Protein–RNA interactions for Protein: A0A0U1RRA0

Uncharacterized protein, humanhuman

Predictions only

Length 63 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
A0A0U1RRA0 RCOR3-202ENST00000367006 2525 ntTSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
A0A0U1RRA0 PLSCR3-209ENST00000574401 2032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
A0A0U1RRA0 RNF130-201ENST00000261947 1766 ntTSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
A0A0U1RRA0 AC142086.6-201ENST00000621154 1765 ntBASIC17.78■□□□□ 0.44
A0A0U1RRA0 TCF24-201ENST00000563496 2450 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.78■□□□□ 0.44
A0A0U1RRA0 AHSA2-201ENST00000357022 2437 ntTSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
A0A0U1RRA0 MVK-208ENST00000539696 608 ntTSL 5 BASIC17.77■□□□□ 0.44
A0A0U1RRA0 PGM5P2-201ENST00000613141 1980 ntTSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.43
A0A0U1RRA0 GIPC1-201ENST00000345425 1782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
A0A0U1RRA0 MTCH1-201ENST00000373616 2006 ntTSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
A0A0U1RRA0 SLC52A2-201ENST00000329994 1896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
A0A0U1RRA0 RRNAD1-201ENST00000368216 2254 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
A0A0U1RRA0 GPR75-ASB3-201ENST00000406625 2113 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.76■□□□□ 0.43
A0A0U1RRA0 CTDSPL-206ENST00000443503 4640 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
A0A0U1RRA0 EFEMP2-201ENST00000307998 2034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
A0A0U1RRA0 MFSD12-201ENST00000355415 2124 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
A0A0U1RRA0 COL13A1-214ENST00000522165 2061 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.75■□□□□ 0.43
A0A0U1RRA0 EFNA3-201ENST00000368408 1782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
A0A0U1RRA0 PLSCR3-214ENST00000619711 2066 ntTSL 5 BASIC17.74■□□□□ 0.43
A0A0U1RRA0 MNX1-201ENST00000252971 2174 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
A0A0U1RRA0 NPDC1-201ENST00000371600 2187 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
A0A0U1RRA0 FLJ37453-201ENST00000317122 2473 ntTSL 2 BASIC17.74■□□□□ 0.43
A0A0U1RRA0 FBXO2-201ENST00000354287 1560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
A0A0U1RRA0 RUNDC3A-206ENST00000590941 1675 ntTSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
A0A0U1RRA0 KIAA1456-206ENST00000528753 2392 ntTSL 2 BASIC17.73■□□□□ 0.43
A0A0U1RRA0 RAB26-201ENST00000210187 1675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
A0A0U1RRA0 BTBD7-201ENST00000298896 2621 ntTSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
A0A0U1RRA0 HDGF-201ENST00000357325 2380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
A0A0U1RRA0 CDH24-206ENST00000610348 2037 ntTSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
A0A0U1RRA0 CNIH2-203ENST00000528852 1524 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
A0A0U1RRA0 OTUD5-208ENST00000610466 2487 ntTSL 5 BASIC17.71■□□□□ 0.43
A0A0U1RRA0 SPATA5L1-208ENST00000638607 1863 ntTSL 2 BASIC17.71■□□□□ 0.43
A0A0U1RRA0 SHARPIN-202ENST00000398712 1765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
A0A0U1RRA0 WTAP-206ENST00000621533 2109 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.71■□□□□ 0.42
A0A0U1RRA0 RCAN1-201ENST00000313806 2490 ntTSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
A0A0U1RRA0 AP003068.2-202ENST00000526623 1662 ntTSL 2 BASIC17.7■□□□□ 0.42
A0A0U1RRA0 WHRN-203ENST00000374057 1718 ntTSL 2 BASIC17.69■□□□□ 0.42
A0A0U1RRA0 GRK2-204ENST00000526285 1458 ntTSL 5 BASIC17.69■□□□□ 0.42
A0A0U1RRA0 PEA15-201ENST00000360472 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
A0A0U1RRA0 CHCHD4-201ENST00000295767 1603 ntTSL 2 BASIC17.69■□□□□ 0.42
A0A0U1RRA0 PCSK6-216ENST00000615296 2921 ntTSL 5 BASIC17.68■□□□□ 0.42
A0A0U1RRA0 AC008738.5-201ENST00000587312 482 ntTSL 3 BASIC17.68■□□□□ 0.42
A0A0U1RRA0 SPTSSA-201ENST00000298130 2777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
A0A0U1RRA0 LRRC61-202ENST00000359623 1877 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.67■□□□□ 0.42
A0A0U1RRA0 SDK1-201ENST00000389531 7606 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.67■□□□□ 0.42
A0A0U1RRA0 LMO2-201ENST00000257818 2294 ntTSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
A0A0U1RRA0 GKAP1-203ENST00000376371 1778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
A0A0U1RRA0 GABBR2-201ENST00000259455 5788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
A0A0U1RRA0 MSANTD3-203ENST00000395067 1362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
A0A0U1RRA0 AC091230.1-202ENST00000564823 5356 ntTSL 2 BASIC17.66■□□□□ 0.42
