Protein–RNA interactions for Protein: A0PK05

TMEM72, Transmembrane protein 72, humanhuman

Predictions only

Length 275 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TMEM72A0PK05 CIB1-201ENST00000328649 1247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
TMEM72A0PK05 ECI1-203ENST00000562238 948 ntTSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
TMEM72A0PK05 CIB1-202ENST00000612800 1096 ntTSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
TMEM72A0PK05 HNRNPLP2-201ENST00000568980 1570 ntBASIC23.86■■□□□ 1.41
TMEM72A0PK05 AC010864.1-201ENST00000609407 1511 ntBASIC23.86■■□□□ 1.41
TMEM72A0PK05 CACNG6-202ENST00000346968 645 ntTSL 5 BASIC23.86■■□□□ 1.41
TMEM72A0PK05 AC012615.2-201ENST00000586259 447 ntTSL 4 BASIC23.86■■□□□ 1.41
TMEM72A0PK05 LYNX1-208ENST00000615007 1293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
TMEM72A0PK05 LANCL3-203ENST00000614025 1469 ntTSL 2 BASIC23.85■■□□□ 1.41
TMEM72A0PK05 ATPAF1-202ENST00000371937 1827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
TMEM72A0PK05 SIRT3-201ENST00000382743 2543 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
TMEM72A0PK05 GFRA4-202ENST00000319242 900 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
TMEM72A0PK05 LZTS2-201ENST00000370220 5741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
TMEM72A0PK05 GIPC1-203ENST00000393033 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
TMEM72A0PK05 KCTD17-202ENST00000403888 1763 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.41
TMEM72A0PK05 PLEKHG6-206ENST00000536531 1683 ntTSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.41
TMEM72A0PK05 AGAP1-202ENST00000336665 5427 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.41
TMEM72A0PK05 MNX1-207ENST00000543409 1620 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.41
TMEM72A0PK05 MYLIP-202ENST00000356840 1666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.4
TMEM72A0PK05 CGGBP1-206ENST00000482016 1147 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.82■■□□□ 1.4
TMEM72A0PK05 CUL4A-202ENST00000375440 2364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
TMEM72A0PK05 EMC10-202ENST00000376918 2014 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
TMEM72A0PK05 TESK1-206ENST00000620767 2438 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.81■■□□□ 1.4
TMEM72A0PK05 CAPNS1-217ENST00000629983 799 ntTSL 5 BASIC23.81■■□□□ 1.4
TMEM72A0PK05 NEUROG2-201ENST00000313341 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
TMEM72A0PK05 BIN1-204ENST00000348750 2074 ntTSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
TMEM72A0PK05 AC139426.1-201ENST00000568218 2529 ntBASIC23.79■■□□□ 1.4
TMEM72A0PK05 STUB1-205ENST00000565677 1560 ntTSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
TMEM72A0PK05 RCC1L-205ENST00000618035 1409 ntTSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
TMEM72A0PK05 AC005559.1-201ENST00000589661 871 ntBASIC23.79■■□□□ 1.4
TMEM72A0PK05 NOXA1-201ENST00000341349 1678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
TMEM72A0PK05 YAP1-204ENST00000526343 2393 ntTSL 5 BASIC23.78■■□□□ 1.4
TMEM72A0PK05 SHOX2-204ENST00000483851 1866 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.77■■□□□ 1.4
TMEM72A0PK05 BATF3-201ENST00000243440 980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
TMEM72A0PK05 TPI1-201ENST00000229270 1763 ntTSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
TMEM72A0PK05 EXOC3L4-201ENST00000380069 2293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
TMEM72A0PK05 ATP6V1E2-204ENST00000522587 1559 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.77■■□□□ 1.4
TMEM72A0PK05 FOXE3-201ENST00000335071 1981 ntAPPRIS P1 BASIC23.76■■□□□ 1.39
TMEM72A0PK05 RPS2-209ENST00000529806 993 ntTSL 3 BASIC23.75■■□□□ 1.39
TMEM72A0PK05 FSD1L-208ENST00000495708 1906 ntTSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
TMEM72A0PK05 SHF-206ENST00000560471 2499 ntTSL 5 BASIC23.74■■□□□ 1.39
TMEM72A0PK05 CHPT1-201ENST00000229266 1585 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
TMEM72A0PK05 FOXQ1-201ENST00000296839 2309 ntAPPRIS P1 BASIC23.73■■□□□ 1.39
TMEM72A0PK05 DUX4L28-201ENST00000623687 678 ntBASIC23.73■■□□□ 1.39
TMEM72A0PK05 TSEN34-203ENST00000396388 1349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
TMEM72A0PK05 TPRA1-202ENST00000355552 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
TMEM72A0PK05 PGAM5-201ENST00000317555 1182 ntTSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
TMEM72A0PK05 MSANTD2-203ENST00000524950 1109 ntTSL 2 BASIC23.72■■□□□ 1.39
TMEM72A0PK05 AP000547.3-202ENST00000592107 1019 ntTSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
TMEM72A0PK05 ECI1-207ENST00000570258 1512 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.71■■□□□ 1.39
