC2LH3BP13 AC012629.2-201ENST00000606513 377 ntTSL 5 BASIC22.4■■□□□ 1.18
TRAPPC2LH3BP13 AC139426.1-201ENST00000568218 2529 ntBASIC22.4■■□□□ 1.18
TRAPPC2LH3BP13 RUNDC3A-206ENST00000590941 1675 ntTSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.18
TRAPPC2LH3BP13 TPRA1-202ENST00000355552 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.18
TRAPPC2LH3BP13 COX4I1-203ENST00000562336 873 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.39■■□□□ 1.17
TRAPPC2LH3BP13 AC005559.1-201ENST00000589661 871 ntBASIC22.39■■□□□ 1.17
TRAPPC2LH3BP13 NOP53-201ENST00000246802 1528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
TRAPPC2LH3BP13 PXDC1-202ENST00000380283 2190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
TRAPPC2LH3BP13 DPY19L1-209ENST00000638088 5075 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.38■■□□□ 1.17
TRAPPC2LH3BP13 FOXQ1-201ENST00000296839 2309 ntAPPRIS P1 BASIC22.37■■□□□ 1.17
TRAPPC2LH3BP13 WDSUB1-205ENST00000409990 1920 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.37■■□□□ 1.17
TRAPPC2LH3BP13 GFRA4-202ENST00000319242 900 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
TRAPPC2LH3BP13 UBE2L6-201ENST00000287156 1354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
TRAPPC2LH3BP13 YAP1-204ENST00000526343 2393 ntTSL 5 BASIC22.36■■□□□ 1.17
TRAPPC2LH3BP13 EFNA3-201ENST00000368408 1782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
TRAPPC2LH3BP13 SSU72-201ENST00000291386 1290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
TRAPPC2LH3BP13 SP8-201ENST00000361443 1714 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
TRAPPC2LH3BP13 EXOC3L4-201ENST00000380069 2293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
TRAPPC2LH3BP13 RCC1L-205ENST00000618035 1409 ntTSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
TRAPPC2LH3BP13 VWA1-201ENST00000338660 2147 ntTSL 2 BASIC22.34■■□□□ 1.17
TRAPPC2LH3BP13 CRIP1-201ENST00000330233 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
TRAPPC2LH3BP13 AC087741.3-201ENST00000624270 1347 ntBASIC22.34■■□□□ 1.17
TRAPPC2LH3BP13 MISP3-201ENST00000269720 1424 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.34■■□□□ 1.17
TRAPPC2LH3BP13 SIGMAR1-203ENST00000378892 1743 ntTSL 2 BASIC22.34■■□□□ 1.17
TRAPPC2LH3BP13 RDX-210ENST00000530301 1549 ntTSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
TRAPPC2LH3BP13 BHLHE23-201ENST00000370346 1057 ntAPPRIS P1 BASIC22.33■■□□□ 1.17
TRAPPC2LH3BP13 ATRAID-201ENST00000380171 1240 ntTSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
TRAPPC2LH3BP13 PGM5P2-201ENST00000613141 1980 ntTSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
TRAPPC2LH3BP13 PIK3R2-208ENST00000617642 1446 ntTSL 5 BASIC22.32■■□□□ 1.16
TRAPPC2LH3BP13 GAL3ST1-204ENST00000402369 1712 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.32■■□□□ 1.16
TRAPPC2LH3BP13 GSTP1-202ENST00000398606 965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
TRAPPC2LH3BP13 PELI3-203ENST00000524466 1671 ntTSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
TRAPPC2LH3BP13 NKIRAS2-202ENST00000316082 833 ntTSL 5 BASIC22.31■■□□□ 1.16
TRAPPC2LH3BP13 SECTM1-201ENST00000269389 2235 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
TRAPPC2LH3BP13 RTN4R-201ENST00000043402 2157 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
TRAPPC2LH3BP13 NOG-201ENST00000332822 1892 ntAPPRIS P1 BASIC22.3■■□□□ 1.16
TRAPPC2LH3BP13 BTBD19-203ENST00000450269 1572 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.3■■□□□ 1.16
TRAPPC2LH3BP13 AC009097.4-201ENST00000566738 777 ntTSL 2 BASIC22.29■■□□□ 1.16
TRAPPC2LH3BP13 AC010864.1-201ENST00000609407 1511 ntBASIC22.29■■□□□ 1.16
TRAPPC2LH3BP13 PPP3CC-204ENST00000518852 1598 ntTSL 2 BASIC22.29■■□□□ 1.16
TRAPPC2LH3BP13 STUB1-201ENST00000219548 1472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
TRAPPC2LH3BP13 DUSP14-206ENST00000617516 1537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
TRAPPC2LH3BP13 SHF-206ENST00000560471 2499 ntTSL 5 BASIC22.28■■□□□ 1.16
TRAPPC2LH3BP13 AP000911.1-206ENST00000531938 711 ntTSL 3 BASIC22.28■■□□□ 1.16
TRAPPC2LH3BP13 DLG3-203ENST00000374360 5905 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
TRAPPC2LH3BP13 LANCL3-203ENST00000614025 1469 ntTSL 2 BASIC22.28■■□□□ 1.16
TRAPPC2LH3BP13 IRX1-201ENST00000302006 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
TRAPPC2LH3BP13 AC104109.3-201ENST00000519718 483 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.27■■□□□ 1.16
TRAPPC2LH3BP13 VEGFA-231ENST00000640499 1188 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
TRAPPC2LH3BP13 CERS2-205ENST00000368954 2505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
TRAPPC2LH3BP13 HSD11B1L-209ENST00000577917 1553 ntTSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
TRAPPC2LH3BP13 SMIM12-205ENST00000456842 918 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.25■■□□□ 1.15
TRAPPC2LH3BP13 EFNA1-202ENST00000368407 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
TRAPPC2LH3BP13 FGF18-201ENST00000274625 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
TRAPPC2LH3BP13 SLC30A10-202ENST00000366926 1915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
TRAPPC2LH3BP13 BCL7C-201ENST00000215115 1740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
TRAPPC2LH3BP13 ZFAND2B-206ENST00000409336 944 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.23■■□□□ 1.15
TRAPPC2LH3BP13 AC044849.2-201ENST00000606596 710 ntBASIC22.23■■□□□ 1.15
TRAPPC2LH3BP13 ZFAND2B-221ENST00000621130 1070 ntTSL 5 BASIC22.23■■□□□ 1.15
TRAPPC2LH3BP13 FSD1L-208ENST00000495708 1906 ntTSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
TRAPPC2LH3BP13 NPHP3-202ENST00000383282 782 ntTSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
TRAPPC2LH3BP13 NMB-202ENST00000394588 1017 ntTSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
TRAPPC2LH3BP13 AL139393.1-201ENST00000417479 573 ntTSL 5 BASIC22.22■■□□□ 1.15
TRAPPC2LH3BP13 MKNK2-202ENST00000309340 1744 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 93.2 ms