Protein–RNA interactions for Protein: A0A539

TCRBV7S3A2, T-cell receptor beta variable 4-2 (Fragment), humanhuman

Predictions only

Length 114 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TCRBV7S3A2A0A539 ZNF787-203ENST00000610935 1925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.82■■□□□ 1.88
TCRBV7S3A2A0A539 ATF4-201ENST00000337304 2019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.81■■□□□ 1.88
TCRBV7S3A2A0A539 UBE2L6-201ENST00000287156 1354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.81■■□□□ 1.88
TCRBV7S3A2A0A539 PPP3CC-204ENST00000518852 1598 ntTSL 2 BASIC26.8■■□□□ 1.88
TCRBV7S3A2A0A539 HOXD-AS2-202ENST00000440016 999 ntTSL 5 BASIC26.8■■□□□ 1.88
TCRBV7S3A2A0A539 ACTR3B-201ENST00000256001 2216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.8■■□□□ 1.88
TCRBV7S3A2A0A539 COL13A1-203ENST00000398969 2267 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.79■■□□□ 1.88
TCRBV7S3A2A0A539 CAPNS1-201ENST00000246533 1918 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.79■■□□□ 1.88
TCRBV7S3A2A0A539 AUTS2-202ENST00000403018 957 ntTSL 1 (best) BASIC26.79■■□□□ 1.88
TCRBV7S3A2A0A539 ABHD17A-202ENST00000292577 1757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.79■■□□□ 1.88
TCRBV7S3A2A0A539 MTCH1-202ENST00000373627 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.78■■□□□ 1.88
TCRBV7S3A2A0A539 PCBD2-201ENST00000254908 1223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.78■■□□□ 1.88
TCRBV7S3A2A0A539 AC010864.1-201ENST00000609407 1511 ntBASIC26.78■■□□□ 1.88
TCRBV7S3A2A0A539 BCL7C-201ENST00000215115 1740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.77■■□□□ 1.88
TCRBV7S3A2A0A539 CCNYL1-205ENST00000420822 952 ntTSL 1 (best) BASIC26.77■■□□□ 1.88
TCRBV7S3A2A0A539 FSD1L-208ENST00000495708 1906 ntTSL 1 (best) BASIC26.77■■□□□ 1.88
TCRBV7S3A2A0A539 ZFAND2B-208ENST00000409594 2021 ntTSL 2 BASIC26.76■■□□□ 1.87
TCRBV7S3A2A0A539 GABRA5-203ENST00000400081 2761 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.75■■□□□ 1.87
TCRBV7S3A2A0A539 EMID1-203ENST00000404820 2118 ntTSL 5 BASIC26.75■■□□□ 1.87
TCRBV7S3A2A0A539 AC068152.1-210ENST00000574741 836 ntTSL 3 BASIC26.74■■□□□ 1.87
TCRBV7S3A2A0A539 FAAH-201ENST00000243167 2094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.74■■□□□ 1.87
TCRBV7S3A2A0A539 COMMD3-201ENST00000376836 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.73■■□□□ 1.87
TCRBV7S3A2A0A539 SHARPIN-202ENST00000398712 1765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.73■■□□□ 1.87
TCRBV7S3A2A0A539 SMARCD3-203ENST00000392811 2018 ntTSL 1 (best) BASIC26.72■■□□□ 1.87
TCRBV7S3A2A0A539 RDX-210ENST00000530301 1549 ntTSL 1 (best) BASIC26.72■■□□□ 1.87
TCRBV7S3A2A0A539 STUB1-205ENST00000565677 1560 ntTSL 1 (best) BASIC26.71■■□□□ 1.87
TCRBV7S3A2A0A539 STUB1-201ENST00000219548 1472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.71■■□□□ 1.87
TCRBV7S3A2A0A539 PLSCR3-209ENST00000574401 2032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.71■■□□□ 1.87
TCRBV7S3A2A0A539 TSPOAP1-AS1-203ENST00000579527 2042 ntTSL 2 BASIC26.71■■□□□ 1.87
TCRBV7S3A2A0A539 ZNF775-201ENST00000329630 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.7■■□□□ 1.87
TCRBV7S3A2A0A539 MKNK2-202ENST00000309340 1744 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.69■■□□□ 1.86
TCRBV7S3A2A0A539 MTCH1-201ENST00000373616 2006 ntTSL 1 (best) BASIC26.69■■□□□ 1.86
TCRBV7S3A2A0A539 PIK3R2-208ENST00000617642 1446 ntTSL 5 BASIC26.69■■□□□ 1.86
