Protein–RNA interactions for Protein: A2VCK2

DCDC2B, Doublecortin domain-containing protein 2B, humanhuman

Predictions only

Length 349 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
DCDC2BA2VCK2 CACNG6-201ENST00000252729 1853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.11■■□□□ 1.77
DCDC2BA2VCK2 QDPR-201ENST00000281243 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.1■■□□□ 1.77
DCDC2BA2VCK2 RNF150-204ENST00000507500 1530 ntTSL 1 (best) BASIC26.1■■□□□ 1.77
DCDC2BA2VCK2 AC018358.1-201ENST00000631079 1402 ntBASIC26.1■■□□□ 1.77
DCDC2BA2VCK2 CBWD5-202ENST00000377384 1347 ntTSL 1 (best) BASIC26.1■■□□□ 1.77
DCDC2BA2VCK2 DTNBP1-202ENST00000344537 1403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.09■■□□□ 1.77
DCDC2BA2VCK2 POLR1D-201ENST00000302979 1166 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.09■■□□□ 1.77
DCDC2BA2VCK2 ENHO-201ENST00000399775 1082 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.09■■□□□ 1.77
DCDC2BA2VCK2 ARTN-202ENST00000372359 1921 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.08■■□□□ 1.77
DCDC2BA2VCK2 CGREF1-204ENST00000402550 1575 ntTSL 2 BASIC26.08■■□□□ 1.77
DCDC2BA2VCK2 ACOT1-202ENST00000557556 1271 ntTSL 1 (best) BASIC26.08■■□□□ 1.77
DCDC2BA2VCK2 MRPL23-202ENST00000381519 643 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC26.07■■□□□ 1.76
DCDC2BA2VCK2 MRPL23-205ENST00000397298 736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.07■■□□□ 1.76
DCDC2BA2VCK2 CEP120-209ENST00000515110 606 ntTSL 3 BASIC26.07■■□□□ 1.76
DCDC2BA2VCK2 MPST-201ENST00000341116 1504 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.07■■□□□ 1.76
DCDC2BA2VCK2 C11orf95-204ENST00000546282 390 ntTSL 3 BASIC26.06■■□□□ 1.76
DCDC2BA2VCK2 AL033527.3-201ENST00000566366 1196 ntBASIC26.06■■□□□ 1.76
DCDC2BA2VCK2 BLOC1S3-202ENST00000587722 732 ntAPPRIS P1 BASIC26.06■■□□□ 1.76
DCDC2BA2VCK2 PTCH1-210ENST00000468211 1254 ntTSL 1 (best) BASIC26.05■■□□□ 1.76
DCDC2BA2VCK2 CHML-204ENST00000638121 920 ntTSL 2 BASIC26.05■■□□□ 1.76
DCDC2BA2VCK2 RAD51-210ENST00000557850 1397 ntTSL 2 BASIC26.05■■□□□ 1.76
DCDC2BA2VCK2 CTXN1-201ENST00000318978 1274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.04■■□□□ 1.76
DCDC2BA2VCK2 UBA52-204ENST00000595158 743 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC26.04■■□□□ 1.76
DCDC2BA2VCK2 C1orf232-201ENST00000634842 643 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC26.04■■□□□ 1.76
DCDC2BA2VCK2 SMARCD3-201ENST00000262188 1993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.03■■□□□ 1.76
DCDC2BA2VCK2 AGO3-204ENST00000397828 1035 ntTSL 2 BASIC26.02■■□□□ 1.76
DCDC2BA2VCK2 AC008813.1-201ENST00000536597 885 ntBASIC26.02■■□□□ 1.76
DCDC2BA2VCK2 CAPNS1-216ENST00000628306 1389 ntTSL 5 BASIC26.02■■□□□ 1.76
DCDC2BA2VCK2 LIME1-206ENST00000487026 805 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.01■■□□□ 1.75
DCDC2BA2VCK2 SNX5-219ENST00000606602 885 ntTSL 1 (best) BASIC26.01■■□□□ 1.75
DCDC2BA2VCK2 RUNX2-211ENST00000625924 1458 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.01■■□□□ 1.75
DCDC2BA2VCK2 ZSCAN1-202ENST00000391700 952 ntTSL 1 (best) BASIC26■■□□□ 1.75
