Protein–RNA interactions for Protein: A0A0A6YY99

TNFSF12-TNFSF13, Protein TNFSF12-TNFSF13, humanhuman

Predictions only

Length 330 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TNFSF12-TNFSF13A0A0A6YY99 MYLIP-202ENST00000356840 1666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
TNFSF12-TNFSF13A0A0A6YY99 TSEN34-203ENST00000396388 1349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
TNFSF12-TNFSF13A0A0A6YY99 ZNF513-201ENST00000323703 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
TNFSF12-TNFSF13A0A0A6YY99 SLC52A2-201ENST00000329994 1896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
TNFSF12-TNFSF13A0A0A6YY99 KIAA2013-202ENST00000376576 2539 ntTSL 2 BASIC23.9■■□□□ 1.42
TNFSF12-TNFSF13A0A0A6YY99 BATF3-201ENST00000243440 980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
TNFSF12-TNFSF13A0A0A6YY99 AC044849.2-201ENST00000606596 710 ntBASIC23.9■■□□□ 1.42
TNFSF12-TNFSF13A0A0A6YY99 PI4KAP2-202ENST00000450651 2294 ntTSL 5 BASIC23.89■■□□□ 1.42
TNFSF12-TNFSF13A0A0A6YY99 HNRNPAB-202ENST00000358344 1796 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.42
TNFSF12-TNFSF13A0A0A6YY99 NPHP3-202ENST00000383282 782 ntTSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.41
TNFSF12-TNFSF13A0A0A6YY99 ZFAND2B-206ENST00000409336 944 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.89■■□□□ 1.41
TNFSF12-TNFSF13A0A0A6YY99 NAA50-207ENST00000493900 962 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC23.89■■□□□ 1.41
TNFSF12-TNFSF13A0A0A6YY99 AC104109.3-201ENST00000519718 483 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.89■■□□□ 1.41
TNFSF12-TNFSF13A0A0A6YY99 SCX-201ENST00000567180 999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.41
TNFSF12-TNFSF13A0A0A6YY99 ZFAND2B-221ENST00000621130 1070 ntTSL 5 BASIC23.89■■□□□ 1.41
TNFSF12-TNFSF13A0A0A6YY99 ATPAF1-202ENST00000371937 1827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.41
TNFSF12-TNFSF13A0A0A6YY99 FAM149A-201ENST00000227065 2708 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.41
TNFSF12-TNFSF13A0A0A6YY99 SMIM12-205ENST00000456842 918 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.88■■□□□ 1.41
TNFSF12-TNFSF13A0A0A6YY99 AP000547.3-202ENST00000592107 1019 ntTSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
TNFSF12-TNFSF13A0A0A6YY99 NOXA1-201ENST00000341349 1678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
TNFSF12-TNFSF13A0A0A6YY99 ATP6V1E2-204ENST00000522587 1559 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.87■■□□□ 1.41
TNFSF12-TNFSF13A0A0A6YY99 AMN-201ENST00000299155 1907 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
TNFSF12-TNFSF13A0A0A6YY99 PHOX2A-201ENST00000298231 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
TNFSF12-TNFSF13A0A0A6YY99 CCDC88C-205ENST00000553403 1651 ntTSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
TNFSF12-TNFSF13A0A0A6YY99 TERF2-207ENST00000567296 1129 ntTSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
TNFSF12-TNFSF13A0A0A6YY99 TM6SF1-202ENST00000322019 2074 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
TNFSF12-TNFSF13A0A0A6YY99 DCBLD1-201ENST00000296955 1979 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
TNFSF12-TNFSF13A0A0A6YY99 AGAP1-202ENST00000336665 5427 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
TNFSF12-TNFSF13A0A0A6YY99 PSMG4-202ENST00000380305 489 ntTSL 5 BASIC23.85■■□□□ 1.41
TNFSF12-TNFSF13A0A0A6YY99 STUB1-205ENST00000565677 1560 ntTSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
TNFSF12-TNFSF13A0A0A6YY99 GTF3C4-202ENST00000483873 1417 ntTSL 3 BASIC23.84■■□□□ 1.41