A0A0U1RRA0 MTCH1-202ENST00000373627 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
A0A0U1RRA0 TMEM64-203ENST00000458549 4997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
A0A0U1RRA0 SOX1-201ENST00000330949 2842 ntAPPRIS P1 BASIC17.65■□□□□ 0.42
A0A0U1RRA0 SKOR2-203ENST00000620245 3048 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.65■□□□□ 0.42
A0A0U1RRA0 AL135925.1-201ENST00000605920 1701 ntBASIC17.64■□□□□ 0.41
A0A0U1RRA0 NREP-202ENST00000379671 2581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
A0A0U1RRA0 LACTB-201ENST00000261893 1972 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
A0A0U1RRA0 COPS6-201ENST00000303904 1432 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
A0A0U1RRA0 PLEKHF1-201ENST00000436066 2084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
A0A0U1RRA0 KCNQ5-205ENST00000370398 6345 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
A0A0U1RRA0 HNRNPAB-202ENST00000358344 1796 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
A0A0U1RRA0 LINC01578-203ENST00000554669 578 ntTSL 5 BASIC17.61■□□□□ 0.41
A0A0U1RRA0 SYNGR1-202ENST00000318801 1361 ntTSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
A0A0U1RRA0 MYBL1-204ENST00000522677 5192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
A0A0U1RRA0 RAB40C-204ENST00000538492 2569 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.61■□□□□ 0.41
A0A0U1RRA0 KHSRP-201ENST00000398148 2993 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
A0A0U1RRA0 CGREF1-202ENST00000312734 1610 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.6■□□□□ 0.41
A0A0U1RRA0 HES7-202ENST00000541682 1674 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
A0A0U1RRA0 SHOX2-204ENST00000483851 1866 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.6■□□□□ 0.41
A0A0U1RRA0 FGF18-201ENST00000274625 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
A0A0U1RRA0 AC135731.1-201ENST00000569415 2548 ntBASIC17.6■□□□□ 0.41
A0A0U1RRA0 CACNG6-201ENST00000252729 1853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
A0A0U1RRA0 IRX1-201ENST00000302006 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
A0A0U1RRA0 SLC4A3-203ENST00000358055 4454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
A0A0U1RRA0 DBP-205ENST00000601104 1489 ntTSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
A0A0U1RRA0 KCNJ4-201ENST00000303592 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
A0A0U1RRA0 AC243773.2-204ENST00000621428 1462 ntTSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.41
A0A0U1RRA0 THAP4-204ENST00000407315 2367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.41
A0A0U1RRA0 MAPKAPK2-201ENST00000294981 2171 ntTSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
A0A0U1RRA0 TCEA2-204ENST00000395053 1733 ntTSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
A0A0U1RRA0 SNTB1-202ENST00000517992 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
A0A0U1RRA0 PLPP2-203ENST00000434325 1383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
A0A0U1RRA0 KANSL1L-207ENST00000452086 2334 ntTSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
A0A0U1RRA0 KIAA2013-201ENST00000376572 2815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
A0A0U1RRA0 AL121749.1-202ENST00000609313 2153 ntBASIC17.57■□□□□ 0.4
A0A0U1RRA0 HUNK-201ENST00000270112 7385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
A0A0U1RRA0 FAM220A-201ENST00000313324 2214 ntTSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
A0A0U1RRA0 SAP30L-201ENST00000297109 6226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
A0A0U1RRA0 VEGFC-202ENST00000618562 2064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
A0A0U1RRA0 NFYB-205ENST00000551727 1727 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.55■□□□□ 0.4
A0A0U1RRA0 CCKBR-201ENST00000334619 2121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
A0A0U1RRA0 DRD5P2-201ENST00000421395 2012 ntBASIC17.55■□□□□ 0.4
A0A0U1RRA0 DDX42-201ENST00000359353 2783 ntTSL 5 BASIC17.55■□□□□ 0.4
A0A0U1RRA0 SERPING1-205ENST00000403558 2231 ntTSL 5 BASIC17.55■□□□□ 0.4
A0A0U1RRA0 MTMR1-202ENST00000370390 2755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
A0A0U1RRA0 ZFAND2B-208ENST00000409594 2021 ntTSL 2 BASIC17.54■□□□□ 0.4
A0A0U1RRA0 CACNG7-203ENST00000391767 2688 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.54■□□□□ 0.4
A0A0U1RRA0 NRXN2-204ENST00000377559 6413 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
A0A0U1RRA0 HNRNPAB-206ENST00000506339 1747 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.53■□□□□ 0.4
A0A0U1RRA0 SDCCAG3-201ENST00000298537 2314 ntTSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 52.5 ms