Protein–RNA interactions for Protein: Q9UQF0

ERVW-1, Syncytin-1, humanhuman

Predictions only

Length 538 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ERVW-1Q9UQF0 ALX3-201ENST00000369792 1859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.82■□□□□ 0.92
ERVW-1Q9UQF0 YBX3-202ENST00000279550 1708 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.82■□□□□ 0.92
ERVW-1Q9UQF0 AC091729.3-201ENST00000423008 1401 ntTSL 2 BASIC20.82■□□□□ 0.92
ERVW-1Q9UQF0 SLC38A7-205ENST00000564010 1437 ntTSL 2 BASIC20.82■□□□□ 0.92
ERVW-1Q9UQF0 UBE2C-201ENST00000243893 476 ntTSL 2 BASIC20.82■□□□□ 0.92
ERVW-1Q9UQF0 SYNE2-201ENST00000341472 1132 ntTSL 1 (best) BASIC20.82■□□□□ 0.92
ERVW-1Q9UQF0 HIST1H2AM-201ENST00000359611 393 ntAPPRIS P1 BASIC20.82■□□□□ 0.92
ERVW-1Q9UQF0 PGM5P4-201ENST00000421970 445 ntBASIC20.82■□□□□ 0.92
ERVW-1Q9UQF0 SERTAD4-AS1-201ENST00000437764 726 ntTSL 1 (best) BASIC20.82■□□□□ 0.92
ERVW-1Q9UQF0 NCBP2-207ENST00000452404 1133 ntTSL 2 BASIC20.82■□□□□ 0.92
ERVW-1Q9UQF0 NREP-209ENST00000455559 698 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC20.82■□□□□ 0.92
ERVW-1Q9UQF0 ZNF346-203ENST00000503425 1191 ntTSL 2 BASIC20.82■□□□□ 0.92
ERVW-1Q9UQF0 CFL1-211ENST00000531407 1062 ntTSL 2 BASIC20.82■□□□□ 0.92
ERVW-1Q9UQF0 ASGR1-204ENST00000572879 797 ntTSL 5 BASIC20.82■□□□□ 0.92
ERVW-1Q9UQF0 FAM32A-205ENST00000589852 1168 ntTSL 1 (best) BASIC20.82■□□□□ 0.92
ERVW-1Q9UQF0 PTCD3-220ENST00000627371 210 ntTSL 5 BASIC20.82■□□□□ 0.92
ERVW-1Q9UQF0 ODC1-201ENST00000234111 2653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.82■□□□□ 0.92
ERVW-1Q9UQF0 PRKRA-201ENST00000325748 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.82■□□□□ 0.92
ERVW-1Q9UQF0 RFT1-202ENST00000394738 1800 ntTSL 5 BASIC20.82■□□□□ 0.92
ERVW-1Q9UQF0 NAPEPLD-208ENST00000427257 1822 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.82■□□□□ 0.92
ERVW-1Q9UQF0 UPF1-207ENST00000599848 5311 ntTSL 1 (best) BASIC20.82■□□□□ 0.92
ERVW-1Q9UQF0 CERS1-202ENST00000542296 1947 ntTSL 1 (best) BASIC20.82■□□□□ 0.92
ERVW-1Q9UQF0 TRIM3-201ENST00000345851 2879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.82■□□□□ 0.92
ERVW-1Q9UQF0 AL049796.1-201ENST00000565336 1766 ntBASIC20.82■□□□□ 0.92
ERVW-1Q9UQF0 SH3RF3-201ENST00000309415 5803 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.82■□□□□ 0.92
ERVW-1Q9UQF0 COPS7A-208ENST00000538410 1610 ntTSL 3 BASIC20.82■□□□□ 0.92
ERVW-1Q9UQF0 PGPEP1L-202ENST00000535714 1483 ntTSL 2 BASIC20.81■□□□□ 0.92
ERVW-1Q9UQF0 CACYBP-201ENST00000367679 2766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.81■□□□□ 0.92
ERVW-1Q9UQF0 SLC9A3R1-201ENST00000262613 1969 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.81■□□□□ 0.92
ERVW-1Q9UQF0 SRP68-201ENST00000307877 2649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.81■□□□□ 0.92
ERVW-1Q9UQF0 EFS-203ENST00000429593 2610 ntTSL 2 BASIC20.81■□□□□ 0.92
ERVW-1Q9UQF0 FBXO25-202ENST00000350302 2229 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.81■□□□□ 0.92
ERVW-1Q9UQF0 CHST8-202ENST00000434302 2225 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.81■□□□□ 0.92
