Protein–RNA interactions for Protein: E7EW31

PROB1, Proline-rich basic protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 1,015 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PROB1E7EW31 SNX5-219ENST00000606602 885 ntTSL 1 (best) BASIC26.74■■□□□ 1.87
PROB1E7EW31 MDFIC-208ENST00000614186 1068 ntTSL 1 (best) BASIC26.74■■□□□ 1.87
PROB1E7EW31 C1orf232-201ENST00000634842 643 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC26.74■■□□□ 1.87
PROB1E7EW31 CHML-204ENST00000638121 920 ntTSL 2 BASIC26.74■■□□□ 1.87
PROB1E7EW31 TPRG1L-201ENST00000344579 2189 ntTSL 1 (best) BASIC26.74■■□□□ 1.87
PROB1E7EW31 CGREF1-204ENST00000402550 1575 ntTSL 2 BASIC26.73■■□□□ 1.87
PROB1E7EW31 CBWD5-202ENST00000377384 1347 ntTSL 1 (best) BASIC26.72■■□□□ 1.87
PROB1E7EW31 RPS20-211ENST00000524349 752 ntTSL 1 (best) BASIC26.72■■□□□ 1.87
PROB1E7EW31 CHMP4B-201ENST00000217402 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.72■■□□□ 1.87
PROB1E7EW31 AGO3-204ENST00000397828 1035 ntTSL 2 BASIC26.71■■□□□ 1.87
PROB1E7EW31 AL033527.3-201ENST00000566366 1196 ntBASIC26.71■■□□□ 1.87
PROB1E7EW31 MPST-201ENST00000341116 1504 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.7■■□□□ 1.86
PROB1E7EW31 DTNBP1-202ENST00000344537 1403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.69■■□□□ 1.86
PROB1E7EW31 C1orf122-201ENST00000373042 973 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.69■■□□□ 1.86
PROB1E7EW31 CEP120-209ENST00000515110 606 ntTSL 3 BASIC26.69■■□□□ 1.86
PROB1E7EW31 AC092902.2-221ENST00000628476 965 ntTSL 5 BASIC26.69■■□□□ 1.86
PROB1E7EW31 AC019069.1-201ENST00000610008 1333 ntBASIC26.68■■□□□ 1.86
PROB1E7EW31 CTXN1-201ENST00000318978 1274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.68■■□□□ 1.86
PROB1E7EW31 LIME1-206ENST00000487026 805 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.68■■□□□ 1.86
PROB1E7EW31 RNF150-204ENST00000507500 1530 ntTSL 1 (best) BASIC26.68■■□□□ 1.86
PROB1E7EW31 AC008813.1-201ENST00000536597 885 ntBASIC26.67■■□□□ 1.86
PROB1E7EW31 C11orf96-203ENST00000617612 1294 ntAPPRIS P1 BASIC26.66■■□□□ 1.86
PROB1E7EW31 RUNX2-211ENST00000625924 1458 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.65■■□□□ 1.86
PROB1E7EW31 CACNG6-201ENST00000252729 1853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.65■■□□□ 1.86
PROB1E7EW31 HES4-202ENST00000428771 1040 ntTSL 2 BASIC26.62■■□□□ 1.85
PROB1E7EW31 MANF-204ENST00000528157 1153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.62■■□□□ 1.85
PROB1E7EW31 FAM168B-201ENST00000389915 944 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC26.61■■□□□ 1.85
PROB1E7EW31 BANF1-208ENST00000533166 1135 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.61■■□□□ 1.85
PROB1E7EW31 AC138207.2-201ENST00000583377 492 ntTSL 2 BASIC26.61■■□□□ 1.85
PROB1E7EW31 CRIP2-201ENST00000329146 1857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.61■■□□□ 1.85
PROB1E7EW31 ATP8B2-201ENST00000368487 1523 ntTSL 1 (best) BASIC26.6■■□□□ 1.85