TCRBV7S3A2A0A539 PLEKHG6-206ENST00000536531 1683 ntTSL 1 (best) BASIC26.69■■□□□ 1.86
TCRBV7S3A2A0A539 GPR75-ASB3-201ENST00000406625 2113 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.68■■□□□ 1.86
TCRBV7S3A2A0A539 HOOK2-201ENST00000264827 2603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.68■■□□□ 1.86
TCRBV7S3A2A0A539 HOXB3-201ENST00000311626 2642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.68■■□□□ 1.86
TCRBV7S3A2A0A539 SSU72-201ENST00000291386 1290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.68■■□□□ 1.86
TCRBV7S3A2A0A539 HAND2-201ENST00000359562 2780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.67■■□□□ 1.86
TCRBV7S3A2A0A539 LRRC75B-201ENST00000318753 1238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.67■■□□□ 1.86
TCRBV7S3A2A0A539 CAHM-201ENST00000604200 896 ntBASIC26.67■■□□□ 1.86
TCRBV7S3A2A0A539 BMP7-204ENST00000450594 1857 ntTSL 2 BASIC26.67■■□□□ 1.86
TCRBV7S3A2A0A539 MARCH11-201ENST00000332432 1741 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.67■■□□□ 1.86
TCRBV7S3A2A0A539 BTBD19-203ENST00000450269 1572 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.67■■□□□ 1.86
TCRBV7S3A2A0A539 SDCCAG3-201ENST00000298537 2314 ntTSL 1 (best) BASIC26.66■■□□□ 1.86
TCRBV7S3A2A0A539 HNRNPAB-205ENST00000506259 1674 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.66■■□□□ 1.86
TCRBV7S3A2A0A539 AC234582.1-201ENST00000447623 923 ntTSL 5 BASIC26.65■■□□□ 1.86
TCRBV7S3A2A0A539 AC136428.2-201ENST00000563187 214 ntBASIC26.65■■□□□ 1.86
TCRBV7S3A2A0A539 KANSL1L-207ENST00000452086 2334 ntTSL 1 (best) BASIC26.65■■□□□ 1.86
TCRBV7S3A2A0A539 AL391121.1-201ENST00000607967 1349 ntBASIC26.65■■□□□ 1.86
TCRBV7S3A2A0A539 ST6GALNAC6-205ENST00000373146 2460 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.64■■□□□ 1.86
TCRBV7S3A2A0A539 FAM117A-201ENST00000240364 2365 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.64■■□□□ 1.85
TCRBV7S3A2A0A539 MNX1-201ENST00000252971 2174 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.64■■□□□ 1.85
TCRBV7S3A2A0A539 PLSCR3-202ENST00000535512 2067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.64■■□□□ 1.85
TCRBV7S3A2A0A539 AC142086.6-201ENST00000621154 1765 ntBASIC26.63■■□□□ 1.85
TCRBV7S3A2A0A539 NADK2-210ENST00000514504 1233 ntTSL 5 BASIC26.63■■□□□ 1.85
TCRBV7S3A2A0A539 DUSP14-206ENST00000617516 1537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.63■■□□□ 1.85
TCRBV7S3A2A0A539 RUNX2-205ENST00000465038 1770 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC26.63■■□□□ 1.85
TCRBV7S3A2A0A539 SENP3-201ENST00000321337 2611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.62■■□□□ 1.85
TCRBV7S3A2A0A539 DRD5P2-201ENST00000421395 2012 ntBASIC26.61■■□□□ 1.85
TCRBV7S3A2A0A539 ATRAID-201ENST00000380171 1240 ntTSL 1 (best) BASIC26.61■■□□□ 1.85
TCRBV7S3A2A0A539 CRIP1-201ENST00000330233 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.61■■□□□ 1.85
TCRBV7S3A2A0A539 MYLIP-202ENST00000356840 1666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.6■■□□□ 1.85
TCRBV7S3A2A0A539 TPGS1-201ENST00000359315 1114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.6■■□□□ 1.85
TCRBV7S3A2A0A539 TCFL5-201ENST00000217162 2453 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.6■■□□□ 1.85
TCRBV7S3A2A0A539 TCFL5-202ENST00000335351 2456 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.6■■□□□ 1.85
TCRBV7S3A2A0A539 TCF24-201ENST00000563496 2450 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.59■■□□□ 1.85
