Protein–RNA interactions for Protein: A0A1W2PQ09

Uncharacterized protein, humanhuman

Predictions only

Length 198 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
A0A1W2PQ09 FAM89A-201ENST00000366654 1495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
A0A1W2PQ09 CPNE1-203ENST00000397442 1695 ntTSL 5 BASIC23.21■■□□□ 1.31
A0A1W2PQ09 SHARPIN-202ENST00000398712 1765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
A0A1W2PQ09 FOXG1-201ENST00000313071 4890 ntAPPRIS P1 BASIC23.2■■□□□ 1.3
A0A1W2PQ09 CHPT1-205ENST00000549872 2001 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.19■■□□□ 1.3
A0A1W2PQ09 CCKBR-201ENST00000334619 2121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
A0A1W2PQ09 LACTB-201ENST00000261893 1972 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
A0A1W2PQ09 HMGB1-205ENST00000399494 1282 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.17■■□□□ 1.3
A0A1W2PQ09 SKOR2-203ENST00000620245 3048 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.15■■□□□ 1.3
A0A1W2PQ09 CBX4-202ENST00000448310 718 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC23.15■■□□□ 1.3
A0A1W2PQ09 TCF24-201ENST00000563496 2450 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.14■■□□□ 1.29
A0A1W2PQ09 SLC52A2-201ENST00000329994 1896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
A0A1W2PQ09 MLST8-203ENST00000397124 1691 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC23.14■■□□□ 1.29
A0A1W2PQ09 CSNK1E-203ENST00000396832 2791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
A0A1W2PQ09 FAM107B-205ENST00000378467 2374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
A0A1W2PQ09 POU3F3-201ENST00000361360 3064 ntAPPRIS P1 BASIC23.13■■□□□ 1.29
A0A1W2PQ09 THRA-204ENST00000546243 1909 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.12■■□□□ 1.29
A0A1W2PQ09 NRGN-202ENST00000412681 1106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
A0A1W2PQ09 CAPN10-208ENST00000404753 2570 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.12■■□□□ 1.29
A0A1W2PQ09 GKAP1-203ENST00000376371 1778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
A0A1W2PQ09 ECI1-201ENST00000301729 1541 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
A0A1W2PQ09 CDK2AP1-203ENST00000535979 1281 ntTSL 3 BASIC23.1■■□□□ 1.29
A0A1W2PQ09 SPATA5L1-208ENST00000638607 1863 ntTSL 2 BASIC23.1■■□□□ 1.29
A0A1W2PQ09 TNIP2-201ENST00000315423 1974 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
A0A1W2PQ09 PLEKHF1-201ENST00000436066 2084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
A0A1W2PQ09 RAB40C-204ENST00000538492 2569 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.08■■□□□ 1.29
A0A1W2PQ09 YAP1-204ENST00000526343 2393 ntTSL 5 BASIC23.08■■□□□ 1.29
A0A1W2PQ09 LMTK3-202ENST00000600059 5113 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.08■■□□□ 1.28
A0A1W2PQ09 PLBD2-202ENST00000545182 2321 ntTSL 2 BASIC23.08■■□□□ 1.28
A0A1W2PQ09 KCTD17-209ENST00000610767 1502 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC23.08■■□□□ 1.28
A0A1W2PQ09 SPTSSA-201ENST00000298130 2777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
A0A1W2PQ09 OTUD5-202ENST00000376488 2692 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
A0A1W2PQ09 CMAS-201ENST00000229329 1787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
A0A1W2PQ09 AC025431.1-201ENST00000559684 874 ntTSL 3 BASIC23.07■■□□□ 1.28
A0A1W2PQ09 PLPPR3-201ENST00000359894 2387 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
A0A1W2PQ09 ADGRB2-204ENST00000398542 5176 ntTSL 5 BASIC23.07■■□□□ 1.28
A0A1W2PQ09 ZNF768-201ENST00000380412 2315 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
A0A1W2PQ09 FRAT2-201ENST00000371019 2213 ntAPPRIS P1 BASIC23.06■■□□□ 1.28
A0A1W2PQ09 GALK1-205ENST00000588479 1866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
A0A1W2PQ09 TAZ-205ENST00000475699 1862 ntTSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
A0A1W2PQ09 RSG1-201ENST00000375599 1545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
A0A1W2PQ09 ARTN-203ENST00000414809 1943 ntAPPRIS P4 TSL 3 BASIC23.05■■□□□ 1.28
A0A1W2PQ09 MTCH1-202ENST00000373627 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
A0A1W2PQ09 HOXB3-210ENST00000489475 1845 ntTSL 2 BASIC23.05■■□□□ 1.28
A0A1W2PQ09 CCND3-202ENST00000372988 2133 ntTSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
A0A1W2PQ09 ESRRA-203ENST00000406310 2218 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
A0A1W2PQ09 ADNP-AS1-201ENST00000558899 927 ntTSL 3 BASIC23.04■■□□□ 1.28
A0A1W2PQ09 SPIRE1-202ENST00000409402 5665 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
