Protein–RNA interactions for Protein: Q9NY91

SLC5A4, Solute carrier family 5 member 4, humanhuman

Predictions only

Length 659 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SLC5A4Q9NY91 NTN1-201ENST00000173229 5954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
SLC5A4Q9NY91 PSPH-201ENST00000275605 2131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.32
SLC5A4Q9NY91 GAL3ST3-201ENST00000312006 2133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.32
SLC5A4Q9NY91 CNEP1R1-202ENST00000427478 2117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.32
SLC5A4Q9NY91 MOGS-202ENST00000409065 2668 ntTSL 5 BASIC23.33■■□□□ 1.32
SLC5A4Q9NY91 C9orf163-202ENST00000624034 2573 ntBASIC23.33■■□□□ 1.32
SLC5A4Q9NY91 EEF1D-225ENST00000529272 1311 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.33■■□□□ 1.32
SLC5A4Q9NY91 TOM1L2-210ENST00000542206 1320 ntTSL 2 BASIC23.33■■□□□ 1.32
SLC5A4Q9NY91 ANKHD1-221ENST00000616482 2064 ntTSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
SLC5A4Q9NY91 SLC25A22-216ENST00000531214 1790 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.32■■□□□ 1.32
SLC5A4Q9NY91 MIF-AS1-201ENST00000406213 1476 ntTSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
SLC5A4Q9NY91 ST3GAL4-215ENST00000532243 1825 ntTSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
SLC5A4Q9NY91 UBE2C-201ENST00000243893 476 ntTSL 2 BASIC23.32■■□□□ 1.32
SLC5A4Q9NY91 RPS2P55-201ENST00000397318 883 ntBASIC23.32■■□□□ 1.32
SLC5A4Q9NY91 AC239809.2-201ENST00000415381 517 ntBASIC23.32■■□□□ 1.32
SLC5A4Q9NY91 ECEL1P3-201ENST00000427961 737 ntBASIC23.32■■□□□ 1.32
SLC5A4Q9NY91 WDR86-AS1-203ENST00000480632 704 ntTSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
SLC5A4Q9NY91 THEM4-205ENST00000489410 643 ntTSL 2 BASIC23.32■■□□□ 1.32
SLC5A4Q9NY91 AC107956.1-201ENST00000494359 873 ntBASIC23.32■■□□□ 1.32
SLC5A4Q9NY91 PAIP2-208ENST00000511706 468 ntTSL 5 BASIC23.32■■□□□ 1.32
SLC5A4Q9NY91 ODC1-201ENST00000234111 2653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
SLC5A4Q9NY91 CAV3-201ENST00000343849 1431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
SLC5A4Q9NY91 HPCAL1-201ENST00000307845 1751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
SLC5A4Q9NY91 NPAS1-201ENST00000439365 1341 ntTSL 2 BASIC23.32■■□□□ 1.32
SLC5A4Q9NY91 GORASP1-220ENST00000479927 1345 ntTSL 2 BASIC23.32■■□□□ 1.32
SLC5A4Q9NY91 SNHG7-201ENST00000414282 2357 ntTSL 2 BASIC23.32■■□□□ 1.32
SLC5A4Q9NY91 HAS1-201ENST00000222115 2087 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
SLC5A4Q9NY91 H2AFY2-201ENST00000373255 1980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
SLC5A4Q9NY91 DES-201ENST00000373960 2248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
SLC5A4Q9NY91 HAS3-201ENST00000219322 1163 ntTSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
SLC5A4Q9NY91 NDUFB1-201ENST00000329559 528 ntTSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
SLC5A4Q9NY91 CLTA-202ENST00000345519 1073 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
SLC5A4Q9NY91 AC105020.4-201ENST00000569467 563 ntTSL 4 BASIC23.31■■□□□ 1.32
SLC5A4Q9NY91 LINC00654-202ENST00000589201 579 ntTSL 3 BASIC23.31■■□□□ 1.32
SLC5A4Q9NY91 AC124016.1-201ENST00000609552 612 ntBASIC23.31■■□□□ 1.32
SLC5A4Q9NY91 AL023875.1-201ENST00000640777 796 ntBASIC23.31■■□□□ 1.32
SLC5A4Q9NY91 LMAN1L-202ENST00000379709 1699 ntTSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
SLC5A4Q9NY91 CEACAM3-202ENST00000357396 1316 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
SLC5A4Q9NY91 CDKN2B-AS1-217ENST00000585267 1337 ntTSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
SLC5A4Q9NY91 CDR2-201ENST00000268383 2702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
SLC5A4Q9NY91 NEURL4-201ENST00000315614 5182 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
SLC5A4Q9NY91 ZNF302-215ENST00000627982 1723 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.3■■□□□ 1.32
SLC5A4Q9NY91 PNKP-215ENST00000600910 1600 ntTSL 5 BASIC23.3■■□□□ 1.32
SLC5A4Q9NY91 BABAM1-213ENST00000601043 1366 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC23.3■■□□□ 1.32
SLC5A4Q9NY91 AKT2-206ENST00000392038 5300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
SLC5A4Q9NY91 SMOX-212ENST00000621355 2322 ntTSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
SLC5A4Q9NY91 DUSP2-201ENST00000288943 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
SLC5A4Q9NY91 AL590666.2-201ENST00000448869 758 ntTSL 2 BASIC23.3■■□□□ 1.32
SLC5A4Q9NY91 HOXB-AS3-204ENST00000466037 522 ntTSL 3 BASIC23.3■■□□□ 1.32
