Protein–RNA interactions for Protein: A6NNA2

SRRM3, Serine/arginine repetitive matrix protein 3, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 597 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SRRM3A6NNA2 AL109917.1-201ENST00000412228 906 ntTSL 2 BASIC27.13■■□□□ 1.93
SRRM3A6NNA2 PI4KAP1-202ENST00000611748 1906 ntTSL 1 (best) BASIC27.13■■□□□ 1.93
SRRM3A6NNA2 HNRNPLP2-201ENST00000568980 1570 ntBASIC27.13■■□□□ 1.93
SRRM3A6NNA2 GABRA5-203ENST00000400081 2761 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.13■■□□□ 1.93
SRRM3A6NNA2 FBXO2-201ENST00000354287 1560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.12■■□□□ 1.93
SRRM3A6NNA2 HOXB3-201ENST00000311626 2642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.12■■□□□ 1.93
SRRM3A6NNA2 KIAA1456-206ENST00000528753 2392 ntTSL 2 BASIC27.1■■□□□ 1.93
SRRM3A6NNA2 AL391121.1-201ENST00000607967 1349 ntBASIC27.1■■□□□ 1.93
SRRM3A6NNA2 SNTB1-202ENST00000517992 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.09■■□□□ 1.93
SRRM3A6NNA2 GSC2-201ENST00000086933 1033 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.09■■□□□ 1.93
SRRM3A6NNA2 PCYT2-205ENST00000570391 1857 ntTSL 2 BASIC27.08■■□□□ 1.93
SRRM3A6NNA2 NFKBIA-209ENST00000557389 1537 ntTSL 2 BASIC27.08■■□□□ 1.93
SRRM3A6NNA2 NAPA-201ENST00000263354 1839 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.07■■□□□ 1.92
SRRM3A6NNA2 SLC30A10-202ENST00000366926 1915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.07■■□□□ 1.92
SRRM3A6NNA2 FOXQ1-201ENST00000296839 2309 ntAPPRIS P1 BASIC27.07■■□□□ 1.92
SRRM3A6NNA2 KCNJ4-201ENST00000303592 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.07■■□□□ 1.92
SRRM3A6NNA2 MIR3665-201ENST00000578708 105 ntBASIC27.06■■□□□ 1.92
SRRM3A6NNA2 FTCD-202ENST00000397743 1834 ntTSL 1 (best) BASIC27.06■■□□□ 1.92
SRRM3A6NNA2 IRX1-201ENST00000302006 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.05■■□□□ 1.92
SRRM3A6NNA2 RUNDC3A-201ENST00000225441 1821 ntTSL 1 (best) BASIC27.04■■□□□ 1.92
SRRM3A6NNA2 FAM185A-202ENST00000413034 1179 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC27.04■■□□□ 1.92
SRRM3A6NNA2 ECI1-203ENST00000562238 948 ntTSL 1 (best) BASIC27.04■■□□□ 1.92
SRRM3A6NNA2 FOXE3-201ENST00000335071 1981 ntAPPRIS P1 BASIC27.04■■□□□ 1.92
SRRM3A6NNA2 GPR75-ASB3-201ENST00000406625 2113 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.04■■□□□ 1.92
SRRM3A6NNA2 ARMC10-205ENST00000428183 2445 ntTSL 1 (best) BASIC27.04■■□□□ 1.92
SRRM3A6NNA2 TRNP1-201ENST00000522111 1958 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.03■■□□□ 1.92
SRRM3A6NNA2 MSANTD2-203ENST00000524950 1109 ntTSL 2 BASIC27.03■■□□□ 1.92
SRRM3A6NNA2 CAPNS1-211ENST00000590874 926 ntTSL 5 BASIC27.03■■□□□ 1.92
SRRM3A6NNA2 CREM-210ENST00000374721 2020 ntTSL 5 BASIC27.02■■□□□ 1.92
SRRM3A6NNA2 PCBD2-201ENST00000254908 1223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.02■■□□□ 1.92
SRRM3A6NNA2 ACTR3B-201ENST00000256001 2216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.02■■□□□ 1.92
SRRM3A6NNA2 FAM220A-206ENST00000616824 2211 ntTSL 1 (best) BASIC27.02■■□□□ 1.92
SRRM3A6NNA2 LY6K-202ENST00000518841 855 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.01■■□□□ 1.91
