Protein–RNA interactions for Protein: A0A0J9YWF9

TRBV2, T-cell receptor beta variable 2 (Fragment), humanhuman

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TRBV2A0A0J9YWF9 MAP6D1-202ENST00000431348 890 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.16■■□□□ 1.3
TRBV2A0A0J9YWF9 AL355297.4-201ENST00000603191 1249 ntTSL 3 BASIC23.16■■□□□ 1.3
TRBV2A0A0J9YWF9 PICK1-201ENST00000356976 2055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
TRBV2A0A0J9YWF9 SPIRE1-203ENST00000410092 5533 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
TRBV2A0A0J9YWF9 CGREF1-204ENST00000402550 1575 ntTSL 2 BASIC23.15■■□□□ 1.3
TRBV2A0A0J9YWF9 HAND2-201ENST00000359562 2780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
TRBV2A0A0J9YWF9 CDH24-206ENST00000610348 2037 ntTSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
TRBV2A0A0J9YWF9 GLRB-203ENST00000509282 1757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
TRBV2A0A0J9YWF9 MNX1-201ENST00000252971 2174 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
TRBV2A0A0J9YWF9 DHRS13-202ENST00000394901 2037 ntTSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
TRBV2A0A0J9YWF9 PLSCR3-214ENST00000619711 2066 ntTSL 5 BASIC23.14■■□□□ 1.29
TRBV2A0A0J9YWF9 CARS2-201ENST00000257347 1879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
TRBV2A0A0J9YWF9 HRH3-201ENST00000317393 1419 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
TRBV2A0A0J9YWF9 MBD2-202ENST00000398398 1237 ntTSL 2 BASIC23.13■■□□□ 1.29
TRBV2A0A0J9YWF9 MBD2-205ENST00000583046 1182 ntTSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
TRBV2A0A0J9YWF9 GNPTAB-201ENST00000299314 5701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
TRBV2A0A0J9YWF9 ATF4-201ENST00000337304 2019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
TRBV2A0A0J9YWF9 XKR6-201ENST00000297303 1550 ntTSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
TRBV2A0A0J9YWF9 EFEMP2-201ENST00000307998 2034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
TRBV2A0A0J9YWF9 FAM89B-201ENST00000316409 1409 ntTSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
TRBV2A0A0J9YWF9 CDKN2D-202ENST00000393599 1422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
TRBV2A0A0J9YWF9 BCL7C-201ENST00000215115 1740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
TRBV2A0A0J9YWF9 SLC9A3R2-202ENST00000432365 1564 ntTSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
TRBV2A0A0J9YWF9 ECI1-201ENST00000301729 1541 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
TRBV2A0A0J9YWF9 NPTXR-202ENST00000640136 1503 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
TRBV2A0A0J9YWF9 AC068152.1-207ENST00000573341 647 ntTSL 2 BASIC23.1■■□□□ 1.29
TRBV2A0A0J9YWF9 WASH5P-204ENST00000632292 975 ntBASIC23.1■■□□□ 1.29
TRBV2A0A0J9YWF9 MXD3-203ENST00000439742 1483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
TRBV2A0A0J9YWF9 DRD5P2-201ENST00000421395 2012 ntBASIC23.08■■□□□ 1.28
TRBV2A0A0J9YWF9 FAAP20-204ENST00000400919 1413 ntTSL 3 BASIC23.08■■□□□ 1.28
TRBV2A0A0J9YWF9 MFSD12-201ENST00000355415 2124 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
TRBV2A0A0J9YWF9 NFYB-205ENST00000551727 1727 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.06■■□□□ 1.28
TRBV2A0A0J9YWF9 LINC01578-204ENST00000554894 556 ntTSL 3 BASIC23.06■■□□□ 1.28
TRBV2A0A0J9YWF9 LINC01578-207ENST00000556895 802 ntTSL 2 BASIC23.06■■□□□ 1.28
TRBV2A0A0J9YWF9 ZFAND2B-208ENST00000409594 2021 ntTSL 2 BASIC23.06■■□□□ 1.28
TRBV2A0A0J9YWF9 TCF24-201ENST00000563496 2450 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.05■■□□□ 1.28
TRBV2A0A0J9YWF9 NPB-202ENST00000573081 2154 ntAPPRIS ALT2 BASIC23.05■■□□□ 1.28
TRBV2A0A0J9YWF9 TNFSF12-201ENST00000293825 1553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
TRBV2A0A0J9YWF9 NPDC1-201ENST00000371600 2187 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
TRBV2A0A0J9YWF9 SCCPDH-201ENST00000366510 2503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
TRBV2A0A0J9YWF9 PLEKHG6-206ENST00000536531 1683 ntTSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
TRBV2A0A0J9YWF9 COMMD7-201ENST00000278980 1900 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
TRBV2A0A0J9YWF9 CLK2-201ENST00000355560 2120 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.03■■□□□ 1.28
TRBV2A0A0J9YWF9 C11orf80-204ENST00000525908 2135 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC23.03■■□□□ 1.28
TRBV2A0A0J9YWF9 PELI3-203ENST00000524466 1671 ntTSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
TRBV2A0A0J9YWF9 DPY19L1-209ENST00000638088 5075 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.02■■□□□ 1.28
TRBV2A0A0J9YWF9 NOP53-201ENST00000246802 1528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
TRBV2A0A0J9YWF9 TP53I13-201ENST00000301057 1530 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
TRBV2A0A0J9YWF9 GAL3ST1-204ENST00000402369 1712 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.01■■□□□ 1.27