DCDC2BA2VCK2 HDAC3-201ENST00000305264 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26■■□□□ 1.75
DCDC2BA2VCK2 B4GALT7-201ENST00000029410 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26■■□□□ 1.75
DCDC2BA2VCK2 MDFIC-208ENST00000614186 1068 ntTSL 1 (best) BASIC25.99■■□□□ 1.75
DCDC2BA2VCK2 C11orf96-203ENST00000617612 1294 ntAPPRIS P1 BASIC25.99■■□□□ 1.75
DCDC2BA2VCK2 KLC2-205ENST00000394078 1557 ntTSL 5 BASIC25.99■■□□□ 1.75
DCDC2BA2VCK2 CTDNEP1-210ENST00000574322 1708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.98■■□□□ 1.75
DCDC2BA2VCK2 MANF-204ENST00000528157 1153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.97■■□□□ 1.75
DCDC2BA2VCK2 TRAPPC10-202ENST00000380221 1763 ntTSL 1 (best) BASIC25.97■■□□□ 1.75
DCDC2BA2VCK2 FAM78B-202ENST00000354422 1475 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.97■■□□□ 1.75
DCDC2BA2VCK2 CGREF1-202ENST00000312734 1610 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC25.96■■□□□ 1.75
DCDC2BA2VCK2 AC004837.3-201ENST00000420748 565 ntTSL 4 BASIC25.96■■□□□ 1.75
DCDC2BA2VCK2 STUB1-201ENST00000219548 1472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.96■■□□□ 1.75
DCDC2BA2VCK2 UBE2L6-201ENST00000287156 1354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.95■■□□□ 1.75
DCDC2BA2VCK2 FAM168B-201ENST00000389915 944 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.95■■□□□ 1.74
DCDC2BA2VCK2 BANF1-208ENST00000533166 1135 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.95■■□□□ 1.74
DCDC2BA2VCK2 AC092902.2-221ENST00000628476 965 ntTSL 5 BASIC25.95■■□□□ 1.74
DCDC2BA2VCK2 RUNX2-203ENST00000371436 1588 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.95■■□□□ 1.74
DCDC2BA2VCK2 FEZF2-201ENST00000283268 2074 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.94■■□□□ 1.74
DCDC2BA2VCK2 C1orf122-201ENST00000373042 973 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.94■■□□□ 1.74
DCDC2BA2VCK2 ANXA5-201ENST00000296511 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.94■■□□□ 1.74
DCDC2BA2VCK2 SLC25A10-203ENST00000545862 1911 ntTSL 1 (best) BASIC25.91■■□□□ 1.74
DCDC2BA2VCK2 CHST11-202ENST00000546689 756 ntTSL 2 BASIC25.91■■□□□ 1.74
DCDC2BA2VCK2 SERINC2-201ENST00000373709 1997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.91■■□□□ 1.74
DCDC2BA2VCK2 TNK2-201ENST00000333602 5270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.9■■□□□ 1.74
DCDC2BA2VCK2 AP000251.1-201ENST00000433071 822 ntTSL 1 (best) BASIC25.9■■□□□ 1.74
DCDC2BA2VCK2 CLTA-207ENST00000470744 1102 ntTSL 2 BASIC25.9■■□□□ 1.74
DCDC2BA2VCK2 AC022413.1-201ENST00000624602 984 ntBASIC25.88■■□□□ 1.73
DCDC2BA2VCK2 AC073111.5-206ENST00000642087 859 ntAPPRIS P1 BASIC25.88■■□□□ 1.73
DCDC2BA2VCK2 ATP8B2-201ENST00000368487 1523 ntTSL 1 (best) BASIC25.88■■□□□ 1.73
DCDC2BA2VCK2 AL590677.1-201ENST00000438431 380 ntTSL 5 BASIC25.84■■□□□ 1.73
DCDC2BA2VCK2 GPI-201ENST00000356487 2210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.84■■□□□ 1.73
DCDC2BA2VCK2 C2orf88-204ENST00000409870 1441 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.83■■□□□ 1.73
DCDC2BA2VCK2 PXMP2-201ENST00000317479 957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.82■■□□□ 1.72
