Protein–RNA interactions for Protein: A0A5B9

TRBC2, T-cell receptor beta-2 chain C region, humanhuman

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Length 178 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TRBC2A0A5B9 SCX-201ENST00000567180 999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
TRBC2A0A5B9 BATF3-201ENST00000243440 980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
TRBC2A0A5B9 NKIRAS2-202ENST00000316082 833 ntTSL 5 BASIC25.26■■□□□ 1.63
TRBC2A0A5B9 AL162393.1-201ENST00000437852 946 ntBASIC25.26■■□□□ 1.63
TRBC2A0A5B9 AP000547.3-202ENST00000592107 1019 ntTSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
TRBC2A0A5B9 NOXA1-201ENST00000341349 1678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
TRBC2A0A5B9 SLC52A2-201ENST00000329994 1896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
TRBC2A0A5B9 ZNF513-201ENST00000323703 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
TRBC2A0A5B9 PSMG4-202ENST00000380305 489 ntTSL 5 BASIC25.24■■□□□ 1.63
TRBC2A0A5B9 TERF2-207ENST00000567296 1129 ntTSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
TRBC2A0A5B9 HNRNPAB-202ENST00000358344 1796 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
TRBC2A0A5B9 ATP6V1E2-204ENST00000522587 1559 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.23■■□□□ 1.63
TRBC2A0A5B9 ATPAF1-202ENST00000371937 1827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
TRBC2A0A5B9 GTF3C4-202ENST00000483873 1417 ntTSL 3 BASIC25.22■■□□□ 1.63
TRBC2A0A5B9 PPP1R14B-201ENST00000309318 982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
TRBC2A0A5B9 AC004080.1-201ENST00000523608 757 ntTSL 2 BASIC25.22■■□□□ 1.63
TRBC2A0A5B9 HOXD13-201ENST00000392539 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
TRBC2A0A5B9 MATK-201ENST00000310132 2133 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
TRBC2A0A5B9 TXNL4A-210ENST00000591711 669 ntTSL 2 BASIC25.21■■□□□ 1.63
TRBC2A0A5B9 STUB1-205ENST00000565677 1560 ntTSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
TRBC2A0A5B9 PHOX2A-201ENST00000298231 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.63
TRBC2A0A5B9 MEX3D-201ENST00000402693 2850 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.63
TRBC2A0A5B9 AMN-201ENST00000299155 1907 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.62
TRBC2A0A5B9 CHPT1-201ENST00000229266 1585 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.62
TRBC2A0A5B9 MTNR1A-201ENST00000307161 1289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.62
TRBC2A0A5B9 ANKRD13D-211ENST00000511455 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.62
TRBC2A0A5B9 ECI1-207ENST00000570258 1512 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.2■■□□□ 1.62
TRBC2A0A5B9 CCDC88C-205ENST00000553403 1651 ntTSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.62
TRBC2A0A5B9 TM6SF1-202ENST00000322019 2074 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
TRBC2A0A5B9 TCEA2-202ENST00000343484 1235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
TRBC2A0A5B9 MAD2L2-205ENST00000376669 864 ntTSL 3 BASIC25.18■■□□□ 1.62
TRBC2A0A5B9 DCBLD1-201ENST00000296955 1979 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
TRBC2A0A5B9 AC087741.3-201ENST00000624270 1347 ntBASIC25.17■■□□□ 1.62
TRBC2A0A5B9 SHOX2-204ENST00000483851 1866 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.16■■□□□ 1.62
TRBC2A0A5B9 CGREF1-203ENST00000402394 1906 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC25.16■■□□□ 1.62
TRBC2A0A5B9 ABHD17A-202ENST00000292577 1757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
TRBC2A0A5B9 RASSF8-202ENST00000381352 2320 ntTSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.62
TRBC2A0A5B9 MACROD1-201ENST00000255681 1205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
TRBC2A0A5B9 UBE2S-203ENST00000589978 496 ntTSL 5 BASIC25.13■■□□□ 1.61
TRBC2A0A5B9 KCTD17-202ENST00000403888 1763 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
TRBC2A0A5B9 CUEDC1-201ENST00000360238 2193 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.12■■□□□ 1.61
TRBC2A0A5B9 ACOT7-201ENST00000361521 2429 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
TRBC2A0A5B9 FSD1L-208ENST00000495708 1906 ntTSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
TRBC2A0A5B9 RRAGC-201ENST00000373001 2732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.11■■□□□ 1.61
TRBC2A0A5B9 AC108673.1-201ENST00000510422 1159 ntBASIC25.11■■□□□ 1.61
TRBC2A0A5B9 PXDC1-202ENST00000380283 2190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.11■■□□□ 1.61
TRBC2A0A5B9 HNRNPAB-204ENST00000504898 1785 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
TRBC2A0A5B9 CCZ1B-215ENST00000626257 2211 ntTSL 2 BASIC25.1■■□□□ 1.61
TRBC2A0A5B9 MAPK13-201ENST00000211287 2052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
