Protein–RNA interactions for Protein: Q9H4D0

CLSTN2, Calsyntenin-2, humanhuman

Predictions only

Length 955 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CLSTN2Q9H4D0 LINC01574-201ENST00000512115 560 ntTSL 2 BASIC23.1■■□□□ 1.29
CLSTN2Q9H4D0 AC010203.1-202ENST00000550096 695 ntTSL 3 BASIC23.1■■□□□ 1.29
CLSTN2Q9H4D0 RASA4CP-201ENST00000424092 1398 ntBASIC23.1■■□□□ 1.29
CLSTN2Q9H4D0 RGMB-207ENST00000513185 2052 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.1■■□□□ 1.29
CLSTN2Q9H4D0 GPR62-201ENST00000322241 2191 ntAPPRIS P1 BASIC23.1■■□□□ 1.29
CLSTN2Q9H4D0 CLDND1-201ENST00000341181 2161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
CLSTN2Q9H4D0 DMPK-205ENST00000458663 2548 ntTSL 5 BASIC23.1■■□□□ 1.29
CLSTN2Q9H4D0 PAQR4-203ENST00000572687 2251 ntTSL 2 BASIC23.1■■□□□ 1.29
CLSTN2Q9H4D0 ENPP7-201ENST00000328313 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
CLSTN2Q9H4D0 ACBD4-204ENST00000431281 2026 ntTSL 5 BASIC23.09■■□□□ 1.29
CLSTN2Q9H4D0 VCPKMT-202ENST00000395860 1761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
CLSTN2Q9H4D0 UTP4-201ENST00000314423 2322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
CLSTN2Q9H4D0 CNEP1R1-203ENST00000458059 2965 ntTSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
CLSTN2Q9H4D0 RNF135-205ENST00000535306 2098 ntTSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
CLSTN2Q9H4D0 ASCL4-201ENST00000342331 2260 ntAPPRIS P1 BASIC23.09■■□□□ 1.29
CLSTN2Q9H4D0 PRDX4-202ENST00000379341 1005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
CLSTN2Q9H4D0 AC096631.2-201ENST00000436136 790 ntBASIC23.09■■□□□ 1.29
CLSTN2Q9H4D0 RNF165-205ENST00000588679 2904 ntBASIC23.09■■□□□ 1.29
CLSTN2Q9H4D0 C2orf54-201ENST00000307486 2017 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
CLSTN2Q9H4D0 INSM2-201ENST00000307169 3013 ntAPPRIS P1 BASIC23.08■■□□□ 1.29
CLSTN2Q9H4D0 DNASE1L2-203ENST00000564065 2194 ntTSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
CLSTN2Q9H4D0 EPS8L1-209ENST00000588359 1407 ntTSL 5 BASIC23.08■■□□□ 1.29
CLSTN2Q9H4D0 RTCA-201ENST00000260563 1534 ntTSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
CLSTN2Q9H4D0 SLC6A11-202ENST00000454147 2794 ntTSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
CLSTN2Q9H4D0 FMR1-AS1-202ENST00000596112 1845 ntTSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
CLSTN2Q9H4D0 ZNF12-201ENST00000342651 2921 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.08■■□□□ 1.29
CLSTN2Q9H4D0 PABPC1L-202ENST00000217074 1263 ntTSL 5 BASIC23.08■■□□□ 1.29
CLSTN2Q9H4D0 EDA-201ENST00000338901 1233 ntBASIC23.08■■□□□ 1.29
CLSTN2Q9H4D0 MIR939-201ENST00000401314 82 ntBASIC23.08■■□□□ 1.29
CLSTN2Q9H4D0 ZPBP-201ENST00000046087 1213 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
CLSTN2Q9H4D0 AP2S1-203ENST00000593442 636 ntTSL 2 BASIC23.08■■□□□ 1.29
CLSTN2Q9H4D0 AC106739.1-201ENST00000617035 715 ntBASIC23.08■■□□□ 1.29
CLSTN2Q9H4D0 NEDD4L-237ENST00000617539 728 ntTSL 2 BASIC23.08■■□□□ 1.29
CLSTN2Q9H4D0 KBTBD13-201ENST00000432196 1377 ntAPPRIS P1 BASIC23.08■■□□□ 1.29
CLSTN2Q9H4D0 SPR-201ENST00000234454 1480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
CLSTN2Q9H4D0 TPD52L1-201ENST00000304877 1468 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.08■■□□□ 1.29
CLSTN2Q9H4D0 DTX4-201ENST00000227451 5642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
CLSTN2Q9H4D0 STIM2-211ENST00000639195 2265 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
CLSTN2Q9H4D0 UBE2B-201ENST00000265339 2515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.28
CLSTN2Q9H4D0 AC138649.1-201ENST00000619611 1449 ntTSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.28
CLSTN2Q9H4D0 ASCC1-205ENST00000394919 2683 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.07■■□□□ 1.28
CLSTN2Q9H4D0 LHX3-202ENST00000371748 2365 ntTSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
CLSTN2Q9H4D0 ZNF281-202ENST00000367352 2933 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.07■■□□□ 1.28
CLSTN2Q9H4D0 ETV7-203ENST00000373737 1488 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
CLSTN2Q9H4D0 C17orf62-204ENST00000437807 2242 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.07■■□□□ 1.28
CLSTN2Q9H4D0 LRRC3C-201ENST00000377924 891 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.07■■□□□ 1.28
CLSTN2Q9H4D0 CDC37L1-202ENST00000381858 1244 ntTSL 5 BASIC23.07■■□□□ 1.28
CLSTN2Q9H4D0 RUFY3-203ENST00000417478 2143 ntTSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
CLSTN2Q9H4D0 AC245052.3-201ENST00000450182 901 ntBASIC23.07■■□□□ 1.28
CLSTN2Q9H4D0 INTS11-202ENST00000411962 1832 ntTSL 5 BASIC23.07■■□□□ 1.28