DCDC2BA2VCK2 SSBP3-204ENST00000371320 2077 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.82■■□□□ 1.72
DCDC2BA2VCK2 RARRES2P1-201ENST00000474487 481 ntBASIC25.81■■□□□ 1.72
DCDC2BA2VCK2 ADRA1D-201ENST00000379453 2728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.81■■□□□ 1.72
DCDC2BA2VCK2 AC138207.2-201ENST00000583377 492 ntTSL 2 BASIC25.8■■□□□ 1.72
DCDC2BA2VCK2 HSD17B12-202ENST00000395700 994 ntTSL 1 (best) BASIC25.79■■□□□ 1.72
DCDC2BA2VCK2 QDPR-208ENST00000513615 1188 ntTSL 2 BASIC25.79■■□□□ 1.72
DCDC2BA2VCK2 AC019069.1-201ENST00000610008 1333 ntBASIC25.79■■□□□ 1.72
DCDC2BA2VCK2 MAPK3-202ENST00000322266 1743 ntTSL 5 BASIC25.79■■□□□ 1.72
DCDC2BA2VCK2 ACTR3B-202ENST00000377776 1566 ntTSL 1 (best) BASIC25.78■■□□□ 1.72
DCDC2BA2VCK2 WHRN-203ENST00000374057 1718 ntTSL 2 BASIC25.77■■□□□ 1.72
DCDC2BA2VCK2 SFRP5-201ENST00000266066 1836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.77■■□□□ 1.72
DCDC2BA2VCK2 MMP28-203ENST00000612672 1092 ntTSL 1 (best) BASIC25.77■■□□□ 1.72
DCDC2BA2VCK2 KIAA2013-203ENST00000616327 2170 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.77■■□□□ 1.72
DCDC2BA2VCK2 JUND-201ENST00000252818 1863 ntAPPRIS P1 BASIC25.77■■□□□ 1.72
DCDC2BA2VCK2 LINC01770-201ENST00000417917 634 ntTSL 2 BASIC25.76■■□□□ 1.71
DCDC2BA2VCK2 HES4-202ENST00000428771 1040 ntTSL 2 BASIC25.76■■□□□ 1.71
DCDC2BA2VCK2 KIF13A-207ENST00000502704 1330 ntTSL 1 (best) BASIC25.76■■□□□ 1.71
DCDC2BA2VCK2 GALK1-205ENST00000588479 1866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.76■■□□□ 1.71
DCDC2BA2VCK2 EI24-212ENST00000615917 1407 ntTSL 2 BASIC25.75■■□□□ 1.71
DCDC2BA2VCK2 TRIM52-AS1-202ENST00000507434 672 ntTSL 1 (best) BASIC25.75■■□□□ 1.71
DCDC2BA2VCK2 GFER-205ENST00000569451 517 ntTSL 5 BASIC25.75■■□□□ 1.71
DCDC2BA2VCK2 CTDNEP1-201ENST00000318988 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.74■■□□□ 1.71
DCDC2BA2VCK2 BRF1-221ENST00000619151 1530 ntTSL 5 BASIC25.74■■□□□ 1.71
DCDC2BA2VCK2 NPW-202ENST00000566435 991 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.74■■□□□ 1.71
DCDC2BA2VCK2 U85056.1-201ENST00000616429 682 ntBASIC25.74■■□□□ 1.71
DCDC2BA2VCK2 CSNK1E-205ENST00000405675 2127 ntTSL 5 BASIC25.73■■□□□ 1.71
DCDC2BA2VCK2 PXMP2-205ENST00000543589 632 ntTSL 3 BASIC25.73■■□□□ 1.71
DCDC2BA2VCK2 MZT2B-201ENST00000281871 933 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.72■■□□□ 1.71
DCDC2BA2VCK2 MZT2A-201ENST00000309451 624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.72■■□□□ 1.71
DCDC2BA2VCK2 MTURN-203ENST00000409688 843 ntTSL 2 BASIC25.72■■□□□ 1.71
DCDC2BA2VCK2 TSR3-201ENST00000007390 1243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.72■■□□□ 1.71
DCDC2BA2VCK2 ATP6V1E2-204ENST00000522587 1559 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.72■■□□□ 1.71
DCDC2BA2VCK2 CTDNEP1-208ENST00000573600 1724 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.71■■□□□ 1.71
DCDC2BA2VCK2 AC231981.1-201ENST00000450917 974 ntTSL 3 BASIC25.71■■□□□ 1.71
DCDC2BA2VCK2 TSPY13P-201ENST00000338964 914 ntBASIC25.69■■□□□ 1.7
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 17.2 ms