ERVW-1Q9UQF0 SLC29A1-207ENST00000393841 2485 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.81■□□□□ 0.92
ERVW-1Q9UQF0 KCNK4-201ENST00000394525 1673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.81■□□□□ 0.92
ERVW-1Q9UQF0 SLC1A6-203ENST00000544886 2420 ntTSL 1 (best) BASIC20.81■□□□□ 0.92
ERVW-1Q9UQF0 IFI27L2-201ENST00000238609 511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.81■□□□□ 0.92
ERVW-1Q9UQF0 AC007285.1-201ENST00000422239 893 ntTSL 5 BASIC20.81■□□□□ 0.92
ERVW-1Q9UQF0 ABCC3-217ENST00000515707 656 ntTSL 3 BASIC20.81■□□□□ 0.92
ERVW-1Q9UQF0 UNC93B5-201ENST00000530315 699 ntBASIC20.81■□□□□ 0.92
ERVW-1Q9UQF0 AC073896.1-201ENST00000549318 937 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.81■□□□□ 0.92
ERVW-1Q9UQF0 AC007114.1-201ENST00000576871 713 ntTSL 2 BASIC20.81■□□□□ 0.92
ERVW-1Q9UQF0 MAPK14-210ENST00000622903 1003 ntTSL 5 BASIC20.81■□□□□ 0.92
ERVW-1Q9UQF0 HLA-B-256ENST00000639848 1089 ntBASIC20.81■□□□□ 0.92
ERVW-1Q9UQF0 APLP2-204ENST00000345598 1862 ntTSL 1 (best) BASIC20.81■□□□□ 0.92
ERVW-1Q9UQF0 PTPN18-202ENST00000347849 2472 ntTSL 1 (best) BASIC20.81■□□□□ 0.92
ERVW-1Q9UQF0 CCDC63-201ENST00000308208 1993 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC20.81■□□□□ 0.92
ERVW-1Q9UQF0 CCDC189-206ENST00000543610 1967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.81■□□□□ 0.92
ERVW-1Q9UQF0 TMEM9B-205ENST00000534025 2083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.81■□□□□ 0.92
ERVW-1Q9UQF0 DTX4-201ENST00000227451 5642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.8■□□□□ 0.92
ERVW-1Q9UQF0 GDF15-201ENST00000252809 1200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.8■□□□□ 0.92
ERVW-1Q9UQF0 FMR1-202ENST00000334557 1295 ntTSL 1 (best) BASIC20.8■□□□□ 0.92
ERVW-1Q9UQF0 MFF-205ENST00000354503 1085 ntTSL 2 BASIC20.8■□□□□ 0.92
ERVW-1Q9UQF0 DUSP23-201ENST00000368107 756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.8■□□□□ 0.92
ERVW-1Q9UQF0 GTF2A2-203ENST00000396061 758 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.8■□□□□ 0.92
ERVW-1Q9UQF0 ESRRAP1-201ENST00000400596 1257 ntBASIC20.8■□□□□ 0.92
ERVW-1Q9UQF0 DIMT1-202ENST00000506390 1208 ntTSL 1 (best) BASIC20.8■□□□□ 0.92
ERVW-1Q9UQF0 AC060766.5-201ENST00000590539 871 ntBASIC20.8■□□□□ 0.92
ERVW-1Q9UQF0 AL356652.1-201ENST00000615962 565 ntBASIC20.8■□□□□ 0.92
ERVW-1Q9UQF0 PAQR6-212ENST00000540423 1729 ntTSL 3 BASIC20.8■□□□□ 0.92
ERVW-1Q9UQF0 TPTEP1-205ENST00000558085 1738 ntTSL 2 BASIC20.8■□□□□ 0.92
ERVW-1Q9UQF0 MPPED1-203ENST00000443721 2507 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.8■□□□□ 0.92
ERVW-1Q9UQF0 JUNB-201ENST00000302754 1820 ntAPPRIS P1 BASIC20.8■□□□□ 0.92
ERVW-1Q9UQF0 PKIB-206ENST00000392490 1811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.8■□□□□ 0.92
ERVW-1Q9UQF0 NAE1-203ENST00000379463 1909 ntTSL 2 BASIC20.8■□□□□ 0.92
ERVW-1Q9UQF0 ABCG4-204ENST00000615496 2459 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.8■□□□□ 0.92
ERVW-1Q9UQF0 CACNG8-201ENST00000270458 8747 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.8■□□□□ 0.92