SLC5A4Q9NY91 HAGHL-213ENST00000564545 663 ntTSL 3 BASIC23.3■■□□□ 1.32
SLC5A4Q9NY91 CIRBP-213ENST00000587323 1092 ntTSL 5 BASIC23.3■■□□□ 1.32
SLC5A4Q9NY91 LINC01023-201ENST00000606054 436 ntBASIC23.3■■□□□ 1.32
SLC5A4Q9NY91 AC110285.5-201ENST00000611501 352 ntBASIC23.3■■□□□ 1.32
SLC5A4Q9NY91 MYCN-201ENST00000281043 2602 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.3■■□□□ 1.32
SLC5A4Q9NY91 PPP1R36-201ENST00000298705 1405 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
SLC5A4Q9NY91 ASRGL1-202ENST00000415229 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
SLC5A4Q9NY91 TERF2-201ENST00000254942 2983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
SLC5A4Q9NY91 PLSCR3-213ENST00000576362 1605 ntTSL 3 BASIC23.3■■□□□ 1.32
SLC5A4Q9NY91 GAS2L1-206ENST00000610653 2238 ntTSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
SLC5A4Q9NY91 KLC1-227ENST00000634686 2229 ntTSL 5 BASIC23.29■■□□□ 1.32
SLC5A4Q9NY91 DACT3-201ENST00000300875 2526 ntTSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
SLC5A4Q9NY91 C11orf86-201ENST00000308963 1187 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.29■■□□□ 1.32
SLC5A4Q9NY91 NDUFV3-202ENST00000354250 1575 ntTSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
SLC5A4Q9NY91 RNF5-203ENST00000375094 1168 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
SLC5A4Q9NY91 RALGPS1-206ENST00000394011 819 ntTSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
SLC5A4Q9NY91 ANKRD54-204ENST00000411961 946 ntTSL 5 BASIC23.29■■□□□ 1.32
SLC5A4Q9NY91 AC211429.1-201ENST00000415277 523 ntBASIC23.29■■□□□ 1.32
SLC5A4Q9NY91 STK24-AS1-201ENST00000434547 1278 ntTSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
SLC5A4Q9NY91 C16orf90-202ENST00000437192 907 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.29■■□□□ 1.32
SLC5A4Q9NY91 SERP1-205ENST00000487153 657 ntTSL 4 BASIC23.29■■□□□ 1.32
SLC5A4Q9NY91 BAALC-AS1-206ENST00000521383 736 ntTSL 3 BASIC23.29■■□□□ 1.32
SLC5A4Q9NY91 TSPAN3-210ENST00000561277 1592 ntTSL 5 BASIC23.29■■□□□ 1.32
SLC5A4Q9NY91 YY1AP1-212ENST00000404643 2654 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
SLC5A4Q9NY91 MSL1-203ENST00000577454 2081 ntTSL 2 BASIC23.29■■□□□ 1.32
SLC5A4Q9NY91 RBPJL-202ENST00000372741 1636 ntTSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
SLC5A4Q9NY91 BZW1-209ENST00000452790 1473 ntTSL 2 BASIC23.29■■□□□ 1.32
SLC5A4Q9NY91 IRF3-221ENST00000598808 1468 ntTSL 5 BASIC23.29■■□□□ 1.32
SLC5A4Q9NY91 SHISA4-201ENST00000362011 1341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
SLC5A4Q9NY91 PHACTR2-208ENST00000440869 2569 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.29■■□□□ 1.32
SLC5A4Q9NY91 NPAS1-202ENST00000449844 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
SLC5A4Q9NY91 APLP2-204ENST00000345598 1862 ntTSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
SLC5A4Q9NY91 AOC3-207ENST00000617500 2392 ntTSL 4 BASIC23.28■■□□□ 1.32
SLC5A4Q9NY91 SH3RF3-201ENST00000309415 5803 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.28■■□□□ 1.32
SLC5A4Q9NY91 TATDN2-201ENST00000287652 5342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
SLC5A4Q9NY91 COX7A2L-201ENST00000234301 1112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
SLC5A4Q9NY91 RER1-204ENST00000378518 522 ntTSL 3 BASIC23.28■■□□□ 1.32
SLC5A4Q9NY91 ZFYVE1-202ENST00000394207 1183 ntTSL 2 BASIC23.28■■□□□ 1.32
SLC5A4Q9NY91 SIVA1-203ENST00000535554 1244 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC23.28■■□□□ 1.32
SLC5A4Q9NY91 AC022211.2-202ENST00000582668 546 ntTSL 4 BASIC23.28■■□□□ 1.32
SLC5A4Q9NY91 AL356652.1-201ENST00000615962 565 ntBASIC23.28■■□□□ 1.32
SLC5A4Q9NY91 ZNF584-203ENST00000593920 2187 ntTSL 2 BASIC23.28■■□□□ 1.32
SLC5A4Q9NY91 MXRA8-203ENST00000445648 2001 ntTSL 2 BASIC23.28■■□□□ 1.32
SLC5A4Q9NY91 FOXK2-201ENST00000335255 5265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
SLC5A4Q9NY91 CCDC9-201ENST00000221922 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
SLC5A4Q9NY91 NKX3-2-201ENST00000382438 2801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
SLC5A4Q9NY91 EFCC1-201ENST00000436022 2691 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.27■■□□□ 1.32
SLC5A4Q9NY91 LAG3-202ENST00000441671 1576 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
SLC5A4Q9NY91 ARX-201ENST00000379044 2876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
SLC5A4Q9NY91 SLC25A42-201ENST00000318596 3120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
SLC5A4Q9NY91 ITGA4-202ENST00000339307 1403 ntTSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 45.1 ms