TRBV2A0A0J9YWF9 ABHD17A-202ENST00000292577 1757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
TRBV2A0A0J9YWF9 AGPAT2-202ENST00000371696 1512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
TRBV2A0A0J9YWF9 MKNK2-202ENST00000309340 1744 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
TRBV2A0A0J9YWF9 FSD1L-208ENST00000495708 1906 ntTSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
TRBV2A0A0J9YWF9 NRTN-201ENST00000303212 1109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
TRBV2A0A0J9YWF9 PLEKHF1-201ENST00000436066 2084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
TRBV2A0A0J9YWF9 SERPING1-205ENST00000403558 2231 ntTSL 5 BASIC22.96■■□□□ 1.27
TRBV2A0A0J9YWF9 SDCCAG3-201ENST00000298537 2314 ntTSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
TRBV2A0A0J9YWF9 MAGI2-215ENST00000628980 6212 ntTSL 5 BASIC22.95■■□□□ 1.26
TRBV2A0A0J9YWF9 AC010864.1-201ENST00000609407 1511 ntBASIC22.94■■□□□ 1.26
TRBV2A0A0J9YWF9 NRGN-202ENST00000412681 1106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
TRBV2A0A0J9YWF9 AC025431.1-201ENST00000559684 874 ntTSL 3 BASIC22.94■■□□□ 1.26
TRBV2A0A0J9YWF9 KANSL1L-207ENST00000452086 2334 ntTSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
TRBV2A0A0J9YWF9 LINC01089-207ENST00000538335 630 ntTSL 3 BASIC22.93■■□□□ 1.26
TRBV2A0A0J9YWF9 AMZ2-201ENST00000359783 1722 ntTSL 5 BASIC22.93■■□□□ 1.26
TRBV2A0A0J9YWF9 CARM1-202ENST00000344150 2722 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.93■■□□□ 1.26
TRBV2A0A0J9YWF9 HYAL2-202ENST00000395139 2136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
TRBV2A0A0J9YWF9 AL133380.1-201ENST00000506013 324 ntBASIC22.92■■□□□ 1.26
TRBV2A0A0J9YWF9 KLF16-203ENST00000592313 508 ntTSL 3 BASIC22.92■■□□□ 1.26
TRBV2A0A0J9YWF9 PPP3CC-204ENST00000518852 1598 ntTSL 2 BASIC22.92■■□□□ 1.26
TRBV2A0A0J9YWF9 MARCH11-201ENST00000332432 1741 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.91■■□□□ 1.26
TRBV2A0A0J9YWF9 MAPKAPK2-201ENST00000294981 2171 ntTSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
TRBV2A0A0J9YWF9 VEGFC-202ENST00000618562 2064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
TRBV2A0A0J9YWF9 RUNX2-205ENST00000465038 1770 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC22.9■■□□□ 1.26
TRBV2A0A0J9YWF9 NOG-201ENST00000332822 1892 ntAPPRIS P1 BASIC22.9■■□□□ 1.26
TRBV2A0A0J9YWF9 ZDHHC23-206ENST00000498275 2055 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.89■■□□□ 1.26
TRBV2A0A0J9YWF9 ZNF276-202ENST00000443381 2267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.26
TRBV2A0A0J9YWF9 CHST14-202ENST00000559991 1968 ntTSL 5 BASIC22.89■■□□□ 1.26
TRBV2A0A0J9YWF9 AL121749.1-202ENST00000609313 2153 ntBASIC22.89■■□□□ 1.26
TRBV2A0A0J9YWF9 FAM78B-202ENST00000354422 1475 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.89■■□□□ 1.25
TRBV2A0A0J9YWF9 RAPGEF1-203ENST00000372195 6256 ntTSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
TRBV2A0A0J9YWF9 WTAP-206ENST00000621533 2109 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.88■■□□□ 1.25
TRBV2A0A0J9YWF9 HNRNPAB-205ENST00000506259 1674 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
TRBV2A0A0J9YWF9 CDK2AP1-203ENST00000535979 1281 ntTSL 3 BASIC22.88■■□□□ 1.25
TRBV2A0A0J9YWF9 RCOR3-202ENST00000367006 2525 ntTSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
TRBV2A0A0J9YWF9 TNIP2-201ENST00000315423 1974 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
TRBV2A0A0J9YWF9 ROM1-201ENST00000278833 1878 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
TRBV2A0A0J9YWF9 SLC16A3-214ENST00000582743 2002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
TRBV2A0A0J9YWF9 FTCD-201ENST00000291670 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
TRBV2A0A0J9YWF9 CAPNS1-204ENST00000587718 1558 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
TRBV2A0A0J9YWF9 SNTB1-202ENST00000517992 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
TRBV2A0A0J9YWF9 THRA-204ENST00000546243 1909 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.86■■□□□ 1.25
TRBV2A0A0J9YWF9 FLJ37453-201ENST00000317122 2473 ntTSL 2 BASIC22.86■■□□□ 1.25
TRBV2A0A0J9YWF9 KCNJ4-201ENST00000303592 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
TRBV2A0A0J9YWF9 TMEM55B-201ENST00000250489 1961 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
TRBV2A0A0J9YWF9 NAPA-201ENST00000263354 1839 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
TRBV2A0A0J9YWF9 HECA-201ENST00000367658 5614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
TRBV2A0A0J9YWF9 TMEM187-201ENST00000369982 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
TRBV2A0A0J9YWF9 AC079305.1-201ENST00000428541 499 ntTSL 3 BASIC22.84■■□□□ 1.25
TRBV2A0A0J9YWF9 SIGMAR1-205ENST00000477726 840 ntTSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
TRBV2A0A0J9YWF9 STUB1-205ENST00000565677 1560 ntTSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
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