Protein–RNA interactions for Protein: A8MW95

BECN2, Beclin-2, humanhuman

Predictions only

Length 431 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
BECN2A8MW95 GPR75-ASB3-201ENST00000406625 2113 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.5■■■□□ 2.31
BECN2A8MW95 MSX2-202ENST00000507785 1188 ntTSL 2 BASIC29.49■■■□□ 2.31
BECN2A8MW95 GUSB-202ENST00000421103 1742 ntTSL 2 BASIC29.48■■■□□ 2.31
BECN2A8MW95 WHRN-203ENST00000374057 1718 ntTSL 2 BASIC29.47■■■□□ 2.31
BECN2A8MW95 HAND2-201ENST00000359562 2780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.47■■■□□ 2.31
BECN2A8MW95 PICK1-201ENST00000356976 2055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.44■■■□□ 2.3
BECN2A8MW95 IRX1-201ENST00000302006 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.42■■■□□ 2.3
BECN2A8MW95 DHRS13-202ENST00000394901 2037 ntTSL 1 (best) BASIC29.41■■■□□ 2.3
BECN2A8MW95 CDH24-206ENST00000610348 2037 ntTSL 1 (best) BASIC29.41■■■□□ 2.3
BECN2A8MW95 PLSCR3-214ENST00000619711 2066 ntTSL 5 BASIC29.41■■■□□ 2.3
BECN2A8MW95 ECI1-201ENST00000301729 1541 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.4■■■□□ 2.3
BECN2A8MW95 RDX-210ENST00000530301 1549 ntTSL 1 (best) BASIC29.4■■■□□ 2.3
BECN2A8MW95 NRGN-202ENST00000412681 1106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.4■■■□□ 2.3
BECN2A8MW95 LACTB-201ENST00000261893 1972 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.4■■■□□ 2.3
BECN2A8MW95 MNX1-201ENST00000252971 2174 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.39■■■□□ 2.3
BECN2A8MW95 AL139393.2-201ENST00000608721 2025 ntBASIC29.39■■■□□ 2.3
BECN2A8MW95 HECA-201ENST00000367658 5614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.39■■■□□ 2.29
BECN2A8MW95 HOXB3-212ENST00000498678 2196 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.39■■■□□ 2.29
BECN2A8MW95 RAPGEF1-203ENST00000372195 6256 ntTSL 1 (best) BASIC29.38■■■□□ 2.29
BECN2A8MW95 EFEMP2-201ENST00000307998 2034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.37■■■□□ 2.29
BECN2A8MW95 RNF150-204ENST00000507500 1530 ntTSL 1 (best) BASIC29.36■■■□□ 2.29
BECN2A8MW95 AC068152.1-207ENST00000573341 647 ntTSL 2 BASIC29.36■■■□□ 2.29
BECN2A8MW95 NRTN-201ENST00000303212 1109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.33■■■□□ 2.29
BECN2A8MW95 MFSD12-201ENST00000355415 2124 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.32■■■□□ 2.28
BECN2A8MW95 FBXO45-201ENST00000311630 5899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.32■■■□□ 2.28
BECN2A8MW95 PCYT2-206ENST00000571105 1628 ntTSL 5 BASIC29.32■■■□□ 2.28
BECN2A8MW95 ATF4-201ENST00000337304 2019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.32■■■□□ 2.28
BECN2A8MW95 GLRB-203ENST00000509282 1757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.31■■■□□ 2.28
BECN2A8MW95 CARS2-201ENST00000257347 1879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.31■■■□□ 2.28
BECN2A8MW95 CGREF1-204ENST00000402550 1575 ntTSL 2 BASIC29.3■■■□□ 2.28
BECN2A8MW95 NPB-202ENST00000573081 2154 ntAPPRIS ALT2 BASIC29.3■■■□□ 2.28
BECN2A8MW95 CHSY1-201ENST00000254190 4550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.3■■■□□ 2.28
BECN2A8MW95 NPDC1-201ENST00000371600 2187 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.29■■■□□ 2.28
