Protein–RNA interactions for Protein: A0A0J9YWV2

TRBV4-1, T-cell receptor beta variable 4-1 (Fragment), humanhuman

Predictions only

Length 114 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TRBV4-1A0A0J9YWV2 HAND2-201ENST00000359562 2780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
TRBV4-1A0A0J9YWV2 RDX-210ENST00000530301 1549 ntTSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
TRBV4-1A0A0J9YWV2 BCL7C-201ENST00000215115 1740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
TRBV4-1A0A0J9YWV2 PURG-201ENST00000339382 2693 ntTSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
TRBV4-1A0A0J9YWV2 PELI3-203ENST00000524466 1671 ntTSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
TRBV4-1A0A0J9YWV2 NOP53-201ENST00000246802 1528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
TRBV4-1A0A0J9YWV2 NRTN-201ENST00000303212 1109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
TRBV4-1A0A0J9YWV2 AC025431.1-201ENST00000559684 874 ntTSL 3 BASIC24.1■■□□□ 1.45
TRBV4-1A0A0J9YWV2 AP003068.2-202ENST00000526623 1662 ntTSL 2 BASIC24.1■■□□□ 1.45
TRBV4-1A0A0J9YWV2 C9orf40-201ENST00000376854 2327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
TRBV4-1A0A0J9YWV2 GAL3ST1-204ENST00000402369 1712 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.1■■□□□ 1.45
TRBV4-1A0A0J9YWV2 MNX1-201ENST00000252971 2174 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
TRBV4-1A0A0J9YWV2 CTBP1-201ENST00000290921 2297 ntTSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
TRBV4-1A0A0J9YWV2 WHRN-203ENST00000374057 1718 ntTSL 2 BASIC24.08■■□□□ 1.45
TRBV4-1A0A0J9YWV2 ZFAND2B-208ENST00000409594 2021 ntTSL 2 BASIC24.08■■□□□ 1.44
TRBV4-1A0A0J9YWV2 AC079305.1-201ENST00000428541 499 ntTSL 3 BASIC24.07■■□□□ 1.44
TRBV4-1A0A0J9YWV2 EFEMP2-201ENST00000307998 2034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
TRBV4-1A0A0J9YWV2 LACTB-201ENST00000261893 1972 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
TRBV4-1A0A0J9YWV2 AGPAT2-202ENST00000371696 1512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
TRBV4-1A0A0J9YWV2 ABHD17A-202ENST00000292577 1757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
TRBV4-1A0A0J9YWV2 DRD5P2-201ENST00000421395 2012 ntBASIC24.04■■□□□ 1.44
TRBV4-1A0A0J9YWV2 FSD1L-208ENST00000495708 1906 ntTSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
TRBV4-1A0A0J9YWV2 TCF24-201ENST00000563496 2450 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.02■■□□□ 1.44
TRBV4-1A0A0J9YWV2 AC010864.1-201ENST00000609407 1511 ntBASIC24.01■■□□□ 1.43
TRBV4-1A0A0J9YWV2 NOG-201ENST00000332822 1892 ntAPPRIS P1 BASIC24.01■■□□□ 1.43
TRBV4-1A0A0J9YWV2 PLEKHG6-206ENST00000536531 1683 ntTSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
TRBV4-1A0A0J9YWV2 PLSCR3-214ENST00000619711 2066 ntTSL 5 BASIC24.01■■□□□ 1.43
TRBV4-1A0A0J9YWV2 PPP3CC-204ENST00000518852 1598 ntTSL 2 BASIC24■■□□□ 1.43
TRBV4-1A0A0J9YWV2 PICK1-201ENST00000356976 2055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
TRBV4-1A0A0J9YWV2 CDK2AP1-203ENST00000535979 1281 ntTSL 3 BASIC24■■□□□ 1.43
TRBV4-1A0A0J9YWV2 FAM78B-202ENST00000354422 1475 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24■■□□□ 1.43
TRBV4-1A0A0J9YWV2 CDH24-206ENST00000610348 2037 ntTSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
TRBV4-1A0A0J9YWV2 ZNF219-201ENST00000360947 3071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