TNFSF12-TNFSF13A0A0A6YY99 ECI1-207ENST00000570258 1512 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.84■■□□□ 1.41
TNFSF12-TNFSF13A0A0A6YY99 CHPT1-201ENST00000229266 1585 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
TNFSF12-TNFSF13A0A0A6YY99 PPP1R14B-201ENST00000309318 982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.41
TNFSF12-TNFSF13A0A0A6YY99 TXNL4A-210ENST00000591711 669 ntTSL 2 BASIC23.83■■□□□ 1.41
TNFSF12-TNFSF13A0A0A6YY99 CGREF1-203ENST00000402394 1906 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC23.82■■□□□ 1.4
TNFSF12-TNFSF13A0A0A6YY99 SHOX2-204ENST00000483851 1866 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.82■■□□□ 1.4
TNFSF12-TNFSF13A0A0A6YY99 COPRS-202ENST00000378634 1041 ntTSL 2 BASIC23.82■■□□□ 1.4
TNFSF12-TNFSF13A0A0A6YY99 RASSF8-202ENST00000381352 2320 ntTSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
TNFSF12-TNFSF13A0A0A6YY99 ANKRD13D-211ENST00000511455 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
TNFSF12-TNFSF13A0A0A6YY99 CDKN2A-201ENST00000304494 1218 ntTSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
TNFSF12-TNFSF13A0A0A6YY99 TCEA2-202ENST00000343484 1235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
TNFSF12-TNFSF13A0A0A6YY99 MAD2L2-205ENST00000376669 864 ntTSL 3 BASIC23.8■■□□□ 1.4
TNFSF12-TNFSF13A0A0A6YY99 ABHD17A-202ENST00000292577 1757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
TNFSF12-TNFSF13A0A0A6YY99 KCTD17-202ENST00000403888 1763 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
TNFSF12-TNFSF13A0A0A6YY99 SRSF9-201ENST00000229390 1201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
TNFSF12-TNFSF13A0A0A6YY99 FOXA2-202ENST00000419308 2422 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
TNFSF12-TNFSF13A0A0A6YY99 BCL3-201ENST00000164227 2038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
TNFSF12-TNFSF13A0A0A6YY99 FSD1L-208ENST00000495708 1906 ntTSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
TNFSF12-TNFSF13A0A0A6YY99 MPST-206ENST00000429360 1331 ntTSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
TNFSF12-TNFSF13A0A0A6YY99 HNRNPAB-204ENST00000504898 1785 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
TNFSF12-TNFSF13A0A0A6YY99 GIPC1-203ENST00000393033 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
TNFSF12-TNFSF13A0A0A6YY99 HSPB11-201ENST00000194214 915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
TNFSF12-TNFSF13A0A0A6YY99 UBE2S-203ENST00000589978 496 ntTSL 5 BASIC23.75■■□□□ 1.39
TNFSF12-TNFSF13A0A0A6YY99 MKNK2-202ENST00000309340 1744 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
TNFSF12-TNFSF13A0A0A6YY99 RDX-210ENST00000530301 1549 ntTSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
TNFSF12-TNFSF13A0A0A6YY99 BOD1-201ENST00000285908 1286 ntTSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
TNFSF12-TNFSF13A0A0A6YY99 ABHD17AP4-201ENST00000411545 909 ntBASIC23.74■■□□□ 1.39
TNFSF12-TNFSF13A0A0A6YY99 MLEC-202ENST00000412616 841 ntTSL 3 BASIC23.74■■□□□ 1.39
TNFSF12-TNFSF13A0A0A6YY99 BOD1-206ENST00000480951 814 ntTSL 2 BASIC23.74■■□□□ 1.39
TNFSF12-TNFSF13A0A0A6YY99 HNRNPAB-205ENST00000506259 1674 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
TNFSF12-TNFSF13A0A0A6YY99 EMC10-202ENST00000376918 2014 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
TNFSF12-TNFSF13A0A0A6YY99 AC108673.1-201ENST00000510422 1159 ntBASIC23.73■■□□□ 1.39
TNFSF12-TNFSF13A0A0A6YY99 NEUROG2-201ENST00000313341 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
TNFSF12-TNFSF13A0A0A6YY99 FOXE3-201ENST00000335071 1981 ntAPPRIS P1 BASIC23.72■■□□□ 1.39
TNFSF12-TNFSF13A0A0A6YY99 PLPPR3-204ENST00000520876 2328 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