BECN2A8MW95 TCF24-201ENST00000563496 2450 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.29■■■□□ 2.28
BECN2A8MW95 C11orf80-204ENST00000525908 2135 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC29.29■■■□□ 2.28
BECN2A8MW95 BCL7C-201ENST00000215115 1740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.28■■■□□ 2.28
BECN2A8MW95 SCCPDH-201ENST00000366510 2503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.28■■■□□ 2.28
BECN2A8MW95 LINC01089-207ENST00000538335 630 ntTSL 3 BASIC29.28■■■□□ 2.28
BECN2A8MW95 DRD5P2-201ENST00000421395 2012 ntBASIC29.28■■■□□ 2.28
BECN2A8MW95 XKR6-201ENST00000297303 1550 ntTSL 1 (best) BASIC29.27■■■□□ 2.28
BECN2A8MW95 NFYB-205ENST00000551727 1727 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC29.27■■■□□ 2.28
BECN2A8MW95 FAM89B-201ENST00000316409 1409 ntTSL 1 (best) BASIC29.26■■■□□ 2.27
BECN2A8MW95 CBX4-202ENST00000448310 718 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC29.25■■■□□ 2.27
BECN2A8MW95 SLC9A3R2-202ENST00000432365 1564 ntTSL 1 (best) BASIC29.25■■■□□ 2.27
BECN2A8MW95 ZFAND2B-208ENST00000409594 2021 ntTSL 2 BASIC29.25■■■□□ 2.27
BECN2A8MW95 NPTXR-202ENST00000640136 1503 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.25■■■□□ 2.27
BECN2A8MW95 CDK2AP1-203ENST00000535979 1281 ntTSL 3 BASIC29.24■■■□□ 2.27
BECN2A8MW95 CDKN2D-202ENST00000393599 1422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.23■■■□□ 2.27
BECN2A8MW95 TNFSF12-201ENST00000293825 1553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.22■■■□□ 2.27
BECN2A8MW95 COMMD7-201ENST00000278980 1900 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.22■■■□□ 2.27
BECN2A8MW95 CLK2-201ENST00000355560 2120 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC29.22■■■□□ 2.27
BECN2A8MW95 WASH5P-204ENST00000632292 975 ntBASIC29.22■■■□□ 2.27
BECN2A8MW95 KLF16-203ENST00000592313 508 ntTSL 3 BASIC29.21■■■□□ 2.27
BECN2A8MW95 MXD3-203ENST00000439742 1483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.21■■■□□ 2.27
BECN2A8MW95 PLEKHG6-206ENST00000536531 1683 ntTSL 1 (best) BASIC29.18■■■□□ 2.26
BECN2A8MW95 AC025431.1-201ENST00000559684 874 ntTSL 3 BASIC29.17■■■□□ 2.26
BECN2A8MW95 PLEKHF1-201ENST00000436066 2084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.16■■■□□ 2.26
BECN2A8MW95 FAAP20-204ENST00000400919 1413 ntTSL 3 BASIC29.16■■■□□ 2.26
BECN2A8MW95 ABHD17A-202ENST00000292577 1757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.16■■■□□ 2.26
BECN2A8MW95 ZFPM1-201ENST00000319555 5380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.15■■■□□ 2.26
BECN2A8MW95 SERPING1-205ENST00000403558 2231 ntTSL 5 BASIC29.15■■■□□ 2.26
BECN2A8MW95 CARM1-202ENST00000344150 2722 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC29.15■■■□□ 2.26
BECN2A8MW95 PELI3-203ENST00000524466 1671 ntTSL 1 (best) BASIC29.15■■■□□ 2.26
BECN2A8MW95 NOP53-201ENST00000246802 1528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.15■■■□□ 2.26
BECN2A8MW95 SDCCAG3-201ENST00000298537 2314 ntTSL 1 (best) BASIC29.14■■■□□ 2.26
BECN2A8MW95 AC079305.1-201ENST00000428541 499 ntTSL 3 BASIC29.14■■■□□ 2.26
BECN2A8MW95 GAL3ST1-204ENST00000402369 1712 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC29.14■■■□□ 2.25