TRBV4-1A0A0J9YWV2 CLK2-201ENST00000355560 2120 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.99■■□□□ 1.43
TRBV4-1A0A0J9YWV2 MKNK2-202ENST00000309340 1744 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
TRBV4-1A0A0J9YWV2 SDCCAG3-201ENST00000298537 2314 ntTSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
TRBV4-1A0A0J9YWV2 SCCPDH-201ENST00000366510 2503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
TRBV4-1A0A0J9YWV2 C1orf122-204ENST00000468084 1234 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.98■■□□□ 1.43
TRBV4-1A0A0J9YWV2 LINC01089-207ENST00000538335 630 ntTSL 3 BASIC23.98■■□□□ 1.43
TRBV4-1A0A0J9YWV2 DHRS13-202ENST00000394901 2037 ntTSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
TRBV4-1A0A0J9YWV2 KANSL1L-207ENST00000452086 2334 ntTSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
TRBV4-1A0A0J9YWV2 NFYB-205ENST00000551727 1727 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.97■■□□□ 1.43
TRBV4-1A0A0J9YWV2 COMMD7-201ENST00000278980 1900 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
TRBV4-1A0A0J9YWV2 MARCH11-201ENST00000332432 1741 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.96■■□□□ 1.43
TRBV4-1A0A0J9YWV2 LZTS2-201ENST00000370220 5741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
TRBV4-1A0A0J9YWV2 SIGMAR1-205ENST00000477726 840 ntTSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
TRBV4-1A0A0J9YWV2 TNFSF12-201ENST00000293825 1553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
TRBV4-1A0A0J9YWV2 GNPTAB-202ENST00000392919 760 ntTSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
TRBV4-1A0A0J9YWV2 STUB1-205ENST00000565677 1560 ntTSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
TRBV4-1A0A0J9YWV2 RUNX2-205ENST00000465038 1770 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC23.92■■□□□ 1.42
TRBV4-1A0A0J9YWV2 HNRNPAB-205ENST00000506259 1674 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
TRBV4-1A0A0J9YWV2 UBE2L6-201ENST00000287156 1354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
TRBV4-1A0A0J9YWV2 INPP5A-202ENST00000368593 1432 ntTSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
TRBV4-1A0A0J9YWV2 ZDHHC23-206ENST00000498275 2055 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.9■■□□□ 1.42
TRBV4-1A0A0J9YWV2 CHST14-202ENST00000559991 1968 ntTSL 5 BASIC23.9■■□□□ 1.42
TRBV4-1A0A0J9YWV2 NPDC1-201ENST00000371600 2187 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.41
TRBV4-1A0A0J9YWV2 MFSD12-201ENST00000355415 2124 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.41
TRBV4-1A0A0J9YWV2 NPB-202ENST00000573081 2154 ntAPPRIS ALT2 BASIC23.88■■□□□ 1.41
TRBV4-1A0A0J9YWV2 PIK3R2-208ENST00000617642 1446 ntTSL 5 BASIC23.88■■□□□ 1.41
TRBV4-1A0A0J9YWV2 SERPING1-205ENST00000403558 2231 ntTSL 5 BASIC23.87■■□□□ 1.41
TRBV4-1A0A0J9YWV2 HYAL2-202ENST00000395139 2136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
TRBV4-1A0A0J9YWV2 AMZ2-201ENST00000359783 1722 ntTSL 5 BASIC23.87■■□□□ 1.41
TRBV4-1A0A0J9YWV2 PLEKHF1-201ENST00000436066 2084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
TRBV4-1A0A0J9YWV2 ATPAF1-201ENST00000329231 1241 ntTSL 2 BASIC23.86■■□□□ 1.41
TRBV4-1A0A0J9YWV2 ABL1-201ENST00000318560 5766 ntTSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
TRBV4-1A0A0J9YWV2 IL13RA1-201ENST00000371642 1096 ntTSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
