Protein–RNA interactions for Protein: A0PJX4

SHISA3, Protein shisa-3 homolog, humanhuman

Predictions only

Length 238 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SHISA3A0PJX4 AC006077.2-201ENST00000623591 457 ntBASIC23.07■■□□□ 1.28
SHISA3A0PJX4 TMEM55B-201ENST00000250489 1961 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
SHISA3A0PJX4 POU3F3-201ENST00000361360 3064 ntAPPRIS P1 BASIC23.07■■□□□ 1.28
SHISA3A0PJX4 CYBA-201ENST00000261623 797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
SHISA3A0PJX4 CHMP4B-201ENST00000217402 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
SHISA3A0PJX4 COMMD7-201ENST00000278980 1900 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
SHISA3A0PJX4 THRA-204ENST00000546243 1909 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.06■■□□□ 1.28
SHISA3A0PJX4 RAB40C-204ENST00000538492 2569 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.05■■□□□ 1.28
SHISA3A0PJX4 KCNQ5-204ENST00000370392 1469 ntTSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
SHISA3A0PJX4 AC005524.1-203ENST00000586528 451 ntTSL 3 BASIC23.05■■□□□ 1.28
SHISA3A0PJX4 ZDHHC23-206ENST00000498275 2055 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.05■■□□□ 1.28
SHISA3A0PJX4 SERPING1-205ENST00000403558 2231 ntTSL 5 BASIC23.05■■□□□ 1.28
SHISA3A0PJX4 IHH-201ENST00000295731 2023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
SHISA3A0PJX4 ANKS1B-202ENST00000333732 1675 ntTSL 2 BASIC23.04■■□□□ 1.28
SHISA3A0PJX4 FAM107B-205ENST00000378467 2374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
SHISA3A0PJX4 GUSB-202ENST00000421103 1742 ntTSL 2 BASIC23.04■■□□□ 1.28
SHISA3A0PJX4 ZNF768-201ENST00000380412 2315 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
SHISA3A0PJX4 CAMKK1-201ENST00000158166 2459 ntTSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
SHISA3A0PJX4 RSG1-201ENST00000375599 1545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
SHISA3A0PJX4 BTBD7-201ENST00000298896 2621 ntTSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
SHISA3A0PJX4 SOX1-201ENST00000330949 2842 ntAPPRIS P1 BASIC23.02■■□□□ 1.28
SHISA3A0PJX4 HDAC3-201ENST00000305264 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
SHISA3A0PJX4 TMEM187-201ENST00000369982 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
SHISA3A0PJX4 CPNE1-202ENST00000352393 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
SHISA3A0PJX4 TNFSF12-201ENST00000293825 1553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
SHISA3A0PJX4 BCL7C-201ENST00000215115 1740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
SHISA3A0PJX4 RUNDC3A-201ENST00000225441 1821 ntTSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
SHISA3A0PJX4 AC135731.1-201ENST00000569415 2548 ntBASIC22.99■■□□□ 1.27
SHISA3A0PJX4 GSTZ1-201ENST00000216465 1338 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
SHISA3A0PJX4 RDX-210ENST00000530301 1549 ntTSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
SHISA3A0PJX4 RHEB-201ENST00000262187 2075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
SHISA3A0PJX4 CYB5R3-201ENST00000352397 2124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
SHISA3A0PJX4 SHF-207ENST00000560540 2062 ntTSL 5 BASIC22.97■■□□□ 1.27
SHISA3A0PJX4 CAPNS1-204ENST00000587718 1558 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
SHISA3A0PJX4 ARTN-203ENST00000414809 1943 ntAPPRIS P4 TSL 3 BASIC22.96■■□□□ 1.27
SHISA3A0PJX4 FADD-201ENST00000301838 1841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
SHISA3A0PJX4 SLC16A3-214ENST00000582743 2002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
SHISA3A0PJX4 EBPL-203ENST00000378270 579 ntTSL 2 BASIC22.94■■□□□ 1.26
SHISA3A0PJX4 DYNLL1-207ENST00000549989 719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
SHISA3A0PJX4 DYNLL1-208ENST00000550178 581 ntBASIC22.94■■□□□ 1.26
SHISA3A0PJX4 ABHD17A-202ENST00000292577 1757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
SHISA3A0PJX4 PHF23-205ENST00000571362 1768 ntTSL 2 BASIC22.93■■□□□ 1.26
SHISA3A0PJX4 PLBD2-202ENST00000545182 2321 ntTSL 2 BASIC22.93■■□□□ 1.26
SHISA3A0PJX4 SPTSSA-201ENST00000298130 2777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
SHISA3A0PJX4 PSMG1-201ENST00000331573 2154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
SHISA3A0PJX4 TLE6-201ENST00000246112 2100 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
SHISA3A0PJX4 NREP-202ENST00000379671 2581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
SHISA3A0PJX4 AJAP1-201ENST00000378190 2383 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.91■■□□□ 1.26
SHISA3A0PJX4 CREM-210ENST00000374721 2020 ntTSL 5 BASIC22.91■■□□□ 1.26
SHISA3A0PJX4 OTUD5-202ENST00000376488 2692 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
SHISA3A0PJX4 CHST14-202ENST00000559991 1968 ntTSL 5 BASIC22.91■■□□□ 1.26