PROB1E7EW31 C2orf88-204ENST00000409870 1441 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.6■■□□□ 1.85
PROB1E7EW31 KLC2-205ENST00000394078 1557 ntTSL 5 BASIC26.59■■□□□ 1.85
PROB1E7EW31 CLTA-207ENST00000470744 1102 ntTSL 2 BASIC26.59■■□□□ 1.85
PROB1E7EW31 UBE2L6-201ENST00000287156 1354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.58■■□□□ 1.85
PROB1E7EW31 QDPR-208ENST00000513615 1188 ntTSL 2 BASIC26.58■■□□□ 1.85
PROB1E7EW31 FAM78B-202ENST00000354422 1475 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.57■■□□□ 1.84
PROB1E7EW31 CTDNEP1-210ENST00000574322 1708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.56■■□□□ 1.84
PROB1E7EW31 AP000251.1-201ENST00000433071 822 ntTSL 1 (best) BASIC26.56■■□□□ 1.84
PROB1E7EW31 S1PR4-201ENST00000246115 1565 ntAPPRIS P1 BASIC26.55■■□□□ 1.84
PROB1E7EW31 RUNX2-203ENST00000371436 1588 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.55■■□□□ 1.84
PROB1E7EW31 HDAC3-201ENST00000305264 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.55■■□□□ 1.84
PROB1E7EW31 AC073111.5-206ENST00000642087 859 ntAPPRIS P1 BASIC26.55■■□□□ 1.84
PROB1E7EW31 AC022413.1-201ENST00000624602 984 ntBASIC26.54■■□□□ 1.84
PROB1E7EW31 LINC01770-201ENST00000417917 634 ntTSL 2 BASIC26.53■■□□□ 1.84
PROB1E7EW31 STUB1-201ENST00000219548 1472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.53■■□□□ 1.84
PROB1E7EW31 ARTN-202ENST00000372359 1921 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.52■■□□□ 1.84
PROB1E7EW31 RARRES2P1-201ENST00000474487 481 ntBASIC26.52■■□□□ 1.84
PROB1E7EW31 MMP28-203ENST00000612672 1092 ntTSL 1 (best) BASIC26.52■■□□□ 1.84
PROB1E7EW31 TSR3-201ENST00000007390 1243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.52■■□□□ 1.84
PROB1E7EW31 FEZF2-201ENST00000283268 2074 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.51■■□□□ 1.83
PROB1E7EW31 TRIP10-202ENST00000313285 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.51■■□□□ 1.83
PROB1E7EW31 TRIM52-AS1-202ENST00000507434 672 ntTSL 1 (best) BASIC26.51■■□□□ 1.83
PROB1E7EW31 AL592295.1-201ENST00000400984 884 ntBASIC26.5■■□□□ 1.83
PROB1E7EW31 AL590677.1-201ENST00000438431 380 ntTSL 5 BASIC26.5■■□□□ 1.83
PROB1E7EW31 PXMP2-205ENST00000543589 632 ntTSL 3 BASIC26.5■■□□□ 1.83
PROB1E7EW31 TXNL4A-208ENST00000588162 752 ntTSL 2 BASIC26.5■■□□□ 1.83
PROB1E7EW31 B4GALT7-201ENST00000029410 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.5■■□□□ 1.83
PROB1E7EW31 RAB12-201ENST00000329286 2137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.5■■□□□ 1.83
PROB1E7EW31 PXMP2-201ENST00000317479 957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.49■■□□□ 1.83
PROB1E7EW31 CHST11-202ENST00000546689 756 ntTSL 2 BASIC26.48■■□□□ 1.83
PROB1E7EW31 GFER-205ENST00000569451 517 ntTSL 5 BASIC26.48■■□□□ 1.83
PROB1E7EW31 HOMER3-207ENST00000594794 903 ntTSL 5 BASIC26.48■■□□□ 1.83
PROB1E7EW31 MZT2B-201ENST00000281871 933 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.47■■□□□ 1.83
PROB1E7EW31 MZT2A-201ENST00000309451 624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.47■■□□□ 1.83