SRRM3A6NNA2 SHOX2-204ENST00000483851 1866 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.01■■□□□ 1.91
SRRM3A6NNA2 CPNE1-203ENST00000397442 1695 ntTSL 5 BASIC27.01■■□□□ 1.91
SRRM3A6NNA2 THAP11-201ENST00000303596 2114 ntAPPRIS P1 BASIC27.01■■□□□ 1.91
SRRM3A6NNA2 RTN2-202ENST00000344680 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.01■■□□□ 1.91
SRRM3A6NNA2 H2AFV-205ENST00000381124 628 ntTSL 3 BASIC27■■□□□ 1.91
SRRM3A6NNA2 AC104109.3-201ENST00000519718 483 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27■■□□□ 1.91
SRRM3A6NNA2 THAP4-204ENST00000407315 2367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.99■■□□□ 1.91
SRRM3A6NNA2 SMARCD3-203ENST00000392811 2018 ntTSL 1 (best) BASIC26.99■■□□□ 1.91
SRRM3A6NNA2 GAL3ST1-205ENST00000406361 1819 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.97■■□□□ 1.91
SRRM3A6NNA2 AC087741.3-201ENST00000624270 1347 ntBASIC26.97■■□□□ 1.91
SRRM3A6NNA2 PGM5P2-201ENST00000613141 1980 ntTSL 1 (best) BASIC26.97■■□□□ 1.91
SRRM3A6NNA2 COPRS-202ENST00000378634 1041 ntTSL 2 BASIC26.97■■□□□ 1.91
SRRM3A6NNA2 WNT5A-AS1-201ENST00000469484 500 ntTSL 3 BASIC26.97■■□□□ 1.91
SRRM3A6NNA2 AP000911.1-206ENST00000531938 711 ntTSL 3 BASIC26.97■■□□□ 1.91
SRRM3A6NNA2 UBALD1-202ENST00000587615 799 ntTSL 2 BASIC26.97■■□□□ 1.91
SRRM3A6NNA2 NREP-216ENST00000508870 540 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC26.95■■□□□ 1.9
SRRM3A6NNA2 ADAP1-201ENST00000265846 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.95■■□□□ 1.9
SRRM3A6NNA2 LMO2-201ENST00000257818 2294 ntTSL 1 (best) BASIC26.95■■□□□ 1.9
SRRM3A6NNA2 SEC61G-204ENST00000450622 512 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.94■■□□□ 1.9
SRRM3A6NNA2 MRAP2-201ENST00000257776 2153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.94■■□□□ 1.9
SRRM3A6NNA2 COL13A1-214ENST00000522165 2061 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.93■■□□□ 1.9
SRRM3A6NNA2 MLST8-203ENST00000397124 1691 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC26.93■■□□□ 1.9
SRRM3A6NNA2 TRAM2-AS1-201ENST00000453216 664 ntTSL 3 BASIC26.93■■□□□ 1.9
SRRM3A6NNA2 SHARPIN-202ENST00000398712 1765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.92■■□□□ 1.9
SRRM3A6NNA2 AC135731.1-201ENST00000569415 2548 ntBASIC26.91■■□□□ 1.9
SRRM3A6NNA2 VEGFC-202ENST00000618562 2064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.91■■□□□ 1.9
SRRM3A6NNA2 ZNF706-207ENST00000519882 959 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC26.91■■□□□ 1.9
SRRM3A6NNA2 ZNF706-213ENST00000521272 732 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.91■■□□□ 1.9
SRRM3A6NNA2 U2AF2-206ENST00000590551 1104 ntTSL 3 BASIC26.91■■□□□ 1.9
SRRM3A6NNA2 RCOR3-202ENST00000367006 2525 ntTSL 1 (best) BASIC26.91■■□□□ 1.9
SRRM3A6NNA2 LACTB-201ENST00000261893 1972 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.9■■□□□ 1.9
SRRM3A6NNA2 AC243773.2-204ENST00000621428 1462 ntTSL 1 (best) BASIC26.9■■□□□ 1.9
SRRM3A6NNA2 TLE6-201ENST00000246112 2100 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.9■■□□□ 1.9
