Protein–RNA interactions for Protein: A6NLW8

DUXA, Double homeobox protein A, humanhuman

Predictions only

Length 204 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
DUXAA6NLW8 WDSUB1-205ENST00000409990 1920 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.49■■□□□ 1.51
DUXAA6NLW8 BIN1-204ENST00000348750 2074 ntTSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
DUXAA6NLW8 PQLC1-202ENST00000357575 2475 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.48■■□□□ 1.51
DUXAA6NLW8 PSMG4-205ENST00000419065 629 ntTSL 2 BASIC24.48■■□□□ 1.51
DUXAA6NLW8 SEC61G-204ENST00000450622 512 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.48■■□□□ 1.51
DUXAA6NLW8 UBALD2-203ENST00000589240 660 ntTSL 2 BASIC24.47■■□□□ 1.51
DUXAA6NLW8 PGM5P2-201ENST00000613141 1980 ntTSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
DUXAA6NLW8 TPRA1-202ENST00000355552 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
DUXAA6NLW8 ACOT7-201ENST00000361521 2429 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
DUXAA6NLW8 MARCH2-202ENST00000381035 1192 ntTSL 5 BASIC24.46■■□□□ 1.51
DUXAA6NLW8 ARTN-204ENST00000438616 889 ntTSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
DUXAA6NLW8 GSC2-201ENST00000086933 1033 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.45■■□□□ 1.5
DUXAA6NLW8 ECI1-207ENST00000570258 1512 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.45■■□□□ 1.5
DUXAA6NLW8 TESK1-206ENST00000620767 2438 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.44■■□□□ 1.5
DUXAA6NLW8 BCL7C-201ENST00000215115 1740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
DUXAA6NLW8 AC092755.2-201ENST00000560199 402 ntTSL 3 BASIC24.44■■□□□ 1.5
DUXAA6NLW8 IRX1-201ENST00000302006 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
DUXAA6NLW8 YAP1-204ENST00000526343 2393 ntTSL 5 BASIC24.44■■□□□ 1.5
DUXAA6NLW8 TPGS1-201ENST00000359315 1114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
DUXAA6NLW8 VWA1-201ENST00000338660 2147 ntTSL 2 BASIC24.43■■□□□ 1.5
DUXAA6NLW8 SIGMAR1-203ENST00000378892 1743 ntTSL 2 BASIC24.42■■□□□ 1.5
DUXAA6NLW8 AC012615.2-201ENST00000586259 447 ntTSL 4 BASIC24.42■■□□□ 1.5
DUXAA6NLW8 AC139426.1-201ENST00000568218 2529 ntBASIC24.41■■□□□ 1.5
DUXAA6NLW8 MZT2B-202ENST00000409255 769 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.41■■□□□ 1.5
DUXAA6NLW8 MKNK2-202ENST00000309340 1744 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
DUXAA6NLW8 PLEKHG6-206ENST00000536531 1683 ntTSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
DUXAA6NLW8 PXDC1-202ENST00000380283 2190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
DUXAA6NLW8 FSD1L-208ENST00000495708 1906 ntTSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.49
DUXAA6NLW8 FGF18-201ENST00000274625 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
DUXAA6NLW8 STUB1-205ENST00000565677 1560 ntTSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
DUXAA6NLW8 MYLIP-202ENST00000356840 1666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
DUXAA6NLW8 RTN4R-201ENST00000043402 2157 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
DUXAA6NLW8 CIB1-201ENST00000328649 1247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
DUXAA6NLW8 AL133346.1-201ENST00000435287 495 ntTSL 2 BASIC24.38■■□□□ 1.49
DUXAA6NLW8 CIB1-202ENST00000612800 1096 ntTSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
DUXAA6NLW8 RRAGC-201ENST00000373001 2732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
DUXAA6NLW8 SECTM1-201ENST00000269389 2235 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
DUXAA6NLW8 FOXG1-201ENST00000313071 4890 ntAPPRIS P1 BASIC24.36■■□□□ 1.49
DUXAA6NLW8 EXOC3L4-201ENST00000380069 2293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
DUXAA6NLW8 ZNF787-203ENST00000610935 1925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
DUXAA6NLW8 BATF3-201ENST00000243440 980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
DUXAA6NLW8 ST6GALNAC6-203ENST00000373142 2448 ntTSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
DUXAA6NLW8 HOXB3-212ENST00000498678 2196 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.35■■□□□ 1.49
DUXAA6NLW8 FEV-201ENST00000295727 1879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
DUXAA6NLW8 ABHD17A-202ENST00000292577 1757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
DUXAA6NLW8 HNRNPAB-205ENST00000506259 1674 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
DUXAA6NLW8 SLC30A10-202ENST00000366926 1915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
DUXAA6NLW8 NMB-202ENST00000394588 1017 ntTSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