ERVW-1Q9UQF0 PRR7-202ENST00000502922 1345 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.79■□□□□ 0.92
ERVW-1Q9UQF0 RASGRP2-210ENST00000394430 2174 ntTSL 2 BASIC20.79■□□□□ 0.92
ERVW-1Q9UQF0 NIPAL4-202ENST00000435489 1600 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.79■□□□□ 0.92
ERVW-1Q9UQF0 ALDH16A1-202ENST00000455361 2470 ntTSL 2 BASIC20.79■□□□□ 0.92
ERVW-1Q9UQF0 MRAP-201ENST00000303645 935 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.79■□□□□ 0.92
ERVW-1Q9UQF0 SERF1A-201ENST00000317633 963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.79■□□□□ 0.92
ERVW-1Q9UQF0 CKLF-CMTM1-204ENST00000532838 587 ntAPPRIS ALT2 TSL 4 BASIC20.79■□□□□ 0.92
ERVW-1Q9UQF0 ITM2C-210ENST00000620962 501 ntBASIC20.79■□□□□ 0.92
ERVW-1Q9UQF0 RASGEF1C-201ENST00000361132 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.79■□□□□ 0.92
ERVW-1Q9UQF0 PPP4R2-201ENST00000356692 4984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.79■□□□□ 0.92
ERVW-1Q9UQF0 SMIM11B-205ENST00000624304 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.79■□□□□ 0.92
ERVW-1Q9UQF0 PARD3-207ENST00000374788 5996 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.79■□□□□ 0.92
ERVW-1Q9UQF0 FN3K-201ENST00000300784 1434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.78■□□□□ 0.92
ERVW-1Q9UQF0 CHKB-201ENST00000406938 1638 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.78■□□□□ 0.92
ERVW-1Q9UQF0 GNB3-201ENST00000229264 1923 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC20.78■□□□□ 0.92
ERVW-1Q9UQF0 HNRNPLL-204ENST00000409328 1908 ntTSL 1 (best) BASIC20.78■□□□□ 0.92
ERVW-1Q9UQF0 C19orf12-201ENST00000323670 2464 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.78■□□□□ 0.92
ERVW-1Q9UQF0 TSPAN17-207ENST00000508164 2457 ntTSL 1 (best) BASIC20.78■□□□□ 0.92
ERVW-1Q9UQF0 RAPH1-210ENST00000453034 2394 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.78■□□□□ 0.92
ERVW-1Q9UQF0 TREX2-202ENST00000334497 1982 ntTSL 1 (best) BASIC20.78■□□□□ 0.92
ERVW-1Q9UQF0 KRT18P29-201ENST00000397031 1267 ntBASIC20.78■□□□□ 0.92
ERVW-1Q9UQF0 ADM-205ENST00000528544 586 ntTSL 2 BASIC20.78■□□□□ 0.92
ERVW-1Q9UQF0 C2orf69P4-201ENST00000565394 541 ntBASIC20.78■□□□□ 0.92
ERVW-1Q9UQF0 CTGF-201ENST00000367976 2339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.78■□□□□ 0.92
ERVW-1Q9UQF0 AC007375.3-201ENST00000600936 2314 ntBASIC20.78■□□□□ 0.92
ERVW-1Q9UQF0 ST8SIA1-204ENST00000404299 1920 ntTSL 1 (best) BASIC20.78■□□□□ 0.92
ERVW-1Q9UQF0 IRX2-201ENST00000302057 2456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.78■□□□□ 0.92
ERVW-1Q9UQF0 PHB2-201ENST00000399433 1308 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC20.78■□□□□ 0.92
ERVW-1Q9UQF0 AMZ1-202ENST00000407112 1862 ntTSL 2 BASIC20.77■□□□□ 0.92
ERVW-1Q9UQF0 SQLE-206ENST00000523430 1879 ntTSL 2 BASIC20.77■□□□□ 0.92
ERVW-1Q9UQF0 FAM69B-202ENST00000371692 1668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.77■□□□□ 0.92
ERVW-1Q9UQF0 CDC42SE2-206ENST00000503291 2025 ntTSL 1 (best) BASIC20.77■□□□□ 0.92
ERVW-1Q9UQF0 SLC25A10-201ENST00000331531 1946 ntTSL 1 (best) BASIC20.77■□□□□ 0.92
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 61.9 ms