CLSTN2Q9H4D0 AC008073.3-201ENST00000610442 2281 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.07■■□□□ 1.28
CLSTN2Q9H4D0 NKX1-2-201ENST00000451024 3364 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.07■■□□□ 1.28
CLSTN2Q9H4D0 NKX6-1-201ENST00000295886 2628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
CLSTN2Q9H4D0 MRM1-204ENST00000614766 1857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
CLSTN2Q9H4D0 CLINT1-207ENST00000523908 2346 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
CLSTN2Q9H4D0 MAP2K5-203ENST00000354498 1783 ntTSL 2 BASIC23.06■■□□□ 1.28
CLSTN2Q9H4D0 COQ10A-201ENST00000308197 1652 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
CLSTN2Q9H4D0 LINC00482-201ENST00000332012 2023 ntTSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
CLSTN2Q9H4D0 KLC1-219ENST00000555836 2467 ntTSL 5 BASIC23.06■■□□□ 1.28
CLSTN2Q9H4D0 SLC39A4-201ENST00000276833 2297 ntTSL 2 BASIC23.06■■□□□ 1.28
CLSTN2Q9H4D0 SPAG16-204ENST00000413312 2258 ntTSL 5 BASIC23.06■■□□□ 1.28
CLSTN2Q9H4D0 TRMT2A-201ENST00000252136 2964 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
CLSTN2Q9H4D0 SNAP91-211ENST00000520213 2168 ntTSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
CLSTN2Q9H4D0 KLC2-204ENST00000394067 2898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
CLSTN2Q9H4D0 HES4-201ENST00000304952 899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
CLSTN2Q9H4D0 DTYMK-201ENST00000305784 1232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
CLSTN2Q9H4D0 PLPP5-201ENST00000419686 794 ntTSL 2 BASIC23.06■■□□□ 1.28
CLSTN2Q9H4D0 AF213884.3-201ENST00000563833 479 ntBASIC23.06■■□□□ 1.28
CLSTN2Q9H4D0 PLEKHJ1-213ENST00000591099 1092 ntTSL 2 BASIC23.06■■□□□ 1.28
CLSTN2Q9H4D0 MGEA5-205ENST00000439817 5043 ntTSL 5 BASIC23.06■■□□□ 1.28
CLSTN2Q9H4D0 SNX21-201ENST00000342644 1506 ntTSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
CLSTN2Q9H4D0 RBAK-202ENST00000396912 6551 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
CLSTN2Q9H4D0 NRL-206ENST00000561028 2103 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.06■■□□□ 1.28
CLSTN2Q9H4D0 KRT16P2-201ENST00000414673 1423 ntBASIC23.06■■□□□ 1.28
CLSTN2Q9H4D0 MKRN1-208ENST00000474576 1661 ntTSL 5 BASIC23.06■■□□□ 1.28
CLSTN2Q9H4D0 AC116562.4-201ENST00000641316 2276 ntBASIC23.06■■□□□ 1.28
CLSTN2Q9H4D0 TPD52L1-203ENST00000368402 1308 ntTSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
CLSTN2Q9H4D0 NAE1-201ENST00000290810 1837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
CLSTN2Q9H4D0 KRT87P-202ENST00000534226 1464 ntBASIC23.05■■□□□ 1.28
CLSTN2Q9H4D0 MEGF6-202ENST00000356575 5455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
CLSTN2Q9H4D0 RARRES2-201ENST00000223271 740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
CLSTN2Q9H4D0 STOML2-202ENST00000452248 1296 ntTSL 2 BASIC23.05■■□□□ 1.28
CLSTN2Q9H4D0 STOML2-205ENST00000619795 1293 ntTSL 3 BASIC23.05■■□□□ 1.28
CLSTN2Q9H4D0 POLR2E-214ENST00000619917 932 ntTSL 5 BASIC23.05■■□□□ 1.28
CLSTN2Q9H4D0 ING1-201ENST00000333219 5119 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
CLSTN2Q9H4D0 COL13A1-205ENST00000398978 3093 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC23.05■■□□□ 1.28
CLSTN2Q9H4D0 NSDHL-201ENST00000370274 1929 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
CLSTN2Q9H4D0 LBX2-AS1-202ENST00000603175 2083 ntBASIC23.05■■□□□ 1.28
CLSTN2Q9H4D0 ZNF398-202ENST00000475153 2860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
CLSTN2Q9H4D0 AP3S1-201ENST00000316788 1730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
CLSTN2Q9H4D0 DNAJC1-202ENST00000376980 2106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
CLSTN2Q9H4D0 GPR35-202ENST00000403859 2032 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC23.04■■□□□ 1.28
CLSTN2Q9H4D0 ARHGAP22-204ENST00000417247 2340 ntTSL 2 BASIC23.04■■□□□ 1.28
CLSTN2Q9H4D0 NGLY1-202ENST00000280700 2473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
CLSTN2Q9H4D0 TMEM51-201ENST00000376008 1931 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.04■■□□□ 1.28
CLSTN2Q9H4D0 TXNRD2-203ENST00000400519 3155 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
CLSTN2Q9H4D0 DDAH1-205ENST00000539042 1519 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.04■■□□□ 1.28
CLSTN2Q9H4D0 RTKN-201ENST00000233330 2220 ntTSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
CLSTN2Q9H4D0 LARGE2-208ENST00000531526 2528 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC23.04■■□□□ 1.28
CLSTN2Q9H4D0 EBPL-204ENST00000378272 766 ntTSL 3 BASIC23.04■■□□□ 1.28
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 22 ms