TRBV4-1A0A0J9YWV2 ADNP-AS1-201ENST00000558899 927 ntTSL 3 BASIC23.85■■□□□ 1.41
TRBV4-1A0A0J9YWV2 C11orf80-204ENST00000525908 2135 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC23.84■■□□□ 1.41
TRBV4-1A0A0J9YWV2 BTBD19-203ENST00000450269 1572 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.84■■□□□ 1.41
TRBV4-1A0A0J9YWV2 RHOC-208ENST00000369642 1355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
TRBV4-1A0A0J9YWV2 LGALS3-201ENST00000254301 1146 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
TRBV4-1A0A0J9YWV2 MAPKAPK2-201ENST00000294981 2171 ntTSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
TRBV4-1A0A0J9YWV2 CARM1-202ENST00000344150 2722 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.83■■□□□ 1.41
TRBV4-1A0A0J9YWV2 STUB1-201ENST00000219548 1472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.41
TRBV4-1A0A0J9YWV2 FTCD-201ENST00000291670 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.41
TRBV4-1A0A0J9YWV2 AC009133.5-201ENST00000562594 473 ntTSL 4 BASIC23.83■■□□□ 1.41
TRBV4-1A0A0J9YWV2 COMMD3-201ENST00000376836 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
TRBV4-1A0A0J9YWV2 ANKS1B-203ENST00000341752 2115 ntTSL 2 BASIC23.8■■□□□ 1.4
TRBV4-1A0A0J9YWV2 CCNYL1-205ENST00000420822 952 ntTSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
TRBV4-1A0A0J9YWV2 HOXD-AS2-202ENST00000440016 999 ntTSL 5 BASIC23.8■■□□□ 1.4
TRBV4-1A0A0J9YWV2 WTAP-206ENST00000621533 2109 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.8■■□□□ 1.4
TRBV4-1A0A0J9YWV2 ECI1-207ENST00000570258 1512 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.79■■□□□ 1.4
TRBV4-1A0A0J9YWV2 SLC16A3-214ENST00000582743 2002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
TRBV4-1A0A0J9YWV2 AGAP1-202ENST00000336665 5427 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
TRBV4-1A0A0J9YWV2 GNAS-211ENST00000371095 1931 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
TRBV4-1A0A0J9YWV2 PPP1CC-208ENST00000551676 1581 ntTSL 2 BASIC23.78■■□□□ 1.4
TRBV4-1A0A0J9YWV2 GNAS-207ENST00000354359 1975 ntTSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
TRBV4-1A0A0J9YWV2 GNAS-210ENST00000371085 1972 ntTSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
TRBV4-1A0A0J9YWV2 CBX4-202ENST00000448310 718 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC23.78■■□□□ 1.4
TRBV4-1A0A0J9YWV2 MYLIP-202ENST00000356840 1666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
TRBV4-1A0A0J9YWV2 TMEM55B-201ENST00000250489 1961 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
TRBV4-1A0A0J9YWV2 AL121749.1-202ENST00000609313 2153 ntBASIC23.77■■□□□ 1.4
TRBV4-1A0A0J9YWV2 AL109917.1-201ENST00000412228 906 ntTSL 2 BASIC23.77■■□□□ 1.4
TRBV4-1A0A0J9YWV2 RARRES2P7-201ENST00000567349 469 ntBASIC23.77■■□□□ 1.4
TRBV4-1A0A0J9YWV2 F8A3-201ENST00000622749 1759 ntAPPRIS P1 BASIC23.76■■□□□ 1.39
TRBV4-1A0A0J9YWV2 VEGFC-202ENST00000618562 2064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
TRBV4-1A0A0J9YWV2 PCBD2-201ENST00000254908 1223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
TRBV4-1A0A0J9YWV2 SETD8P1-201ENST00000623146 1180 ntBASIC23.76■■□□□ 1.39
TRBV4-1A0A0J9YWV2 TNIP2-201ENST00000315423 1974 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
TRBV4-1A0A0J9YWV2 SSU72-201ENST00000291386 1290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 62 ms