BECN2A8MW95 ZNF276-202ENST00000443381 2267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.13■■■□□ 2.25
BECN2A8MW95 ADNP-AS1-201ENST00000558899 927 ntTSL 3 BASIC29.13■■■□□ 2.25
BECN2A8MW95 FSD1L-208ENST00000495708 1906 ntTSL 1 (best) BASIC29.12■■■□□ 2.25
BECN2A8MW95 MKNK2-202ENST00000309340 1744 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.11■■■□□ 2.25
BECN2A8MW95 KANSL1L-207ENST00000452086 2334 ntTSL 1 (best) BASIC29.11■■■□□ 2.25
BECN2A8MW95 HYAL2-202ENST00000395139 2136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.11■■■□□ 2.25
BECN2A8MW95 RCOR3-202ENST00000367006 2525 ntTSL 1 (best) BASIC29.1■■■□□ 2.25
BECN2A8MW95 AGPAT2-202ENST00000371696 1512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.1■■■□□ 2.25
BECN2A8MW95 WTAP-206ENST00000621533 2109 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.09■■■□□ 2.25
BECN2A8MW95 VEGFC-202ENST00000618562 2064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.09■■■□□ 2.25
BECN2A8MW95 TP53I13-201ENST00000301057 1530 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.09■■■□□ 2.25
BECN2A8MW95 AL121749.1-202ENST00000609313 2153 ntBASIC29.08■■■□□ 2.25
BECN2A8MW95 MAPKAPK2-201ENST00000294981 2171 ntTSL 1 (best) BASIC29.08■■■□□ 2.25
BECN2A8MW95 FLJ37453-201ENST00000317122 2473 ntTSL 2 BASIC29.08■■■□□ 2.25
BECN2A8MW95 OSBP-201ENST00000263847 5083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.07■■■□□ 2.24
BECN2A8MW95 SNTB1-202ENST00000517992 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.06■■■□□ 2.24
BECN2A8MW95 ROM1-201ENST00000278833 1878 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.06■■■□□ 2.24
BECN2A8MW95 AL133380.1-201ENST00000506013 324 ntBASIC29.06■■■□□ 2.24
BECN2A8MW95 ZDHHC23-206ENST00000498275 2055 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC29.06■■■□□ 2.24
BECN2A8MW95 KCNJ4-201ENST00000303592 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.05■■■□□ 2.24
BECN2A8MW95 PCYT2-203ENST00000538936 5147 ntTSL 1 (best) BASIC29.05■■■□□ 2.24
BECN2A8MW95 RRNAD1-201ENST00000368216 2254 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.05■■■□□ 2.24
BECN2A8MW95 AC010864.1-201ENST00000609407 1511 ntBASIC29.04■■■□□ 2.24
BECN2A8MW95 TNIP2-201ENST00000315423 1974 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.04■■■□□ 2.24
BECN2A8MW95 AMZ2-201ENST00000359783 1722 ntTSL 5 BASIC29.04■■■□□ 2.24
BECN2A8MW95 THRA-204ENST00000546243 1909 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.04■■■□□ 2.24
BECN2A8MW95 MARCH11-201ENST00000332432 1741 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.03■■■□□ 2.24
BECN2A8MW95 CAPNS1-204ENST00000587718 1558 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.03■■■□□ 2.24
BECN2A8MW95 NAPA-201ENST00000263354 1839 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.03■■■□□ 2.24
BECN2A8MW95 SLC16A3-214ENST00000582743 2002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.03■■■□□ 2.24
BECN2A8MW95 TMEM55B-201ENST00000250489 1961 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.02■■■□□ 2.24
BECN2A8MW95 CHST14-202ENST00000559991 1968 ntTSL 5 BASIC29.02■■■□□ 2.24
BECN2A8MW95 PEA15-201ENST00000360472 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.02■■■□□ 2.24
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 49.4 ms