DUXAA6NLW8 CHML-205ENST00000638160 705 ntTSL 3 BASIC24.33■■□□□ 1.49
DUXAA6NLW8 RUNX2-205ENST00000465038 1770 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC24.32■■□□□ 1.48
DUXAA6NLW8 MIR762-201ENST00000390236 83 ntBASIC24.32■■□□□ 1.48
DUXAA6NLW8 AC012629.2-201ENST00000606513 377 ntTSL 5 BASIC24.32■■□□□ 1.48
DUXAA6NLW8 MISP3-201ENST00000269720 1424 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.32■■□□□ 1.48
DUXAA6NLW8 ATF4-201ENST00000337304 2019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
DUXAA6NLW8 EFNA1-202ENST00000368407 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
DUXAA6NLW8 LANCL3-203ENST00000614025 1469 ntTSL 2 BASIC24.31■■□□□ 1.48
DUXAA6NLW8 AL139393.2-201ENST00000608721 2025 ntBASIC24.3■■□□□ 1.48
DUXAA6NLW8 CIC-201ENST00000160740 6111 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.3■■□□□ 1.48
DUXAA6NLW8 ZBTB10-204ENST00000455036 5458 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC24.3■■□□□ 1.48
DUXAA6NLW8 LMO1-202ENST00000428101 1038 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
DUXAA6NLW8 SCX-201ENST00000567180 999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
DUXAA6NLW8 PDCD2-215ENST00000614056 1287 ntTSL 2 BASIC24.3■■□□□ 1.48
DUXAA6NLW8 AMZ2-201ENST00000359783 1722 ntTSL 5 BASIC24.3■■□□□ 1.48
DUXAA6NLW8 CERS2-205ENST00000368954 2505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
DUXAA6NLW8 SUZ12P1-203ENST00000578195 985 ntBASIC24.28■■□□□ 1.48
DUXAA6NLW8 MNX1-207ENST00000543409 1620 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
DUXAA6NLW8 NOXA1-201ENST00000341349 1678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
DUXAA6NLW8 HOPX-206ENST00000503639 1248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
DUXAA6NLW8 MTCH1-202ENST00000373627 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
DUXAA6NLW8 SHF-206ENST00000560471 2499 ntTSL 5 BASIC24.26■■□□□ 1.47
DUXAA6NLW8 ATP6V1E2-204ENST00000522587 1559 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.25■■□□□ 1.47
DUXAA6NLW8 HNRNPAB-204ENST00000504898 1785 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
DUXAA6NLW8 VEGFA-231ENST00000640499 1188 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
DUXAA6NLW8 COL13A1-214ENST00000522165 2061 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.25■■□□□ 1.47
DUXAA6NLW8 GRK6-206ENST00000507633 1660 ntTSL 5 BASIC24.24■■□□□ 1.47
DUXAA6NLW8 MBD2-201ENST00000256429 5188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
DUXAA6NLW8 GFRA4-202ENST00000319242 900 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
DUXAA6NLW8 CHPT1-201ENST00000229266 1585 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
DUXAA6NLW8 ENKD1-201ENST00000243878 1579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
DUXAA6NLW8 SPATA5L1-208ENST00000638607 1863 ntTSL 2 BASIC24.24■■□□□ 1.47
DUXAA6NLW8 ARHGAP22-202ENST00000374170 2107 ntTSL 5 BASIC24.23■■□□□ 1.47
DUXAA6NLW8 H2AFV-205ENST00000381124 628 ntTSL 3 BASIC24.23■■□□□ 1.47
DUXAA6NLW8 RPS2-209ENST00000529806 993 ntTSL 3 BASIC24.23■■□□□ 1.47
DUXAA6NLW8 LYNX1-208ENST00000615007 1293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
DUXAA6NLW8 HNRNPLP2-201ENST00000568980 1570 ntBASIC24.23■■□□□ 1.47
DUXAA6NLW8 AP000547.3-202ENST00000592107 1019 ntTSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
DUXAA6NLW8 MARCH11-201ENST00000332432 1741 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.21■■□□□ 1.47
DUXAA6NLW8 TESK1-201ENST00000336395 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
DUXAA6NLW8 AC005559.1-201ENST00000589661 871 ntBASIC24.2■■□□□ 1.46
DUXAA6NLW8 SHARPIN-202ENST00000398712 1765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
DUXAA6NLW8 HDGF-210ENST00000537739 2073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
DUXAA6NLW8 PDPK1-203ENST00000389224 2416 ntTSL 2 BASIC24.2■■□□□ 1.46
DUXAA6NLW8 DPF1-202ENST00000412732 2303 ntTSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
DUXAA6NLW8 ADAP1-201ENST00000265846 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
DUXAA6NLW8 FZD2-201ENST00000315323 2112 ntAPPRIS P1 BASIC24.17■■□□□ 1.46
DUXAA6NLW8 IL17D-201ENST00000304920 1861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
DUXAA6NLW8 TNFSF12-201ENST00000293825 1553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
DUXAA6NLW8 AP004833.2-201ENST00000532228 1454 ntBASIC24.15■■□□□ 1.46
DUXAA6NLW8 TOMM40-201ENST00000252487 1707 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.45
DUXAA6NLW8 TOMM40-202ENST00000405636 1709 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.45
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 9.7 ms