A0A1W2PQ09 NFYB-205ENST00000551727 1727 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.04■■□□□ 1.28
A0A1W2PQ09 RASSF8-202ENST00000381352 2320 ntTSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
A0A1W2PQ09 PHF23-205ENST00000571362 1768 ntTSL 2 BASIC23.04■■□□□ 1.28
A0A1W2PQ09 GTF2IP1-204ENST00000616377 2632 ntTSL 2 BASIC23.03■■□□□ 1.28
A0A1W2PQ09 IHH-201ENST00000295731 2023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
A0A1W2PQ09 AC068152.1-207ENST00000573341 647 ntTSL 2 BASIC23.02■■□□□ 1.28
A0A1W2PQ09 NOG-201ENST00000332822 1892 ntAPPRIS P1 BASIC23.01■■□□□ 1.27
A0A1W2PQ09 TMEM187-201ENST00000369982 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
A0A1W2PQ09 GRK2-204ENST00000526285 1458 ntTSL 5 BASIC23■■□□□ 1.27
A0A1W2PQ09 CYB5R3-201ENST00000352397 2124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
A0A1W2PQ09 FGF18-201ENST00000274625 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
A0A1W2PQ09 ANKRD53-201ENST00000272421 2185 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
A0A1W2PQ09 TMEM55B-201ENST00000250489 1961 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
A0A1W2PQ09 DEDD-212ENST00000545495 2329 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.99■■□□□ 1.27
A0A1W2PQ09 PGM5-201ENST00000396392 1782 ntTSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
A0A1W2PQ09 DDX42-201ENST00000359353 2783 ntTSL 5 BASIC22.98■■□□□ 1.27
A0A1W2PQ09 MSX2-202ENST00000507785 1188 ntTSL 2 BASIC22.98■■□□□ 1.27
A0A1W2PQ09 FADD-201ENST00000301838 1841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
A0A1W2PQ09 CAMKK1-201ENST00000158166 2459 ntTSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
A0A1W2PQ09 DRD5P2-201ENST00000421395 2012 ntBASIC22.98■■□□□ 1.27
A0A1W2PQ09 CAPNS1-204ENST00000587718 1558 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
A0A1W2PQ09 RARRES2P7-201ENST00000567349 469 ntBASIC22.96■■□□□ 1.27
A0A1W2PQ09 KLF16-203ENST00000592313 508 ntTSL 3 BASIC22.96■■□□□ 1.27
A0A1W2PQ09 GIPC1-201ENST00000345425 1782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
A0A1W2PQ09 HNRNPAB-202ENST00000358344 1796 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
A0A1W2PQ09 ST6GALNAC6-204ENST00000373144 2406 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
A0A1W2PQ09 HYAL2-202ENST00000395139 2136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
A0A1W2PQ09 RASSF5-204ENST00000580449 1932 ntTSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
A0A1W2PQ09 RAB26-201ENST00000210187 1675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
A0A1W2PQ09 OTUD5-203ENST00000396743 2682 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
A0A1W2PQ09 AJAP1-201ENST00000378190 2383 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.94■■□□□ 1.26
A0A1W2PQ09 NXPH3-201ENST00000328741 2179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
A0A1W2PQ09 CATIP-201ENST00000289388 1323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
A0A1W2PQ09 VIPR2-203ENST00000402066 1926 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.93■■□□□ 1.26
A0A1W2PQ09 MAPK4-202ENST00000540640 1576 ntTSL 2 BASIC22.91■■□□□ 1.26
A0A1W2PQ09 ZBTB10-204ENST00000455036 5458 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.91■■□□□ 1.26
A0A1W2PQ09 MORF4L1-202ENST00000379535 2274 ntTSL 2 BASIC22.91■■□□□ 1.26
A0A1W2PQ09 SERPING1-205ENST00000403558 2231 ntTSL 5 BASIC22.9■■□□□ 1.26
A0A1W2PQ09 CACNG7-203ENST00000391767 2688 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.9■■□□□ 1.26
A0A1W2PQ09 HECA-201ENST00000367658 5614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
A0A1W2PQ09 KIAA2013-201ENST00000376572 2815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
A0A1W2PQ09 CHCHD4-201ENST00000295767 1603 ntTSL 2 BASIC22.88■■□□□ 1.25
A0A1W2PQ09 HNRNPAB-204ENST00000504898 1785 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
A0A1W2PQ09 MSX1-201ENST00000382723 1939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
A0A1W2PQ09 RHEB-201ENST00000262187 2075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
A0A1W2PQ09 AL135925.1-201ENST00000605920 1701 ntBASIC22.86■■□□□ 1.25
A0A1W2PQ09 AC079305.1-201ENST00000428541 499 ntTSL 3 BASIC22.86■■□□□ 1.25
A0A1W2PQ09 AC009133.5-201ENST00000562594 473 ntTSL 4 BASIC22.86■■□□□ 1.25
A0A1W2PQ09 CTDNEP1-201ENST00000318988 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
A0A1W2PQ09 LFNG-203ENST00000359574 1377 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
A0A1W2PQ09 SHD-201ENST00000543264 2577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
A0A1W2PQ09 EVC-203ENST00000509451 1960 ntTSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 47.8 ms