PROB1E7EW31 BAX-202ENST00000345358 793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.47■■□□□ 1.83
PROB1E7EW31 AC231981.1-201ENST00000450917 974 ntTSL 3 BASIC26.47■■□□□ 1.83
PROB1E7EW31 NPW-202ENST00000566435 991 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.47■■□□□ 1.83
PROB1E7EW31 TSPY13P-201ENST00000338964 914 ntBASIC26.45■■□□□ 1.82
PROB1E7EW31 EI24-212ENST00000615917 1407 ntTSL 2 BASIC26.45■■□□□ 1.82
PROB1E7EW31 HSD17B12-202ENST00000395700 994 ntTSL 1 (best) BASIC26.44■■□□□ 1.82
PROB1E7EW31 U85056.1-201ENST00000616429 682 ntBASIC26.44■■□□□ 1.82
PROB1E7EW31 BRF1-221ENST00000619151 1530 ntTSL 5 BASIC26.44■■□□□ 1.82
PROB1E7EW31 CGREF1-202ENST00000312734 1610 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC26.43■■□□□ 1.82
PROB1E7EW31 KIF13A-207ENST00000502704 1330 ntTSL 1 (best) BASIC26.43■■□□□ 1.82
PROB1E7EW31 LYSMD2-202ENST00000454181 1228 ntTSL 1 (best) BASIC26.43■■□□□ 1.82
PROB1E7EW31 TRAPPC10-202ENST00000380221 1763 ntTSL 1 (best) BASIC26.43■■□□□ 1.82
PROB1E7EW31 C20orf24-203ENST00000373852 1059 ntTSL 1 (best) BASIC26.4■■□□□ 1.82
PROB1E7EW31 LINC01918-201ENST00000436841 797 ntTSL 2 BASIC26.4■■□□□ 1.82
PROB1E7EW31 CCDC37-AS1-202ENST00000506660 986 ntTSL 1 (best) BASIC26.4■■□□□ 1.82
PROB1E7EW31 SMARCD3-201ENST00000262188 1993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.4■■□□□ 1.82
PROB1E7EW31 TMEM114-202ENST00000568335 899 ntTSL 3 BASIC26.38■■□□□ 1.81
PROB1E7EW31 FOXD1-202ENST00000615637 2272 ntAPPRIS P1 BASIC26.36■■□□□ 1.81
PROB1E7EW31 TNFRSF4-201ENST00000379236 1068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.36■■□□□ 1.81
PROB1E7EW31 MTURN-203ENST00000409688 843 ntTSL 2 BASIC26.36■■□□□ 1.81
PROB1E7EW31 PRRX2-201ENST00000372469 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.36■■□□□ 1.81
PROB1E7EW31 HYI-213ENST00000583037 1322 ntTSL 5 BASIC26.36■■□□□ 1.81
PROB1E7EW31 ACTR3B-202ENST00000377776 1566 ntTSL 1 (best) BASIC26.35■■□□□ 1.81
PROB1E7EW31 AC004987.1-201ENST00000428627 508 ntBASIC26.35■■□□□ 1.81
PROB1E7EW31 ATP5G2P3-201ENST00000429083 425 ntBASIC26.34■■□□□ 1.81
PROB1E7EW31 DSG2-202ENST00000585206 1081 ntTSL 2 BASIC26.34■■□□□ 1.81
PROB1E7EW31 SERP2-201ENST00000379179 784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.33■■□□□ 1.81
PROB1E7EW31 GUK1-208ENST00000366728 842 ntTSL 2 BASIC26.32■■□□□ 1.8
PROB1E7EW31 SURF1-201ENST00000371974 1093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.32■■□□□ 1.8
PROB1E7EW31 SURF1-205ENST00000615505 991 ntTSL 1 (best) BASIC26.32■■□□□ 1.8
PROB1E7EW31 WHRN-203ENST00000374057 1718 ntTSL 2 BASIC26.31■■□□□ 1.8
PROB1E7EW31 RAB4B-203ENST00000594800 1173 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.31■■□□□ 1.8
PROB1E7EW31 ZDHHC16-201ENST00000345745 1519 ntTSL 1 (best) BASIC26.3■■□□□ 1.8
PROB1E7EW31 MDFIC-203ENST00000423503 474 ntTSL 1 (best) BASIC26.3■■□□□ 1.8
PROB1E7EW31 KLHL21-203ENST00000463043 667 ntTSL 5 BASIC26.3■■□□□ 1.8
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 14.9 ms