TNFSF12-TNFSF13A0A0A6YY99 BCL7C-201ENST00000215115 1740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
TNFSF12-TNFSF13A0A0A6YY99 KLC2-205ENST00000394078 1557 ntTSL 5 BASIC23.71■■□□□ 1.39
TNFSF12-TNFSF13A0A0A6YY99 RCE1-201ENST00000309657 1485 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
TNFSF12-TNFSF13A0A0A6YY99 NGB-201ENST00000298352 1884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.39
TNFSF12-TNFSF13A0A0A6YY99 IRX1-201ENST00000302006 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.39
TNFSF12-TNFSF13A0A0A6YY99 AP002884.3-203ENST00000419895 1711 ntTSL 2 BASIC23.7■■□□□ 1.39
TNFSF12-TNFSF13A0A0A6YY99 ENKD1-201ENST00000243878 1579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
TNFSF12-TNFSF13A0A0A6YY99 CUL4A-202ENST00000375440 2364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
TNFSF12-TNFSF13A0A0A6YY99 MFAP2-202ENST00000375535 1260 ntTSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
TNFSF12-TNFSF13A0A0A6YY99 SIRT3-201ENST00000382743 2543 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
TNFSF12-TNFSF13A0A0A6YY99 FGFRL1-205ENST00000510644 2304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
TNFSF12-TNFSF13A0A0A6YY99 ZNF787-203ENST00000610935 1925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
TNFSF12-TNFSF13A0A0A6YY99 POLR1D-201ENST00000302979 1166 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
TNFSF12-TNFSF13A0A0A6YY99 YAP1-204ENST00000526343 2393 ntTSL 5 BASIC23.69■■□□□ 1.38
TNFSF12-TNFSF13A0A0A6YY99 CUEDC1-201ENST00000360238 2193 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.68■■□□□ 1.38
TNFSF12-TNFSF13A0A0A6YY99 EFNA3-201ENST00000368408 1782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
TNFSF12-TNFSF13A0A0A6YY99 GRK6-206ENST00000507633 1660 ntTSL 5 BASIC23.68■■□□□ 1.38
TNFSF12-TNFSF13A0A0A6YY99 VAX2-201ENST00000234392 1147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
TNFSF12-TNFSF13A0A0A6YY99 VEGFA-207ENST00000413642 1197 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
TNFSF12-TNFSF13A0A0A6YY99 RUNX2-205ENST00000465038 1770 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC23.68■■□□□ 1.38
TNFSF12-TNFSF13A0A0A6YY99 ESRRA-201ENST00000000442 2215 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
TNFSF12-TNFSF13A0A0A6YY99 TRAM2-AS1-201ENST00000453216 664 ntTSL 3 BASIC23.67■■□□□ 1.38
TNFSF12-TNFSF13A0A0A6YY99 ZNF706-207ENST00000519882 959 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.67■■□□□ 1.38
TNFSF12-TNFSF13A0A0A6YY99 ZNF706-213ENST00000521272 732 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.67■■□□□ 1.38
TNFSF12-TNFSF13A0A0A6YY99 MIR6090-201ENST00000622481 60 ntBASIC23.67■■□□□ 1.38
TNFSF12-TNFSF13A0A0A6YY99 MISP3-202ENST00000587086 1535 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
TNFSF12-TNFSF13A0A0A6YY99 FOXQ1-201ENST00000296839 2309 ntAPPRIS P1 BASIC23.67■■□□□ 1.38
TNFSF12-TNFSF13A0A0A6YY99 EBAG9-202ENST00000395785 1467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
TNFSF12-TNFSF13A0A0A6YY99 RNF130-205ENST00000521389 2263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
TNFSF12-TNFSF13A0A0A6YY99 HDAC11-206ENST00000405025 576 ntTSL 4 BASIC23.66■■□□□ 1.38
TNFSF12-TNFSF13A0A0A6YY99 RUNDC3A-206ENST00000590941 1675 ntTSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
TNFSF12-TNFSF13A0A0A6YY99 DTNBP1-202ENST00000344537 1403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
TNFSF12-TNFSF13A0A0A6YY99 PIP4K2B-204ENST00000619039 5734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
TNFSF12-TNFSF13A0A0A6YY99 MATK-201ENST00000310132 2133 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 127.3 ms