SHISA3A0PJX4 PCYT2-206ENST00000571105 1628 ntTSL 5 BASIC22.9■■□□□ 1.26
SHISA3A0PJX4 CARS2-201ENST00000257347 1879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
SHISA3A0PJX4 FTCD-201ENST00000291670 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
SHISA3A0PJX4 SLC25A6-201ENST00000381401 2062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.26
SHISA3A0PJX4 DEAF1-201ENST00000382409 2500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.26
SHISA3A0PJX4 FRAT2-201ENST00000371019 2213 ntAPPRIS P1 BASIC22.89■■□□□ 1.26
SHISA3A0PJX4 NXPH3-201ENST00000328741 2179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.26
SHISA3A0PJX4 VIPR2-203ENST00000402066 1926 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.89■■□□□ 1.25
SHISA3A0PJX4 XKR6-201ENST00000297303 1550 ntTSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
SHISA3A0PJX4 CACNG7-203ENST00000391767 2688 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.88■■□□□ 1.25
SHISA3A0PJX4 PLEKHG6-206ENST00000536531 1683 ntTSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
SHISA3A0PJX4 MTMR1-202ENST00000370390 2755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
SHISA3A0PJX4 PRELID2-202ENST00000394450 1102 ntTSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
SHISA3A0PJX4 KIAA2013-201ENST00000376572 2815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
SHISA3A0PJX4 DNAJC21-201ENST00000342382 2309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
SHISA3A0PJX4 PCSK6-216ENST00000615296 2921 ntTSL 5 BASIC22.86■■□□□ 1.25
SHISA3A0PJX4 ALYREF-202ENST00000505490 1088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
SHISA3A0PJX4 REXO4-202ENST00000371942 2360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
SHISA3A0PJX4 PELI3-203ENST00000524466 1671 ntTSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
SHISA3A0PJX4 CATIP-201ENST00000289388 1323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
SHISA3A0PJX4 TMEM200C-201ENST00000383490 1920 ntAPPRIS P1 BASIC22.82■■□□□ 1.24
SHISA3A0PJX4 SAP30-201ENST00000296504 1108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
SHISA3A0PJX4 ZNRF2P1-201ENST00000441407 443 ntBASIC22.82■■□□□ 1.24
SHISA3A0PJX4 AL031258.1-201ENST00000623562 325 ntBASIC22.82■■□□□ 1.24
SHISA3A0PJX4 FAM220A-206ENST00000616824 2211 ntTSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
SHISA3A0PJX4 CDH23-208ENST00000461841 2000 ntTSL 5 BASIC22.82■■□□□ 1.24
SHISA3A0PJX4 MARCH11-201ENST00000332432 1741 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.82■■□□□ 1.24
SHISA3A0PJX4 GAL3ST1-204ENST00000402369 1712 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.82■■□□□ 1.24
SHISA3A0PJX4 RNF150-204ENST00000507500 1530 ntTSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
SHISA3A0PJX4 NPTXR-202ENST00000640136 1503 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
SHISA3A0PJX4 NDEL1-202ENST00000380025 2181 ntTSL 5 BASIC22.82■■□□□ 1.24
SHISA3A0PJX4 EVC-203ENST00000509451 1960 ntTSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
SHISA3A0PJX4 GLRB-203ENST00000509282 1757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
SHISA3A0PJX4 FSD1L-208ENST00000495708 1906 ntTSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
SHISA3A0PJX4 HDGFL1-201ENST00000510882 2174 ntAPPRIS P1 BASIC22.81■■□□□ 1.24
SHISA3A0PJX4 DEDD-212ENST00000545495 2329 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.81■■□□□ 1.24
SHISA3A0PJX4 GNAS-211ENST00000371095 1931 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
SHISA3A0PJX4 MXD3-203ENST00000439742 1483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
SHISA3A0PJX4 SLC9A3R2-201ENST00000424542 2194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
SHISA3A0PJX4 RAB3IL1-202ENST00000394836 2284 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
SHISA3A0PJX4 SKOR2-203ENST00000620245 3048 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.79■■□□□ 1.24
SHISA3A0PJX4 GNAS-207ENST00000354359 1975 ntTSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
SHISA3A0PJX4 GNAS-210ENST00000371085 1972 ntTSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
SHISA3A0PJX4 MKNK2-202ENST00000309340 1744 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
SHISA3A0PJX4 SLC9A3R2-202ENST00000432365 1564 ntTSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
SHISA3A0PJX4 C17orf97-201ENST00000360127 1839 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
SHISA3A0PJX4 NOP53-201ENST00000246802 1528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
SHISA3A0PJX4 ANKS1B-203ENST00000341752 2115 ntTSL 2 BASIC22.76■■□□□ 1.23
SHISA3A0PJX4 HMGB1-205ENST00000399494 1282 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.74■■□□□ 1.23
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 12.7 ms