TRBC2A0A5B9 COX4I1-203ENST00000562336 873 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.1■■□□□ 1.61
TRBC2A0A5B9 NGB-201ENST00000298352 1884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
TRBC2A0A5B9 PQLC1-202ENST00000357575 2475 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC25.1■■□□□ 1.61
TRBC2A0A5B9 RNF130-205ENST00000521389 2263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
TRBC2A0A5B9 MKNK2-202ENST00000309340 1744 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
TRBC2A0A5B9 ABCB10P3-201ENST00000561950 2166 ntBASIC25.09■■□□□ 1.61
TRBC2A0A5B9 RCE1-201ENST00000309657 1485 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
TRBC2A0A5B9 ABL1-201ENST00000318560 5766 ntTSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.61
TRBC2A0A5B9 RDX-210ENST00000530301 1549 ntTSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.61
TRBC2A0A5B9 HNRNPAB-205ENST00000506259 1674 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.61
TRBC2A0A5B9 CDKN2A-201ENST00000304494 1218 ntTSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.61
TRBC2A0A5B9 RPS2P35-201ENST00000443417 897 ntBASIC25.08■■□□□ 1.61
TRBC2A0A5B9 AP000911.1-206ENST00000531938 711 ntTSL 3 BASIC25.08■■□□□ 1.61
TRBC2A0A5B9 AC044849.2-201ENST00000606596 710 ntBASIC25.08■■□□□ 1.61
TRBC2A0A5B9 ST6GALNAC6-203ENST00000373142 2448 ntTSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.61
TRBC2A0A5B9 KLC2-205ENST00000394078 1557 ntTSL 5 BASIC25.08■■□□□ 1.61
TRBC2A0A5B9 GIPC1-203ENST00000393033 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.6
TRBC2A0A5B9 MFAP2-202ENST00000375535 1260 ntTSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
TRBC2A0A5B9 RCC1L-202ENST00000614461 2419 ntTSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
TRBC2A0A5B9 RTN2-201ENST00000245923 2293 ntTSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
TRBC2A0A5B9 FGFRL1-205ENST00000510644 2304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
TRBC2A0A5B9 POLR1D-201ENST00000302979 1166 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
TRBC2A0A5B9 EMC10-202ENST00000376918 2014 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
TRBC2A0A5B9 BCL7C-201ENST00000215115 1740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
TRBC2A0A5B9 AP002884.3-203ENST00000419895 1711 ntTSL 2 BASIC25.06■■□□□ 1.6
TRBC2A0A5B9 ENKD1-201ENST00000243878 1579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
TRBC2A0A5B9 NEUROG2-201ENST00000313341 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
TRBC2A0A5B9 FOXE3-201ENST00000335071 1981 ntAPPRIS P1 BASIC25.04■■□□□ 1.6
TRBC2A0A5B9 PARD6A-202ENST00000458121 1260 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
TRBC2A0A5B9 MIR6090-201ENST00000622481 60 ntBASIC25.04■■□□□ 1.6
TRBC2A0A5B9 IRX1-201ENST00000302006 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
TRBC2A0A5B9 ZNF787-203ENST00000610935 1925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
TRBC2A0A5B9 PPP1R35-201ENST00000292330 1031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
TRBC2A0A5B9 AC009097.4-201ENST00000566738 777 ntTSL 2 BASIC25.03■■□□□ 1.6
TRBC2A0A5B9 GRK6-206ENST00000507633 1660 ntTSL 5 BASIC25.03■■□□□ 1.6
TRBC2A0A5B9 MISP3-202ENST00000587086 1535 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
TRBC2A0A5B9 CUL4A-202ENST00000375440 2364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
TRBC2A0A5B9 AGAP1-202ENST00000336665 5427 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
TRBC2A0A5B9 SMIM12-205ENST00000456842 918 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.02■■□□□ 1.6
TRBC2A0A5B9 RUNX2-205ENST00000465038 1770 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC25.01■■□□□ 1.59
TRBC2A0A5B9 SIRT3-201ENST00000382743 2543 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
TRBC2A0A5B9 VAX2-201ENST00000234392 1147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
TRBC2A0A5B9 DTNBP1-202ENST00000344537 1403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
TRBC2A0A5B9 EBAG9-202ENST00000395785 1467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
TRBC2A0A5B9 YAP1-204ENST00000526343 2393 ntTSL 5 BASIC25.01■■□□□ 1.59
TRBC2A0A5B9 EFNA3-201ENST00000368408 1782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
TRBC2A0A5B9 TOMM40-201ENST00000252487 1707 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.99■■□□□ 1.59
TRBC2A0A5B9 TOMM40-202ENST00000405636 1709 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.99■■□□□ 1.59
TRBC2A0A5B9 FOXQ1-201ENST00000296839 2309 ntAPPRIS P1 BASIC24.98■■□□□ 1.59
TRBC2A0A5B9 LZTS2-201ENST00000370220 5741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
TRBC2A0A5B9 SRSF9-201ENST00000229390 1201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
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