TMEM72A0PK05 SCX-201ENST00000567180 999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
TMEM72A0PK05 EFNA3-201ENST00000368408 1782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.39
TMEM72A0PK05 GTF3C4-202ENST00000483873 1417 ntTSL 3 BASIC23.7■■□□□ 1.38
TMEM72A0PK05 FAM185A-202ENST00000413034 1179 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC23.7■■□□□ 1.38
TMEM72A0PK05 ZFP90-204ENST00000564323 560 ntTSL 4 BASIC23.7■■□□□ 1.38
TMEM72A0PK05 TERF2-207ENST00000567296 1129 ntTSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
TMEM72A0PK05 ZFP90-219ENST00000611381 695 ntTSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
TMEM72A0PK05 ABHD17A-202ENST00000292577 1757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
TMEM72A0PK05 EFNA1-202ENST00000368407 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
TMEM72A0PK05 IRX1-201ENST00000302006 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
TMEM72A0PK05 AGFG1-205ENST00000409979 2089 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.69■■□□□ 1.38
TMEM72A0PK05 MKNK2-202ENST00000309340 1744 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
TMEM72A0PK05 HNRNPAB-205ENST00000506259 1674 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
TMEM72A0PK05 PSMG4-202ENST00000380305 489 ntTSL 5 BASIC23.68■■□□□ 1.38
TMEM72A0PK05 AP006261.1-201ENST00000584783 668 ntBASIC23.68■■□□□ 1.38
TMEM72A0PK05 TPRA1-209ENST00000489960 1903 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.68■■□□□ 1.38
TMEM72A0PK05 ZNF787-203ENST00000610935 1925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
TMEM72A0PK05 VWA1-201ENST00000338660 2147 ntTSL 2 BASIC23.67■■□□□ 1.38
TMEM72A0PK05 MIR3665-201ENST00000578708 105 ntBASIC23.67■■□□□ 1.38
TMEM72A0PK05 RDX-210ENST00000530301 1549 ntTSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
TMEM72A0PK05 BCL7C-201ENST00000215115 1740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
TMEM72A0PK05 FGF18-201ENST00000274625 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
TMEM72A0PK05 PGM5P2-201ENST00000613141 1980 ntTSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
TMEM72A0PK05 NKIRAS2-202ENST00000316082 833 ntTSL 5 BASIC23.66■■□□□ 1.38
TMEM72A0PK05 NAA50-207ENST00000493900 962 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC23.66■■□□□ 1.38
TMEM72A0PK05 NRG1-221ENST00000614767 762 ntTSL 5 BASIC23.66■■□□□ 1.38
TMEM72A0PK05 TXNL4A-210ENST00000591711 669 ntTSL 2 BASIC23.65■■□□□ 1.38
TMEM72A0PK05 HNRNPAB-204ENST00000504898 1785 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
TMEM72A0PK05 WDSUB1-205ENST00000409990 1920 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.65■■□□□ 1.38
TMEM72A0PK05 AC004080.1-201ENST00000523608 757 ntTSL 2 BASIC23.64■■□□□ 1.37
TMEM72A0PK05 RUNDC3A-206ENST00000590941 1675 ntTSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.37
TMEM72A0PK05 PPP1R14B-201ENST00000309318 982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
TMEM72A0PK05 MAD2L2-205ENST00000376669 864 ntTSL 3 BASIC23.63■■□□□ 1.37
TMEM72A0PK05 AL162393.1-201ENST00000437852 946 ntBASIC23.63■■□□□ 1.37
TMEM72A0PK05 RUNX2-205ENST00000465038 1770 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC23.63■■□□□ 1.37
TMEM72A0PK05 HOXB3-212ENST00000498678 2196 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.62■■□□□ 1.37
TMEM72A0PK05 SECTM1-201ENST00000269389 2235 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
TMEM72A0PK05 TOMM40-201ENST00000252487 1707 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
TMEM72A0PK05 TOMM40-202ENST00000405636 1709 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
TMEM72A0PK05 ENKD1-201ENST00000243878 1579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
TMEM72A0PK05 RTN4R-201ENST00000043402 2157 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
TMEM72A0PK05 CERS2-205ENST00000368954 2505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
TMEM72A0PK05 TCEA2-202ENST00000343484 1235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
TMEM72A0PK05 ATF4-201ENST00000337304 2019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
TMEM72A0PK05 GRK6-206ENST00000507633 1660 ntTSL 5 BASIC23.6■■□□□ 1.37
TMEM72A0PK05 PQLC1-203ENST00000397778 2555 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
TMEM72A0PK05 MARCH11-201ENST00000332432 1741 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.59■■□□□ 1.37
TMEM72A0PK05 MTNR1A-201ENST00000307161 1289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
TMEM72A0PK05 RCE1-201ENST00000309657 1485 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
TMEM72A0PK05 AP002884.3-203ENST00000419895 1711 ntTSL 2 BASIC23.59■■□□□ 1.37
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 32.5 ms