SRRM3A6NNA2 EFEMP2-201ENST00000307998 2034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.9■■□□□ 1.9
SRRM3A6NNA2 FLJ37453-201ENST00000317122 2473 ntTSL 2 BASIC26.9■■□□□ 1.9
SRRM3A6NNA2 AL121749.1-202ENST00000609313 2153 ntBASIC26.9■■□□□ 1.9
SRRM3A6NNA2 PEA15-201ENST00000360472 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.89■■□□□ 1.9
SRRM3A6NNA2 SHF-207ENST00000560540 2062 ntTSL 5 BASIC26.89■■□□□ 1.89
SRRM3A6NNA2 SLC52A2-201ENST00000329994 1896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.89■■□□□ 1.89
SRRM3A6NNA2 CD151-202ENST00000397420 1648 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.88■■□□□ 1.89
SRRM3A6NNA2 RBPMS-209ENST00000520161 842 ntTSL 2 BASIC26.88■■□□□ 1.89
SRRM3A6NNA2 CAPNS1-204ENST00000587718 1558 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.88■■□□□ 1.89
SRRM3A6NNA2 AC044849.2-201ENST00000606596 710 ntBASIC26.87■■□□□ 1.89
SRRM3A6NNA2 GKAP1-203ENST00000376371 1778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.86■■□□□ 1.89
SRRM3A6NNA2 MAPKAPK2-201ENST00000294981 2171 ntTSL 1 (best) BASIC26.86■■□□□ 1.89
SRRM3A6NNA2 PGAM5-201ENST00000317555 1182 ntTSL 1 (best) BASIC26.86■■□□□ 1.89
SRRM3A6NNA2 GALK1-205ENST00000588479 1866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.86■■□□□ 1.89
SRRM3A6NNA2 CHPT1-205ENST00000549872 2001 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.84■■□□□ 1.89
SRRM3A6NNA2 HDGF-210ENST00000537739 2073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.84■■□□□ 1.89
SRRM3A6NNA2 THRA-204ENST00000546243 1909 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.84■■□□□ 1.89
SRRM3A6NNA2 SMIM12-205ENST00000456842 918 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.83■■□□□ 1.89
SRRM3A6NNA2 NOG-201ENST00000332822 1892 ntAPPRIS P1 BASIC26.83■■□□□ 1.88
SRRM3A6NNA2 ZNRF2P2-203ENST00000454624 420 ntBASIC26.82■■□□□ 1.88
SRRM3A6NNA2 DUX4L28-201ENST00000623687 678 ntBASIC26.82■■□□□ 1.88
SRRM3A6NNA2 TNIP2-201ENST00000315423 1974 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.82■■□□□ 1.88
SRRM3A6NNA2 MTMR1-214ENST00000542156 1227 ntTSL 1 (best) BASIC26.81■■□□□ 1.88
SRRM3A6NNA2 TAZ-205ENST00000475699 1862 ntTSL 1 (best) BASIC26.81■■□□□ 1.88
SRRM3A6NNA2 RPS2-201ENST00000343262 985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.8■■□□□ 1.88
SRRM3A6NNA2 PHF23-205ENST00000571362 1768 ntTSL 2 BASIC26.79■■□□□ 1.88
SRRM3A6NNA2 ACOT12-204ENST00000513751 612 ntTSL 1 (best) BASIC26.79■■□□□ 1.88
SRRM3A6NNA2 TMEM187-201ENST00000369982 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.79■■□□□ 1.88
SRRM3A6NNA2 CPNE1-202ENST00000352393 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.78■■□□□ 1.88
SRRM3A6NNA2 EBPL-202ENST00000378268 680 ntTSL 3 BASIC26.78■■□□□ 1.88
SRRM3A6NNA2 HOXB3-210ENST00000489475 1845 ntTSL 2 BASIC26.78■■□□□ 1.88
SRRM3A6NNA2 TP53I13-201ENST00000301057 1530 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.77■■□□□ 1.88
SRRM3A6NNA2 HAND2-201ENST00000359562 2780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.77■■□□□ 1.88
SRRM3A6NNA2 WSB2-201ENST00000315436 2646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.76■■□□□ 1.87
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 18.5 ms