TCRBV7S3A2A0A539 CLK2-201ENST00000355560 2120 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC26.59■■□□□ 1.85
TCRBV7S3A2A0A539 EBPL-202ENST00000378268 680 ntTSL 3 BASIC26.59■■□□□ 1.85
TCRBV7S3A2A0A539 EFEMP2-201ENST00000307998 2034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.59■■□□□ 1.85
TCRBV7S3A2A0A539 DENR-202ENST00000455982 1052 ntTSL 5 BASIC26.58■■□□□ 1.85
TCRBV7S3A2A0A539 LACTB-201ENST00000261893 1972 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.58■■□□□ 1.85
TCRBV7S3A2A0A539 GSTP1-202ENST00000398606 965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.56■■□□□ 1.84
TCRBV7S3A2A0A539 FGF3-201ENST00000334134 892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.55■■□□□ 1.84
TCRBV7S3A2A0A539 ZFAND2B-204ENST00000409217 886 ntTSL 2 BASIC26.55■■□□□ 1.84
TCRBV7S3A2A0A539 AC097358.2-201ENST00000607541 1159 ntBASIC26.55■■□□□ 1.84
TCRBV7S3A2A0A539 CHST14-202ENST00000559991 1968 ntTSL 5 BASIC26.54■■□□□ 1.84
TCRBV7S3A2A0A539 HSD11B1L-209ENST00000577917 1553 ntTSL 1 (best) BASIC26.54■■□□□ 1.84
TCRBV7S3A2A0A539 CADPS-215ENST00000490353 2669 ntTSL 5 BASIC26.53■■□□□ 1.84
TCRBV7S3A2A0A539 DUSP15-202ENST00000339738 1454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.53■■□□□ 1.84
TCRBV7S3A2A0A539 ECI1-207ENST00000570258 1512 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.53■■□□□ 1.84
TCRBV7S3A2A0A539 NOXA1-201ENST00000341349 1678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.53■■□□□ 1.84
TCRBV7S3A2A0A539 ZDHHC23-206ENST00000498275 2055 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.53■■□□□ 1.84
TCRBV7S3A2A0A539 COMMD7-201ENST00000278980 1900 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.52■■□□□ 1.84
TCRBV7S3A2A0A539 SCCPDH-201ENST00000366510 2503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.52■■□□□ 1.84
TCRBV7S3A2A0A539 WHRN-203ENST00000374057 1718 ntTSL 2 BASIC26.52■■□□□ 1.84
TCRBV7S3A2A0A539 AL139393.1-201ENST00000417479 573 ntTSL 5 BASIC26.52■■□□□ 1.84
TCRBV7S3A2A0A539 C9orf40-201ENST00000376854 2327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.51■■□□□ 1.84
TCRBV7S3A2A0A539 TOMM40-201ENST00000252487 1707 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.51■■□□□ 1.83
TCRBV7S3A2A0A539 TOMM40-202ENST00000405636 1709 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.51■■□□□ 1.83
TCRBV7S3A2A0A539 CCND3-203ENST00000372991 2085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.51■■□□□ 1.83
TCRBV7S3A2A0A539 ENKD1-201ENST00000243878 1579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.5■■□□□ 1.83
TCRBV7S3A2A0A539 BATF3-201ENST00000243440 980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.5■■□□□ 1.83
TCRBV7S3A2A0A539 CIB1-201ENST00000328649 1247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.5■■□□□ 1.83
TCRBV7S3A2A0A539 AC006486.1-201ENST00000594664 634 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC26.5■■□□□ 1.83
TCRBV7S3A2A0A539 CIB1-202ENST00000612800 1096 ntTSL 1 (best) BASIC26.5■■□□□ 1.83
TCRBV7S3A2A0A539 AP003068.2-202ENST00000526623 1662 ntTSL 2 BASIC26.5■■□□□ 1.83
TCRBV7S3A2A0A539 ATP6V1E2-204ENST00000522587 1559 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC26.5■■□□□ 1.83
TCRBV7S3A2A0A539 AMZ2-201ENST00000359783 1722 ntTSL 5 BASIC26.49■■□□□ 1.83
TCRBV7S3A2A0A539 NFYB-205ENST00000551727 1727 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC26.49■■□□□ 1.83
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 16.4 ms